<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU407311.8 1 GAATTCATTTTATGTTAGGGCAAATTCAAGTCTCTGTTATGCATATGGTA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145550 GAATTCATTTTATGTTAGGGCAAATTCAAGTCTCTGTTATGCATATGGTA 145599 CU407311.8 51 AGATTCATTATGCATTTACATAAACTAGATTTTCTGATAGGAATTTGATG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145600 AGATTCATTATGCATTTACATAAACTAGATTTTCTGATAGGAATTTGATG 145649 CU407311.8 101 AGCTTAGAGTGATGTTAGATGTGTCTGACACCAAATTGGTAGCTTCACCT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145650 AGCTTAGAGTGATGTTAGATGTGTCTGACACCAAATTGGTAGCTTCACCT 145699 CU407311.8 151 TAGATTCAATAATTTCCTTATCTAATAAAACTTCATGGTTTACATGTGGA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145700 TAGATTCAATAATTTCCTTATCTAATAAAACTTCATGGTTTACATGTGGA 145749 CU407311.8 201 GTTGAAATACTGCTTAATGATTCCCTTTATCAGTAATAGAGATAAGGAAT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145750 GTTGAAATACTGCTTAATGATTCCCTTTATCAGTAATAGAGATAAGGAAT 145799 CU407311.8 251 GGATACAAACCAGCAAGTATAAACAAACAAACAAACAAACAAATAAATAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145800 GGATACAAACCAGCAAGTATAAACAAACAAACAAACAAACAAATAAATAA 145849 CU407311.8 301 ATATGTTCACTCTGGTTTTCCAAGCAGTTTGTATTTACAGAGTGATCTAG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145850 ATATGTTCACTCTGGTTTTCCAAGCAGTTTGTATTTACAGAGTGATCTAG 145899 CU407311.8 351 AGAGAATATCGTGAGTACGTTCCGTCTTCCTGTCGCCAAGTCTACTCTTC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145900 AGAGAATATCGTGAGTACGTTCCGTCTTCCTGTCGCCAAGTCTACTCTTC 145949 CU407311.8 401 CCTGTGATTAGCTACATTTATATTTTGCTATGATAGTTTATACTTTTCTA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 145950 CCTGTGATTAGCTACATTTATATTTTGCTATGATAGTTTATACTTTTCTA 145999 CU407311.8 451 AACAAAAATCTTCCTAGTATGTTGCTGGTGCTGTCTGAATGTGCACACAC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146000 AACAAAAATCTTCCTAGTATGTTGCTGGTGCTGTCTGAATGTGCACACAC 146049 CU407311.8 501 ATATATTTTTGATGAAAAATATTGTGTACTTGTATGTACAGACATAAAAT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146050 ATATATTTTTGATGAAAAATATTGTGTACTTGTATGTACAGACATAAAAT 146099 CU407311.8 551 TCTCTTCAGCAGCAGCATGCAGTTGAAAGTTGACATTTTTTAACTACTAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146100 TCTCTTCAGCAGCAGCATGCAGTTGAAAGTTGACATTTTTTAACTACTAT 146149 CU407311.8 601 TGTTGAAAGTAACATGGTTGTGACTTTGGTTTCATTTGTTTCTGCCAGAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146150 TGTTGAAAGTAACATGGTTGTGACTTTGGTTTCATTTGTTTCTGCCAGAA 146199 CU407311.8 651 TTTTATTTAGAATGATTTTGTAACCTACATTATTAAACTTCGTATTAATA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146200 TTTTATTTAGAATGATTTTGTAACCTACATTATTAAACTTCGTATTAATA 146249 CU407311.8 701 TCTGTTTTTTTCTTCCTATGTATCTGATTATATGTAGAGGAAGCGATGAC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146250 TCTGTTTTTTTCTTCCTATGTATCTGATTATATGTAGAGGAAGCGATGAC 146299 CU407311.8 751 AATTTTGTATTCTTAGATATTCTAATCCTTTTTGTGTATTTATTTGGCCA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146300 AATTTTGTATTCTTAGATATTCTAATCCTTTTTGTGTATTTATTTGGCCA 146349 CU407311.8 801 TTTGTTTCATTGCCCCATTGCATATTGTTCTAGATACCGTGTGGGATAGC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146350 TTTGTTTCATTGCCCCATTGCATATTGTTCTAGATACCGTGTGGGATAGC 146399 CU407311.8 851 TTTGGCTATCCTAACCCCATGCCTGATGTGAGAAGCAAGGCAGATGTCTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146400 TTTGGCTATCCTAACCCCATGCCTGATGTGAGAAGCAAGGCAGATGTCTT 146449 CU407311.8 901 TTCCAAGATCAATTAAATTGCTTTTTACTACAGATTTCCTGAGAAACCAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146450 TTCCAAGATCAATTAAATTGCTTTTTACTACAGATTTCCTGAGAAACCAG 146499 CU407311.8 951 ATCTCTCAAAAAGAAACAAAGAAGAACCACGACTTTAAGACCCAGTGCAA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146500 ATCTCTCAAAAAGAAACAAAGAAGAACCACGACTTTAAGACCCAGTGCAA 