<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU459207.8	1	ATTTCTGAGAATTTACAGTCCTTGACTCCATTGTTTCTGGGTTAATTCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63266	ATTTCTGAGAATTTACAGTCCTTGACTCCATTGTTTCTGGGTTAATTCTA	63315

CU459207.8	51	AGTCAGAGTATAAATAGTTACAAGAGTGTATGTAGGTTAGAGAATTCTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63316	AGTCAGAGTATAAATAGTTACAAGAGTGTATGTAGGTTAGAGAATTCTGT	63365

CU459207.8	101	TCACCTCATGGTAGACAGGAAGCAGAAAGCTAGAAAGGCACTAGGGACCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63366	TCACCTCATGGTAGACAGGAAGCAGAAAGCTAGAAAGGCACTAGGGACCA	63415

CU459207.8	151	GGTACAACCTTAAAGGAATGCACTGAATGATCTTTCTCTTCCAGGTAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63416	GGTACAACCTTAAAGGAATGCACTGAATGATCTTTCTCTTCCAGGTAAAC	63465

CU459207.8	201	CCTACTACTTCTTTAGGTTTCAATAACTTTCAACATAGTACTGCAGCGCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63466	CCTACTACTTCTTTAGGTTTCAATAACTTTCAACATAGTACTGCAGCGCT	63515

CU459207.8	251	TGCATAGGACAGAGAGGGTTTCAGATTTCCTGGGATTGGAATTGCAAACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63516	TGCATAGGACAGAGAGGGTTTCAGATTTCCTGGGATTGGAATTGCAAACA	63565

CU459207.8	301	AGAGCAGCCAGACCTGTGAGTGCAAAGAATGGAAACCTAGTGGGCCATCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63566	AGAGCAGCCAGACCTGTGAGTGCAAAGAATGGAAACCTAGTGGGCCATCA	63615

CU459207.8	351	GTGGGAGGAGAGGCCCTTGGTCTTGTGAAGATTCTAGGCCCCAGTATAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63616	GTGGGAGGAGAGGCCCTTGGTCTTGTGAAGATTCTAGGCCCCAGTATAGG	63665

CU459207.8	401	GGCAATGCCAGGGCCAGGAAGTGGGAGTGGGTGGGTTGAGGAGGAGGGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63666	GGCAATGCCAGGGCCAGGAAGTGGGAGTGGGTGGGTTGAGGAGGAGGGGG	63715

CU459207.8	451	AGGGGGGAGATAGGAGATTTTCCAGGAAGGAAACTAGGAAAGGGAATAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63716	AGGGGGGAGATAGGAGATTTTCCAGGAAGGAAACTAGGAAAGGGAATAGT	63765

CU459207.8	501	ATTTGAAATGTAAATGAAGAAAACATATAATAATAATAATAATAATAATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63766	ATTTGAAATGTAAATGAAGAAAACATATAATAATAATAATAATAATAATA	63815

CU459207.8	551	ATAATAATAATAATAATAATAAAGAATGGAAATCAGGTGAAAAAGGAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63816	ATAATAATAATAATAATAATAAAGAATGGAAATCAGGTGAAAAAGGAGCC	63865

CU459207.8	601	AGTGCTCTTAATCACTGAGCCATCTCTCCAGACCCACCACTGACATTATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63866	AGTGCTCTTAATCACTGAGCCATCTCTCCAGACCCACCACTGACATTATT	63915

CU459207.8	651	TTACATCACCCCCCCCCCCCTTCCACTAATGCCAGTGTTTTATCACCTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63916	TTACATCACCCCCCCCCCCCTTCCACTAATGCCAGTGTTTTATCACCTAA	63965

CU459207.8	701	CAAGAATGACAATGGAACTTTCTGTTGATAAACTTGCAAACCAAGAGAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	63966	CAAGAATGACAATGGAACTTTCTGTTGATAAACTTGCAAACCAAGAGAGG	64015

CU459207.8	751	AACAGAAAAACAACTGACAACAATGTAAAAGAAGCCGTCATAGCTGAAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64016	AACAGAAAAACAACTGACAACAATGTAAAAGAAGCCGTCATAGCTGAAAA	64065

CU459207.8	801	GGTCTCAGAATTATGAAAAATCCTGACCTATCCTCAATAGCAGGCTTTAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64066	GGTCTCAGAATTATGAAAAATCCTGACCTATCCTCAATAGCAGGCTTTAC	64115

CU459207.8	851	AAATACAGCAGCAGCAACAGCAAACAACAAGGCTTGAAGCTATGACTAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64116	AAATACAGCAGCAGCAACAGCAAACAACAAGGCTTGAAGCTATGACTAGT	64165

CU459207.8	901	CAGGGGAGATGGTTCAGCACATAGATGGAGTTACCAGGAAGCCCAACCAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64166	CAGGGGAGATGGTTCAGCACATAGATGGAGTTACCAGGAAGCCCAACCAT	64215

CU459207.8	951	TTATGATTTCGATAATTCTATAGACATTTTAAATAAAAAACTGGAACATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64216	TTATGATTTCGATAATTCTATAGACATTTTAAATAAAAAACTGGAACATT	64265

