<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU467498.4 1 GATCTGTGCTCCTGATGGCTGTTTATCCCTGACCCAGGCCTTGCAGCTCC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 40970 GATCTGTGCTCCTGATGGCTGTTTATCCCTGACCCAGGCCTTGCAGCTCC 41019 CU467498.4 51 CAGGACAGAGGCCCCACTCTTCACATCTCCTGTCCCCTTTTGTCCCTTGC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41020 CAGGACAGAGGCCCCACTCTTCACATCTCCTGTCCCCTTTTGTCCCTTGC 41069 CU467498.4 101 CTTTTGTCTGGCACTTCTGAGCCAGTCTGCTGTCATATGCTTTTTTACAT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41070 CTTTTGTCTGGCACTTCTGAGCCAGTCTGCTGTCATATGCTTTTTTACAT 41119 CU467498.4 151 TTTTCTCAAATAAACAAATAATGAAAGTCATCTGCTTCATAGAGTTTCAA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41120 TTTTCTCAAATAAACAAATAATGAAAGTCATCTGCTTCATAGAGTTTCAA 41169 CU467498.4 201 GCAGAAGAAACAGTAAAAAGAAAGACAGGACCCACTATAAGACACTGTTC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41170 GCAGAAGAAACAGTAAAAAGAAAGACAGGACCCACTATAAGACACTGTTC 41219 CU467498.4 251 ATGCATAATTGTAGATGCCAGCAGCTACATGAACTGGGCTCCTGAAAGGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41220 ATGCATAATTGTAGATGCCAGCAGCTACATGAACTGGGCTCCTGAAAGGA 41269 CU467498.4 301 AAGCTGGGGCTGTATGGGTGGGGGGGGGGTGGCGAGAGAAGAATGAGACC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41270 AAGCTGGGGCTGTATGGGTGGGGGGGGGGTGGCGAGAGAAGAATGAGACC 41319 CU467498.4 351 AAGACAAAGTTTCTGATGAAGGTCCAATGTTTACATTTTGAATCTGAACC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41320 AAGACAAAGTTTCTGATGAAGGTCCAATGTTTACATTTTGAATCTGAACC 41369 CU467498.4 401 TAAAGCGGCGGGGGACCCATCCCCTACTATGCCAGGTTCTCCTGGCTTGT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41370 TAAAGCGGCGGGGGACCCATCCCCTACTATGCCAGGTTCTCCTGGCTTGT 41419 CU467498.4 451 CAGAATCTCCTCAGGAAAACAAACTCAGCCTCTCAGCAGATGTGGCAGGA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41420 CAGAATCTCCTCAGGAAAACAAACTCAGCCTCTCAGCAGATGTGGCAGGA 41469 CU467498.4 501 CAATAGATGTTCCCTACGTCAGAAGACTCCACCCTATGTGGGCTAGCAGG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41470 CAATAGATGTTCCCTACGTCAGAAGACTCCACCCTATGTGGGCTAGCAGG 41519 CU467498.4 551 CTGTGGCATGAACAAGGTCTAAATCAGCCTGCTCAAGGCTGGGAGAAGGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41520 CTGTGGCATGAACAAGGTCTAAATCAGCCTGCTCAAGGCTGGGAGAAGGC 41569 CU467498.4 601 ACACATAATAAGCATGGGAGTTATTGTATAAGAAATAAATTCAGTTTTAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41570 ACACATAATAAGCATGGGAGTTATTGTATAAGAAATAAATTCAGTTTTAA 41619 CU467498.4 651 TTCATTAATTGTCAATTAGAGTATTTTTACAAGTTGGATTAAATTTGAGA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41620 TTCATTAATTGTCAATTAGAGTATTTTTACAAGTTGGATTAAATTTGAGA 41669 CU467498.4 701 ATACCACCTATAATCATTACAGACAGAGTCATTGAAGCACACAAGAATCC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41670 ATACCACCTATAATCATTACAGACAGAGTCATTGAAGCACACAAGAATCC 41719 CU467498.4 751 CTTCTCCCTTCACTTACACCATCTGTGAGAATCTGTTAGATGAGAAAGAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41720 CTTCTCCCTTCACTTACACCATCTGTGAGAATCTGTTAGATGAGAAAGAT 41769 CU467498.4 801 GTTGCTGTGGGCCTTGTCGATATCTATATGAGAACACAGTCAGGGCCATG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41770 GTTGCTGTGGGCCTTGTCGATATCTATATGAGAACACAGTCAGGGCCATG 41819 CU467498.4 851 CTCCAAATCCCACAGGCTCTGTCCTTTGCTCTGTGGAGCAGCAGGATGGG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41820 CTCCAAATCCCACAGGCTCTGTCCTTTGCTCTGTGGAGCAGCAGGATGGG 41869 CU467498.4 901 AAGAGAAAGGTACCTGCTCAAGAATCTGGACAATTCTGCCATGGAGTTCC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41870 AAGAGAAAGGTACCTGCTCAAGAATCTGGACAATTCTGCCATGGAGTTCC 41919 CU467498.4 951 ACGTGATGAGCCAGTCTGCAGACACCTGAGGCTTTGCTCTGGCCTGCACA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41920 ACGTGATGAGCCAGTCTGCAGACACCTGAGGCTTTGCTCTGGCCTGCACA 41969 CU467498.4 1001 