<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5995 bps / non-identical: 150 bps

Full alignment

FP236739.3	1	GATCTGGCATTGCTGTGGCTGTGGTGTAGCCTGCAGCTACATCTCTGATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	172822	GATCTGGCATTGCTGTGGCTGTGGTGTAGCCTGCAGCTACATCTCTGATT	172871

FP236739.3	51	CTACCCCTAGCCTGGGAAACTCCATATGCCTTGGTTGCAGCCCTAAAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	172872	CTACCCCTAGCCTGGGAAACTCCATATGCCTTGGTTGCAGCCCTAAAAAG	172921

FP236739.3	101	ACAGACAGGAAGGGAGGGGAGGAGGGAAAAGGAAAGGAGAGGAAAGAGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	172922	ACAGACAGGAAGGGAGGGGAGGAGGGAAAAGGAAAGGAGAGGAAAGAGAA	172971

FP236739.3	151	AAGAAAAGAAAACCTACTAAATCTTGGTCCAAACAGCAGGCATTTGAGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	172972	AAGAAAAGAAAACCTACTAAATCTTGGTCCAAACAGCAGGCATTTGAGCC	173021

FP236739.3	201	GCATCCACTCTCTTGCCCTCTGTCTCAAGAAAGCTCCTGGGGCTCTGAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173022	GCATCCACTCTCTTGCCCTCTGTCTCAAGAAAGCTCCTGGGGCTCTGAGA	173071

FP236739.3	251	GGCAGGCACCCTCCCAGGCTCCTGCTTGAAGCTGTCTTCATCTGAGCTCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173072	GGCAGGCACCCTCCCAGGCTCCTGCTTGAAGCTGTCTTCATCTGAGCTCA	173121

FP236739.3	301	GCACAACCCTCCAGCCTGTGTTTATTGCAAGGTCCTATTCTAGACTAACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173122	GCACAACCCTCCAGCCTGTGTTTATTGCAAGGTCCTATTCTAGACTAACA	173171

FP236739.3	351	GTCTAACTAGAGAGGACAGGACCTCCCTTCCTCACTGCTCCCACGCTTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173172	GTCTAACTAGAGAGGACAGGACCTCCCTTCCTCACTGCTCCCACGCTTCC	173221

FP236739.3	401	AGGGGATAAGCTCTACCCCAGGTGTGGCCCTAGCAGAACAGAGGGCCCAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173222	AGGGGATAAGCTCTACCCCAGGTGTGGCCCTAGCAGAACAGAGGGCCCAG	173271

FP236739.3	451	TGTTCCCCTAGCTGCCCATCCTCCAGGGAGGGCCAGCTGCTATTTGGGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173272	TGTTCCCCTAGCTGCCCATCCTCCAGGGAGGGCCAGCTGCTATTTGGGGG	173321

FP236739.3	501	GCTCAAGGCTCACACTGGGACAAGTGGGTCAGCACCCACCCTAGCTTCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173322	GCTCAAGGCTCACACTGGGACAAGTGGGTCAGCACCCACCCTAGCTTCAG	173371

FP236739.3	551	CTTGTGCAGGGGCACAGAGATCCTGTCCAGGGGTCTGCAGCTCTGGCTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173372	CTTGTGCAGGGGCACAGAGATCCTGTCCAGGGGTCTGCAGCTCTGGCTGA	173421

FP236739.3	601	GGGGGCTGACTCTATTCAGAACAGAAGAGAATCCCACACTTACGGGCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173422	GGGGGCTGACTCTATTCAGAACAGAAGAGAATCCCACACTTACGGGCTTT	173471

FP236739.3	651	GTCAGAAACAATGAAGATCTTGGTGGAGAACAATTAAGAGGGCACTCAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173472	GTCAGAAACAATGAAGATCTTGGTGGAGAACAATTAAGAGGGCACTCAGC	173521

FP236739.3	701	TCCAGGATGTTAAGAGCACAACAGAATGTCAGTCAAGGAAACAGCTAAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173522	TCCAGGATGTTAAGAGCACAACAGAATGTCAGTCAAGGAAACAGCTAAGA	173571

FP236739.3	751	AGGATCCTCCTGGAATCGCTGTCCAGGCTATGGTCAGTGGACTAGGCCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173572	AGGATCCTCCTGGAATCGCTGTCCAGGCTATGGTCAGTGGACTAGGCCAG	173621

