<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463831.7	1	GAATTCTGCCAAACTCTATCTATCCCAGTTGTACATTCTGGCTCTGGAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	90709	GAATTCTGCCAAACTCTATCTATCCCAGTTGTACATTCTGGCTCTGGAAA	90758

CU463831.7	51	AACAACCACAGGATGAATACAGGAACCTACTGGACCGAGTGAGAATCAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	90759	AACAACCACAGGATGAATACAGGAACCTACTGGACCGAGTGAGAATCAGA	90808

CU463831.7	101	CTTCTACCAAATTTTCATTAATCACCAGACCTATATAAGACCCTACTTTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	90809	CTTCTACCAAATTTTCATTAATCACCAGACCTATATAAGACCCTACTTTA	90858

CU463831.7	151	ACTGCAGGGCCATATATTTCTTAGAATCTCAAGCAATCAGCATTAATTTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	90859	ACTGCAGGGCCATATATTTCTTAGAATCTCAAGCAATCAGCATTAATTTG	90908

CU463831.7	201	GACCAGTATCCAATGGACAAGGGAAAGTCTGATTATTTCTCTCCCCCCTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	90909	GACCAGTATCCAATGGACAAGGGAAAGTCTGATTATTTCTCTCCCCCCTC	90958

CU463831.7	251	CCTGTGTATGGTTACCCTAGTGAAAGCCTGTAGGTCCCACCAGAAAAGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	90959	CCTGTGTATGGTTACCCTAGTGAAAGCCTGTAGGTCCCACCAGAAAAGGA	91008

CU463831.7	301	TTGGAGAAAGGCCAGCAGAAAACATTTTAGGTACTTTTTAGGTACTTACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91009	TTGGAGAAAGGCCAGCAGAAAACATTTTAGGTACTTTTTAGGTACTTACT	91058

CU463831.7	351	AAGTCAAACCTGACCATCGTTCATTCAAGGGGTTCTGGGTCTGCAAACTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91059	AAGTCAAACCTGACCATCGTTCATTCAAGGGGTTCTGGGTCTGCAAACTG	91108

CU463831.7	401	ACTCAAGTCTAGAAACTGATTCACGGGCAGAGCTGTTCCTTTGCCAGTAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91109	ACTCAAGTCTAGAAACTGATTCACGGGCAGAGCTGTTCCTTTGCCAGTAT	91158

CU463831.7	451	TATGTAGCCTTTCTCTCATTTTAGACAATTTTCCCACTTACATGATCAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91159	TATGTAGCCTTTCTCTCATTTTAGACAATTTTCCCACTTACATGATCAAG	91208

CU463831.7	501	CAAAAATTCAGTAGGTATCTGTGTTGCTTTGATTAAGAATATTTGCCTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91209	CAAAAATTCAGTAGGTATCTGTGTTGCTTTGATTAAGAATATTTGCCTGG	91258

CU463831.7	551	CTGTGTTTGTGCAAACCCAGAGGCAGACAGATCTCTGAGTTTGAGACCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91259	CTGTGTTTGTGCAAACCCAGAGGCAGACAGATCTCTGAGTTTGAGACCAG	91308

CU463831.7	601	CCTAGTGTACAGAGTAGGTTCCAGGACAGCCATGGAAAAACCTGTAGCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91309	CCTAGTGTACAGAGTAGGTTCCAGGACAGCCATGGAAAAACCTGTAGCTA	91358

CU463831.7	651	GTCTTTGCTACTGTGTTGGTTCTTTTTTCTCACCCTATATCCTCGTGGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91359	GTCTTTGCTACTGTGTTGGTTCTTTTTTCTCACCCTATATCCTCGTGGTT	91408

CU463831.7	701	TCACCCACTATGACTATATAGGAAAGAAGAAAGGAAAGAGGGAGAGAGAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91409	TCACCCACTATGACTATATAGGAAAGAAGAAAGGAAAGAGGGAGAGAGAG	91458

CU463831.7	751	AGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAAAGACAGAGAGACAGAGACAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91459	AGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAAAGACAGAGAGACAGAGACAG	91508

CU463831.7	801	AGAGAGAGAGGGAGAGGAGGACAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91509	AGAGAGAGAGGGAGAGGAGGACAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	91558

CU463831.7	851	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTAGAGAGAGAGACCTGAATCTAATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91559	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTAGAGAGAGAGACCTGAATCTAATT	91608

CU463831.7	901	TCTTTCCCAATCATTTCTCCCAGTTTCCAGCCCAGTTCCTTCAAATGTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91609	TCTTTCCCAATCATTTCTCCCAGTTTCCAGCCCAGTTCCTTCAAATGTTT	91658

CU463831.7	951	CTCCCAGCCTTTCCTCCCTCAGTTTCCCAACAGTCTGCTTAAACACTCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91659	CTCCCAGCCTTTCCTCCCTCAGTTTCCCAACAGTCTGCTTAAACACTCCC	91708