CACAAGGACATACATTAAACAAAGAAAAACAAAAGAAAAAAAAAGGCATG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 41970 CACAAGGACATACATTAAACAAAGAAAAACAAAAGAAAAAAAAAGGCATG 42019 CU467498.4 1051 AACTGTAACAATTCAGGAACAATGAAACAAACTAGCTAAGCAAAATGATG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42020 AACTGTAACAATTCAGGAACAATGAAACAAACTAGCTAAGCAAAATGATG 42069 CU467498.4 1101 AGTCAAAGGTGGATATGCTAGTAGGCAATTTCCTGAGGGGAATACATGTC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42070 AGTCAAAGGTGGATATGCTAGTAGGCAATTTCCTGAGGGGAATACATGTC 42119 CU467498.4 1151 CTATAGAAATTATATGGGACGTAACCCTTGAGTAGCAGGGAGATGGCTCA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42120 CTATAGAAATTATATGGGACGTAACCCTTGAGTAGCAGGGAGATGGCTCA 42169 CU467498.4 1201 GGCCATGGAAGCTGATGCAGGTAGTTTTCCTACTCCACTTTAAGCTCTTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42170 GGCCATGGAAGCTGATGCAGGTAGTTTTCCTACTCCACTTTAAGCTCTTT 42219 CU467498.4 1251 AAGGGTGGAACACACTACTAGTCCTCACCCAGATTACCTTGGGTCCATGG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42220 AAGGGTGGAACACACTACTAGTCCTCACCCAGATTACCTTGGGTCCATGG 42269 CU467498.4 1301 ATAAAAATCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42270 ATAAAAATCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 42319 CU467498.4 1351 ACACACGACTTTATCTTAAAATGTCTTTGCTAACTCACTGACTGGGCATT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42320 ACACACGACTTTATCTTAAAATGTCTTTGCTAACTCACTGACTGGGCATT 42369 CU467498.4 1401 CCTAAACCTCCCCTGCCACTCCAGGCCAGTTGCCAGTCCAACCAAAACCT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42370 CCTAAACCTCCCCTGCCACTCCAGGCCAGTTGCCAGTCCAACCAAAACCT 42419 CU467498.4 1451 CACGTGGGTCATTGGCTTTATCTCCTGTTACTACTGCTTCCTCTTTTTCC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42420 CACGTGGGTCATTGGCTTTATCTCCTGTTACTACTGCTTCCTCTTTTTCC 42469 CU467498.4 1501 CCAGTTCTCCCCATTCTCCCTGAATCCTCCCACACAACTCTAAGTGTCCT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42470 CCAGTTCTCCCCATTCTCCCTGAATCCTCCCACACAACTCTAAGTGTCCT 42519 CU467498.4 1551 GCCCCTCACTCAAACATTGGTCACTGGTATCTTTATTGATTGATCAAGAA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42520 GCCCCTCACTCAAACATTGGTCACTGGTATCTTTATTGATTGATCAAGAA 42569 CU467498.4 1601 CCAATTGGGGAACAGGACCTTAGCATCAGCCCCACCTTCTATATCTCACC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42570 CCAATTGGGGAACAGGACCTTAGCATCAGCCCCACCTTCTATATCTCACC 42619 CU467498.4 1651 TTTCCTGTCTAATAATAATAATAGTAATAATAATCTCTCTCCCAGACATA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42620 TTTCCTGTCTAATAATAATAATAGTAATAATAATCTCTCTCCCAGACATA 42669 CU467498.4 1701 AATTGAACAAAACTATAACAATTATGTAAATTACAATATATGATATATAA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42670 AATTGAACAAAACTATAACAATTATGTAAATTACAATATATGATATATAA 42719 CU467498.4 1751 TTTTAATTTCCAGTCCATAATATTTGTCAATTAGAAAAAAGTACTCTACT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42720 TTTTAATTTCCAGTCCATAATATTTGTCAATTAGAAAAAAGTACTCTACT 42769 CU467498.4 1801 ATCATTTGTAACTTAAAGAATTATGGTTCTATCCCTGGATTGTTTAGATT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42770 ATCATTTGTAACTTAAAGAATTATGGTTCTATCCCTGGATTGTTTAGATT 42819 CU467498.4 1851 TTAGTCTGTAAAGCCATCTGAAAACCATATCTTCCACTCTATAACCTCTC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42820 TTAGTCTGTAAAGCCATCTGAAAACCATATCTTCCACTCTATAACCTCTC 42869 CU467498.4 1901 TCTCAGTGTTAAAAAACTTGAGTGATTATGAGAGTATAACTAATCTTCAA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42870 TCTCAGTGTTAAAAAACTTGAGTGATTATGAGAGTATAACTAATCTTCAA 42919 CU467498.4 1951 TCCTGTTAGCAGTCCAAGAAAAACGTATACATTACCTGGGTATGCAGGAA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU467495.3 42920 TCCTGTTAGCAGTCCAAGAAAAACGTATACATTACCTGGGTATGCAGGAA 42969
Overview
- Query
- CU467498.4 - 20047 bps
- Hit
- CU467495.3 - 42969 bps
- Total alignments
- 3
- Best alignment
- alignment #1 (HSP: 2000 bps)
- Best alignment cartoon