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Alignment #1 HSP: 10412 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

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C  FP015875.13	118915	AATTTGGCAAATAATTCGACTACAGATGTCCATGTAGGTTAAACACCTCA	118866
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C  FP015875.13	118865	CTTTCTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATT	118816
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C  FP015875.13	118815	TTGACTCTGAAACTCGCGCGTGCCCAAATAGACACTCCCACACCCTCCCA	118766
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C  FP015875.13	117565	TTCCCACACACAACCAGATCATATGCTAAGCAAGATATTTCTACAAGTAC	117516
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  FP016177.1	28957	CTAGATTGTGGGATAATTTGGGTGCTCAAGTGACCGAGATGTAAGCGAGA	29006

C  FP015875.13	115115	GATTTACGGTCAGTTTTCAAAATAAAAGACTTTTCAAAATAAATGATCGT	115066
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29007	GATTTACGGTCAGTTTTCAAAATAAAAGACTTTTCAAAATAAATGATCGT	29056

C  FP015875.13	115065	TCCGACTCAGACAATAAATAAAGCGGAAATAATTAATGACTTCTTGTGCA	115016
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29057	TCCGACTCAGACAATAAATAAAGCGGAAATAATTAATGACTTCTTGTGCA	29106

C  FP015875.13	115015	GCCTGGTACCAATTGATCCACGGACCGGTGATTGAAGACCACTGAGCTAG	114966
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29107	GCCTGGTACCAATTGATCCACGGACCGGTGATTGAAGACCACTGAGCTAG	29156

C  FP015875.13	114965	GAAATGAACTAAGGCAACATGATCATTTTCCTAATTGTCCAATGCTAAGA	114916
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29157	GAAATGAACTAAGGCAACATGATCATTTTCCTAATTGTCCAATGCTAAGA	29206

C  FP015875.13	114915	ATTTTTAAAAATATGACGCGACCATAGAGCTCACTGAGGCCCCCTTGTGG	114866
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29207	ATTTTTAAAAATATGACGCGACCATAGAGCTCACTGAGGCCCCCTTGTGG	29256

C  FP015875.13	114865	GCCGGGACCCCCCTGTTGGGAACCGCTAATCTAGATAATAAAAAAAACCA	114816
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29257	GCCGGGACCCCCCTGTTGGGAACCGCTAATCTAGATAATAAAAAAAACCA	29306

C  FP015875.13	114815	CACACACCAAACGAAAATCAAGGACTTTTAAGCACTTTTTCCAGCACCTA	114766
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	114765	TTTTTATTTTCAAGACTGACAAGCAACGTACTGAACACCTGAAATGTATT	114716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29357	TTTTTATTTTCAAGACTGACAAGCAACGTACTGAACACCTGAAATGTATT	29406

C  FP015875.13	114715	CTCATCACCCATAAATGGTTTAATGCTCAATTCACAGATACAAGTGAACT	114666
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	114665	GCAAACAAAGGAAGTATGGTCGATTTTTCCTTTCCTTTCAAAACTACCAC	114616
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	114615	ACACTCTATAAGGCCACAGAGACACTTTTTGTCCATTGTTAAACAATATT	114566
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	114565	TTCAAGCTTTGAAAGGTTTAATCAAAGTATTTGATGAAAACATATTCATA	114516
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29557	TTCAAGCTTTGAAAGGTTTAATCAAAGTATTTGATGAAAACATATTCATA	29606

C  FP015875.13	114515	AGATAAAAATATTTAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATT	114466
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29607	AGATAAAAATATTTAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATT	29656

C  FP015875.13	114465	ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAT	114416
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	114415	TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTGTTG	114366
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29707	TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTGTTG	29756

C  FP015875.13	114365	TTATTATCAGGGTTCATACAGGCACAGCCTAACAAAAATCAAGGACTTTT	114316
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	114315	AAGCACTTTTTCCAGCACCTATTCTATTTTGAGGACTGACACGCAACGTA	114266
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29807	AAGCACTTTTTCCAGCACCTATTCTATTTTGAGGACTGACACGCAACGTA	29856

C  FP015875.13	114265	CTGAATAGGAATTTATACAAATAAAAACCATTAATAATAATAGTATAATA	114216
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29857	CTGAATAGGAATTTATACAAATAAAAACCATTAATAATAATAGTATAATA	29906