CU463831.7	1001	TCCTCCCAGTTTTCCCAATGCCAGCAGTTCCAAACTGTAACAATTGTTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91709	TCCTCCCAGTTTTCCCAATGCCAGCAGTTCCAAACTGTAACAATTGTTCT	91758

CU463831.7	1051	AGCCTCTCTGCTCAGTCAGCTCCTCCTGGCTCTACTGTCTCCCAACAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91759	AGCCTCTCTGCTCAGTCAGCTCCTCCTGGCTCTACTGTCTCCCAACAATA	91808

CU463831.7	1101	TCTTCTGCACCAACTGCTTCTCCTCTCACTCTGCTCACCCAATCCTCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91809	TCTTCTGCACCAACTGCTTCTCCTCTCACTCTGCTCACCCAATCCTCTTT	91858

CU463831.7	1151	CTCAGCCTCGGCGTTTTAAAATAACCTATCCTGTTCCTAGAAATCCAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91859	CTCAGCCTCGGCGTTTTAAAATAACCTATCCTGTTCCTAGAAATCCAAGG	91908

CU463831.7	1201	GGCAACAAGCCATAAGGTTATAGTTTCAGGCAGTTCTAACAGCTAAGAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91909	GGCAACAAGCCATAAGGTTATAGTTTCAGGCAGTTCTAACAGCTAAGAAT	91958

CU463831.7	1251	TCTAAAGGGCCGGTTGCCTAGCAACTGGGTACCTTTTAAAGGGCCAGGTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	91959	TCTAAAGGGCCGGTTGCCTAGCAACTGGGTACCTTTTAAAGGGCCAGGTA	92008

CU463831.7	1301	CACAAGATAAAGCACACTACAGACACACAGTTTAAAAACAAAAACAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92009	CACAAGATAAAGCACACTACAGACACACAGTTTAAAAACAAAAACAAAAA	92058

CU463831.7	1351	CAAAAAGGAACAGAAAATATATTCAATATTCAGCCCCATAAGCTCATAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92059	CAAAAAGGAACAGAAAATATATTCAATATTCAGCCCCATAAGCTCATAAA	92108

CU463831.7	1401	TTTGAATTCTTGGTCTTCAGGGAGTGGAAGTACTTGTGGCAATTAGAGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92109	TTTGAATTCTTGGTCTTCAGGGAGTGGAAGTACTTGTGGCAATTAGAGGA	92158

CU463831.7	1451	TGTGGTTTTGGTAGAGGAAGCCTGTCAATGGGGTGGGAACTGGGGCTACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92159	TGTGGTTTTGGTAGAGGAAGCCTGTCAATGGGGTGGGAACTGGGGCTACA	92208

CU463831.7	1501	AAGCCAAGATAGTTGCAGAGGCGCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCTCTCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92209	AAGCCAAGATAGTTGCAGAGGCGCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCTCTCTT	92258

CU463831.7	1551	TCTCCTCTCTCCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92259	TCTCCTCTCTCCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTC	92308

CU463831.7	1601	TCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCCTGGCTGTGCATCCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92309	TCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCCTGGCTGTGCATCCAG	92358

CU463831.7	1651	TGTAGAGCTCTCACCTACTTCTCCAGCACCACGTGTGCCTGCGTGCCTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92359	TGTAGAGCTCTCACCTACTTCTCCAGCACCACGTGTGCCTGCGTGCCTCC	92408

CU463831.7	1701	ATGCTGCCCGCCATTACAGTAATGTAACAAACCTCTCAAGCTATAAGCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92409	ATGCTGCCCGCCATTACAGTAATGTAACAAACCTCTCAAGCTATAAGCAC	92458

CU463831.7	1751	GCCCCAATTAAATGCTTCATTTCATAAGTGTGGCCACGATCATGATTTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92459	GCCCCAATTAAATGCTTCATTTCATAAGTGTGGCCACGATCATGATTTGT	92508

CU463831.7	1801	CTCACAGCAATGGGACACTGACTCAGAGTTTGCTACCAAGGAGCATGGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92509	CTCACAGCAATGGGACACTGACTCAGAGTTTGCTACCAAGGAGCATGGCA	92558

CU463831.7	1851	CTGCTGTCACAGGCCTGACAGTGCTGCTTGCAGGTGCAATGAGGATTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92559	CTGCTGTCACAGGCCTGACAGTGCTGCTTGCAGGTGCAATGAGGATTGGA	92608

CU463831.7	1901	TTTGGAAAGTAACCAAGTGCTTTAAGTAGGGCTTCATGGGACACTCGTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92609	TTTGGAAAGTAACCAAGTGCTTTAAGTAGGGCTTCATGGGACACTCGTAA	92658

CU463831.7	1951	GAGCATGCGAGACAGTGCTGAGGGCGATTAGAACTGGTGGGAAGGCAGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463307.7	92659	GAGCATGCGAGACAGTGCTGAGGGCGATTAGAACTGGTGGGAAGGCAGGC	92708

Overview

Query
CU463831.7 - 144601 bps
Hit
CU463307.7 - 92708 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link