<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210874.8	1	GAATTCAAGTCCCAACTGACCGTTTGAGAGAGCTTGGGTTAGTCAGGAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107655	GAATTCAAGTCCCAACTGACCGTTTGAGAGAGCTTGGGTTAGTCAGGAGC	107704

CU210874.8	51	CTGTCCAAGCTTTCTGTTTGCAAGCAAGAAAGTGCATGCAGTACAGAAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107705	CTGTCCAAGCTTTCTGTTTGCAAGCAAGAAAGTGCATGCAGTACAGAAAC	107754

CU210874.8	101	TGCACACACAACCTCTCCATTATTAGGATGGAAGGTTTTATTGTGACTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107755	TGCACACACAACCTCTCCATTATTAGGATGGAAGGTTTTATTGTGACTAA	107804

CU210874.8	151	GAGAAAGAACAGCCAGAGGCATCTGCGGGAGTCTGCCATGGCTACCTCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107805	GAGAAAGAACAGCCAGAGGCATCTGCGGGAGTCTGCCATGGCTACCTCTC	107854

CU210874.8	201	AGGGATGGAGAGAGGACCAGAGAGAAAAAGCAGGGAGAGGTGCAGGCTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107855	AGGGATGGAGAGAGGACCAGAGAGAAAAAGCAGGGAGAGGTGCAGGCTGG	107904

CU210874.8	251	CAATCGGCAGGGCTGTGGGAGCTGCAAAGCTAGGAAAAATGGTGGGAGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107905	CAATCGGCAGGGCTGTGGGAGCTGCAAAGCTAGGAAAAATGGTGGGAGAG	107954

CU210874.8	301	TCCTGCCCGTAATGAGGGGCTATGCTGCGGTGGGGGTGGGGGGAGGGCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	107955	TCCTGCCCGTAATGAGGGGCTATGCTGCGGTGGGGGTGGGGGGAGGGCAA	108004

CU210874.8	351	GTTAGCTGGCACAGCCTGGGAGTTAGCATGGGCTCTGATCTATTGGAGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108005	GTTAGCTGGCACAGCCTGGGAGTTAGCATGGGCTCTGATCTATTGGAGGC	108054

CU210874.8	401	TTGTCTGAATTAATAGAGAACTAGATACTCTCCGGAGATCAGGGGGTGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108055	TTGTCTGAATTAATAGAGAACTAGATACTCTCCGGAGATCAGGGGGTGGG	108104

CU210874.8	451	GAGGGCTTGTAGGAGCGGATAAGAAAGTAATGGCTTTCTCCTGCATACAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108105	GAGGGCTTGTAGGAGCGGATAAGAAAGTAATGGCTTTCTCCTGCATACAG	108154

CU210874.8	501	AAACCCACTTTACAAGGTTTCTGAGGAGTGCCGAGTGGGTACTGGGTCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108155	AAACCCACTTTACAAGGTTTCTGAGGAGTGCCGAGTGGGTACTGGGTCAC	108204

CU210874.8	551	AGTTCAGCCTGAGCTGAGCCCAGATTGTCATTTTGGGGGGCTAAGACCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108205	AGTTCAGCCTGAGCTGAGCCCAGATTGTCATTTTGGGGGGCTAAGACCAG	108254

CU210874.8	601	ACACTCTCTACTTCTCATAATGGGGTATCCTTGTCTATCCATGTCGAACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108255	ACACTCTCTACTTCTCATAATGGGGTATCCTTGTCTATCCATGTCGAACT	108304

CU210874.8	651	GATGGTCTAGCTCACTGAAAAGATGGGAGATGCTTGTGGGAGGTCAGAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108305	GATGGTCTAGCTCACTGAAAAGATGGGAGATGCTTGTGGGAGGTCAGAAC	108354

CU210874.8	701	AGAGCAGAAGAACCTGCAATGGATCCCTGGGTCCCCTTAGAAAATGCAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108355	AGAGCAGAAGAACCTGCAATGGATCCCTGGGTCCCCTTAGAAAATGCAGA	108404

CU210874.8	751	GCCTGGGCAAGCTGCCTATCTCCCAGAGCATCGCCCCTGGCTCTGTGATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108405	GCCTGGGCAAGCTGCCTATCTCCCAGAGCATCGCCCCTGGCTCTGTGATC	108454

CU210874.8	801	CCCAAGGGAGAATTGGAAATGCCTCTAGCAGGGTCCAAGACAGAAAGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108455	CCCAAGGGAGAATTGGAAATGCCTCTAGCAGGGTCCAAGACAGAAAGAGA	108504

CU210874.8	851	GTATTTATCCAGAGCTGACCCTGTGTCAACATTGTGCAAGCCGGTTTGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108505	GTATTTATCCAGAGCTGACCCTGTGTCAACATTGTGCAAGCCGGTTTGTG	108554

CU210874.8	901	TGAATTGTGGTTCTTGATTCTTCCCAGCTCCAGTAAGAACACCCATACTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108555	TGAATTGTGGTTCTTGATTCTTCCCAGCTCCAGTAAGAACACCCATACTA	108604

CU210874.8	951	ACACTTACTAACAACACACTCCAGCTTGCAGATGTAAGAACCGGTCACAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108605	ACACTTACTAACAACACACTCCAGCTTGCAGATGTAAGAACCGGTCACAC	108654