C  FP015875.13	114215	ATTAATTAAGTTATAAGTTAAAGTATATGATGAAAAGATTTTAATAAGAT	114166
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29907	ATTAATTAAGTTATAAGTTAAAGTATATGATGAAAAGATTTTAATAAGAT	29956

C  FP015875.13	114165	AAAAAGATTTAGCTTTTTATTTATTTATTGTCTTTACAATATGGCTACTC	114116
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	29957	AAAAAGATTTAGCTTTTTATTTATTTATTGTCTTTACAATATGGCTACTC	30006

C  FP015875.13	114115	AGTTGCTTAAATAGCTGTACATCACATGTACATTTTATTTTACACTTGAT	114066
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30007	AGTTGCTTAAATAGCTGTACATCACATGTACATTTTATTTTACACTTGAT	30056

C  FP015875.13	114065	CCTAAACCAAAATAATTTTACTAAAAAGACAAGTACACTGTCAGTAATAA	114016
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30057	CCTAAACCAAAATAATTTTACTAAAAAGACAAGTACACTGTCAGTAATAA	30106

C  FP015875.13	114015	TAATAAAACAAATGACTGCGTTTCACTTGAGGTTATTGAAATATGACAAC	113966
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30107	TAATAAAACAAATGACTGCGTTTCACTTGAGGTTATTGAAATATGACAAC	30156

C  FP015875.13	113965	ACTGTATTTCTCAAAGCAGTGTTTTAAGAGCCTTATTGTTTATTCTGATA	113916
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30157	ACTGTATTTCTCAAAGCAGTGTTTTAAGAGCCTTATTGTTTATTCTGATA	30206

C  FP015875.13	113915	AAAGTACAATTTATTGCTTTGACCTGTAATGCCTCTACAATTTAGTGATG	113866
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30207	AAAGTACAATTTATTGCTTTGACCTGTAATGCCTCTACAATTTAGTGATG	30256

C  FP015875.13	113865	CTTTAAGACAGATTAGAATACAGCTATTATGTATAAATCATATAAATACC	113816
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30257	CTTTAAGACAGATTAGAATACAGCTATTATGTATAAATCATATAAATACC	30306

C  FP015875.13	113815	TCAAACAAAAACATTTCTAGCATAATTACTTTGTCATAAAGAAATGAATT	113766
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113765	TCCACCTTTGCTAAATGTATAAGTTTCACTTCACGATGCAGCTAAATAAG	113716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113715	AAGTCCGTTAGCATTTTCATCTGTCATGCATTCGAAATACTGGATAGTTT	113666
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113665	TTGACTAAATTTAGTCAAGGAGCAAAGATAAATAACTTCTACTTTAAAGG	113616
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	30457	TTGACTAAATTTAGTCAAGGAGCAAAGATAAATAACTTCTACTTTAAAGG	30506

C  FP015875.13	113615	GTCACGAAACACCAAAACACATTTTTTGAGCTGTTGACAGTCATATATGT	113566
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113565	GTCCCACACTGCTAAAAACACTATTAGGACACTTATATTTCACTAAAAAG	113516
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113515	TGTAAATTGGTTGTTTTTGCGTTATTTCAAGCAAATTCGTACTTCCGGTT	113466
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113465	TGAAACGAATTTTTGAAGCTGCGTCACGGCCATGACATAATAGCGTGTAT	113416
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113415	TCCAGCGTGCAGACTGGACGTCTGTACCAGAGTGAGTCTTATTACGTCTT	113366
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  FP016177.1	30707	TCCAGCGTGCAGACTGGACGTCTGTACCAGAGTGAGTCTTATTACGTCTT	30756

C  FP015875.13	113365	ACAGTGTGATGCATTAATGCATGAGTAAGGCTTGGTTCAAACCAATCAGC	113316
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113315	GCGCTCTATTGTGCAACTTCATTAATATTCATTACTGTCACAGTGTTTAG	113266
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113265	ACGACAGAGACGCCACGTTGTGTTGGCAAAACAAGCGTGAAGTGTTGCTT	113216
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C  FP015875.13	113215	TTATAGTTTGCTGCAGTTAAGTTTCATTTTAATTTTCTCTCTGTGAAAGC	113166
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113165	TCAGACTCACGTGTGGATTACAGTGTACGCGACGCTCGACAACAATAACT	113116
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113115	TACGTGTCTAAGGAGGATTATTGTTTACCTGAGAGCTGTTCTCATCTGCA	113066
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113065	AACGCTGAGATCTGGAATCGCTTGTAGTCTCCTCTAAATAAAGACGCGGC	113016
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	113015	TCTAGTTGCTTGTGATTGCCCTGTCTGTACAGATTTGGTAAGTGAGCGAC	112966
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	112915	TTGCAACGAGTGTAAACAAGTTAGCACTAACAGTTATAACTTAACTATAA	112866
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	112765	TCATTCGCCGTGCGGTATCAAACATTGCATGAAAAATACACGCTTAGAGC	112716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	31357	TCATTCGCCGTGCGGTATCAAACATTGCATGAAAAATACACGCTTAGAGC	31406