FP236739.3	801	CCTCACTCACGAGCAACCTGACCAGCATGCAGACCAGACTTGAGCATCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173622	CCTCACTCACGAGCAACCTGACCAGCATGCAGACCAGACTTGAGCATCTT	173671

FP236739.3	851	CCCCAAGCTGCATGCAGATCCATCAGCAGATGGTGCAGGCCTCCCTGGGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173672	CCCCAAGCTGCATGCAGATCCATCAGCAGATGGTGCAGGCCTCCCTGGGA	173721

FP236739.3	901	CAGGGGCTTTGATACAGCCTGTGACCCAACCACTGGCTGAACAATAACCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173722	CAGGGGCTTTGATACAGCCTGTGACCCAACCACTGGCTGAACAATAACCT	173771

FP236739.3	951	TTCAACTCCTAGGAAGCCAGGCTGAAAAATGAAGTTACACGCATGCCTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173772	TTCAACTCCTAGGAAGCCAGGCTGAAAAATGAAGTTACACGCATGCCTGG	173821

FP236739.3	1001	CAGTCTGGACAACTGTACCTGCCTATAGTCTGCCTCGTAGCTGCAGAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173822	CAGTCTGGACAACTGTACCTGCCTATAGTCTGCCTCGTAGCTGCAGAACA	173871

FP236739.3	1051	GCACCCTTGCATCAGCTGAGTTCACGGCCACCCCTCAGACTGTGGAGGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173872	GCACCCTTGCATCAGCTGAGTTCACGGCCACCCCTCAGACTGTGGAGGTG	173921

FP236739.3	1101	GGCAGGTAGACACCCTTCCTCCCAATGCACTGAGGAGTGTCACTCGGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173922	GGCAGGTAGACACCCTTCCTCCCAATGCACTGAGGAGTGTCACTCGGCCA	173971

FP236739.3	1151	GGCTGGCCAGCTCCCCTCAGCAGCTGAGGGGATGCTGCCTTTGACCCAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	173972	GGCTGGCCAGCTCCCCTCAGCAGCTGAGGGGATGCTGCCTTTGACCCAGT	174021

FP236739.3	1201	TTCTAGAGTCTCGGGTTTCCTTCCCAGCAGTGAAGTCTTGGCCATTTTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174022	TTCTAGAGTCTCGGGTTTCCTTCCCAGCAGTGAAGTCTTGGCCATTTTAT	174071

FP236739.3	1251	AAACCCCATTCCCACCCCCAACAATGGATCATCAAATGCTCTCTCTACCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174072	AAACCCCATTCCCACCCCCAACAATGGATCATCAAATGCTCTCTCTACCT	174121

FP236739.3	1301	ACCTGAACTTTGGAGTTCCTCTTCGTGCTTTCTTTGTCCAAAAATCCCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174122	ACCTGAACTTTGGAGTTCCTCTTCGTGCTTTCTTTGTCCAAAAATCCCTC	174171

FP236739.3	1351	TGCTTCCCCTCACCCCTACTCCCCTAAAAAAATTTAAAATGAAACACACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174172	TGCTTCCCCTCACCCCTACTCCCCTAAAAAAATTTAAAATGAAACACACA	174221

FP236739.3	1401	CTCTCACTCAGGGCCCTGAAAGAGGGGAGACCAGGAATTTGTATCCAAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174222	CTCTCACTCAGGGCCCTGAAAGAGGGGAGACCAGGAATTTGTATCCAAGC	174271

FP236739.3	1451	TCTCATATCTTCTCTACCTTCCATCCCTTCTTTTATTTTTGCTTTATTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174272	TCTCATATCTTCTCTACCTTCCATCCCTTCTTTTATTTTTGCTTTATTAT	174321

FP236739.3	1501	AGGTTATTATGTTCCATGTGTGAAGTCAGCTGACATCTGTTTTGGAGTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174322	AGGTTATTATGTTCCATGTGTGAAGTCAGCTGACATCTGTTTTGGAGTAA	174371

FP236739.3	1551	GATGGTATATAAACCTTCTACTTGATCAGCATATGTTAACCAAATTTTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174372	GATGGTATATAAACCTTCTACTTGATCAGCATATGTTAACCAAATTTTCA	174421

