<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FP104545.5	139636	AGCTGCACCCTGCAGTTTCATAAATGCAATCCAGTCTATTCAGTCCTTTT	139587
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177222	AGCTGCACCCTGCAGTTTCATAAATGCAATCCAGTCTATTCAGTCCTTTT	177271

C  FP104545.5	139586	CATTCCTGAGGCTCATGCTTTGTCCATCTGCTTATCTAAGATGCATATAC	139537
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177272	CATTCCTGAGGCTCATGCTTTGTCCATCTGCTTATCTAAGATGCATATAC	177321

C  FP104545.5	139536	TGGGTGGACTAATTGAGTGGGCTGCCCCCTGTAACTGCATGTAGCCAATA	139487
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177322	TGGGTGGACTAATTGAGTGGGCTGCCCCCTGTAACTGCATGTAGCCAATA	177371

C  FP104545.5	139486	ATGCTTGCCCTCTATGTATTATCTCTAATTTCTCCTGAATATAGGCTGTT	139437
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177372	ATGCTTGCCCTCTATGTATTATCTCTAATTTCTCCTGAATATAGGCTGTT	177421

C  FP104545.5	139436	AAAATAATAATAACAATATTTAACATTAATATAGTACTTACTGTGTGCCA	139387
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177422	AAAATAATAATAACAATATTTAACATTAATATAGTACTTACTGTGTGCCA	177471

C  FP104545.5	139386	GGCACTGTGCTAATATATTGACAACAACCCTGGGAGGTAGATGTTATTAT	139337
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177472	GGCACTGTGCTAATATATTGACAACAACCCTGGGAGGTAGATGTTATTAT	177521

C  FP104545.5	139336	TATCCCCATTTTACAAATGAGGAAACTGAGGCAGACTTAAGTGACTTGCT	139287
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177522	TATCCCCATTTTACAAATGAGGAAACTGAGGCAGACTTAAGTGACTTGCT	177571

C  FP104545.5	139286	CAGGATCTCACACTAGTAAGTGTCTGAGGCCAGATTTGAACTCAGATATT	139237
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177572	CAGGATCTCACACTAGTAAGTGTCTGAGGCCAGATTTGAACTCAGATATT	177621

C  FP104545.5	139236	CCTGACTCCAGGTCTGGTATTCTCTTCCACAGAACCACTTAGCTGCCTCT	139187
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177622	CCTGACTCCAGGTCTGGTATTCTCTTCCACAGAACCACTTAGCTGCCTCT	177671

C  FP104545.5	139186	GTACTATAAGCTTCTTGAGAGCACGGACTGGGTTTTTTATCTGACTTTTC	139137
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177672	GTACTATAAGCTTCTTGAGAGCACGGACTGGGTTTTTTATCTGACTTTTC	177721

C  FP104545.5	139136	TTTGTATCTCCAGCACTTAGCACAGTATCTGATACATACAATTTTCATTT	139087
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177722	TTTGTATCTCCAGCACTTAGCACAGTATCTGATACATACAATTTTCATTT	177771

C  FP104545.5	139086	TATGTATGTATTTAAAAAATGTTTGTTGACATGAATATATATTTTTCATC	139037
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177772	TATGTATGTATTTAAAAAATGTTTGTTGACATGAATATATATTTTTCATC	177821

C  FP104545.5	139036	TATTAATTTTTCCCACATAGATTGCCAATTATATATATATGTATATTTAA	138987
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177822	TATTAATTTTTCCCACATAGATTGCCAATTATATATATATGTATATTTAA	177871

C  FP104545.5	138986	GCTACCACAGCTCTCATTCAGGAAGTTCTGTACTGTTTCAGGGTTTGGCA	138937
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177872	GCTACCACAGCTCTCATTCAGGAAGTTCTGTACTGTTTCAGGGTTTGGCA	177921

C  FP104545.5	138936	AAATCCATGCACATCATCAGCAGAGGCAGTGGAGTATAGTAGATAAGGCA	138887
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177922	AAATCCATGCACATCATCAGCAGAGGCAGTGGAGTATAGTAGATAAGGCA	177971

C  FP104545.5	138886	TTGGACTTAAAGTCAGGAGGTCCTGGGTTCACTCACTTCAAACACTGTAT	138837
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	177972	TTGGACTTAAAGTCAGGAGGTCCTGGGTTCACTCACTTCAAACACTGTAT	178021

C  FP104545.5	138836	GATCCTTGATAAATCATTTAACCTCTCTAGACTTGTTTCCTTATCTGTAA	138787
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178022	GATCCTTGATAAATCATTTAACCTCTCTAGACTTGTTTCCTTATCTGTAA	178071

C  FP104545.5	138786	AATGAGGTTTGGTCTTTATGGATTCTAAGGTACTTTCCAGATCTAAGTTT	138737
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178072	AATGAGGTTTGGTCTTTATGGATTCTAAGGTACTTTCCAGATCTAAGTTT	178121

C  FP104545.5	138736	ATGATCAGAAATAGAATCTATATGACCTCAAAATACAAAGGGAATAACTC	138687
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178122	ATGATCAGAAATAGAATCTATATGACCTCAAAATACAAAGGGAATAACTC	178171

C  FP104545.5	138686	TTCTATGTAGTAGTGGCACAGGATAATGCTCCAAGGCAGTGTCAAATACA	138637
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178172	TTCTATGTAGTAGTGGCACAGGATAATGCTCCAAGGCAGTGTCAAATACA	178221

C  FP104545.5	138636	CCTGGAAAGCATACATCTCCCTGTGTTATCACTCAATTGGGGTACTAATC	138587
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178222	CCTGGAAAGCATACATCTCCCTGTGTTATCACTCAATTGGGGTACTAATC	178271

