<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463331.8	1	GAATTCATGCAGGTGCACACATACACACTGTGGGTGTTGGTGACTGTGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75357	GAATTCATGCAGGTGCACACATACACACTGTGGGTGTTGGTGACTGTGGA	75406

CU463331.8	51	AGGACAGTGGCTGTATAATAAAACGGGACAGCATACGTGCAGTGATTGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75407	AGGACAGTGGCTGTATAATAAAACGGGACAGCATACGTGCAGTGATTGAA	75456

CU463331.8	101	GTGGTTAGAGTTGTATTGTGTGTAGTGTGTTTCCTTTATTTTTGTTTTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75457	GTGGTTAGAGTTGTATTGTGTGTAGTGTGTTTCCTTTATTTTTGTTTTTC	75506

CU463331.8	151	CTTTGAGTCAGGGTCTCTCTATATAGCCTGTGCTGCTCTGGAATTCACTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75507	CTTTGAGTCAGGGTCTCTCTATATAGCCTGTGCTGCTCTGGAATTCACTA	75556

CU463331.8	201	TGCAGACCTGACTGGCTTCACAGAGATTCACTTCTCTCTGCTTCCCACGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75557	TGCAGACCTGACTGGCTTCACAGAGATTCACTTCTCTCTGCTTCCCACGT	75606

CU463331.8	251	GCTGGAATCAAAGGCGTGTGCCACACTATACCTAGCCTGTATTATATGTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75607	GCTGGAATCAAAGGCGTGTGCCACACTATACCTAGCCTGTATTATATGTA	75656

CU463331.8	301	CTTAATCACACAAAAGCACCCATTGGGCATGGTGGTACATGTTTGTGATC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75657	CTTAATCACACAAAAGCACCCATTGGGCATGGTGGTACATGTTTGTGATC	75706

CU463331.8	351	CCTGTACTAAGGAGGGTACTCTAGAATTTGAGGGTAACCTGGGCTATATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75707	CCTGTACTAAGGAGGGTACTCTAGAATTTGAGGGTAACCTGGGCTATATA	75756

CU463331.8	401	GTAAGTTTGAAAATCATCTGGGTTACATGATAAGACCCTAAATCAAAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75757	GTAAGTTTGAAAATCATCTGGGTTACATGATAAGACCCTAAATCAAAACA	75806

CU463331.8	451	ACAAAACAAGAGCTATAGTTCAGGGGGAAAGTGTTTAGCTAGCATGCATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75807	ACAAAACAAGAGCTATAGTTCAGGGGGAAAGTGTTTAGCTAGCATGCATG	75856

CU463331.8	501	AAGCTCTGTTTTCAAGTCTAAGCAATTGAGAAAAGACAAAAATGTGACTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75857	AAGCTCTGTTTTCAAGTCTAAGCAATTGAGAAAAGACAAAAATGTGACTA	75906

CU463331.8	551	GATAGAATATTGCTGATGAGTAGTGTATTATAAATGCTCTTCTATGCTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75907	GATAGAATATTGCTGATGAGTAGTGTATTATAAATGCTCTTCTATGCTGG	75956

CU463331.8	601	CATGCCCTCAGGGTTTTGTTGTTGGTCGTTTTTTAACGCCTGTAAGAGCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	75957	CATGCCCTCAGGGTTTTGTTGTTGGTCGTTTTTTAACGCCTGTAAGAGCT	76006

CU463331.8	651	CTGAGTGAGCAGTAGGGTATCTAACCAGAACATCTTCAGGGCAGGACTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76007	CTGAGTGAGCAGTAGGGTATCTAACCAGAACATCTTCAGGGCAGGACTCT	76056

CU463331.8	701	GGCCTTACTCTCATATTTTTTCTCTGATCCTCAGATTTCCCCCTCTACCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76057	GGCCTTACTCTCATATTTTTTCTCTGATCCTCAGATTTCCCCCTCTACCT	76106

CU463331.8	751	TGGCAAGAATGTAGTTGGTCGAAGCCCTGACTGCTCTGTGGCCCTGCCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76107	TGGCAAGAATGTAGTTGGTCGAAGCCCTGACTGCTCTGTGGCCCTGCCTT	76156

CU463331.8	801	TTCCATCCATCTCCAAACAGCATGCAGTAATTGAAATCTCAGCTTGGAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76157	TTCCATCCATCTCCAAACAGCATGCAGTAATTGAAATCTCAGCTTGGAAC	76206

CU463331.8	851	AAAGCCCCTATCCTCCAGGATTGTGGGAGCCTCAATGGCACTCAAATCGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76207	AAAGCCCCTATCCTCCAGGATTGTGGGAGCCTCAATGGCACTCAAATCGT	76256

CU463331.8	901	AAAGCCTCCTAGGGTCCTACCTCCTGGAGTGAGCCATCGTCTGAGGGACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76257	AAAGCCTCCTAGGGTCCTACCTCCTGGAGTGAGCCATCGTCTGAGGGACC	76306

