<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482118.7	1	CCCCATGACTCATCCCAAATGGTAATCTAAATTTCAGTGACACTACCCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47124	CCCCATGACTCATCCCAAATGGTAATCTAAATTTCAGTGACACTACCCTC	47173

FQ482118.7	51	AGGATTGTAGTTGAGCATGTGGATCCAGGACAGAAGCTCTTTGGGCATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47174	AGGATTGTAGTTGAGCATGTGGATCCAGGACAGAAGCTCTTTGGGCATTT	47223

FQ482118.7	101	GGACTTGGCTGATCTGGAAGGCAGTCCTGAAAGTTGATATTTTATTCTAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47224	GGACTTGGCTGATCTGGAAGGCAGTCCTGAAAGTTGATATTTTATTCTAG	47273

FQ482118.7	151	ATGGACTTTGGGAAGGGATGGAAATGCCTGATGAGAGAAGACAAGTGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47274	ATGGACTTTGGGAAGGGATGGAAATGCCTGATGAGAGAAGACAAGTGAGA	47323

FQ482118.7	201	AGATTTCAAAAGCAAAGCCCAGTGAGTTCTGGGTTCCAACAAAAGGACTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47324	AGATTTCAAAAGCAAAGCCCAGTGAGTTCTGGGTTCCAACAAAAGGACTT	47373

FQ482118.7	251	GGAAAACCTGCCAGCCATTCTGGGCTTATAGTTTCGAGTTTCAATTCCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47374	GGAAAACCTGCCAGCCATTCTGGGCTTATAGTTTCGAGTTTCAATTCCTT	47423

FQ482118.7	301	CTCAATTATAGACCATTCATTTGGCAAACATGTACTAAATATCTACTATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47424	CTCAATTATAGACCATTCATTTGGCAAACATGTACTAAATATCTACTATG	47473

FQ482118.7	351	TGATGGCCGCTGCTTTTAGAAGGAACTGGGGCTGATGGAACCTCACTCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47474	TGATGGCCGCTGCTTTTAGAAGGAACTGGGGCTGATGGAACCTCACTCTC	47523

FQ482118.7	401	CTGGCACTCAAGGTTGGCTCAGTCTTGCTCAGCCTAACATGGGTAAGGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47524	CTGGCACTCAAGGTTGGCTCAGTCTTGCTCAGCCTAACATGGGTAAGGAA	47573

FQ482118.7	451	GTTTTAACACAAATGGTAAGGGCAACCTGCACAGGTGCCTTGTGGACATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47574	GTTTTAACACAAATGGTAAGGGCAACCTGCACAGGTGCCTTGTGGACATA	47623

FQ482118.7	501	TATGTAGACTGGCAGCTTTGAGCAAGGAGTTACAAAAACCTTATAAAAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47624	TATGTAGACTGGCAGCTTTGAGCAAGGAGTTACAAAAACCTTATAAAAGA	47673

FQ482118.7	551	GGCAGCATATGAGCTGCATTTTGAGTATAAGTAGGAACCCAATGGACACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47674	GGCAGCATATGAGCTGCATTTTGAGTATAAGTAGGAACCCAATGGACACC	47723

FQ482118.7	601	CAGGAGAAATGAACATGACTCATAATCCAGGACATGCATTCCTTGGCCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47724	CAGGAGAAATGAACATGACTCATAATCCAGGACATGCATTCCTTGGCCTA	47773

FQ482118.7	651	GGCCAGGACAGGACTCAGACTAAGCTGACTGGGGAGCCTTGCCAGTTTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47774	GGCCAGGACAGGACTCAGACTAAGCTGACTGGGGAGCCTTGCCAGTTTCT	47823

FQ482118.7	701	TTCCTGGCAAGAAAGTATGCCCCCAACATCTGACTGCTCAGGAATCACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47824	TTCCTGGCAAGAAAGTATGCCCCCAACATCTGACTGCTCAGGAATCACAG	47873

FQ482118.7	751	TTACTAAATACTGAGATGAGGAGTGGGCAGGGCGGGGCTGGATTTGAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47874	TTACTAAATACTGAGATGAGGAGTGGGCAGGGCGGGGCTGGATTTGAACA	47923

FQ482118.7	801	GGAAAATTCTGCTGCAGGGATTGTTAAAATGCAAAGCCCTGGGCCCTCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47924	GGAAAATTCTGCTGCAGGGATTGTTAAAATGCAAAGCCCTGGGCCCTCAC	47973

FQ482118.7	851	CCCTGGAGTTCTCATCAGTAGGTCTGGGATAGGTCCTGAAAACTGCATCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	47974	CCCTGGAGTTCTCATCAGTAGGTCTGGGATAGGTCCTGAAAACTGCATCC	48023

FQ482118.7	901	CAGCTGATGCCAGTGTAGCCTGTTTTGGGGCTGCACTTTGAGAACTATAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48024	CAGCTGATGCCAGTGTAGCCTGTTTTGGGGCTGCACTTTGAGAACTATAC	48073

FQ482118.7	951	TAGAACCACTTTCCTGCAGGAAGAGCAAGGGTTTATGAGTCTAGTTTGGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48074	TAGAACCACTTTCCTGCAGGAAGAGCAAGGGTTTATGAGTCTAGTTTGGT	48123

