<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210934.6	1	GAATTCAGAGATCACCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	77759	GAATTCAGAGATCACCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGCA	77808

CU210934.6	51	CCACGCCTGGCAAGAGGATCTCTCTTAACTTAGTGATACTAACAGCCTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	77809	CCACGCCTGGCAAGAGGATCTCTCTTAACTTAGTGATACTAACAGCCTGT	77858

CU210934.6	101	GTTAATAATTTATAAACATCAGGTGATGACTTGCTTCAGCCAGTGGTTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	77859	GTTAATAATTTATAAACATCAGGTGATGACTTGCTTCAGCCAGTGGTTTT	77908

CU210934.6	151	TGGGAAAAGCTGAGGATAACATTTGAGATCATATTCTGCTGATCTGATGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	77909	TGGGAAAAGCTGAGGATAACATTTGAGATCATATTCTGCTGATCTGATGT	77958

CU210934.6	201	AGGAATGTTTTAATACAAAAATGTTCACAGCGTTAACTTTTCTCCGCTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	77959	AGGAATGTTTTAATACAAAAATGTTCACAGCGTTAACTTTTCTCCGCTCT	78008

CU210934.6	251	TTAAAGAAACATTATTTTTCTCCTTTTGGCACTTATCTTTTGGAATCCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78009	TTAAAGAAACATTATTTTTCTCCTTTTGGCACTTATCTTTTGGAATCCTT	78058

CU210934.6	301	TGTCTTACAAATTAATGGTTTTTGACGTAATAGTGTCTTTTCATGAAGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78059	TGTCTTACAAATTAATGGTTTTTGACGTAATAGTGTCTTTTCATGAAGAT	78108

CU210934.6	351	GGAAACTCATGATGTGGACTTGTAACTGGCTTCTTTAAAATCTCAGGTAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78109	GGAAACTCATGATGTGGACTTGTAACTGGCTTCTTTAAAATCTCAGGTAG	78158

CU210934.6	401	TCTGTTTGGAATAGGGCTGACGGGGCTTTTCATTGCAGCCTGTTAGATGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78159	TCTGTTTGGAATAGGGCTGACGGGGCTTTTCATTGCAGCCTGTTAGATGC	78208

CU210934.6	451	TGAGCAGGGCTGGGGTCTGCTCTCTGTGAGGCATTTCATCGTCCTGTAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78209	TGAGCAGGGCTGGGGTCTGCTCTCTGTGAGGCATTTCATCGTCCTGTAAA	78258

CU210934.6	501	GCTAGGAGTCATAAACAAATTACTGCTGTCCTGAGAAGGAGGGTGGGTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78259	GCTAGGAGTCATAAACAAATTACTGCTGTCCTGAGAAGGAGGGTGGGTTT	78308

CU210934.6	551	GTTCTTGGATTCTAGGGTAGACATTAAAAATTCTTCCATCAGGAAGAATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78309	GTTCTTGGATTCTAGGGTAGACATTAAAAATTCTTCCATCAGGAAGAATC	78358

CU210934.6	601	TAGACTTGCTGCCTTCCTAATGCTTTTACCACTGACTACAGATTCTAGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78359	TAGACTTGCTGCCTTCCTAATGCTTTTACCACTGACTACAGATTCTAGGT	78408

CU210934.6	651	TCCTTCACTCCTACAGATCTCTGGTAAACACCTGATCTAAGGGCGTTGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78409	TCCTTCACTCCTACAGATCTCTGGTAAACACCTGATCTAAGGGCGTTGCC	78458

CU210934.6	701	ATCTTTTTCATCTCCTGCATCTCCATCTTCCTGATTTCAGTGTCTGCTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78459	ATCTTTTTCATCTCCTGCATCTCCATCTTCCTGATTTCAGTGTCTGCTGC	78508

CU210934.6	751	ACAGACACACAAATCTGACTTATTGATACTTACTTTAAGTTACTGTGTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78509	ACAGACACACAAATCTGACTTATTGATACTTACTTTAAGTTACTGTGTTA	78558

CU210934.6	801	ATTTTATTTTGACAATAGACATGGAAAATGGAAATGCAGTGGGCTTAATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78559	ATTTTATTTTGACAATAGACATGGAAAATGGAAATGCAGTGGGCTTAATG	78608

CU210934.6	851	TTTTCGATCAGAAGCAAAGTATAGCTCAGGCTGAATATCATAGGAATAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78609	TTTTCGATCAGAAGCAAAGTATAGCTCAGGCTGAATATCATAGGAATAAT	78658

CU210934.6	901	CCTGTTGATACCAGGCAGTCAGTTGAAGCCTTAGCTGACTTCCTAGGAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78659	CCTGTTGATACCAGGCAGTCAGTTGAAGCCTTAGCTGACTTCCTAGGAGG	78708

CU210934.6	951	CTGTCTGTCTGTCCTGGGTGTAATTTGTGCCGTTCCTTCTTGTCTTGTAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78709	CTGTCTGTCTGTCCTGGGTGTAATTTGTGCCGTTCCTTCTTGTCTTGTAG	78758