C  FP015875.13	112715	AGTTCCTCGAATCAAATATCACGTTTATCGGGAGGGACATGAATGAATTC	112666
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	112665	TCTGAATGAAAGAGCCAAACTGCAGTTTAAGTCCACCATTTAATAATTTG	112616
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	112615	GCAAATAATTCGACTACAGATGTCCATGTAAACACAGTCACATTGTCCGC	112566
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	112065	ATCTCTATAGTGAAGAAAGTGTCTATAGTGTTTTTCAGTTGTTTTTTTCT	112016
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	112015	GTTACTGCAACACATAAAGGTCTTTGTTCCGCCCTTATGTTTCGCATAAA	111966
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	111965	ACTAGACGAGGTCGACTGTGATTGGTCACTTTACATATCAGTCAAATCAC	111916
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  FP015875.13	111915	CGCTTGGGAGTCATGGTAGTTTGTGCAGGTATTTTTGCATTAAATTGCCA	111866
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32207	CGCTTGGGAGTCATGGTAGTTTGTGCAGGTATTTTTGCATTAAATTGCCA	32256

C  FP015875.13	111865	CAAAAGTTATAAAAAACATTATTATTTTTCTGGCGTGAAAACTGTATAGA	111816
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32257	CAAAAGTTATAAAAAACATTATTATTTTTCTGGCGTGAAAACTGTATAGA	32306

C  FP015875.13	111815	AGTTCTCCTTTTAATTTCAAGCACTTTTAAGCACTTTCAACCAAACAAAA	111766
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32307	AGTTCTCCTTTTAATTTCAAGCACTTTTAAGCACTTTCAACCAAACAAAA	32356

C  FP015875.13	111765	CTGTTTTCCAGGTATTCCAGGCCTTGAATTTCTAAAAGCCAAATTCAGGC	111716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32357	CTGTTTTCCAGGTATTCCAGGCCTTGAATTTCTAAAAGCCAAATTCAGGC	32406

C  FP015875.13	111715	ACTTTAAGCACCTTGTGCGAACCCTGTATTATTATTATTATTATTATTAT	111666
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32407	ACTTTAAGCACCTTGTGCGAACCCTGTATTATTATTATTATTATTATTAT	32456

C  FP015875.13	111665	TATTATTATTATTATTATTATTTAATTATAAACACACCATGAACTAAAGT	111616
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32457	TATTATTATTATTATTATTATTTAATTATAAACACACCATGAACTAAAGT	32506

C  FP015875.13	111615	ATAAGCACAGTTTGTAGACGCTTGATCCAGATAATTAAAAAACACTTGAA	111566
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32507	ATAAGCACAGTTTGTAGACGCTTGATCCAGATAATTAAAAAACACTTGAA	32556

C  FP015875.13	111565	TAAACTCATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAACTAAAGTAAAAAC	111516
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32557	TAAACTCATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAACTAAAGTAAAAAC	32606

C  FP015875.13	111515	AATTTATAGACGCTAGATCCATATAATAAAAAACACATCTAGCATGGACT	111466
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32607	AATTTATAGACGCTAGATCCATATAATAAAAAACACATCTAGCATGGACT	32656

C  FP015875.13	111465	CATTTGCATAGATGTTTGATCCTTTTTCACATGTATGCAAATTAAGTTGC	111416
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32657	CATTTGCATAGATGTTTGATCCTTTTTCACATGTATGCAAATTAAGTTGC	32706

C  FP015875.13	111415	AATATTGTCATTATCTATTATTATTATCACTATAAAATCATAAACAGAGC	111366
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP016177.1	32707	AATATTGTCATTATCTATTATTATTATCACTATAAAATCATAAACAGAGC	32756

C  FP015875.13	111365	ATAAAAAATAAGACAACACTTTCTAGTATAAACGTATAGCATAAATGTAA	111316
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