FP236739.3	1601	GAAACAGAGACCTGATTGAAATTTAATGTATTCCTTTGAGGTTTGTAAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174422	GAAACAGAGACCTGATTGAAATTTAATGTATTCCTTTGAGGTTTGTAAGG	174471

FP236739.3	1651	ACTGCCCAGGAGAGACAGATTCAAGAAGCGCTTGAATTATGTTCTGCCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174472	ACTGCCCAGGAGAGACAGATTCAAGAAGCGCTTGAATTATGTTCTGCCAG	174521

FP236739.3	1701	CCTACAAAATAGGGGGTTGCTTATAAACACAGAACACCTGTGAAGTTACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174522	CCTACAAAATAGGGGGTTGCTTATAAACACAGAACACCTGTGAAGTTACA	174571

FP236739.3	1751	TAAATTGTTCTTCAGAAATTGACTGGCAAGAAGGAAGTGTGCTTGTTAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174572	TAAATTGTTCTTCAGAAATTGACTGGCAAGAAGGAAGTGTGCTTGTTAAG	174621

FP236739.3	1801	CAAGGACCCATGGGATCCAAAATGGTTGCATAGTTACAAGGTGGGAGACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174622	CAAGGACCCATGGGATCCAAAATGGTTGCATAGTTACAAGGTGGGAGACC	174671

FP236739.3	1851	GTAAGGTTGCAGCTGGGAGGTGCTGTTTGTTCTAAATATGATTAGTGGTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174672	GTAAGGTTGCAGCTGGGAGGTGCTGTTTGTTCTAAATATGATTAGTGGTA	174721

FP236739.3	1901	TCCTTGGATCTGGTTCAGTTCAAAGAAAGTTCAGGTTCTCATGGAGGAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174722	TCCTTGGATCTGGTTCAGTTCAAAGAAAGTTCAGGTTCTCATGGAGGAGA	174771

FP236739.3	1951	GACCTGTGTGAGACCAGATCCTTAAGGTGGCTGCCTGACTTCATTTTTAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174772	GACCTGTGTGAGACCAGATCCTTAAGGTGGCTGCCTGACTTCATTTTTAT	174821

FP236739.3	2001	ACACTTGAACTGTGATCACTCCATTGTAATTTCAATTTGTTGTCACAGCA	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174822	ACACTTGAACTGTGATCACTCCATTGTAATTTCAATTTGTTGTCACAGCA	174871

FP236739.3	2051	AAGCTACCTTCCTCATTTTCCTGCCTTCTGACCTTGAGGCAGCAAACACA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174872	AAGCTACCTTCCTCATTTTCCTGCCTTCTGACCTTGAGGCAGCAAACACA	174921

FP236739.3	2101	CAGGGAAGTTTTGGTTGTATGGGTATATTGAAAACATCCTTATCAAAGGG	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174922	CAGGGAAGTTTTGGTTGTATGGGTATATTGAAAACATCCTTATCAAAGGG	174971

FP236739.3	2151	ATTTTTGTGTGAGGTTCTGTTTTTATCTCCATGATATTACAACTCAAGAT	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	174972	ATTTTTGTGTGAGGTTCTGTTTTTATCTCCATGATATTACAACTCAAGAT	175021

FP236739.3	2201	AATTAGTTTTATGTTGCACCACACAAGAGACCAGGTGACAAATTGGTGAT	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175022	AATTAGTTTTATGTTGCACCACACAAGAGACCAGGTGACAAATTGGTGAT	175071

FP236739.3	2251	GGATGTATGCTTTTGTTTTGTCTTTATAGGGCCACAGGTGTGGCATATGG	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175072	GGATGTATGCTTTTGTTTTGTCTTTATAGGGCCACAGGTGTGGCATATGG	175121

FP236739.3	2301	AGGTTCCCAGGCTAGGGGTAGAATCGGAGCTGTGGCTGCTGGCCACAGCC	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175122	AGGTTCCCAGGCTAGGGGTAGAATCGGAGCTGTGGCTGCTGGCCACAGCC	175171

FP236739.3	2351	ACAGCTACAGCCACAGCCACGTGGCATCCAAGCCACATCTGCGACCTACA	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175172	ACAGCTACAGCCACAGCCACGTGGCATCCAAGCCACATCTGCGACCTACA	175221