CU210934.6	1001	GAATGGGAGTGCTCCCCAGTAGGAAGCAGGTGACAGTACAGCCTGCATCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78759	GAATGGGAGTGCTCCCCAGTAGGAAGCAGGTGACAGTACAGCCTGCATCA	78808

CU210934.6	1051	GCTCTACTCATGAGGTGTGTTTCCTCATTAGCCACTTTATTCTTTTAAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78809	GCTCTACTCATGAGGTGTGTTTCCTCATTAGCCACTTTATTCTTTTAAAT	78858

CU210934.6	1101	TTGGCATAGAGACATCTAACCCACAGGTCCTGCTCATCCTCCTTCAGGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78859	TTGGCATAGAGACATCTAACCCACAGGTCCTGCTCATCCTCCTTCAGGGG	78908

CU210934.6	1151	CTAGCCTCCACACCCCTCAAGTGCTGGTTGTCACCGTGGTTGGTTTATAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78909	CTAGCCTCCACACCCCTCAAGTGCTGGTTGTCACCGTGGTTGGTTTATAC	78958

CU210934.6	1201	AGTGCTGGGGAGCCAACCCAGGACTTGAAGGATATTACACAAACACTGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	78959	AGTGCTGGGGAGCCAACCCAGGACTTGAAGGATATTACACAAACACTGTA	79008

CU210934.6	1251	CTAACTGAGCTGCACCCAAGCCATTAACCTGCTCTTTACTGTTACACATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79009	CTAACTGAGCTGCACCCAAGCCATTAACCTGCTCTTTACTGTTACACATC	79058

CU210934.6	1301	ACTTGTAGCCTGTTCCTGTTTAGTAGATAACTTCTACTGTTGAATAATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79059	ACTTGTAGCCTGTTCCTGTTTAGTAGATAACTTCTACTGTTGAATAATTT	79108

CU210934.6	1351	ACACATAGATTTTTTTTTTAATTTAATTAAAGCTCTTCACATCAAGTATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79109	ACACATAGATTTTTTTTTTAATTTAATTAAAGCTCTTCACATCAAGTATT	79158

CU210934.6	1401	TAAGAACTGTCTTCATGAATATTATGTCAGCTTTGCCGCGTTTCACTCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79159	TAAGAACTGTCTTCATGAATATTATGTCAGCTTTGCCGCGTTTCACTCAA	79208

CU210934.6	1451	TCATTTCAGATTCAGCTTGTACACCAGTTTTTACATCACTGTTAAACCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79209	TCATTTCAGATTCAGCTTGTACACCAGTTTTTACATCACTGTTAAACCTA	79258

CU210934.6	1501	TCACTTTGTTTTCTTGGGTTGACATTTCACTTGTGTGCATGAATACACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79259	TCACTTTGTTTTCTTGGGTTGACATTTCACTTGTGTGCATGAATACACAT	79308

CU210934.6	1551	GTGCATGTAGAGGCTTGAGAACCCCCGGGAGCACGTTTGCCAGCGCTGTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79309	GTGCATGTAGAGGCTTGAGAACCCCCGGGAGCACGTTTGCCAGCGCTGTC	79358

CU210934.6	1601	CAGTCTCCCTTATATTGTGTGCGCATCTATAGTGCATGCTTTGGTGGGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79359	CAGTCTCCCTTATATTGTGTGCGCATCTATAGTGCATGCTTTGGTGGGTG	79408

CU210934.6	1651	GGTGGGGGTGTGCGTGTGTGCTCCCTCTGGATGGGTGCTCCTGTCACAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79409	GGTGGGGGTGTGCGTGTGTGCTCCCTCTGGATGGGTGCTCCTGTCACAGC	79458

CU210934.6	1701	ACACATGTGGAACTCAGAGAACAACTTTCACTTTATTTTCTCCTACCATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79459	ACACATGTGGAACTCAGAGAACAACTTTCACTTTATTTTCTCCTACCATG	79508

CU210934.6	1751	TGGGGTTCCAGGCTTCAAATTCCGGTCATCAGAGTTTTGTGGCAAGTGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79509	TGGGGTTCCAGGCTTCAAATTCCGGTCATCAGAGTTTTGTGGCAAGTGCT	79558

CU210934.6	1801	TTTAACAGTCATTTGCCCTGGCCATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79559	TTTAACAGTCATTTGCCCTGGCCATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGA	79608

CU210934.6	1851	GATAGTCTATTACTGTCTGGGATTGGCCCGTAGGCTAGGCTAGATGCCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79609	GATAGTCTATTACTGTCTGGGATTGGCCCGTAGGCTAGGCTAGATGCCAG	79658

CU210934.6	1901	AGAATCTGAAAGATCCTGGTATTTCTGCTTTCCCAGTCCTGGGACTGTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79659	AGAATCTGAAAGATCCTGGTATTTCTGCTTTCCCAGTCCTGGGACTGTCA	79708

CU210934.6	1951	GGTGCGCTGTCAGCCCATGCAAGGCTGATGCTTTGCTGGCTGGGCTGTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU424443.7	79709	GGTGCGCTGTCAGCCCATGCAAGGCTGATGCTTTGCTGGCTGGGCTGTCT	79758

Overview

Query
CU210934.6 - 176559 bps
Hit
CU424443.7 - 79758 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link