FQ482118.7	1001	TTCTAATATCAGAAGGGAGCTATGAGGTATGGAATAAACCAGACCACACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48124	TTCTAATATCAGAAGGGAGCTATGAGGTATGGAATAAACCAGACCACACC	48173

FQ482118.7	1051	TGACCCACCCTGGCACTGCACGCCTACCCCAGTGACCCAGTGTTTGATTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48174	TGACCCACCCTGGCACTGCACGCCTACCCCAGTGACCCAGTGTTTGATTG	48223

FQ482118.7	1101	CCTTGGGGTCACAAGAGCTGCAAACAGCCAGGAAGGGACCAGATTTGGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48224	CCTTGGGGTCACAAGAGCTGCAAACAGCCAGGAAGGGACCAGATTTGGAG	48273

FQ482118.7	1151	GTCGGAGAGGGTGCCCGGGAAGCAGAGCTCGACACTCAGCACCTGGGGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48274	GTCGGAGAGGGTGCCCGGGAAGCAGAGCTCGACACTCAGCACCTGGGGCT	48323

FQ482118.7	1201	GCTGCAGCTCCACAGACTGGCTCCTGCGCCCTCAGGTCCTTCCTCACCCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48324	GCTGCAGCTCCACAGACTGGCTCCTGCGCCCTCAGGTCCTTCCTCACCCC	48373

FQ482118.7	1251	TCAGGACGCTGACTTCCAGGCCTTCCTCTTACTCTACCTCAAATGTTTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48374	TCAGGACGCTGACTTCCAGGCCTTCCTCTTACTCTACCTCAAATGTTTGG	48423

FQ482118.7	1301	GCCTCTGATGACAGAGGAGCTCTGTCTGGATCTTTCTGATCCAGACAGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48424	GCCTCTGATGACAGAGGAGCTCTGTCTGGATCTTTCTGATCCAGACAGGG	48473

FQ482118.7	1351	GAACATAAGGTGACAGACATGGACAAACTTACAGGTTAACAGAATGGGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48474	GAACATAAGGTGACAGACATGGACAAACTTACAGGTTAACAGAATGGGCT	48523

FQ482118.7	1401	AATAACGAGGGCCCTGAAAGTGTTGGCAAATGGCTTCAGTCAGGTGTCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48524	AATAACGAGGGCCCTGAAAGTGTTGGCAAATGGCTTCAGTCAGGTGTCCT	48573

FQ482118.7	1451	AGGAGAAACACCAGAGAGTCACGTTGGTCTAGGAGTGTGACTCTCGCTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48574	AGGAGAAACACCAGAGAGTCACGTTGGTCTAGGAGTGTGACTCTCGCTTC	48623

FQ482118.7	1501	GGGTGTGAGAGGTCCTGGCTTCAAATCCTGATCGAGCCCCCATCCTTTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48624	GGGTGTGAGAGGTCCTGGCTTCAAATCCTGATCGAGCCCCCATCCTTTTG	48673

FQ482118.7	1551	GGCTTCCCTGATGGCTCGGACAGTAAAGAATCTGCCTGCAATGCAGGAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48674	GGCTTCCCTGATGGCTCGGACAGTAAAGAATCTGCCTGCAATGCAGGAGA	48723

FQ482118.7	1601	CCTAGGTTTGATCCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGAAGAAGGACATGGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48724	CCTAGGTTTGATCCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGAAGAAGGACATGGAA	48773

FQ482118.7	1651	ACCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCCCCCACGAACAGAGGAGCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48774	ACCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCCCCCACGAACAGAGGAGCCT	48823

FQ482118.7	1701	GGCAGGCTACAGTCTATGGGCTGCAAAGAGTTGGACATGACTGAGAGACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48824	GGCAGGCTACAGTCTATGGGCTGCAAAGAGTTGGACATGACTGAGAGACT	48873

FQ482118.7	1751	AAGCACACAAGAGAAACACCAAAGTTATTTATCTAACTTTTGAGACTTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48874	AAGCACACAAGAGAAACACCAAAGTTATTTATCTAACTTTTGAGACTTTG	48923

FQ482118.7	1801	ACATGGACGCTAGAGGGCGATCTGAGATTGCTGAAACTACAAATGTTGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48924	ACATGGACGCTAGAGGGCGATCTGAGATTGCTGAAACTACAAATGTTGGT	48973

FQ482118.7	1851	CCAACCACCCAAAGAATGCTTTGTAGGCTCGGCGAGCATGCTCAGTCATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	48974	CCAACCACCCAAAGAATGCTTTGTAGGCTCGGCGAGCATGCTCAGTCATG	49023

FQ482118.7	1901	TCCCACTCTTTATGAGGCTGCCAGGCTGCCAGACTCCTATGTCTGTGGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	49024	TCCCACTCTTTATGAGGCTGCCAGGCTGCCAGACTCCTATGTCTGTGGGA	49073

FQ482118.7	1951	ACCCAGGCAAGAATACTGGATTGGGTTGTCATTTCCTCCTCCAGGGGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482133.3	49074	ACCCAGGCAAGAATACTGGATTGGGTTGTCATTTCCTCCTCCAGGGGATC	49123

Overview

Query
FQ482118.7 - 87974 bps
Hit
FQ482133.3 - 49123 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link