FP236739.3	2401	CCATGGCAACACCAGATCCTTAACCCACTGAGAGAGGCCAGGGATCGAAC	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175222	CCATGGCAACACCAGATCCTTAACCCACTGAGAGAGGCCAGGGATCGAAC	175271

FP236739.3	2451	CTATGTTTTCATAGATGCTAGTCAGATTTGTTTCTCACTGCACCATGACA	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175272	CTATGTTTTCATAGATGCTAGTCAGATTTGTTTCTCACTGCACCATGACA	175321

FP236739.3	2501	GGAACTCCTGCTTTAATTTTTAGAACTGGTGAGATTGACTTTTGAAATAG	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175322	GGAACTCCTGCTTTAATTTTTAGAACTGGTGAGATTGACTTTTGAAATAG	175371

FP236739.3	2551	AAAAACAGCAGATTCTAGAAACAATTTGTTTCAATGATGAGTTCTTTCAC	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175372	AAAAACAGCAGATTCTAGAAACAATTTGTTTCAATGATGAGTTCTTTCAC	175421

FP236739.3	2601	TAAATTTAATTCTTGCATCAATAAAGCTGATAGAAATAACTAAAAGTAAA	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175422	TAAATTTAATTCTTGCATCAATAAAGCTGATAGAAATAACTAAAAGTAAA	175471

FP236739.3	2651	ATTTGTAGTACAAATATTACATTAGATAATTTACCTTTGTCAGTTAACTT	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175472	ATTTGTAGTACAAATATTACATTAGATAATTTACCTTTGTCAGTTAACTT	175521

FP236739.3	2701	CCATGATGTTCTAGATAAAGGAAATCAGGCTAAGATGTAATTAACTTGAT	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175522	CCATGATGTTCTAGATAAAGGAAATCAGGCTAAGATGTAATTAACTTGAT	175571

FP236739.3	2751	ACACCTTCTATGATACACCACTTCTGCCATTTCACAAGGGCTGTCACATT	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175572	ACACCTTCTATGATACACCACTTCTGCCATTTCACAAGGGCTGTCACATT	175621

FP236739.3	2801	TTTTTAGGAAGCTTGTGGCTTTTCCTACAGATTAAAACATTTGTTTTAAA	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175622	TTTTTAGGAAGCTTGTGGCTTTTCCTACAGATTAAAACATTTGTTTTAAA	175671

FP236739.3	2851	GATGTTTGTATTGGAGTTCTTGTAGTGGCACAGCAGAAACGAATCCAACC	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175672	GATGTTTGTATTGGAGTTCTTGTAGTGGCACAGCAGAAACGAATCCAACC	175721

FP236739.3	2901	AGGAAACACGAGGTTGCAGGTTCAATCCCTGGCCTTGCTCAGTGGGTTAA	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175722	AGGAAACACGAGGTTGCAGGTTCAATCCCTGGCCTTGCTCAGTGGGTTAA	175771

FP236739.3	2951	GGATCCGGCATTGCTGTGGCTGAGGTGTAGGCTGGTGACTATAGCTCTGA	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
CU856325.3	175772	GGATCCGGCATTGCTGTGGCTGAGGTGTAGGCTGGTGACTATAGCTCCGA	175821

FP236739.3	3001	TTAGACCCCTAGCCTGGGAACCTCCATATGCCACAGGTGTGGCCCTAAAA	3050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175822	TTAGACCCCTAGCCTGGGAACCTCCATATGCCACAGGTGTGGCCCTAAAA	175871

FP236739.3	3051	GACCGAAAAAAAAAAAAAGATGTTTGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175872	GACCGAAAAAAAAAAAAAGATGTTTGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT	175921

FP236739.3	3101	TTTTTGGCTTTTTTTGCTATTTCTTTGGGCCGCTCCTGCGGTATATGGAG	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175922	TTTTTGGCTTTTTTTGCTATTTCTTTGGGCCGCTCCTGCGGTATATGGAG	175971

FP236739.3	3151	GTTCCCAGGCTAGGGGTCGAATCGGAGCTGTAGCCACCAGCCTACGCCAG	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	175972	GTTCCCAGGCTAGGGGTCGAATCGGAGCTGTAGCCACCAGCCTACGCCAG	176021