C  FP104545.5	138586	AGAGAATCATTGAGCATAGTTATCTCCTTCTACGAGGGAATTTTGCAGAC	138537
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178272	AGAGAATCATTGAGCATAGTTATCTCCTTCTACGAGGGAATTTTGCAGAC	178321

C  FP104545.5	138536	ACATTGGAGGTGAAGTTTTAAATCTACGTTTCCTTACACCACATCAAATG	138487
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178322	ACATTGGAGGTGAAGTTTTAAATCTACGTTTCCTTACACCACATCAAATG	178371

C  FP104545.5	138486	CTTGCAGGGGTGTGTTTAATAAAAAAAAAAAAAGCATTCCCCACCCCCCT	138437
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178372	CTTGCAGGGGTGTGTTTAATAAAAAAAAAAAAAGCATTCCCCACCCCCCT	178421

C  FP104545.5	138436	TTAATTGAAAGATGATGTGAGGACAAGCTCTTCAATAGAAAGCTATCTGG	138387
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178422	TTAATTGAAAGATGATGTGAGGACAAGCTCTTCAATAGAAAGCTATCTGG	178471

C  FP104545.5	138386	GAAAGCCTGTCTGTTACCTGCCCTTATCTTCATCTAAGATATACTCCATA	138337
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178472	GAAAGCCTGTCTGTTACCTGCCCTTATCTTCATCTAAGATATACTCCATA	178521

C  FP104545.5	138336	GGAGCATATTTCATCCTCATAAAAATTTCATAGTACTGAGAAAGGAGGCA	138287
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178522	GGAGCATATTTCATCCTCATAAAAATTTCATAGTACTGAGAAAGGAGGCA	178571

C  FP104545.5	138286	TGTGAGTTTGCTTGACTTTGGTGGGGAGAGCGGTTAATAATTATATCTGG	138237
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178572	TGTGAGTTTGCTTGACTTTGGTGGGGAGAGCGGTTAATAATTATATCTGG	178621

C  FP104545.5	138236	AATTTAAAAATAACAACAACATTCTTTGTTCATACTGTCCAGAAGGAAGA	138187
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178622	AATTTAAAAATAACAACAACATTCTTTGTTCATACTGTCCAGAAGGAAGA	178671

C  FP104545.5	138186	ATGGAATTCCTTGGGATTCCACTCCATTCAGGAGAAGGTGGTTTCGCCAT	138137
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178672	ATGGAATTCCTTGGGATTCCACTCCATTCAGGAGAAGGTGGTTTCGCCAT	178721

C  FP104545.5	138136	TTATTGAGCATGCCGTTAAAAGCATTCTTGGTTAAGTACAGTTGAATTAG	138087
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178722	TTATTGAGCATGCCGTTAAAAGCATTCTTGGTTAAGTACAGTTGAATTAG	178771

C  FP104545.5	138086	ATGGCTTACTGAAGTCCCTTCCAAGTCTGGGATTCTACCATCTGTTAGCT	138037
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178772	ATGGCTTACTGAAGTCCCTTCCAAGTCTGGGATTCTACCATCTGTTAGCT	178821

C  FP104545.5	138036	CTCTGCTATGCACCTGTAAACTAAGCCATCTTAGACTATTATATCATATT	137987
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178822	CTCTGCTATGCACCTGTAAACTAAGCCATCTTAGACTATTATATCATATT	178871

C  FP104545.5	137986	TAAAAAAAATAATCTTAAATCAACATGTCCATTTTAGTCATGGGATCTTG	137937
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178872	TAAAAAAAATAATCTTAAATCAACATGTCCATTTTAGTCATGGGATCTTG	178921

C  FP104545.5	137936	GATTTAAAGTTAGAAGGGACCTTAGACTATTCCAACTTCATCTTTTCTAA	137887
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178922	GATTTAAAGTTAGAAGGGACCTTAGACTATTCCAACTTCATCTTTTCTAA	178971

C  FP104545.5	137886	CCTAGTTGTTTTATAGATGAGGAGGAGGGGAAGGGGAATAAGCATTTATT	137837
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	178972	CCTAGTTGTTTTATAGATGAGGAGGAGGGGAAGGGGAATAAGCATTTATT	179021

C  FP104545.5	137836	AAGTGTTTACTAGGTGCCAGGCACTGTGCTAGGTGGTTTACATATGTCTC	137787
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	179022	AAGTGTTTACTAGGTGCCAGGCACTGTGCTAGGTGGTTTACATATGTCTC	179071

C  FP104545.5	137786	ATTTGACCCTCACAACAACCCTATGAGGTGGGTGGGTGCTATTATTATCC	137737
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	179072	ATTTGACCCTCACAACAACCCTATGAGGTGGGTGGGTGCTATTATTATCC	179121

C  FP104545.5	137736	TTATTTTACAGTTAAGGAAACTGAGTCAATCAGGTTAAGTGACTTGTCCT	137687
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	179122	TTATTTTACAGTTAAGGAAACTGAGTCAATCAGGTTAAGTGACTTGTCCT	179171

C  FP104545.5	137686	GGGTTGCCCAGGTAAGTGGTATCCTTATGTCTACAGGTTCTCTGAAGCTT	137637
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU464026.9	179172	GGGTTGCCCAGGTAAGTGGTATCCTTATGTCTACAGGTTCTCTGAAGCTT	179221

Overview

Query
FP104545.5 - 139636 bps
Hit
CU464026.9 - 179221 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002000137637139636-11772221792211
Short-link