<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU462907.10	1	TTCTGGGTCAGAGTCTTTGACTGGGATGGCAATCCCATCCCTTGATGCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223546	TTCTGGGTCAGAGTCTTTGACTGGGATGGCAATCCCATCCCTTGATGCTC	223595

CU462907.10	51	TGTCTTTCTAATGGAGGTGGGTTCTACAAGTTCCCTCTCCTCACTGTAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223596	TGTCTTTCTAATGGAGGTGGGTTCTACAAGTTCCCTCTCCTCACTGTAGG	223645

CU462907.10	101	GCATTTCATCTAAGTTCCCTCCCTTTGAAGCCTGAAAGTCTTTCACCTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223646	GCATTTCATCTAAGTTCCCTCCCTTTGAAGCCTGAAAGTCTTTCACCTCC	223695

CU462907.10	151	CAGGTATCTGATACATTCTAGAGGGTCCCCCCACATCCTACCTCCCAAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223696	CAGGTATCTGATACATTCTAGAGGGTCCCCCCACATCCTACCTCCCAAGG	223745

CU462907.10	201	ATGCCTGTCTTCCTTCTTTCTGGCCCCTCAGATCTTCAGAAATAAGTGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223746	ATGCCTGTCTTCCTTCTTTCTGGCCCCTCAGATCTTCAGAAATAAGTGGA	223795

CU462907.10	251	TCTTAGCCCCCCAAAGTACACAATACCCAGGATACAATCCACAGAAATCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223796	TCTTAGCCCCCCAAAGTACACAATACCCAGGATACAATCCACAGAAATCA	223845

CU462907.10	301	AAAGGGTTAGCAAGTCAAAGGGCCCAAGTAAGGTGCCTCAACCCCACCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223846	AAAGGGTTAGCAAGTCAAAGGGCCCAAGTAAGGTGCCTCAACCCCACCAG	223895

CU462907.10	351	GGAGGGAGAAGAAAGCAATCACATGGGGTGGGGGGAGGGACCTGGGTGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223896	GGAGGGAGAAGAAAGCAATCACATGGGGTGGGGGGAGGGACCTGGGTGGC	223945

CU462907.10	401	AAAAGAGACAGGGAAGGGAAGAGGGGAACATGATCATGTATTGGGTAGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223946	AAAAGAGACAGGGAAGGGAAGAGGGGAACATGATCATGTATTGGGTAGGG	223995

CU462907.10	451	GGAATAAAGAAAGTTTAATAGCTAATACTGAGAAGGGGGAGAGAATAAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	223996	GGAATAAAGAAAGTTTAATAGCTAATACTGAGAAGGGGGAGAGAATAAGG	224045

CU462907.10	501	CTGGACTTCCTGCCAGCCAGGAGAGGAGGTGTAGAGAGAAAACCTGGATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224046	CTGGACTTCCTGCCAGCCAGGAGAGGAGGTGTAGAGAGAAAACCTGGATT	224095

CU462907.10	551	TAGCCATGGGGAGAGAGTCTAGGAGACACCCAGGGAAAACAACTAGAGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224096	TAGCCATGGGGAGAGAGTCTAGGAGACACCCAGGGAAAACAACTAGAGAA	224145

CU462907.10	601	GAGAAAGCCATAAAAAGAGTCTTGGGAAATTTGCCTAGGAGGTAGTCACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224146	GAGAAAGCCATAAAAAGAGTCTTGGGAAATTTGCCTAGGAGGTAGTCACT	224195

CU462907.10	651	TTATTGTAGAGGATTAAAATCGAGACATACTGCTGAACTGTTGCCCCCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224196	TTATTGTAGAGGATTAAAATCGAGACATACTGCTGAACTGTTGCCCCCTT	224245

CU462907.10	701	TAAATCATGTTAAAGAAATGTAATGATCCAATCTCAATTATTTGTGAGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224246	TAAATCATGTTAAAGAAATGTAATGATCCAATCTCAATTATTTGTGAGTT	224295

CU462907.10	751	AGCTAAGTAAGACACTAAATAAAAAGCCACTAACAACTGTCCTAGATTAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224296	AGCTAAGTAAGACACTAAATAAAAAGCCACTAACAACTGTCCTAGATTAC	224345

CU462907.10	801	CTAAGTCTGAATCTCTTTGTAGCACTTGAAACAAATTACTTATCTCTTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224346	CTAAGTCTGAATCTCTTTGTAGCACTTGAAACAAATTACTTATCTCTTGA	224395

CU462907.10	851	GTAGTTAATCCCATGATGGGACATTGGGAATTAATATCTCCCATTAATTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224396	GTAGTTAATCCCATGATGGGACATTGGGAATTAATATCTCCCATTAATTT	224445

CU462907.10	901	TTGAAAAATTATGAATACTTTGTAATTGATCTCTCATTTTGTGGTTGAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224446	TTGAAAAATTATGAATACTTTGTAATTGATCTCTCATTTTGTGGTTGAAT	224495

CU462907.10	951	TTTTGTTGAGTTATTTAAAAACCCAAACAGGTAATAAAACCTGCTCTGCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224496	TTTTGTTGAGTTATTTAAAAACCCAAACAGGTAATAAAACCTGCTCTGCG	224545