FP236739.3	3201	AGCCACAGCAACGCGGGATCCGAGCCGCGTCTGCAACCTACACCACAGCT	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176022	AGCCACAGCAACGCGGGATCCGAGCCGCGTCTGCAACCTACACCACAGCT	176071

FP236739.3	3251	CACGGCAACGCCGGATCCTTAACCCACTGAGCAAGGGCAGGGACCGAACC	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176072	CACGGCAACGCCGGATCCTTAACCCACTGAGCAAGGGCAGGGACCGAACC	176121

FP236739.3	3301	TGCAACCTCATGGTTCCTAGTTGGATTCGTTAACCACTGCGCCACGACGG	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176122	TGCAACCTCATGGTTCCTAGTTGGATTCGTTAACCACTGCGCCACGACGG	176171

FP236739.3	3351	GAACTCCTGTATTTTTTTCAGCAGGACATATATGCTACTAAAATTTTTAT	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176172	GAACTCCTGTATTTTTTTCAGCAGGACATATATGCTACTAAAATTTTTAT	176221

FP236739.3	3401	GTAAAACTTTTAAAAACATGTTTCAGGATGGAAGTCTTTTTTTTTTACCC	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176222	GTAAAACTTTTAAAAACATGTTTCAGGATGGAAGTCTTTTTTTTTTACCC	176271

FP236739.3	3451	CCCAGAATTTAAAGACAATTAAAAGATTAAATTGTAACTAATCATCTGTA	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176272	CCCAGAATTTAAAGACAATTAAAAGATTAAATTGTAACTAATCATCTGTA	176321

FP236739.3	3501	AGACAATAGTAAATTTGTGGAATAAAGTACTAATTATTATAATCATACTT	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176322	AGACAATAGTAAATTTGTGGAATAAAGTACTAATTATTATAATCATACTT	176371

FP236739.3	3551	ACAGAATTAATAGATTAATATCTGTGCTTTATTTGGACGTTATTATGGGA	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176372	ACAGAATTAATAGATTAATATCTGTGCTTTATTTGGACGTTATTATGGGA	176421

FP236739.3	3601	TGAAGGTTTGACTATAGTTTAAAATTATTTTAGTGTACCTTGTAGTACCA	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176422	TGAAGGTTTGACTATAGTTTAAAATTATTTTAGTGTACCTTGTAGTACCA	176471

FP236739.3	3651	ATTTTAATAAATTCTTGAATAAATTAGTTCTCCCCCATTTAATTTAAATA	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176472	ATTTTAATAAATTCTTGAATAAATTAGTTCTCCCCCATTTAATTTAAATA	176521

FP236739.3	3701	ACAGCAAAGGCAATCAGAAACAACCTTTGTAATAAAAAATGGAAAATAGT	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176522	ACAGCAAAGGCAATCAGAAACAACCTTTGTAATAAAAAATGGAAAATAGT	176571

FP236739.3	3751	GATAGAAGAAAGCACATTAGTGAAAGAATTTTAAATCACACATCTTAAAA	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176572	GATAGAAGAAAGCACATTAGTGAAAGAATTTTAAATCACACATCTTAAAA	176621

FP236739.3	3801	AAGAAATACTGTTTCTGCATATAATATTCAGTGAGTGATATTTTACTGAA	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176622	AAGAAATACTGTTTCTGCATATAATATTCAGTGAGTGATATTTTACTGAA	176671

FP236739.3	3851	GCCAAGATTGCATAACATGTGAGTTTAAGTGGAAAATTAGTCTTTCATGC	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176672	GCCAAGATTGCATAACATGTGAGTTTAAGTGGAAAATTAGTCTTTCATGC	176721

FP236739.3	3901	AAAATAAAGAAAAGGAATGTTGGTTTTAATCATTCCATATAGTATGTAAC	3950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176722	AAAATAAAGAAAAGGAATGTTGGTTTTAATCATTCCATATAGTATGTAAC	176771

FP236739.3	3951	TGTTTATTTGTGTTGGGAGAGAAAATATTGAATCAGTCCTGAAATGATAC	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176772	TGTTTATTTGTGTTGGGAGAGAAAATATTGAATCAGTCCTGAAATGATAC	176821

