<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU570803.6	1	AGGAGATACATATTTTAAGATCCCTGATATAGATTATCACATGATATCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175155	AGGAGATACATATTTTAAGATCCCTGATATAGATTATCACATGATATCTA	175204

CU570803.6	51	GCTCATTTACAATCTATCAGTTAGTATGAAAATATTCACAACTGATATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175205	GCTCATTTACAATCTATCAGTTAGTATGAAAATATTCACAACTGATATTT	175254

CU570803.6	101	AGAGATGAGTTGAGGTGATTTTTCTTCTGTGAATTTTTTCATTGGGTTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175255	AGAGATGAGTTGAGGTGATTTTTCTTCTGTGAATTTTTTCATTGGGTTTG	175304

CU570803.6	151	TGATGAGAATTCCTGCTAAAAAGGTGTTTCAGTCAGCTGATTTAAAGTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175305	TGATGAGAATTCCTGCTAAAAAGGTGTTTCAGTCAGCTGATTTAAAGTAC	175354

CU570803.6	201	AGAAAGGTGAGGTTGATGTCATGCCATGGGTCATTGGACTATTTCTTACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175355	AGAAAGGTGAGGTTGATGTCATGCCATGGGTCATTGGACTATTTCTTACC	175404

CU570803.6	251	AGAGGCTAACTCTAGCCCTTTAAGTAACCTGCTTCAGAACTAACATATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175405	AGAGGCTAACTCTAGCCCTTTAAGTAACCTGCTTCAGAACTAACATATTT	175454

CU570803.6	301	GATTAGTAGATAAAAACTTCATGAAATCTATGAACATATCTGACTACTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175455	GATTAGTAGATAAAAACTTCATGAAATCTATGAACATATCTGACTACTAA	175504

CU570803.6	351	AATCCATTTACCTGAAGGCTTAGAATGTCTTCTGATGACCTGTGGCAAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175505	AATCCATTTACCTGAAGGCTTAGAATGTCTTCTGATGACCTGTGGCAAAT	175554

CU570803.6	401	CTTCTATCTTTCTGCAATCACGTCTCTGTTGTACAAACAAATGTATAATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175555	CTTCTATCTTTCTGCAATCACGTCTCTGTTGTACAAACAAATGTATAATA	175604

CU570803.6	451	AAATTGTCCTTATTTATGATTTTCTACATCCTTCAAAACCTCAAAACTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175605	AAATTGTCCTTATTTATGATTTTCTACATCCTTCAAAACCTCAAAACTTT	175654

CU570803.6	501	ATGAAATTGCTTCTACATTTGACATGGAACCATGATCTGTCAAAAGTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175655	ATGAAATTGCTTCTACATTTGACATGGAACCATGATCTGTCAAAAGTTTT	175704

CU570803.6	551	CCAGAACACACTATCATTTATTCCTTTTAAGGTGAAAGCTGGATTTTGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175705	CCAGAACACACTATCATTTATTCCTTTTAAGGTGAAAGCTGGATTTTGCA	175754

CU570803.6	601	TCAGTAGACCTTATTTGAACACCCTTGCTGTGAAACATTGCTACTGAGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175755	TCAGTAGACCTTATTTGAACACCCTTGCTGTGAAACATTGCTACTGAGGT	175804

CU570803.6	651	TGCACATTCTAGTGATGATTCACATGCTGGATACATTAGACACTTCACTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175805	TGCACATTCTAGTGATGATTCACATGCTGGATACATTAGACACTTCACTG	175854

CU570803.6	701	GGATTGAGGGTACAGTTCAGGGTAGGGCATGTACAGAGTCTTGACCTCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175855	GGATTGAGGGTACAGTTCAGGGTAGGGCATGTACAGAGTCTTGACCTCAT	175904

CU570803.6	751	ACAGCACAGTAATCATAATAGCAAAAATAATAATACAAATGATGATGATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175905	ACAGCACAGTAATCATAATAGCAAAAATAATAATACAAATGATGATGATA	175954

CU570803.6	801	GTAACAAAAACAATGATAATAATAACAGAATAAAGAGAGGAAGTAAAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	175955	GTAACAAAAACAATGATAATAATAACAGAATAAAGAGAGGAAGTAAAAGA	176004

CU570803.6	851	CTATTTGATTTCAATAGTATATTGCTATGAGCTTACCAATTTTAAAATGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176005	CTATTTGATTTCAATAGTATATTGCTATGAGCTTACCAATTTTAAAATGT	176054

CU570803.6	901	GTTCACAACTTTCAAAAAATTTTATTTTCATTTGATTGTAGGTTTTCCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176055	GTTCACAACTTTCAAAAAATTTTATTTTCATTTGATTGTAGGTTTTCCAA	176104

CU570803.6	951	CTGGCTGGCTTGTTTTTCATGAAAACAATTTAAATTGTTCTTTAACTCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176105	CTGGCTGGCTTGTTTTTCATGAAAACAATTTAAATTGTTCTTTAACTCAA	176154

