<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU372918.5	1	GAATTCACAAAGGAGGAATCTCAAATGGCTGAGAAACACCTAAAAAATGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	111705	GAATTCACAAAGGAGGAATCTCAAATGGCTGAGAAACACCTAAAAAATGT	111754

CU372918.5	51	TTAAAGTCCCTAGTGATCAGAGGAATGCAAATCAAAATTACCCTGATATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	111755	TTAAAGTCCCTAGTGATCAGAGGAATGCAAATCAAAATTACCCTGATATT	111804

CU372918.5	101	CCATCTTATACCATTCAGAGTGGCTAACATCGAAACCTCAGGCTACAGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	111805	CCATCTTATACCATTCAGAGTGGCTAACATCGAAACCTCAGGCTACAGCA	111854

CU372918.5	151	TATGTTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAAGAACACTCCATTGCAGGTGGAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	111855	TATGTTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAAGAACACTCCATTGCAGGTGGAAT	111904

CU372918.5	201	TGAAAACTGGTATAACCACTCTGGAAATCAATCTGGAGGTTCCTCAGAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	111905	TGAAAACTGGTATAACCACTCTGGAAATCAATCTGGAGGTTCCTCAGAAA	111954

CU372918.5	251	ATTGGAAATAGTACTACCTGAAGACCCAGCAATACCACTCTTGGGAATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	111955	ATTGGAAATAGTACTACCTGAAGACCCAGCAATACCACTCTTGGGAATTT	112004

CU372918.5	301	ACCCAAAAGATGCCCCACCATGCTACAGGGGCACGTGTTCCACTATGTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112005	ACCCAAAAGATGCCCCACCATGCTACAGGGGCACGTGTTCCACTATGTTC	112054

CU372918.5	351	ATAGTGGTCTTGTTTGTGATAACCAGAAGCTGGAAACAACCCAGATGTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112055	ATAGTGGTCTTGTTTGTGATAACCAGAAGCTGGAAACAACCCAGATGTCC	112104

CU372918.5	401	CACAACAGAAGAATGGATACAGAAAATGTTTTTCATTTACACAGTGGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112105	CACAACAGAAGAATGGATACAGAAAATGTTTTTCATTTACACAGTGGAAT	112154

CU372918.5	451	ACTACTCAGCTATTAAGAATGAGGACATTCTGAGTTTTGCTGGCAAATGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112155	ACTACTCAGCTATTAAGAATGAGGACATTCTGAGTTTTGCTGGCAAATGG	112204

CU372918.5	501	ATGGAACTAGAAAATATCATCTTGAGTGAAGTAACTCAGACCCAAAATGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112205	ATGGAACTAGAAAATATCATCTTGAGTGAAGTAACTCAGACCCAAAATGA	112254

CU372918.5	551	CATGCATGGTATGTACTCACTAATAAGTGGATATTAGTCCCCCCCCCCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112255	CATGCATGGTATGTACTCACTAATAAGTGGATATTAGTCCCCCCCCCCAA	112304

CU372918.5	601	AAAAAGTGTTCAATACGCAAGGTACAGCCCATAGAACTCAAAAAGCTGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112305	AAAAAGTGTTCAATACGCAAGGTACAGCCCATAGAACTCAAAAAGCTGAA	112354

CU372918.5	651	GGGCCCAAGTGAGGATGCCTCAGTCCCACTTGGGAGGGAGAAAAAAAGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112355	GGGCCCAAGTGAGGATGCCTCAGTCCCACTTGGGAGGGAGAAAAAAAGCA	112404

CU372918.5	701	ACCATAAGAGGGGAGGGAGGGACCTGAGAGGGAAAGGGGATGGGGTGGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112405	ACCATAAGAGGGGAGGGAGGGACCTGAGAGGGAAAGGGGATGGGGTGGGG	112454

CU372918.5	751	TGTGGAAAGGGGAACATGGTTGGGTATTGGGTGGGGGGAAAGGACTGAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112455	TGTGGAAAGGGGAACATGGTTGGGTATTGGGTGGGGGGAAAGGACTGAAA	112504

CU372918.5	801	TCCCTGAGGGCCAGCAGAAAGAATGGAAACAGGCAACCCTGGGAGGTAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112505	TCCCTGAGGGCCAGCAGAAAGAATGGAAACAGGCAACCCTGGGAGGTAGG	112554

CU372918.5	851	AGGTTGGGGGGGGGTCATATACCAGAGACATGGGAGGGAAGAGACTCTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112555	AGGTTGGGGGGGGGTCATATACCAGAGACATGGGAGGGAAGAGACTCTCA	112604

CU372918.5	901	GGACTCAAAGAGAGGAACCTTAGATGAAATGCCTGACGGTAGGGAGAAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112605	GGACTCAAAGAGAGGAACCTTAGATGAAATGCCTGACGGTAGGGAGAAGG	112654

CU372918.5	951	AACTTATAGAGCCCACCTTCAGCAGAAATAAGGACATGAAGTGAGGGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112655	AACTTATAGAGCCCACCTTCAGCAGAAATAAGGACATGAAGTGAGGGATG	112704