FP236739.3	4001	ATACATACTTTATCTTTAGTGACTTAGTGTCAGTTTGTAAAGTGTTGATC	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176822	ATACATACTTTATCTTTAGTGACTTAGTGTCAGTTTGTAAAGTGTTGATC	176871

FP236739.3	4051	CAGGGAATGATAAGAAAGGAAATGTTTAATTCATAATAGGCCTGTTTTTC	4100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176872	CAGGGAATGATAAGAAAGGAAATGTTTAATTCATAATAGGCCTGTTTTTC	176921

FP236739.3	4101	AGATCTTTCTGAGTAACTCTCTGGAGATGAATAGAAAGACCACAGGTCTG	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176922	AGATCTTTCTGAGTAACTCTCTGGAGATGAATAGAAAGACCACAGGTCTG	176971

FP236739.3	4151	TGTTTATCTGGCTTATGCTGACAGATCAGACAGGTTCCAGCCTGGTATCA	4200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	176972	TGTTTATCTGGCTTATGCTGACAGATCAGACAGGTTCCAGCCTGGTATCA	177021

FP236739.3	4201	AAATCAAAGTGACATGGAATATCTTTGCAAAACCCCCCAGGCAATTATAT	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177022	AAATCAAAGTGACATGGAATATCTTTGCAAAACCCCCCAGGCAATTATAT	177071

FP236739.3	4251	CATTCTCCTAATGATATTGATAAAATAAAACAGAGTTGGAGTTTGTATTG	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177072	CATTCTCCTAATGATATTGATAAAATAAAACAGAGTTGGAGTTTGTATTG	177121

FP236739.3	4301	TCTGATTTGGATTTCTTAGTTAGCTACTTCAGATCCTGCCAGAAGAGTTA	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177122	TCTGATTTGGATTTCTTAGTTAGCTACTTCAGATCCTGCCAGAAGAGTTA	177171

FP236739.3	4351	CCATTTGGAGGCCTTCAGGAGGTCAGGTTTCCAGGAGCCATGGGAGAAAA	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177172	CCATTTGGAGGCCTTCAGGAGGTCAGGTTTCCAGGAGCCATGGGAGAAAA	177221

FP236739.3	4401	ATTTCACACCTTCCACTCTCAGGCCTTGGGGTACATTTTGGGTACAATAC	4450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177222	ATTTCACACCTTCCACTCTCAGGCCTTGGGGTACATTTTGGGTACAATAC	177271

FP236739.3	4451	TTTTCTTTGTACAAAGGTGTTTCTTTGTAGCTGCATTATTTTAAGTTTTT	4500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177272	TTTTCTTTGTACAAAGGTGTTTCTTTGTAGCTGCATTATTTTAAGTTTTT	177321

FP236739.3	4501	ATAAAACCCACTGACTTTAAATGGTGTGGGGCCCTCTGACACCCTCTGCA	4550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177322	ATAAAACCCACTGACTTTAAATGGTGTGGGGCCCTCTGACACCCTCTGCA	177371

FP236739.3	4551	GATTTGCTGGCCTTTGTCAGTTATAAAAAAATACTCTGAGGTGGTGGTCT	4600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177372	GATTTGCTGGCCTTTGTCAGTTATAAAAAAATACTCTGAGGTGGTGGTCT	177421

FP236739.3	4601	CTCCTGAAATTTTTTATTTGTTAGCTTTTATGTATTTTGACTAGAACTTC	4650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177422	CTCCTGAAATTTTTTATTTGTTAGCTTTTATGTATTTTGACTAGAACTTC	177471

FP236739.3	4651	AGGACCACTGCTTTAGAGAGTTTGGTATGTTTCCTTTCAATTTTGGCTTG	4700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177472	AGGACCACTGCTTTAGAGAGTTTGGTATGTTTCCTTTCAATTTTGGCTTG	177521

FP236739.3	4701	TGATTATAAAGGGGAAAATGCATTAAATATTTTCTGCCCTTTTGCAAGGT	4750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177522	TGATTATAAAGGGGAAAATGCATTAAATATTTTCTGCCCTTTTGCAAGGT	177571

FP236739.3	4751	TTTGTTGTAAAATGGAAACTTTCCTGTTATATAGGTTTAAAAAGATCTTC	4800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177572	TTTGTTGTAAAATGGAAACTTTCCTGTTATATAGGTTTAAAAAGATCTTC	177621