CU463331.8	951	AGGAATTAATTCTGTTTGCAGATTTTCCCTGCCAGTACCATCGCCTGGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76307	AGGAATTAATTCTGTTTGCAGATTTTCCCTGCCAGTACCATCGCCTGGAT	76356

CU463331.8	1001	GTCCCACCACCCTTGGTCCCTCGGAGTCTTCTAACTATAGAGAAAACCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76357	GTCCCACCACCCTTGGTCCCTCGGAGTCTTCTAACTATAGAGAAAACCCC	76406

CU463331.8	1051	CAGAATACGGATAGAATCCCAAAATTCCAGAGTTTTGTTGGCTGCCGATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76407	CAGAATACGGATAGAATCCCAAAATTCCAGAGTTTTGTTGGCTGCCGATT	76456

CU463331.8	1101	CAGAGGAAGAAGGGGGTAAGTTTGTGCCTTTGGCATAGGTATGAAAAGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76457	CAGAGGAAGAAGGGGGTAAGTTTGTGCCTTTGGCATAGGTATGAAAAGAC	76506

CU463331.8	1151	AGGGATGATGGCTATAAACTCAATTTATTCTTTCCTGTTCTTGCCAGATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76507	AGGGATGATGGCTATAAACTCAATTTATTCTTTCCTGTTCTTGCCAGATT	76556

CU463331.8	1201	TTCCTTCTGGAAGGTGTGTGGCGAATGGACAAAGGAATACAGCATCCCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76557	TTCCTTCTGGAAGGTGTGTGGCGAATGGACAAAGGAATACAGCATCCCCT	76606

CU463331.8	1251	TCAGCAACAGTAGTTCCAGAAAGGTGGGTACCAAAGTACCAGATACCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76607	TCAGCAACAGTAGTTCCAGAAAGGTGGGTACCAAAGTACCAGATACCTGA	76656

CU463331.8	1301	ATATTTATGTTTGCTTGCTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76657	ATATTTATGTTTGCTTGCTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGA	76706

CU463331.8	1351	GACAGGGTTTCTCTGCGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACCAACTTTGTAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76707	GACAGGGTTTCTCTGCGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACCAACTTTGTAGA	76756

CU463331.8	1401	CCAGGCTGGCCTCGAGCTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCCTAAGTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76757	CCAGGCTGGCCTCGAGCTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCCTAAGTGC	76806

CU463331.8	1451	CGGGATTAAAGGGGTGCGCCACCACTGCCTGCCAGATGATTATCTTGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76807	CGGGATTAAAGGGGTGCGCCACCACTGCCTGCCAGATGATTATCTTGAAA	76856

CU463331.8	1501	GGTGGCACTAAGAGCCTCTGAATAATATTTCCCCAGCTGAATTAAACCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76857	GGTGGCACTAAGAGCCTCTGAATAATATTTCCCCAGCTGAATTAAACCAT	76906

CU463331.8	1551	AATGAGCACTACTACTACTACCACTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTTTTCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76907	AATGAGCACTACTACTACTACCACTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTTTTCTT	76956

CU463331.8	1601	CTTTTTAAGGATTTATGTATTATATTTATATGAGTACACTGTAGCTGTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	76957	CTTTTTAAGGATTTATGTATTATATTTATATGAGTACACTGTAGCTGTTT	77006

CU463331.8	1651	TCAGACACAGCAGAAGAGGGTGTCAGATTCTATTACAGATGATTGTGAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77007	TCAGACACAGCAGAAGAGGGTGTCAGATTCTATTACAGATGATTGTGAGC	77056

CU463331.8	1701	CACCATATGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTTCAGAAGAACAGTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77057	CACCATATGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTTCAGAAGAACAGTCA	77106

CU463331.8	1751	GGGTTCTTTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTGGTTGTGGTCCGCCCCCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77107	GGGTTCTTTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTGGTTGTGGTCCGCCCCCCC	77156

CU463331.8	1801	CCCCCCCTTCCGAGACAGGGTTTCTTTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77157	CCCCCCCTTCCGAGACAGGGTTTCTTTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAA	77206

CU463331.8	1851	CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGATCAGTCAGTGGTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77207	CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGATCAGTCAGTGGTTTG	77256

CU463331.8	1901	TTGTTGTTGTTTTTAATATTTATTTATTTATCATATGTAAGTGCACTGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77257	TTGTTGTTGTTTTTAATATTTATTTATTTATCATATGTAAGTGCACTGTA	77306

CU463331.8	1951	GCTGTCTTCAGATACACCAGAAGAGGGCATCAGATTTCGTTACAGATGGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467817.5	77307	GCTGTCTTCAGATACACCAGAAGAGGGCATCAGATTTCGTTACAGATGGT	77356

Overview

Query
CU463331.8 - 156464 bps
Hit
CU467817.5 - 77356 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link