<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207361.21	1	GAATTCGTGAAATTGCAGGGAGAAATTTGGTGACTTGATCTTCTCAGAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	131908	GAATTCGTGAAATTGCAGGGAGAAATTTGGTGACTTGATCTTCTCAGAAG	131957

CU207361.21	51	CCAGCCTCCCTCACGCACTGATAACATTTCCTTATGATCAGAGCATGAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	131958	CCAGCCTCCCTCACGCACTGATAACATTTCCTTATGATCAGAGCATGAAT	132007

CU207361.21	101	GGAGCAGTGTCTGCCTTTGTCTGCAGATGTGACCACTGTTCAATGAAGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132008	GGAGCAGTGTCTGCCTTTGTCTGCAGATGTGACCACTGTTCAATGAAGAA	132057

CU207361.21	151	GGAGTTTTCTTTTGTTGTGTCTTGGCAGGAGGACATCCTTGACTGAAAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132058	GGAGTTTTCTTTTGTTGTGTCTTGGCAGGAGGACATCCTTGACTGAAAGT	132107

CU207361.21	201	CTCCCCTTGCATCTCATTGGCCATGACGAGGTCACATGCTTCTCACGACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132108	CTCCCCTTGCATCTCATTGGCCATGACGAGGTCACATGCTTCTCACGACA	132157

CU207361.21	251	GGAGGAATAGAAACACCGGCCAATCATGACTGTCAGATCGTAGCCTGCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132158	GGAGGAATAGAAACACCGGCCAATCATGACTGTCAGATCGTAGCCTGCCC	132207

CU207361.21	301	TCGGAGTGTTTAGCTTTCTGGGAACAGGACCAAAATCCCATGCCTTCGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132208	TCGGAGTGTTTAGCTTTCTGGGAACAGGACCAAAATCCCATGCCTTCGCT	132257

CU207361.21	351	AAGGAGCTATCCTACACTGTGCAGATAATAAACAACATGCTCAGAGAACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132258	AAGGAGCTATCCTACACTGTGCAGATAATAAACAACATGCTCAGAGAACT	132307

CU207361.21	401	AGAAAAATAATCAAGATGTCCAGCCAGCCTACAATGTCAAAGGAATTAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132308	AGAAAAATAATCAAGATGTCCAGCCAGCCTACAATGTCAAAGGAATTAAA	132357

CU207361.21	451	TCTGCGTATTACACAGACTTCTGCACTAATGTGTTTATTACAACACTATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132358	TCTGCGTATTACACAGACTTCTGCACTAATGTGTTTATTACAACACTATT	132407

CU207361.21	501	TACAACAGCCAAGATGGTAAATTAGCCAAGGTATCCGTGGATGGATAACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132408	TACAACAGCCAAGATGGTAAATTAGCCAAGGTATCCGTGGATGGATAACT	132457

CU207361.21	551	GGGTGTACTGGCTAGTTTTATGTCAACTTGACCCAAGCTAGAATCATCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132458	GGGTGTACTGGCTAGTTTTATGTCAACTTGACCCAAGCTAGAATCATCTG	132507

CU207361.21	601	AAAAGAAGAAACGTCAGGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTCCAAAAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132508	AAAAGAAGAAACGTCAGGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTCCAAAAGA	132557

CU207361.21	651	TCAAACTGTAAACAAGCCAGTAGTAAGGCATTTCCTTAATTAGTGATTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132558	TCAAACTGTAAACAAGCCAGTAGTAAGGCATTTCCTTAATTAGTGATTGA	132607

CU207361.21	701	TAGGGGAGGACGCTCAGAGTCATGGGTGGTGGTCCTGAGTCCTATAAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132608	TAGGGGAGGACGCTCAGAGTCATGGGTGGTGGTCCTGAGTCCTATAAGAA	132657

CU207361.21	751	AGCAGGCTGAGAGAGCCATGTGGAGCAAGCCAGTGAGCAGCAGCCCTCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132658	AGCAGGCTGAGAGAGCCATGTGGAGCAAGCCAGTGAGCAGCAGCCCTCCC	132707

CU207361.21	801	CTGGCCTTTGCATCAGCTCCTGTCTCCAGGTGCTTGCCCAGTTTGAATTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132708	CTGGCCTTTGCATCAGCTCCTGTCTCCAGGTGCTTGCCCAGTTTGAATTC	132757

CU207361.21	851	TGGTCCTGATTTCCTCCAATGATGAACAGTGATATGGAAGTCTAAGCTAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132758	TGGTCCTGATTTCCTCCAATGATGAACAGTGATATGGAAGTCTAAGCTAA	132807

CU207361.21	901	ATAAACTTTTGTTATCAACTTGCTTTTGGTCATAGGGTTTCAAAACAGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132808	ATAAACTTTTGTTATCAACTTGCTTTTGGTCATAGGGTTTCAAAACAGCA	132857

CU207361.21	951	ATAGAAACCCTAACTAAAACAGTAAGGAAAGAAAATAGAATATGTATCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132858	ATAGAAACCCTAACTAAAACAGTAAGGAAAGAAAATAGAATATGTATCAT	132907