FP236739.3	4801	CCCACTCTAATATTTAAAAATATATTTGGGCCTAGGATAGGCTAAAGTGT	4850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177622	CCCACTCTAATATTTAAAAATATATTTGGGCCTAGGATAGGCTAAAGTGT	177671

FP236739.3	4851	TTCCAGAAGCTAAGTTCTCCAACTTAACAGAGATTAGAACTCCTAGAGTT	4900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177672	TTCCAGAAGCTAAGTTCTCCAACTTAACAGAGATTAGAACTCCTAGAGTT	177721

FP236739.3	4901	TTGTCCTCTATAACCAAGAAGAAAAGGAATGAAATTACCACCTTTTTATT	4950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177722	TTGTCCTCTATAACCAAGAAGAAAAGGAATGAAATTACCACCTTTTTATT	177771

FP236739.3	4951	AGAGATTCTGATCCCTGTGTTCTTTCAGGAGGTTGGGAGGGTGAAGATAA	5000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177772	AGAGATTCTGATCCCTGTGTTCTTTCAGGAGGTTGGGAGGGTGAAGATAA	177821

FP236739.3	5001	TACAAGAAAGAAAGTATAAGCTATTTTGCCTACTGTTTTGCATTTTAGAA	5050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177822	TACAAGAAAGAAAGTATAAGCTATTTTGCCTACTGTTTTGCATTTTAGAA	177871

FP236739.3	5051	AATAGAAAGAAAAGCTAGGGGTGAATTTAAGATATCAGGTGTATTTAATC	5100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177872	AATAGAAAGAAAAGCTAGGGGTGAATTTAAGATATCAGGTGTATTTAATC	177921

FP236739.3	5101	ATATCACCATTGAAATCCACTGGGGTTGTGTGGTTTGAGAAACTATGCTT	5150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177922	ATATCACCATTGAAATCCACTGGGGTTGTGTGGTTTGAGAAACTATGCTT	177971

FP236739.3	5151	CTAGCACAGTAGATGTTCTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTGAATAAAA	5200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	177972	CTAGCACAGTAGATGTTCTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTGAATAAAA	178021

FP236739.3	5201	GTAGTTAAGATCACTTTCAGATTGAAGAAAAAGATTTTTCTGAGTAGAAT	5250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178022	GTAGTTAAGATCACTTTCAGATTGAAGAAAAAGATTTTTCTGAGTAGAAT	178071

FP236739.3	5251	GAAACTAACAGAAAAATAAAAGCATTTTAGGTGATGTTATACACACATCT	5300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178072	GAAACTAACAGAAAAATAAAAGCATTTTAGGTGATGTTATACACACATCT	178121

FP236739.3	5301	CATAAGACAAATTAGAAATCTTTAGAAAATTGTCATTAAAGGGGCACATT	5350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178122	CATAAGACAAATTAGAAATCTTTAGAAAATTGTCATTAAAGGGGCACATT	178171

FP236739.3	5351	TGGTTACAAATTATAGAGAACCACCTTAAATTAAGTAACACCCCAGAAGG	5400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178172	TGGTTACAAATTATAGAGAACCACCTTAAATTAAGTAACACCCCAGAAGG	178221

FP236739.3	5401	ATTTCTCAGAGGCCTCAAGAGCCCAAGGTAAAGGGAAGCAGCCTTAGGCA	5450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178222	ATTTCTCAGAGGCCTCAAGAGCCCAAGGTAAAGGGAAGCAGCCTTAGGCA	178271

FP236739.3	5451	GGATAGGGACAAACCAAGGGACCAGTGTGGGGTCTCTTCCCTGGCAAAAT	5500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178272	GGATAGGGACAAACCAAGGGACCAGTGTGGGGTCTCTTCCCTGGCAAAAT	178321

FP236739.3	5501	GGTTAACATCTCGTTTCACTTTTTTTTTAAGTTGTCTGATTTGGGGAAAT	5550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178322	GGTTAACATCTCGTTTCACTTTTTTTTTAAGTTGTCTGATTTGGGGAAAT	178371

FP236739.3	5551	TTATAGAAACCCTCTATGCCTCCATTTCCTCATTTTTTTTCCTTTTTTTT	5600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
CU856325.3	178372	TTATAGAAACCCTCTATGCCTCCATTTCCTCATTTTTTTTCCTTTTTTTG	178421

