<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482097.2	1	TGTTTCTGCCAGGACTTCCAAAAAAAGGTAACTAACTGGTTTGGAGCTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	79928	TGTTTCTGCCAGGACTTCCAAAAAAAGGTAACTAACTGGTTTGGAGCTAA	79977

FQ482097.2	51	GTATTAAAACAATGAAAAGAAATATTTTAGGTAAGCCTAAGATAGTAGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	79978	GTATTAAAACAATGAAAAGAAATATTTTAGGTAAGCCTAAGATAGTAGGT	80027

FQ482097.2	101	CTTGGTTTTGTTTCGTTTGGAATTGAGAAATTTTCCAGTAAGTTACTTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80028	CTTGGTTTTGTTTCGTTTGGAATTGAGAAATTTTCCAGTAAGTTACTTTT	80077

FQ482097.2	151	ATGTGGCTAGTATCTGGAAAACATATGCATGAAGACATTTTGATAGATAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80078	ATGTGGCTAGTATCTGGAAAACATATGCATGAAGACATTTTGATAGATAA	80127

FQ482097.2	201	GTCCATTCATAGCCATAAATCAACTTTGTAAGTTCTAATGCTATTATTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80128	GTCCATTCATAGCCATAAATCAACTTTGTAAGTTCTAATGCTATTATTTC	80177

FQ482097.2	251	ACTTTCTATGTTCCTCTCACATTAGTGAACTTTCTTTAGAAATTACTGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80178	ACTTTCTATGTTCCTCTCACATTAGTGAACTTTCTTTAGAAATTACTGAA	80227

FQ482097.2	301	AATTTTCAGAAAAGTTTAAAAGTATCCATTATAAGACTAAGTACCACAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80228	AATTTTCAGAAAAGTTTAAAAGTATCCATTATAAGACTAAGTACCACAAA	80277

FQ482097.2	351	GCAAATAAAAATAATTTCAAAATGTAGATGACATCTATACAGAAGAGTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80278	GCAAATAAAAATAATTTCAAAATGTAGATGACATCTATACAGAAGAGTAC	80327

FQ482097.2	401	AATGATGAAAAAAATAGATAGGTAAAACTTTACTGTAACATCATACTGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80328	AATGATGAAAAAAATAGATAGGTAAAACTTTACTGTAACATCATACTGCT	80377

FQ482097.2	451	TTCCTAAAAGATTTTAATATTAATAGTTCTTTGCTCTGGGTAAGAAAAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80378	TTCCTAAAAGATTTTAATATTAATAGTTCTTTGCTCTGGGTAAGAAAAGT	80427

FQ482097.2	501	AAAGTATACAAAAAATAACCTCTCAACAGAGGCCCTTCAAATAGAACACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80428	AAAGTATACAAAAAATAACCTCTCAACAGAGGCCCTTCAAATAGAACACT	80477

FQ482097.2	551	AAGATTTCTGAGATTAATCAGACATTAACATGATCTTTCATGAAACACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80478	AAGATTTCTGAGATTAATCAGACATTAACATGATCTTTCATGAAACACAA	80527

FQ482097.2	601	AGAATCTCAACTGCTTTGAAATTCCCTTGACTTTTCTTTTTGGAGCACCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80528	AGAATCTCAACTGCTTTGAAATTCCCTTGACTTTTCTTTTTGGAGCACCC	80577

FQ482097.2	651	TCTGAAAATTACATGATTGACAGTTTTGTTTCAACACACACACGTAGAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80578	TCTGAAAATTACATGATTGACAGTTTTGTTTCAACACACACACGTAGAGA	80627

FQ482097.2	701	AATTTCTTGATTAGATATATTTTCATATATTATGCATTACTTATGTCTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80628	AATTTCTTGATTAGATATATTTTCATATATTATGCATTACTTATGTCTTT	80677

FQ482097.2	751	ATTTTTCTTTCTGTTTTAAAGCACCTGTATCAACCATCAGTAAGTTCCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80678	ATTTTTCTTTCTGTTTTAAAGCACCTGTATCAACCATCAGTAAGTTCCTT	80727

FQ482097.2	801	TCAAATCTTAAAATCCATAGGCTATTGGCTATTACAGTGTCAGTGGTCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80728	TCAAATCTTAAAATCCATAGGCTATTGGCTATTACAGTGTCAGTGGTCTA	80777

FQ482097.2	851	AAACCTCAATGCTAATATTTCTCTACCCTTTCTCTGTGTGATACAGATGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80778	AAACCTCAATGCTAATATTTCTCTACCCTTTCTCTGTGTGATACAGATGA	80827

FQ482097.2	901	ATAGCTGATGATGCTGTGAAAGATTAAGAATTAACTATATATGTATAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80828	ATAGCTGATGATGCTGTGAAAGATTAAGAATTAACTATATATGTATAATG	80877

FQ482097.2	951	TATATATTATGTGTGTGTATATATATATATATACACTCTTTATGAGAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80878	TATATATTATGTGTGTGTATATATATATATATACACTCTTTATGAGAAAT	80927