CU210874.8	1001	CCAGGTGTGATGGTTCACACCTTATCCAGGCAGTGGGGAGGCAGAGGCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108655	CCAGGTGTGATGGTTCACACCTTATCCAGGCAGTGGGGAGGCAGAGGCAG	108704

CU210874.8	1051	GCAGATCTCTTTGAGTTCAAGGCCAGCTGGATGTGTGTAATGAGCCAAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108705	GCAGATCTCTTTGAGTTCAAGGCCAGCTGGATGTGTGTAATGAGCCAAAG	108754

CU210874.8	1101	CTACATAGTGAGACCCTGGGTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108755	CTACATAGTGAGACCCTGGGTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACAC	108804

CU210874.8	1151	AATTAACAAGAAGAACCGAGCACAAAGAGGCCCACAGCTAGTGTGTGACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108805	AATTAACAAGAAGAACCGAGCACAAAGAGGCCCACAGCTAGTGTGTGACC	108854

CU210874.8	1201	CACGCAAGATGTGAAGCAGGCAGTTGAATGAGAGAGCCCACCCTGCCGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108855	CACGCAAGATGTGAAGCAGGCAGTTGAATGAGAGAGCCCACCCTGCCGCA	108904

CU210874.8	1251	GTGGCCCTGCCACGTGGAAGGTGAATGCTTAGGCTGCAGCCTCTGAATGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108905	GTGGCCCTGCCACGTGGAAGGTGAATGCTTAGGCTGCAGCCTCTGAATGG	108954

CU210874.8	1301	ATGAGTTGGAGGTGTGTAAGCACGCCTGGTTCATCTTCTCCCCCTGCCAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	108955	ATGAGTTGGAGGTGTGTAAGCACGCCTGGTTCATCTTCTCCCCCTGCCAC	109004

CU210874.8	1351	CCGGTGAGGAAGCCCAGGAAGCAGGCAGCAGTGGGGTTCCCTTGTCTAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109005	CCGGTGAGGAAGCCCAGGAAGCAGGCAGCAGTGGGGTTCCCTTGTCTAAC	109054

CU210874.8	1401	TCCCAGCAATGCCGCCACACTCCTCAGTGCAGCATCTCCACCGGGCGCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109055	TCCCAGCAATGCCGCCACACTCCTCAGTGCAGCATCTCCACCGGGCGCTG	109104

CU210874.8	1451	GGGCCCCACAGCACGCCTCCCATGGCAGAAGCTCTCTTGGCTCCCTCTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109105	GGGCCCCACAGCACGCCTCCCATGGCAGAAGCTCTCTTGGCTCCCTCTGC	109154

CU210874.8	1501	TAATTCATTTGCTCCCATGTTAACTTTTATTACTTATTGATTTTCCTCCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109155	TAATTCATTTGCTCCCATGTTAACTTTTATTACTTATTGATTTTCCTCCA	109204

CU210874.8	1551	GCCTCCCCTGGCTATCTCCATGTTGATCTGCTTAGCTTAGTGGAAGGTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109205	GCCTCCCCTGGCTATCTCCATGTTGATCTGCTTAGCTTAGTGGAAGGTAC	109254

CU210874.8	1601	TCAATGGGAGAGGTAGAATGTGGTATTCTGTGGCTGCAGATGGGCACCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109255	TCAATGGGAGAGGTAGAATGTGGTATTCTGTGGCTGCAGATGGGCACCCA	109304

CU210874.8	1651	TACTAATGGGGACCAGGGCCTTTGTGGGGGGCAGCGGTCACCCATCACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109305	TACTAATGGGGACCAGGGCCTTTGTGGGGGGCAGCGGTCACCCATCACTC	109354

CU210874.8	1701	TAACACCCTGTTGAGCTAAGGAAGCCCAAGGGGTGGGGCTCCCATCTGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109355	TAACACCCTGTTGAGCTAAGGAAGCCCAAGGGGTGGGGCTCCCATCTGCT	109404

CU210874.8	1751	TCCTTAGACGGTACCAGCAGTGAGCTCAGCCTCTGCAAGACGCCTGGTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109405	TCCTTAGACGGTACCAGCAGTGAGCTCAGCCTCTGCAAGACGCCTGGTGA	109454

CU210874.8	1801	GGACCCTGGGCTTGGAGCAAGAACAGAATAAGCAGCAGACTGGGGGGTAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109455	GGACCCTGGGCTTGGAGCAAGAACAGAATAAGCAGCAGACTGGGGGGTAG	109504

CU210874.8	1851	GGGGGACATGCTGAATCAGGTCTCAGGTGAGGAGACGAAAGGGAGGGAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109505	GGGGGACATGCTGAATCAGGTCTCAGGTGAGGAGACGAAAGGGAGGGAGG	109554

CU210874.8	1901	GTCTTAGCAAGGGTCACACAGAAAGGATGATGGTCTATGAGACAAGGGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109555	GTCTTAGCAAGGGTCACACAGAAAGGATGATGGTCTATGAGACAAGGGGG	109604

CU210874.8	1951	CCACTAGAGGCTGGGCCCCACAGGAAGCTGGGGTGTTCTGTACTGAACAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463837.8	109605	CCACTAGAGGCTGGGCCCCACAGGAAGCTGGGGTGTTCTGTACTGAACAC	109654

Overview

Query
CU210874.8 - 54854 bps
Hit
CU463837.8 - 109654 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link