146549 CU407311.8 1001 ACGTCCACCACCATCCCTTTTATGAGTTTATGTGGGTGAATAAGTATTGT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146550 ACGTCCACCACCATCCCTTTTATGAGTTTATGTGGGTGAATAAGTATTGT 146599 CU407311.8 1051 TTTATATACATCTCTCAATTAGTACAAATTGCATTAACTGATTCTCAAAT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146600 TTTATATACATCTCTCAATTAGTACAAATTGCATTAACTGATTCTCAAAT 146649 CU407311.8 1101 GTTGCACCACTCTGGCCTTTCTACATAGATTGGTGTCTCTGGATTTAGTC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146650 GTTGCACCACTCTGGCCTTTCTACATAGATTGGTGTCTCTGGATTTAGTC 146699 CU407311.8 1151 TCTAATACTTTCTCAATAGCTAAGGGCACACACAGCAGCAGCCATTGTCT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146700 TCTAATACTTTCTCAATAGCTAAGGGCACACACAGCAGCAGCCATTGTCT 146749 CU407311.8 1201 CTGCTCCTGACTGTGTGTGAGTGTATTCCAAGCATCCATTCTCTTCGTCC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146750 CTGCTCCTGACTGTGTGTGAGTGTATTCCAAGCATCCATTCTCTTCGTCC 146799 CU407311.8 1251 TTGACTCTGCATGTCTATAGTCCAAGCATCCATTCTCTCCGTCCTTGACT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146800 TTGACTCTGCATGTCTATAGTCCAAGCATCCATTCTCTCCGTCCTTGACT 146849 CU407311.8 1301 CTGCATGTCTATAGTCCAAGCATCCATTCTCTTTGCTCCTGAATGTGCAT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146850 CTGCATGTCTATAGTCCAAGCATCCATTCTCTTTGCTCCTGAATGTGCAT 146899 CU407311.8 1351 GGAGTGCCCTTGTGTTTCTGCCTTGATGTTACAGCAGATGTGGCTGGAAT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146900 GGAGTGCCCTTGTGTTTCTGCCTTGATGTTACAGCAGATGTGGCTGGAAT 146949 CU407311.8 1401 CTGGAATTGTCAATCAATCAATTCCATCTTCCATCAGTTGCTTTTGTCAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 146950 CTGGAATTGTCAATCAATCAATTCCATCTTCCATCAGTTGCTTTTGTCAG 146999 CU407311.8 1451 AGTGTTTGTCATGGTGACAGAAAGGAAGCTAAATGGACTAAACCTGGAAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147000 AGTGTTTGTCATGGTGACAGAAAGGAAGCTAAATGGACTAAACCTGGAAG 147049 CU407311.8 1501 CAGAGCCCCTGGGGCTGGAAGAAGGGACTGAGGAAGACCTTCACCAGCCC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147050 CAGAGCCCCTGGGGCTGGAAGAAGGGACTGAGGAAGACCTTCACCAGCCC 147099 CU407311.8 1551 GACTCCACTGACCTATTTCTGAAGCCAAGCTAACCACTTCCTTAATTTCA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147100 GACTCCACTGACCTATTTCTGAAGCCAAGCTAACCACTTCCTTAATTTCA 147149 CU407311.8 1601 CAATCAGCCACTGTAGAGGATCTGAAACATGAGACTCTGTCATAGAACCC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147150 CAATCAGCCACTGTAGAGGATCTGAAACATGAGACTCTGTCATAGAACCC 147199 CU407311.8 1651 AGGCTGGCCCTCAGTGTCCCCTGGCCATTTCCTAATGCAAAGGATGTTAT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147200 AGGCTGGCCCTCAGTGTCCCCTGGCCATTTCCTAATGCAAAGGATGTTAT 147249 CU407311.8 1701 TACCAGTGGTTATTACCAGTGTCCACAATCGCCCCTGCTCTGTCATTGTC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147250 TACCAGTGGTTATTACCAGTGTCCACAATCGCCCCTGCTCTGTCATTGTC 147299 CU407311.8 1751 ATTAGTTACCCAAGGCCAGGCCCTCACTTTTGAGATTTGTTCTGCTAAGG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147300 ATTAGTTACCCAAGGCCAGGCCCTCACTTTTGAGATTTGTTCTGCTAAGG 147349 CU407311.8 1801 ATAAGCATAAAAGCCATTACAAGAGCCAAATAATAATTCTCATTCTTTCC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147350 ATAAGCATAAAAGCCATTACAAGAGCCAAATAATAATTCTCATTCTTTCC 147399 CU407311.8 1851 TTTTAGTAAATCTGTTTGGGGAGTTCATACATAAGTAAGTATACTGAATT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147400 TTTTAGTAAATCTGTTTGGGGAGTTCATACATAAGTAAGTATACTGAATT 147449 CU407311.8 1901 TGTATATTTACATCATTTCCACCATTCCCTCTACCACCCAGCTTCTCCCA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147450 TGTATATTTACATCATTTCCACCATTCCCTCTACCACCCAGCTTCTCCCA 147499 CU407311.8 1951 CGATCCCCCAACCACCTGCTCACACTTTCAGAATTCATGGCATCTTCACA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU424424.15 147500 CGATCCCCCAACCACCTGCTCACACTTTCAGAATTCATGGCATCTTCACA 147549