CU462907.10	1001	TCATTATTCAGGAGCAATATGTAACCCCCACCATGGCAGAATTCTTTGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224546	TCATTATTCAGGAGCAATATGTAACCCCCACCATGGCAGAATTCTTTGTT	224595

CU462907.10	1051	TCCTTAAACATTTTCTGTAAAGTATCTGTGTCAGAATCAGTCCACAAAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224596	TCCTTAAACATTTTCTGTAAAGTATCTGTGTCAGAATCAGTCCACAAAAT	224645

CU462907.10	1101	ATTAACTATGTAATGACAAACAATGGACTGAGGAAATATCCCATGAATAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224646	ATTAACTATGTAATGACAAACAATGGACTGAGGAAATATCCCATGAATAA	224695

CU462907.10	1151	AATGTAGTGATTGTTGCACAAAATATTGACAAAATTTAGACTGTTTAACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224696	AATGTAGTGATTGTTGCACAAAATATTGACAAAATTTAGACTGTTTAACA	224745

CU462907.10	1201	TTCCCCATGGCAGAATGTTCCACTGATGTCTTTTTATGGAGTGAGCATTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224746	TTCCCCATGGCAGAATGTTCCACTGATGTCTTTTTATGGAGTGAGCATTA	224795

CU462907.10	1251	TTTTGAGTAGATGCTGTGAAAGCAAACCTTTCCTCATCTTGCTCATGCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224796	TTTTGAGTAGATGCTGTGAAAGCAAACCTTTCCTCATCTTGCTCATGCAA	224845

CU462907.10	1301	GTGGACAGTAACAAAATTATAATCATAGGCCATTAAGTAATGAAGAAGGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224846	GTGGACAGTAACAAAATTATAATCATAGGCCATTAAGTAATGAAGAAGGT	224895

CU462907.10	1351	AAAGAAATTCTGGGCTGTAACAGACCCACTGATTGGATCATTCTATTCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224896	AAAGAAATTCTGGGCTGTAACAGACCCACTGATTGGATCATTCTATTCAC	224945

CU462907.10	1401	TGCTCTTAAATCTTCTGACATTTTTCATTTCCTTGGTGCTTGGTGTCCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224946	TGCTCTTAAATCTTCTGACATTTTTCATTTCCTTGGTGCTTGGTGTCCTT	224995

CU462907.10	1451	TATATATAACAAATTCAGAAGAATTGCACGGGCTACTAGGCTTTTATATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	224996	TATATATAACAAATTCAGAAGAATTGCACGGGCTACTAGGCTTTTATATA	225045

CU462907.10	1501	TGCTGAGCCTTCAACTCCTATTGTACCAGCTGCTCAAGTGCCTGTAATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225046	TGCTGAGCCTTCAACTCCTATTGTACCAGCTGCTCAAGTGCCTGTAATTT	225095

CU462907.10	1551	TTCCTTAGTTATGGGCCATTGATCTGTCTACAGACTTGTCAGTAAACCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225096	TTCCTTAGTTATGGGCCATTGATCTGTCTACAGACTTGTCAGTAAACCAC	225145

CU462907.10	1601	TTTAATGGTAAAAACATTGTTATTTAACCAGTGCCCCTCCACATAAAATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225146	TTTAATGGTAAAAACATTGTTATTTAACCAGTGCCCCTCCACATAAAATT	225195

CU462907.10	1651	TAGAAGCCCAATGGCCTTTATATCCTGTATTTGAACAAGGTGAACAGCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225196	TAGAAGCCCAATGGCCTTTATATCCTGTATTTGAACAAGGTGAACAGCCT	225245

CU462907.10	1701	GGGATTGTTTTGATGACATATATCAATACCTTCCCCAATAAGCATCTGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225246	GGGATTGTTTTGATGACATATATCAATACCTTCCCCAATAAGCATCTGTC	225295

CU462907.10	1751	ACTTGATCTTTCATTTCATTATGGGCTGTGTCTGAGATTACAGGAATATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225296	ACTTGATCTTTCATTTCATTATGGGCTGTGTCTGAGATTACAGGAATATT	225345

CU462907.10	1801	AATCTAGGTAACACACTGTTTTAAAAGATCACTTCCTTATAAATTTAAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225346	AATCTAGGTAACACACTGTTTTAAAAGATCACTTCCTTATAAATTTAAGG	225395

CU462907.10	1851	GTATATAAGCAACTTAAGGCATTAACACTCCTATTTGACTTTCCATTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225396	GTATATAAGCAACTTAAGGCATTAACACTCCTATTTGACTTTCCATTCTC	225445

CU462907.10	1901	ACATATTTATCCCATCTCATGATTTGTTTTTTTTTTCTAAGATAACTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225446	ACATATTTATCCCATCTCATGATTTGTTTTTTTTTTCTAAGATAACTTTT	225495

CU462907.10	1951	AAATACCTAGAATCTGTATACAAACGTTTAAACCTGGCCATTCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU462875.11	225496	AAATACCTAGAATCTGTATACAAACGTTTAAACCTGGCCATTCTGAATTC	225545

Overview

Query
CU462907.10 - 184228 bps
Hit
CU462875.11 - 225545 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link