CU372918.5	1001	GGTCTCTTATCCCACAGTCAAAACTCTGACCCATAATTGTTCCTGTCTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112705	GGTCTCTTATCCCACAGTCAAAACTCTGACCCATAATTGTTCCTGTCTGA	112754

CU372918.5	1051	AAGAACTACAGGCATAGAGATGGAAAGGAGGCTGAGGAAAGGAAGGTCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112755	AAGAACTACAGGCATAGAGATGGAAAGGAGGCTGAGGAAAGGAAGGTCCA	112804

CU372918.5	1101	GTGACAGGCCCAAAGTGGGATTCGGCTCAAAGGGAGACCTCAAGACCTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112805	GTGACAGGCCCAAAGTGGGATTCGGCTCAAAGGGAGACCTCAAGACCTGA	112854

CU372918.5	1151	CACTATTGCAGAGGCTATGGAGCACTCACGAAAGGGGACCTATCATATCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112855	CACTATTGCAGAGGCTATGGAGCACTCACGAAAGGGGACCTATCATATCA	112904

CU372918.5	1201	TGTCTGTCCTCTGAAAGACTCAACAAGCAGCTGAAAGAGTCAGATGCAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112905	TGTCTGTCCTCTGAAAGACTCAACAAGCAGCTGAAAGAGTCAGATGCAGA	112954

CU372918.5	1251	TATTTACATCCAACCAATAGACAGAAGCAGCTGACCCCTGTGGTTGAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	112955	TATTTACATCCAACCAATAGACAGAAGCAGCTGACCCCTGTGGTTGAATT	113004

CU372918.5	1301	AGGGGAAAGCTGGAAGAAGCTGAGGAGAGCAACCCTGTAGGAGGACCAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113005	AGGGGAAAGCTGGAAGAAGCTGAGGAGAGCAACCCTGTAGGAGGACCAGC	113054

CU372918.5	1351	AGTATTAATTAACCTGGACCCTGAGATCTCTCAGACACTGGATCACCAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113055	AGTATTAATTAACCTGGACCCTGAGATCTCTCAGACACTGGATCACCAAC	113104

CU372918.5	1401	CAGGCAGCATACACCAGCTGATATGAGGCCCCCAACACATATACAGCAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113105	CAGGCAGCATACACCAGCTGATATGAGGCCCCCAACACATATACAGCAGA	113154

CU372918.5	1451	GGACTGCTGGGTCTTGGATCAGGCTGAGTAGATGTACCTAACCCTCAAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113155	GGACTGCTGGGTCTTGGATCAGGCTGAGTAGATGTACCTAACCCTCAAGA	113204

CU372918.5	1501	GACTGGAGGCCCCAGGGAGTTTAGAGGTCAGGGGGGGTGGGGGTGGGGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113205	GACTGGAGGCCCCAGGGAGTTTAGAGGTCAGGGGGGGTGGGGGTGGGGGT	113254

CU372918.5	1551	CGGGAATAAGGGGTGGGGACATCCTCGTGGAAACAGGGAAGCAGAGGGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113255	CGGGAATAAGGGGTGGGGACATCCTCGTGGAAACAGGGAAGCAGAGGGGA	113304

CU372918.5	1601	GGTATGGGATGTGGAACAGTTGGAAGGTGGACTGGTAGGGGAATAAAATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113305	GGTATGGGATGTGGAACAGTTGGAAGGTGGACTGGTAGGGGAATAAAATA	113354

CU372918.5	1651	TGGAGTTTAAAAGAAAAAATAGAAAATTTGGCATATGCGAAGATTATATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113355	TGGAGTTTAAAAGAAAAAATAGAAAATTTGGCATATGCGAAGATTATATA	113404

CU372918.5	1701	TATATAATCTTATGTGTATGTATATCATACACATATATCTAGCATATATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113405	TATATAATCTTATGTGTATGTATATCATACACATATATCTAGCATATATA	113454

CU372918.5	1751	TATATATATATATGTATATATGTATGTATGTATATGCTCCATCCCTTTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113455	TATATATATATATGTATATATGTATGTATGTATATGCTCCATCCCTTTGC	113504

CU372918.5	1801	ACACAGTACCGGTACTCTATTAAATCTGAGTTAGTGCTCTGGAAATACTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113505	ACACAGTACCGGTACTCTATTAAATCTGAGTTAGTGCTCTGGAAATACTT	113554

CU372918.5	1851	TAGCCTCTGTCATTTTCTTTCTGTATCTGTCTCTTCACATGATAATGGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113555	TAGCCTCTGTCATTTTCTTTCTGTATCTGTCTCTTCACATGATAATGGCT	113604

CU372918.5	1901	GCTTTTCTGTACAGCCTGGGACCTGTTCCTCCAGTGCAATAAACTAGGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113605	GCTTTTCTGTACAGCCTGGGACCTGTTCCTCCAGTGCAATAAACTAGGAT	113654

CU372918.5	1951	AGAGAGAAGTCAGTCTCAAAATGCCTTATTCTCTAACAAGATCAGGAAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459074.36	113655	AGAGAGAAGTCAGTCTCAAAATGCCTTATTCTCTAACAAGATCAGGAAAC	113704

Overview

Query
CU372918.5 - 121029 bps
Hit
CU459074.36 - 113704 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link