FQ482097.2	1001	ACTATTACCAGTGTTTGATACTGCATCCAATGTGATGTTCATAAGTATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80928	ACTATTACCAGTGTTTGATACTGCATCCAATGTGATGTTCATAAGTATAA	80977

FQ482097.2	1051	ACAAAGAAATAAGGAAAATTAACAAAAGTATAAGAAGAAGGGAGATTAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	80978	ACAAAGAAATAAGGAAAATTAACAAAAGTATAAGAAGAAGGGAGATTAAG	81027

FQ482097.2	1101	TGGTATGACTTCTTGACAGGTCCAAAAATGGTATAAATCGACTGCAGTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81028	TGGTATGACTTCTTGACAGGTCCAAAAATGGTATAAATCGACTGCAGTGG	81077

FQ482097.2	1151	GCAAGAAAACAATATCTAAATAGGCACCAAGAAGATAATTCACTTTGCCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81078	GCAAGAAAACAATATCTAAATAGGCACCAAGAAGATAATTCACTTTGCCT	81127

FQ482097.2	1201	TTCTACCAGAATAAAAGAGCCCTAACTCCAGACATCTGCATATCTGAGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81128	TTCTACCAGAATAAAAGAGCCCTAACTCCAGACATCTGCATATCTGAGGT	81177

FQ482097.2	1251	TATTGATATTTCTCCCGGCAATCTTCATTCCACCTTGTGCTTCTTCCAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81178	TATTGATATTTCTCCCGGCAATCTTCATTCCACCTTGTGCTTCTTCCAGT	81227

FQ482097.2	1301	CCAGCGTTTCTCATGACGTACTCTGCATGTAAGTTAAATAAGCAGGGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81228	CCAGCGTTTCTCATGACGTACTCTGCATGTAAGTTAAATAAGCAGGGTGA	81277

FQ482097.2	1351	CAATATACAGCCTTGATGTACTCCTTTTCCTATTTGGAATCAGTCTGTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81278	CAATATACAGCCTTGATGTACTCCTTTTCCTATTTGGAATCAGTCTGTTG	81327

FQ482097.2	1401	TTCCATGTCCAGTTCTAAATGTTGCTTCCTGACCTGCATACAGATTTCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81328	TTCCATGTCCAGTTCTAAATGTTGCTTCCTGACCTGCATACAGATTTCTC	81377

FQ482097.2	1451	AAGAGGCAGGTCAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTTCAGAATTTTCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81378	AAGAGGCAGGTCAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTTCAGAATTTTCCA	81427

FQ482097.2	1501	CAGTTTATTGTGATCCACACAATCAAAGGCTTTGGCATAGTCAAAAAAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81428	CAGTTTATTGTGATCCACACAATCAAAGGCTTTGGCATAGTCAAAAAAGC	81477

FQ482097.2	1551	AGAAATAGATGTTTTTTCTGGAACTCTCTTGCTTTTTCCATGATCCAGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81478	AGAAATAGATGTTTTTTCTGGAACTCTCTTGCTTTTTCCATGATCCAGTG	81527

FQ482097.2	1601	GATGTTGGCAATTTGATCTCTGGTTCCTCTGCCTTTTCTAAATCCAGCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81528	GATGTTGGCAATTTGATCTCTGGTTCCTCTGCCTTTTCTAAATCCAGCTT	81577

FQ482097.2	1651	GAACATCAGGAAGTTCATGGTTCACGTATTCCTGAAGCCTGGCTTGGAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81578	GAACATCAGGAAGTTCATGGTTCACGTATTCCTGAAGCCTGGCTTGGAGA	81627

FQ482097.2	1701	ATTTTGAGCATTACTGTACTAGCATGTGAGATGAGTGCAATTGTGCAGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81628	ATTTTGAGCATTACTGTACTAGCATGTGAGATGAGTGCAATTGTGCAGTG	81677

FQ482097.2	1751	GTTTGAGCATTCTTTGGCATTGCCTTTCTTTGGGATTGGAATGAAAACTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81678	GTTTGAGCATTCTTTGGCATTGCCTTTCTTTGGGATTGGAATGAAAACTG	81727

FQ482097.2	1801	ACCTTTTCCAGTCCTGTGGCCACTGCTGAGTTTTCCAAATTTGCTGGCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81728	ACCTTTTCCAGTCCTGTGGCCACTGCTGAGTTTTCCAAATTTGCTGGCAT	81777

FQ482097.2	1851	ATTGAGTGCAACACTTTCACGGCATCATCATTCAGGATTTGAAATAGCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81778	ATTGAGTGCAACACTTTCACGGCATCATCATTCAGGATTTGAAATAGCTC	81827

FQ482097.2	1901	AACTGGAATTCCATCACCTCCACTAGCTTCATTTGTAGTGATGCTTTCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81828	AACTGGAATTCCATCACCTCCACTAGCTTCATTTGTAGTGATGCTTTCTA	81877

FQ482097.2	1951	AGGCCCACTTGACTTCACATTCCAGAATGTCTGGCTCTAGGTCAGTGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482131.2	81878	AGGCCCACTTGACTTCACATTCCAGAATGTCTGGCTCTAGGTCAGTGATC	81927

Overview

Query
FQ482097.2 - 140450 bps
Hit
FQ482131.2 - 81927 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link