CU570803.6	1001	GAGACAGTGATTAACCACACACTGGGAAAATGTGGATGGCTCAAGACTAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176155	GAGACAGTGATTAACCACACACTGGGAAAATGTGGATGGCTCAAGACTAG	176204

CU570803.6	1051	AAGAGGAACTGAAGATACACTGTCAAGCCTGATGCCTAATAGAGTAGGTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176205	AAGAGGAACTGAAGATACACTGTCAAGCCTGATGCCTAATAGAGTAGGTA	176254

CU570803.6	1101	GGAGGGGACCACCTGCTTTTCTCTTCCATTACTAAACTAAATTCCAGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176255	GGAGGGGACCACCTGCTTTTCTCTTCCATTACTAAACTAAATTCCAGCCA	176304

CU570803.6	1151	GCCTTGAATTATAAATACTCAGTGGCTTCTTAGGTCTTTCTTTCACTCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176305	GCCTTGAATTATAAATACTCAGTGGCTTCTTAGGTCTTTCTTTCACTCCA	176354

CU570803.6	1201	CCTCCATTATCTTTTCTCCCAGTTTATAAACTATTCATGTGCTTATCAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176355	CCTCCATTATCTTTTCTCCCAGTTTATAAACTATTCATGTGCTTATCAAT	176404

CU570803.6	1251	AGACAGTGTTGCCTGCTTCTTATATGACCAAGGTCTGTCTCCTTAAATTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176405	AGACAGTGTTGCCTGCTTCTTATATGACCAAGGTCTGTCTCCTTAAATTG	176454

CU570803.6	1301	TTTATTTTTATAGATGTACGAAAAGAACTTTTATATTGATTATTATTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176455	TTTATTTTTATAGATGTACGAAAAGAACTTTTATATTGATTATTATTGTT	176504

CU570803.6	1351	TCATGTGTGTATGTTTAATAATGTTTGAGTGCATACAAGCCATGTGGTAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176505	TCATGTGTGTATGTTTAATAATGTTTGAGTGCATACAAGCCATGTGGTAT	176554

CU570803.6	1401	ACAGAGGAAAACTTTGGGGGTTAGCCTTTTTCTTCTACAGAGAATTCAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176555	ACAGAGGAAAACTTTGGGGGTTAGCCTTTTTCTTCTACAGAGAATTCAAT	176604

CU570803.6	1451	GAAACAATTTTTTGGCTGTCATCAGACTATGCTGTAGTGCTTTTACCCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176605	GAAACAATTTTTTGGCTGTCATCAGACTATGCTGTAGTGCTTTTACCCAC	176654

CU570803.6	1501	TAAGACAATTCAAATTCCAGTTTTTGATACTTTAAACCAAATATGTATGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176655	TAAGACAATTCAAATTCCAGTTTTTGATACTTTAAACCAAATATGTATGA	176704

CU570803.6	1551	GTTACCACTCAAGTCTGCCATTATCATGTACCTGACCTTCATTAAACAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176705	GTTACCACTCAAGTCTGCCATTATCATGTACCTGACCTTCATTAAACAGA	176754

CU570803.6	1601	TGACAGAATTTACATCATCTCAACAGTGTCATGAAAGTTCTGTGGATGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176755	TGACAGAATTTACATCATCTCAACAGTGTCATGAAAGTTCTGTGGATGGA	176804

CU570803.6	1651	GCGTGGATGATTCCATAACACCTCCAGCTAGTCACTTTTGTCTGTAACCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176805	GCGTGGATGATTCCATAACACCTCCAGCTAGTCACTTTTGTCTGTAACCC	176854

CU570803.6	1701	CTCACCCTGGGGGAATCATTCTATTTATAAACTACACACACACACACACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176855	CTCACCCTGGGGGAATCATTCTATTTATAAACTACACACACACACACACA	176904

CU570803.6	1751	CACACACACACACACACACACACACACACACTGGGGGAATCATTCTATTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176905	CACACACACACACACACACACACACACACACTGGGGGAATCATTCTATTT	176954

CU570803.6	1801	ATAAACTGCACACACACACACACACATGCACACTCACACTCACACACACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	176955	ATAAACTGCACACACACACACACACATGCACACTCACACTCACACACACA	177004

CU570803.6	1851	TGCACATGCACATACATATATACACATACACATACACACAGAGTACATGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	177005	TGCACATGCACATACATATATACACATACACATACACACAGAGTACATGG	177054

CU570803.6	1901	GTAGTGGGGTGGAGAAGCAGCAGTGTTGAACAACAGTGTCCCTGTGCAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	177055	GTAGTGGGGTGGAGAAGCAGCAGTGTTGAACAACAGTGTCCCTGTGCAGG	177104

CU570803.6	1951	CAGATGCTTGTGCCATATCAGCTTTCCTCAGAAAAGACTCTGAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463286.9	177105	CAGATGCTTGTGCCATATCAGCTTTCCTCAGAAAAGACTCTGAAGAATTC	177154

Overview

Query
CU570803.6 - 92369 bps
Hit
CU463286.9 - 177154 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link