FP236739.3	5601	TTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTCACTTTTGACTGCCTCAAAGCGTATG	5650
			 |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178422	ATTTTTTTTTTTTT-CTCTTTTTTCACTTTTGACTGCCTCAAAGCGTATG	178470

FP236739.3	5651	GAGTTTCCAGGCCAGGGATCAGATCCCTGCAACACAGCCACTGTTCTGAG	5700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178471	GAGTTTCCAGGCCAGGGATCAGATCCCTGCAACACAGCCACTGTTCTGAG	178520

FP236739.3	5701	CCGGGGATTGAACCTGGGTCCTGGCTCTCCAGAGACATGGTCCATCCCAT	5750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178521	CCGGGGATTGAACCTGGGTCCTGGCTCTCCAGAGACATGGTCCATCCCAT	178570

FP236739.3	5751	TGCACCACAGCAGGAACTCCCTTTTTTTTTTCTAATTTCTGAAATGAGAA	5800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178571	TGCACCACAGCAGGAACTCCCTTTTTTTTTTCTAATTTCTGAAATGAGAA	178620

FP236739.3	5801	GAATAGGCGTTCCCTTCATGGCTCAGTGGTTAACGAACCTGACTAAGATC	5850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178621	GAATAGGCGTTCCCTTCATGGCTCAGTGGTTAACGAACCTGACTAAGATC	178670

FP236739.3	5851	CATAAGGACATGGGTTTGATCCCTGGCCTCACTCAGTGGGTTAAGGATCA	5900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178671	CATAAGGACATGGGTTTGATCCCTGGCCTCACTCAGTGGGTTAAGGATCA	178720

FP236739.3	5901	GACGTTGCCTTGAGCTGTGGTAGAGGTAGAAGACGAAGCTCAGATTTAGC	5950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178721	GACGTTGCCTTGAGCTGTGGTAGAGGTAGAAGACGAAGCTCAGATTTAGC	178770

FP236739.3	5951	ATTGCTGTGGCTGTGGTGTAGGCCAGCAGCTACAGCTCTGATTCA	5995
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178771	ATTGCTGTGGCTGTGGTGTAGGCCAGCAGCTACAGCTCTGATTCA	178815

Compact alignment

skip 2950 bps 100% identity alignment

FP236739.3	2951	GGATCCGGCATTGCTGTGGCTGAGGTGTAGGCTGGTGACTATAGCTCTGA	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
CU856325.3	175772	GGATCCGGCATTGCTGTGGCTGAGGTGTAGGCTGGTGACTATAGCTCCGA	175821

skip 2550 bps 100% identity alignment

FP236739.3	5551	TTATAGAAACCCTCTATGCCTCCATTTCCTCATTTTTTTTCCTTTTTTTT	5600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
CU856325.3	178372	TTATAGAAACCCTCTATGCCTCCATTTCCTCATTTTTTTTCCTTTTTTTG	178421

FP236739.3	5601	TTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTCACTTTTGACTGCCTCAAAGCGTATG	5650
			 |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU856325.3	178422	ATTTTTTTTTTTTT-CTCTTTTTTCACTTTTGACTGCCTCAAAGCGTATG	178470

skip 345 bps 100% identity alignment

Overview

Query
FP236739.3 - 99051 bps
Hit
CU856325.3 - 185715 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5995 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.91592059951599511728221788151
298.2711693120922272434815167782799691
399.96515675283681511911564531632031
499.98640565545179758350-11789161854701
599.950215134459515108415140102701
697.824852514440415455581151431
799.8340035665906462629110379139421
895.0819902114152161732911332111353251
991.65100714346026561698-11697761712121
1083.9396320445732459367-11543041563201
1182.7275816155962461238-11527661543161
1282.9759613036382665128-11546671559691
1375.4858319994371345711130999330041
1496.213694543107131524-1255029981
1576.38369951538715482111411381421021
1696.263664494296643414-176227766801
1790.53645644514445707-175385759631
1885.633486826630466985-11704171710841
1976.5534514405998261421-159462609151
2074.663337776381564591-11788121795881
2184.123296741896919642-159065597441
2283.91328654189691962211643731650121
Short-link