CU207361.21	1001	GGAATATTACTCAGCCATAAAAAGAAGGAAATTCTGTCTTCTGCAGACCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132908	GGAATATTACTCAGCCATAAAAAGAAGGAAATTCTGTCTTCTGCAGACCA	132957

CU207361.21	1051	TGGATGGAACTGAAAGATGCTGTGTGAAGTGAAGTAAGTCAGACTCAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	132958	TGGATGGAACTGAAAGATGCTGTGTGAAGTGAAGTAAGTCAGACTCAGAA	133007

CU207361.21	1101	AGGCAAACACCATGTGTCTCCATCGATGTGTGAGAAGTAAAAGAGTTGAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133008	AGGCAAACACCATGTGTCTCCATCGATGTGTGAGAAGTAAAAGAGTTGAT	133057

CU207361.21	1151	TTCCCAGGAGTGGAGACTAGAATATGATGATCAGGACTCACAAGAGTGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133058	TTCCCAGGAGTGGAGACTAGAATATGATGATCAGGACTCACAAGAGTGGT	133107

CU207361.21	1201	GGAGAGGGTCCAGGCAAGCAAGCACTGTGACCTGGACACAGGTTCTCACT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133108	GGAGAGGGTCCAGGCAAGCAAGCACTGTGACCTGGACACAGGTTCTCACT	133157

CU207361.21	1251	TGCCCACGGGCTCCTTATGTGCCCTTGACCGAGGCCTGGCTCTCTCAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133158	TGCCCACGGGCTCCTTATGTGCCCTTGACCGAGGCCTGGCTCTCTCAGGA	133207

CU207361.21	1301	TTCCACTGGCCTCATTTGTCCAATGGGGCCAAGCTCCATAGCCTGACAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133208	TTCCACTGGCCTCATTTGTCCAATGGGGCCAAGCTCCATAGCCTGACAAT	133257

CU207361.21	1351	AGGTACAATACAGCAGTGGGCACAGCATGGTGGTGGGGACAGTATGGCAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133258	AGGTACAATACAGCAGTGGGCACAGCATGGTGGTGGGGACAGTATGGCAG	133307

CU207361.21	1401	TGGCAGCGTGTCCCCAGTGCATCCTGGATTCAGCTCAGGGACTGTCACTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133308	TGGCAGCGTGTCCCCAGTGCATCCTGGATTCAGCTCAGGGACTGTCACTC	133357

CU207361.21	1451	ACTCACTCAGTTGACATGTATTGGCAGGACAGCCATTTGTGGTGGATACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133358	ACTCACTCAGTTGACATGTATTGGCAGGACAGCCATTTGTGGTGGATACT	133407

CU207361.21	1501	CAGAGAAGATGGAAACCCAGCATGCAGCTGGCCACGATGAGCCCGCCCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133408	CAGAGAAGATGGAAACCCAGCATGCAGCTGGCCACGATGAGCCCGCCCTC	133457

CU207361.21	1551	CAGCTAGGGAGACTTGGAAACAGCCACACGGGTGATGATGACCACGGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133458	CAGCTAGGGAGACTTGGAAACAGCCACACGGGTGATGATGACCACGGTGA	133507

CU207361.21	1601	ACTGGGACTGTGGTGCTCTGGAGCTATGAGAGGAAGTTTCAGAGGGGGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133508	ACTGGGACTGTGGTGCTCTGGAGCTATGAGAGGAAGTTTCAGAGGGGGCT	133557

CU207361.21	1651	ACAGAGATGCCTCTGTCAGTGAAGGGGTTGCATTGACAGGATGAGAACCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133558	ACAGAGATGCCTCTGTCAGTGAAGGGGTTGCATTGACAGGATGAGAACCT	133607

CU207361.21	1701	GAGTAAAGAGCTCCAGTGTCGGCTTAAAAGGCCGTGTGCAGAGGCAAGTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133608	GAGTAAAGAGCTCCAGTGTCGGCTTAAAAGGCCGTGTGCAGAGGCAAGTA	133657

CU207361.21	1751	CCTCGCATCCCACCACTGAGGAAACGGGGATGGGAAGATGCCTGGAGCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133658	CCTCGCATCCCACCACTGAGGAAACGGGGATGGGAAGATGCCTGGAGCCT	133707

CU207361.21	1801	GCTGCCCCTCAGTCATGGCAAGGAATGGAAGCACTCCAGAGTCAGTGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133708	GCTGCCCCTCAGTCATGGCAAGGAATGGAAGCACTCCAGAGTCAGTGAAA	133757

CU207361.21	1851	GACCTCGTCTCAAAACTAGAGAGGAACTGGGGATCTGATGGCAACCGTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133758	GACCTCGTCTCAAAACTAGAGAGGAACTGGGGATCTGATGGCAACCGTTG	133807

CU207361.21	1901	GCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133808	GCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC	133857

CU207361.21	1951	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTGTGTGACTTTTCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467499.7	133858	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTGTGTGACTTTTCA	133907

Overview

Query
CU207361.21 - 34137 bps
Hit
CU467499.7 - 133907 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link