<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CU570767.2	2000	GAATTCTTTTACTCTACCCTGCTAGAAATCATATAGGGGAAGAGAAACTA	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1	GAATTCTTTTACTCTACCCTGCTAGAAATCATATAGGGGAAGAGAAACTA	50

C  CU570767.2	1950	TTCCTGTGCCAATAATTCTAGGACTAGTGTGTCCAAAGCCTGGAGTGTGG	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	51	TTCCTGTGCCAATAATTCTAGGACTAGTGTGTCCAAAGCCTGGAGTGTGG	100

C  CU570767.2	1900	ACTGACCTAATGGTACACAGAACAGAGGCTAACAATTATCTGCCCTGAGA	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	101	ACTGACCTAATGGTACACAGAACAGAGGCTAACAATTATCTGCCCTGAGA	150

C  CU570767.2	1850	ACTACTTAGCTGTTCCAGTCCAATACAAAGGGTTTACATGTCTTGAGGAA	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	151	ACTACTTAGCTGTTCCAGTCCAATACAAAGGGTTTACATGTCTTGAGGAA	200

C  CU570767.2	1800	TATGGAATTTTAGTATAACAAGCTGAGATCACTTAGAAGTAGTTTGAAGA	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	201	TATGGAATTTTAGTATAACAAGCTGAGATCACTTAGAAGTAGTTTGAAGA	250

C  CU570767.2	1750	TTTACAAATGTACAAATGTTCATCTGCACATACATAAATTTGTAAATTTT	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	251	TTTACAAATGTACAAATGTTCATCTGCACATACATAAATTTGTAAATTTT	300

C  CU570767.2	1700	AGAAAATCTTGCAAATATACCCATAAATTTTTGTTTACCGTTGTTTCTTC	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	301	AGAAAATCTTGCAAATATACCCATAAATTTTTGTTTACCGTTGTTTCTTC	350

C  CU570767.2	1650	TCCTATAATATCACTATTTTTTAATTATTTACATCTTAGAAAATTCTGAC	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	351	TCCTATAATATCACTATTTTTTAATTATTTACATCTTAGAAAATTCTGAC	400

C  CU570767.2	1600	AATTATTTCTCATATTTTTTTCTTTAATGGTTTGTTAAATGGTAGATTAA	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	401	AATTATTTCTCATATTTTTTTCTTTAATGGTTTGTTAAATGGTAGATTAA	450

C  CU570767.2	1550	AAAGTTGACAGTTTGCAAAATTGGAATGTTTACATGTTCTGTAAACAGGA	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	451	AAAGTTGACAGTTTGCAAAATTGGAATGTTTACATGTTCTGTAAACAGGA	500

C  CU570767.2	1500	TCCATAAAAGAATTATTAAGTTCTACATTACATGTGTGTATAATTTCATC	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	501	TCCATAAAAGAATTATTAAGTTCTACATTACATGTGTGTATAATTTCATC	550

C  CU570767.2	1450	TGAAGAATTTAAAGACTTTTATGAGAGGAAATACCCTGCTTCATAAAGCT	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	551	TGAAGAATTTAAAGACTTTTATGAGAGGAAATACCCTGCTTCATAAAGCT	600

C  CU570767.2	1400	ATTAAGGCAGTAAGTACCACTTATATTTAATACTTAATGTTTTGCTAACC	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	601	ATTAAGGCAGTAAGTACCACTTATATTTAATACTTAATGTTTTGCTAACC	650

C  CU570767.2	1350	GGTGTAGAGTGCAGAGGTAACAGGTATATCAGGGGCCGGACAATGGCTGA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	651	GGTGTAGAGTGCAGAGGTAACAGGTATATCAGGGGCCGGACAATGGCTGA	700

C  CU570767.2	1300	GAATGCATACAGAGAATTTTTAAGGCTCCTGAGATATTAGCAAGTGATTT	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	701	GAATGCATACAGAGAATTTTTAAGGCTCCTGAGATATTAGCAAGTGATTT	750

C  CU570767.2	1250	AAATTCTTCCCAGATGAAAATATTTAAGTACTGGACTAACCTACTAAAGT	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	751	AAATTCTTCCCAGATGAAAATATTTAAGTACTGGACTAACCTACTAAAGT	800

C  CU570767.2	1200	TATTTAGTAGCAATCATACATTTCCATTATTTGTAATTAAAAAAAAATCA	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	801	TATTTAGTAGCAATCATACATTTCCATTATTTGTAATTAAAAAAAAATCA	850

C  CU570767.2	1150	TGCTGAATAAAGAGAATACTCTAAGACAAAGTTACGTTTATTAAAGGTTC	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	851	TGCTGAATAAAGAGAATACTCTAAGACAAAGTTACGTTTATTAAAGGTTC	900

C  CU570767.2	1100	CTTTAAGGCAGCCAGGAAGAGCACAGCAATTTTGTTTGCTTACTTGGACA	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	901	CTTTAAGGCAGCCAGGAAGAGCACAGCAATTTTGTTTGCTTACTTGGACA	950

C  CU570767.2	1050	GACTGTGCACCCTTTCAGGAGCACTTCAGGATCCTCAGTTACCTATTCAT	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	951	GACTGTGCACCCTTTCAGGAGCACTTCAGGATCCTCAGTTACCTATTCAT	1000

