<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FQ482126.2	2000	GATCATTGGGGAAGGGGGAGAATTAGTGTGTTTACTATGTTGAATCTACC	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1	GATCATTGGGGAAGGGGGAGAATTAGTGTGTTTACTATGTTGAATCTACC	50

C  FQ482126.2	1950	AATACAAGAACATAGTATGTCTCTCCAAATACTTACAACTTTTGATTATT	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	51	AATACAAGAACATAGTATGTCTCTCCAAATACTTACAACTTTTGATTATT	100

C  FQ482126.2	1900	TAAGCAAGTGTTTAAAACACTTTAAGCATACAAGTTCTATACATGTTTGT	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	101	TAAGCAAGTGTTTAAAACACTTTAAGCATACAAGTTCTATACATGTTTGT	150

C  FQ482126.2	1850	TAGGTTTTTATGTATTTATCCCATTTTTGAATGATTGGTCATAATATTTT	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	151	TAGGTTTTTATGTATTTATCCCATTTTTGAATGATTGGTCATAATATTTT	200

C  FQ482126.2	1800	ACTGTTAAATTTGACTCCATGTATTCACTGCAAGTATATAGAAATAGAAT	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	201	ACTGTTAAATTTGACTCCATGTATTCACTGCAAGTATATAGAAATAGAAT	250

C  FQ482126.2	1750	TGATGTGTGTAGGTTTATTTTGCATCCCGAGACCCTGCTAAACTCAGTTG	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	251	TGATGTGTGTAGGTTTATTTTGCATCCCGAGACCCTGCTAAACTCAGTTG	300

C  FQ482126.2	1700	TTATTTTAGAAATATTTTTAAGTCTTTAAACATTTTATAGAACTATCCAT	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	301	TTATTTTAGAAATATTTTTAAGTCTTTAAACATTTTATAGAACTATCCAT	350

C  FQ482126.2	1650	TTTATGAAACCACCTGGCTCTGGAGATTTCTTTTTCTTGAGTTTAAATAT	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	351	TTTATGAAACCACCTGGCTCTGGAGATTTCTTTTTCTTGAGTTTAAATAT	400

C  FQ482126.2	1600	AAAGAATTAAAATTTTAAAATAGTTGTAGAGGTGTTCAGATTATCCAGTC	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	401	AAAGAATTAAAATTTTAAAATAGTTGTAGAGGTGTTCAGATTATCCAGTC	450

C  FQ482126.2	1550	CATCTTGTGAGAATTTTTATATTTATACTTCTTGAGGAGTTGGCTCATTT	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	451	CATCTTGTGAGAATTTTTATATTTATACTTCTTGAGGAGTTGGCTCATTT	500

C  FQ482126.2	1500	TGCAGAAGTTATCAAATTTGTGTGTATAAAGTTGTTTATAGTATCACTTT	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	501	TGCAGAAGTTATCAAATTTGTGTGTATAAAGTTGTTTATAGTATCACTTT	550

C  FQ482126.2	1450	ATTATTTTTTGGTATCTGTAGGGTCTGTGGGTATCTCTTGTTTTCTTCCT	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	551	ATTATTTTTTGGTATCTGTAGGGTCTGTGGGTATCTCTTGTTTTCTTCCT	600

C  FQ482126.2	1400	GATACTTGCAAATACTATTTTCTTTATCAGCCTTGCTAAAAGCTTGTCAT	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	601	GATACTTGCAAATACTATTTTCTTTATCAGCCTTGCTAAAAGCTTGTCAT	650

C  FQ482126.2	1350	TTTTACTGATCTTTTCAAAAGGTCAATTTTCATTTTATTGATATTTTATA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	651	TTTTACTGATCTTTTCAAAAGGTCAATTTTCATTTTATTGATATTTTATA	700

C  FQ482126.2	1300	TTGTTCTGTTTTCAATATCACTAATTTCTGCACATGTCTGAATCTCAATC	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	701	TTGTTCTGTTTTCAATATCACTAATTTCTGCACATGTCTGAATCTCAATC	750

C  FQ482126.2	1250	CTTCCTTCTGCCTGCCTTGAATTTTTTGCTTTTCTTATTTTAGTTCCTTT	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	751	CTTCCTTCTGCCTGCCTTGAATTTTTTGCTTTTCTTATTTTAGTTCCTTT	800

C  FQ482126.2	1200	AGGTGGGAACTTACTTTATTAATACAAGATTTCTCAGCTTCTCTACAGTC	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	801	AGGTGGGAACTTACTTTATTAATACAAGATTTCTCAGCTTCTCTACAGTC	850

C  FQ482126.2	1150	AACATTTAGTGCTGTAAATTTCTTGCTAAGCACTGTTTTAGCTGTATCTC	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	851	AACATTTAGTGCTGTAAATTTCTTGCTAAGCACTGTTTTAGCTGTATCTC	900

C  FQ482126.2	1100	ACAAATTTTGGTGTGTTGTTTTTACATTTTTATTGGGAATATAAAACCTC	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	901	ACAAATTTTGGTGTGTTGTTTTTACATTTTTATTGGGAATATAAAACCTC	950

C  FQ482126.2	1050	CACTTAGATCTTTGGATTAGTTATAAACATCAGTCTGTAAATATTGTTCT	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	951	CACTTAGATCTTTGGATTAGTTATAAACATCAGTCTGTAAATATTGTTCT	1000

