<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU462864.4	1	GAATTCTTGAAATAATCTTCTGTAGCAGTGGCTTCATGATCAGATATTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182229	GAATTCTTGAAATAATCTTCTGTAGCAGTGGCTTCATGATCAGATATTTA	182278

CU462864.4	51	TTTAGTGTTTATCATGGATTTTTTTTGTACTTTACTTATGGAAAATAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182279	TTTAGTGTTTATCATGGATTTTTTTTGTACTTTACTTATGGAAAATAATT	182328

CU462864.4	101	ATCTAGTCTGGACACAGTAATGTAATATGGCAAAATTTTTTGTTAAGGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182329	ATCTAGTCTGGACACAGTAATGTAATATGGCAAAATTTTTTGTTAAGGAA	182378

CU462864.4	151	TTAAAGTACAGAATGCCATACTCTTGGCATTTAGGGTTTTTATTAAAGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182379	TTAAAGTACAGAATGCCATACTCTTGGCATTTAGGGTTTTTATTAAAGGT	182428

CU462864.4	201	AGGGTTTGACTTTTAATTTTTCTTATTATTTATTTATGCCTATATGTGCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182429	AGGGTTTGACTTTTAATTTTTCTTATTATTTATTTATGCCTATATGTGCT	182478

CU462864.4	251	TGTGGGGGTGTGTCCATACAAGGACAGAAATGGGCATTTTATTCTCTGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182479	TGTGGGGGTGTGTCCATACAAGGACAGAAATGGGCATTTTATTCTCTGGA	182528

CU462864.4	301	GCTGTAGATGAGGGTACTTGTGCTACACTCATCATGGTACTGGGAATACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182529	GCTGTAGATGAGGGTACTTGTGCTACACTCATCATGGTACTGGGAATACA	182578

CU462864.4	351	TACTTGGTTTCCAAGAAAAACAATAAGTACTTTTAAGCACTGTGTAAGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182579	TACTTGGTTTCCAAGAAAAACAATAAGTACTTTTAAGCACTGTGTAAGCT	182628

CU462864.4	401	CTCCAGATCCCAACAACAACCAACTGCTGTTATTTTATGGATTTATCTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182629	CTCCAGATCCCAACAACAACCAACTGCTGTTATTTTATGGATTTATCTTT	182678

CU462864.4	451	GTATGTGACTTGCACTTCTCTTGGTTTTCCATAATTTTTCTTTATTTTAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182679	GTATGTGACTTGCACTTCTCTTGGTTTTCCATAATTTTTCTTTATTTTAT	182728

CU462864.4	501	TTATCTATTGTTTATGTTAACATGGCACTTCTAAACTGTAGATAAAATAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182729	TTATCTATTGTTTATGTTAACATGGCACTTCTAAACTGTAGATAAAATAA	182778

CU462864.4	551	ATCAAGAGAATGGCTGTAACCAATGAAAGCCACCCAAAAGAATTCATCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182779	ATCAAGAGAATGGCTGTAACCAATGAAAGCCACCCAAAAGAATTCATCCT	182828

CU462864.4	601	ACTGGGCTTTGCTAACCATCCTTGGCTGGAACTCCCTCTTTTTGTTACTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182829	ACTGGGCTTTGCTAACCATCCTTGGCTGGAACTCCCTCTTTTTGTTACTC	182878

CU462864.4	651	TTCTGATAACATATCCCATGGCTTTGATGGGGAACATCGCCATCATTCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182879	TTCTGATAACATATCCCATGGCTTTGATGGGGAACATCGCCATCATTCTG	182928

CU462864.4	701	GTGTCAACCTTAGACCCTCGTCTCCACAGCCCCATGTACTTTTTCCTCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182929	GTGTCAACCTTAGACCCTCGTCTCCACAGCCCCATGTACTTTTTCCTCAC	182978

CU462864.4	751	AAATCTCTCCTTTCTGGACATGTGCTACACCACAAGCATTGTGCCTCAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	182979	AAATCTCTCCTTTCTGGACATGTGCTACACCACAAGCATTGTGCCTCAGA	183028

CU462864.4	801	TGCTGTTTAACCTGGGGAGCTCCAGAAAAACTATTACTTACATTGGATGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183029	TGCTGTTTAACCTGGGGAGCTCCAGAAAAACTATTACTTACATTGGATGT	183078

CU462864.4	851	GTTGTTCAACTTTATGTCTTCCACATAATGGGAGGCACAGAATGTCTACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183079	GTTGTTCAACTTTATGTCTTCCACATAATGGGAGGCACAGAATGTCTACT	183128

CU462864.4	901	TTTGGCTATTATGTCCTTTGATCGATATGTGGCTATCTGCAAACCTCTCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183129	TTTGGCTATTATGTCCTTTGATCGATATGTGGCTATCTGCAAACCTCTCC	183178

CU462864.4	951	ACTACACCCTCATCATGAACCAAAGAGTGTGCATTTTGTTAGTGTCTATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183179	ACTACACCCTCATCATGAACCAAAGAGTGTGCATTTTGTTAGTGTCTATT	183228