C  CU570767.2	1000	TATCAGAACTTTCTTCAGACTCAGTGTTTTTCTCAGTGCTGCCTTCACTT	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1001	TATCAGAACTTTCTTCAGACTCAGTGTTTTTCTCAGTGCTGCCTTCACTT	1050

C  CU570767.2	950	CCTTGTTCCTTAAGCTATAGATGATGGGGTTCAGCATGGATGTCACCGCT	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1051	CCTTGTTCCTTAAGCTATAGATGATGGGGTTCAGCATGGATGTCACCGCT	1100

C  CU570767.2	900	GTGTAGAAAAGGGCCAAGAGTTTATCCACTTCTGGTGAGTGATCAGATTT	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1101	GTGTAGAAAAGGGCCAAGAGTTTATCCACTTCTGGTGAGTGATCAGATTT	1150

C  CU570767.2	850	GGGCCTCAAATAGGTGGCAGACGTTGAGCCATAGAAGAGTGTGACTACAA	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1151	GGGCCTCAAATAGGTGGCAGACGTTGAGCCATAGAAGAGTGTGACTACAA	1200

C  CU570767.2	800	GTAGATGGGAAGAACAGATGGAGAGAGCTTTATGGCGCCCCTCACGTGAG	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1201	GTAGATGGGAAGAACAGATGGAGAGAGCTTTATGGCGCCCCTCACGTGAG	1250

C  CU570767.2	750	GGCATTACCAGCACTGCAATCAGAATTCTGACATAGGAAGAAATAATCAG	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1251	GGCATTACCAGCACTGCAATCAGAATTCTGACATAGGAAGAAATAATCAG	1300

C  CU570767.2	700	CAAAAATGGACTAAATATGCAGAGGACTGCCGCCACAAAAATTGCAGCCT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1301	CAAAAATGGACTAAATATGCAGAGGACTGCCGCCACAAAAATTGCAGCCT	1350

C  CU570767.2	650	CATTTTGGGATGTATCTCCACAGGCAAGTGCCAGGACAGGTGGAAGGTCA	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1351	CATTTTGGGATGTATCTCCACAGGCAAGTGCCAGGACAGGTGGAAGGTCA	1400

C  CU570767.2	600	CAGAAGAAGTGGTCTATCTCACAGGGTCCACAGAAGTTCAACGAGAAAAT	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1401	CAGAAGAAGTGGTCTATCTCACAGGGTCCACAGAAGTTCAACGAGAAAAT	1450

C  CU570767.2	550	AAAATTGGTCTGTCCCAACCCTACTATACATCCCATTCCCCATGAAACTA	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1451	AAAATTGGTCTGTCCCAACCCTACTATACATCCCATTCCCCATGAAACTA	1500

C  CU570767.2	500	TGGCCAAATGGGCACATACCCCACGACTCATTCGTGTTGCATAGTGGAGT	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1501	TGGCCAAATGGGCACATACCCCACGACTCATTCGTGTTGCATAGTGGAGT	1550

C  CU570767.2	450	GGGGAGCATATGGCCATGTAGCGGTCAAAAGCCATGGCTGCCAATAGACA	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1551	GGGGAGCATATGGCCATGTAGCGGTCAAAAGCCATGGCTGCCAATAGACA	1600

C  CU570767.2	400	GCACTCAGTTATACCAAAGAATATAAAGAAAAACATCTGTGTGGCACACC	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1601	GCACTCAGTTATACCAAAGAATATAAAGAAAAACATCTGTGTGGCACACC	1650

C  CU570767.2	350	CTTCCCGTGAGATCCCTCGGGCCTCACTTACAAGGCTCTGTAACATCTTG	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1651	CTTCCCGTGAGATCCCTCGGGCCTCACTTACAAGGCTCTGTAACATCTTG	1700

C  CU570767.2	300	GGTATGACAGAGCAAGTGTAGCCGATCTCCAGGAGAGACAAATTGGCCAG	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1701	GGTATGACAGAGCAAGTGTAGCCGATCTCCAGGAGAGACAAATTGGCCAG	1750

C  CU570767.2	250	AAAGAAGTACATTGGGGTATGTAGGGCTGCACTGGTGCAGATGGCAAGGG	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1751	AAAGAAGTACATTGGGGTATGTAGGGCTGCACTGGTGCAGATGGCAAGGG	1800

C  CU570767.2	200	CTATGAGTGAATTTCCTGTCAGTGATACTAAGAACATGAGGAGGATGAGG	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1801	CTATGAGTGAATTTCCTGTCAGTGATACTAAGAACATGAGGAGGATGAGG	1850

C  CU570767.2	150	GTGAACAGGAGGAAGCATTCTCCAGGGACCTCAGAGAACTTGGCAAATGC	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1851	GTGAACAGGAGGAAGCATTCTCCAGGGACCTCAGAGAACTTGGCAAATGC	1900

C  CU570767.2	100	AAAGCGTTTGACAGACAAGCTGTTCTCCTGCCACAGAGAGCAGTTGATAC	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1901	AAAGCGTTTGACAGACAAGCTGTTCTCCTGCCACAGAGAGCAGTTGATAC	1950

C  CU570767.2	50	TCATCTCCTGAAAGAAAGGACAGCAAATCATTACAATTCTTGCAGATGGG	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU463330.8	1951	TCATCTCCTGAAAGAAAGGACAGCAAATCATTACAATTCTTGCAGATGGG	2000

Overview

Query
CU570767.2 - 33468 bps
Hit
CU463330.8 - 160046 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link