C  FQ482126.2	1000	CTAAATACTGATTAGATCCTATTTGTTTATAGTGTTCAGTTCTTTTCCAT	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1001	CTAAATACTGATTAGATCCTATTTGTTTATAGTGTTCAGTTCTTTTCCAT	1050

C  FQ482126.2	950	CCTTCTTGAGTTTCTGTTTAGTTGTTTTGAGAGGAATAGTGAAATCTCCA	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1051	CCTTCTTGAGTTTCTGTTTAGTTGTTTTGAGAGGAATAGTGAAATCTCCA	1100

C  FQ482126.2	900	GCTATAATTGTGAATATGTTTTTTTCTCATTTTAGTTTGATCAGTTTTTT	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1101	GCTATAATTGTGAATATGTTTTTTTCTCATTTTAGTTTGATCAGTTTTTT	1150

C  FQ482126.2	850	CTTCAGCTATTTTTCAGCTCCGTTGTTGGGTGCAACACATTCAGGATTGC	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1151	CTTCAGCTATTTTTCAGCTCCGTTGTTGGGTGCAACACATTCAGGATTGC	1200

C  FQ482126.2	800	ATTGTTTACGTGGTGGAGAATATTTTTATCTTTATGTAATGTTCCTCCTC	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1201	ATTGTTTACGTGGTGGAGAATATTTTTATCTTTATGTAATGTTCCTCCTC	1250

C  FQ482126.2	750	TGTTCCTGGTAATTTTATTTGTTCTAAAATCTACTTTATCTTATATTAAT	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1251	TGTTCCTGGTAATTTTATTTGTTCTAAAATCTACTTTATCTTATATTAAT	1300

C  FQ482126.2	700	ACAGACTCTTCTGCTCTGTTTTGATAATATTTGCACATTGTACCCTTTTT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1301	ACAGACTCTTCTGCTCTGTTTTGATAATATTTGCACATTGTACCCTTTTT	1350

C  FQ482126.2	650	TTTTTTTTTTTTTTGCATTGCTGCTGCTAAGTCACTTCAGTCGTGTCCGA	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1351	TTTTTTTTTTTTTTGCATTGCTGCTGCTAAGTCACTTCAGTCGTGTCCGA	1400

C  FQ482126.2	600	CTCTGTGTGACCCCATAGACGGCAGCCCACCAGGCTCCCCGGTCCCTGGG	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1401	CTCTGTGTGACCCCATAGACGGCAGCCCACCAGGCTCCCCGGTCCCTGGG	1450

C  FQ482126.2	550	ATTCTCCAAGCCAAGAAACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCATTTCCAATGC	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1451	ATTCTCCAAGCCAAGAAACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCATTTCCAATGC	1500

C  FQ482126.2	500	ATGAAAGTGAAAAGTGAAAGTGAAGTTTCTCAGTCGTGTCCAACCCTTAG	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1501	ATGAAAGTGAAAAGTGAAAGTGAAGTTTCTCAGTCGTGTCCAACCCTTAG	1550

C  FQ482126.2	450	CGACCCCATGGACTGCAGCCCACCAGGCTCCTCCATCCATGGGATTTTCC	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1551	CGACCCCATGGACTGCAGCCCACCAGGCTCCTCCATCCATGGGATTTTCC	1600

C  FQ482126.2	400	AGGCAAGAACACTGGAGCGGGGTGCCATTGCCCTCTCATTCAACATACTT	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1601	AGGCAAGAACACTGGAGCGGGGTGCCATTGCCCTCTCATTCAACATACTT	1650

C  FQ482126.2	350	ATATTGCTGTAATTGAAGTGAACTTCTCATAGACATTAATTAGTGGGTCA	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1651	ATATTGCTGTAATTGAAGTGAACTTCTCATAGACATTAATTAGTGGGTCA	1700

C  FQ482126.2	300	TTATCTTATCCACCTAGCAGTTTGATTACAGATTTTCCTCTATTTATGAT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1701	TTATCTTATCCACCTAGCAGTTTGATTACAGATTTTCCTCTATTTATGAT	1750

C  FQ482126.2	250	AGTGTTATTTACTGATTAGTTGAAAATATCAAAACACCAAAAACAAAAAC	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1751	AGTGTTATTTACTGATTAGTTGAAAATATCAAAACACCAAAAACAAAAAC	1800

C  FQ482126.2	200	AATTTTAAAAAAGTTGAAAATGTCAAAAATGTGTTTAATACACCTAACCG	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1801	AATTTTAAAAAAGTTGAAAATGTCAAAAATGTGTTTAATACACCTAACCG	1850

C  FQ482126.2	150	ACTAAACATCATCGCTTACCCTAAACTAATTTAAATGTTAAATGTTAAGC	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1851	ACTAAACATCATCGCTTACCCTAAACTAATTTAAATGTTAAATGTTAAGC	1900

C  FQ482126.2	100	TGAAGCTGAAACTCTAATACTTTGGCCACCTGATGAGAACTGACTCATTG	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1901	TGAAGCTGAAACTCTAATACTTTGGCCACCTGATGAGAACTGACTCATTG	1950

C  FQ482126.2	50	GAAAAGACCCTGATGCTGGGAAAGATTGAAGGCAGGAGAAGGGGACGACA	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482110.1	1951	GAAAAGACCCTGATGCTGGGAAAGATTGAAGGCAGGAGAAGGGGACGACA	2000

Overview

Query
FQ482126.2 - 115850 bps
Hit
FQ482110.1 - 148732 bps
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