CU459207.8	1001	TATGACATGGAATCTTTATGTTCTTGATTTTGTTTGCTAACTTGACTCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64266	TATGACATGGAATCTTTATGTTCTTGATTTTGTTTGCTAACTTGACTCCA	64315

CU459207.8	1051	TTAGAAAAATGTCAGGGAGATTAGAGTGACTGACTGGAGGAGAGGAGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64316	TTAGAAAAATGTCAGGGAGATTAGAGTGACTGACTGGAGGAGAGGAGGGG	64365

CU459207.8	1101	CAGGGGACTGTGGTTGGGATGTCATGGACGAGAGAAGAAAAACAGTAAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64366	CAGGGGACTGTGGTTGGGATGTCATGGACGAGAGAAGAAAAACAGTAAGT	64415

CU459207.8	1151	TAAACAAGTTTAGCACTTCAATTATTCCACTTGACTAGTGTGCTATGTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64416	TAAACAAGTTTAGCACTTCAATTATTCCACTTGACTAGTGTGCTATGTAT	64465

CU459207.8	1201	TGTGTCATCTACTCAATTTAATACGAATGCCTTGGAAAAATAATCCAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64466	TGTGTCATCTACTCAATTTAATACGAATGCCTTGGAAAAATAATCCAAAA	64515

CU459207.8	1251	GCAAACATAACTAGCTTATGTATCTGATCCATTGTCTACAGCAAAGTACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64516	GCAAACATAACTAGCTTATGTATCTGATCCATTGTCTACAGCAAAGTACT	64565

CU459207.8	1301	TATAACAATGTCATTGAAAATAGCAATAGAAGTTAGTGATATTAAAATGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64566	TATAACAATGTCATTGAAAATAGCAATAGAAGTTAGTGATATTAAAATGT	64615

CU459207.8	1351	TCAAAGCTACGGCACAATTTCAATTGTCGGATTCTTCTAGATCAACTAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64616	TCAAAGCTACGGCACAATTTCAATTGTCGGATTCTTCTAGATCAACTAAA	64665

CU459207.8	1401	TCCTCAAATATCATTTTCATAGGAAATGACAACACTTACCTTAGCAATCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64666	TCCTCAAATATCATTTTCATAGGAAATGACAACACTTACCTTAGCAATCT	64715

CU459207.8	1451	GGACACACCAGTTCAACAGCAGCTGTGATCCGATGTTATCCTTGTGTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64716	GGACACACCAGTTCAACAGCAGCTGTGATCCGATGTTATCCTTGTGTTCA	64765

CU459207.8	1501	TGAACATAGTCCAGTAGGCAGCCATGCGGCATCAGCTGCGTAACCAACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64766	TGAACATAGTCCAGTAGGCAGCCATGCGGCATCAGCTGCGTAACCAACTG	64815

CU459207.8	1551	GATAGTGGGACTCAGACACACTCCCAATAGGCGAACTAGGTGTGGGTGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64816	GATAGTGGGACTCAGACACACTCCCAATAGGCGAACTAGGTGTGGGTGAT	64865

CU459207.8	1601	CCATACTTGCCATGATCAGAGCCTCCTGTAGCAGCAACAATAGCAAGAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64866	CCATACTTGCCATGATCAGAGCCTCCTGTAGCAGCAACAATAGCAAGAAA	64915

CU459207.8	1651	AAACAGAATATCATAACTTCAACTCAGCATTCCTCAGTATTTTAAATACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64916	AAACAGAATATCATAACTTCAACTCAGCATTCCTCAGTATTTTAAATACA	64965

CU459207.8	1701	TTGGAGAAAAGGTGTATAATAGATTAACAACATACTCAGTAAGTCAGACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	64966	TTGGAGAAAAGGTGTATAATAGATTAACAACATACTCAGTAAGTCAGACA	65015

CU459207.8	1751	TAGTGCTTACTTAAGCTTTTAAGCCAACATTCAGGAAGCAGAGGTCAGTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	65016	TAGTGCTTACTTAAGCTTTTAAGCCAACATTCAGGAAGCAGAGGTCAGTG	65065

CU459207.8	1801	AAGCTCTGTGTGTTTGAAGCCAGCCTATTTTACACACTGAGTTCGAGGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	65066	AAGCTCTGTGTGTTTGAAGCCAGCCTATTTTACACACTGAGTTCGAGGTC	65115

CU459207.8	1851	AGTTATGGCAATGGAATAAGACCCAGTTTCAAAAGAAACATCAGTAGACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	65116	AGTTATGGCAATGGAATAAGACCCAGTTTCAAAAGAAACATCAGTAGACT	65165

CU459207.8	1901	CAACTAACTATGTAAATATATTTATTAAATCCTTTCCTGCTTAGACTGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	65166	CAACTAACTATGTAAATATATTTATTAAATCCTTTCCTGCTTAGACTGAT	65215

CU459207.8	1951	ATAATTAAATGAAGCAAAGGAAGAAATGGTCTATACCACAAAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459008.2	65216	ATAATTAAATGAAGCAAAGGAAGAAATGGTCTATACCACAAAGTGAATTC	65265

Overview

Query
CU459207.8 - 58525 bps
Hit
CU459008.2 - 65265 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link