CU462864.4	1001	ATGTGGCTGACTGGCGTGATCTTTGCTTTTTCAGAGGCTACACTTACATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183229	ATGTGGCTGACTGGCGTGATCTTTGCTTTTTCAGAGGCTACACTTACATT	183278

CU462864.4	1051	ACAATTGCCATTGTGTGGCATACATAAACTGGATCATTTATTGTGTGAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183279	ACAATTGCCATTGTGTGGCATACATAAACTGGATCATTTATTGTGTGAAA	183328

CU462864.4	1101	TCCCAGTTCTCATAAAAACTGCCTGTGGTGAAAAGGAGTCTAATGAGCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183329	TCCCAGTTCTCATAAAAACTGCCTGTGGTGAAAAGGAGTCTAATGAGCTA	183378

CU462864.4	1151	GCACTTTCTGTGGTATGCATTTTTATACTGGCTGTTCCTCTGTGCTTAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183379	GCACTTTCTGTGGTATGCATTTTTATACTGGCTGTTCCTCTGTGCTTAAT	183428

CU462864.4	1201	TCTTGCTTCTTATGTTAATATTGGGTGTGCAGTACTTAGAATTAAATCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183429	TCTTGCTTCTTATGTTAATATTGGGTGTGCAGTACTTAGAATTAAATCTT	183478

CU462864.4	1251	CTGAAGGAAGGAAAAAAGCCTTTGGGACATGTTCTTCCCATCTTGTTGTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183479	CTGAAGGAAGGAAAAAAGCCTTTGGGACATGTTCTTCCCATCTTGTTGTA	183528

CU462864.4	1301	GTTTCTTTATTCTATGGTCCAGCCATTAGCATGTACCTTCAGCCTTCTTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183529	GTTTCTTTATTCTATGGTCCAGCCATTAGCATGTACCTTCAGCCTTCTTC	183578

CU462864.4	1351	ATCCATTACAAGGGACCAACCCAAGTTCATGGCTCTCTTTTATGCAGTGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183579	ATCCATTACAAGGGACCAACCCAAGTTCATGGCTCTCTTTTATGCAGTGA	183628

CU462864.4	1401	TAACTCCTACACTGAATCCATTCATCTATACCCTAAGAAACAAGGATGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183629	TAACTCCTACACTGAATCCATTCATCTATACCCTAAGAAACAAGGATGTA	183678

CU462864.4	1451	AAGGGTGCCTTAAAAAAACTCCTGAGAAGCATTTTCAGTTCAAAATGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183679	AAGGGTGCCTTAAAAAAACTCCTGAGAAGCATTTTCAGTTCAAAATGAAA	183728

CU462864.4	1501	TTTCTTTGATATTAAAATTACTAATTGTAGTGATTTTATACTGGCTTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183729	TTTCTTTGATATTAAAATTACTAATTGTAGTGATTTTATACTGGCTTCTC	183778

CU462864.4	1551	TTATAATGATCAAATATTCCAGGTCCACAGAGTATAGCATTCTTGCAAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183779	TTATAATGATCAAATATTCCAGGTCCACAGAGTATAGCATTCTTGCAAGA	183828

CU462864.4	1601	CTTTTCTCATTTCTAGTATTACAGCATTGTGAGTTTTGTTCTTGAATTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183829	CTTTTCTCATTTCTAGTATTACAGCATTGTGAGTTTTGTTCTTGAATTCA	183878

CU462864.4	1651	GATGAAGTGTATGACCTTTACATAAAGAATTTGTAATGATATATTAAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183879	GATGAAGTGTATGACCTTTACATAAAGAATTTGTAATGATATATTAAAAT	183928

CU462864.4	1701	ATACAAATAGACAAAAACTATGTGCAAATATTCAATTCTTTTTAAAACAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183929	ATACAAATAGACAAAAACTATGTGCAAATATTCAATTCTTTTTAAAACAT	183978

CU462864.4	1751	AGCTAGTATAAGTCTTGAATCACTGAAAAAAGGGAAGTGACATTACTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	183979	AGCTAGTATAAGTCTTGAATCACTGAAAAAAGGGAAGTGACATTACTAAT	184028

CU462864.4	1801	GAAGAACAGTCTGGAAACATTTCTGAAACTAAACTGGGACCTTTAGATGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	184029	GAAGAACAGTCTGGAAACATTTCTGAAACTAAACTGGGACCTTTAGATGT	184078

CU462864.4	1851	GCCTTTGAAATTTGACATGAATCAATAGAGAAAAAAAAAACATTTTTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	184079	GCCTTTGAAATTTGACATGAATCAATAGAGAAAAAAAAAACATTTTTCTC	184128

CU462864.4	1901	ATGGGAAAGAAATGAATTACATTAATAAAAATGATTGTATTTTGATGAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	184129	ATGGGAAAGAAATGAATTACATTAATAAAAATGATTGTATTTTGATGAAG	184178

CU462864.4	1951	CTTATTTTAAAGGCAATGATATTCAAAATATATTCCATTACAAATTGAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462907.10	184179	CTTATTTTAAAGGCAATGATATTCAAAATATATTCCATTACAAATTGAAA	184228

Overview

Query
CU462864.4 - 214084 bps
Hit
CU462907.10 - 184228 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link