<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU424437.12 1 GAATTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTAGAACTCAGAAATCCGCCTGCC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125400 GAATTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTAGAACTCAGAAATCCGCCTGCC 125449 CU424437.12 51 TCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGAGCTGCTTTTTTTTTTTT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125450 TCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGAGCTGCTTTTTTTTTTTT 125499 CU424437.12 101 TTTTTAAAGATTTATTTATTACATGCATACACTGTAGCTGTCTTCAGACA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125500 TTTTTAAAGATTTATTTATTACATGCATACACTGTAGCTGTCTTCAGACA 125549 CU424437.12 151 CTCCAGAAGAGGGAGTCAGATCTTGTTACAGATGGTTATAAGCCACCATG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125550 CTCCAGAAGAGGGAGTCAGATCTTGTTACAGATGGTTATAAGCCACCATG 125599 CU424437.12 201 TGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCAGAAGAGCAGTTGGTGCTCT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125600 TGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCAGAAGAGCAGTTGGTGCTCT 125649 CU424437.12 251 TAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCACTGTCTAAGCTTACTTACAAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125650 TAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCACTGTCTAAGCTTACTTACAAA 125699 CU424437.12 301 GGCGGATCTCTGAATTCATTTGTAATGTTAAAAAAAATGTCAAATGGGCT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125700 GGCGGATCTCTGAATTCATTTGTAATGTTAAAAAAAATGTCAAATGGGCT 125749 CU424437.12 351 GGTGTCAAGGAATGTTTGTAGGACAGTCAAATTGGGACCTGGAATAAATG 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125750 GGTGTCAAGGAATGTTTGTAGGACAGTCAAATTGGGACCTGGAATAAATG 125799 CU424437.12 401 ACTTGATTGATATGTAAATAAAAGACTGGACTCTGGTCTTGAAAGCTGAG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125800 ACTTGATTGATATGTAAATAAAAGACTGGACTCTGGTCTTGAAAGCTGAG 125849 CU424437.12 451 CTTTGAGTTGTTCTTCTTGCAGCTTCATTTCCTCAGAACCCCTCACCAAG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125850 CTTTGAGTTGTTCTTCTTGCAGCTTCATTTCCTCAGAACCCCTCACCAAG 125899 CU424437.12 501 CTGAGGCAGGTCCTTGGCACAGGGCTACATGCATACTACACATGAACTCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125900 CTGAGGCAGGTCCTTGGCACAGGGCTACATGCATACTACACATGAACTCT 125949 CU424437.12 551 ACCAATTGAGCAACATTTCTGAACCCTCTCTTTTTCCTTTCTATGCAGTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 125950 ACCAATTGAGCAACATTTCTGAACCCTCTCTTTTTCCTTTCTATGCAGTC 125999 CU424437.12 601 TAGACTGGCCTTGATTTCCTTCCTCAGGCCTTCTATTTTGTTAGAATTAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126000 TAGACTGGCCTTGATTTCCTTCCTCAGGCCTTCTATTTTGTTAGAATTAT 126049 CU424437.12 651 AGAATCATCCTTCTCTTTAGTAGGTAACAACAAGCCCCATTATTTTGTGG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126050 AGAATCATCCTTCTCTTTAGTAGGTAACAACAAGCCCCATTATTTTGTGG 126099 CU424437.12 701 TTTAACTAGTCTTTCAGAGGGAGTGTGGGATATGGCTGAGATTTACATTT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126100 TTTAACTAGTCTTTCAGAGGGAGTGTGGGATATGGCTGAGATTTACATTT 126149 CU424437.12 751 TTTTTTTTTTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGTTCTGG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126150 TTTTTTTTTTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGTTCTGG 126199 CU424437.12 801 AACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTAGAACTCAGAAATCCGCCTGCCT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126200 AACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTAGAACTCAGAAATCCGCCTGCCT 126249 CU424437.12 851 CTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGTGGCACCACCGGCTCTGAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126250 CTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGTGGCACCACCGGCTCTGAT 126299 CU424437.12 901 TTACATTTTATAAGACTATGTTGGCGTAAGAAAATTCTACCTTTTCCTAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126300 TTACATTTTATAAGACTATGTTGGCGTAAGAAAATTCTACCTTTTCCTAG 126349 CU424437.12 951 TACTCCAGAGTTTTTAAGGAAAAAAAATCATATAAATCTAGCAAACACTG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126350 TACTCCAGAGTTTTTAAGGAAAAAAAATCATATAAATCTAGCAAACACTG 126399 CU424437.12 1001 TATAAACACTTTTGCATATAGAAAAAAATAGGAGAACTAAAGTTGCTAAC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126400 TATAAACACTTTTGCATATAGAAAAAAATAGGAGAACTAAAGTTGCTAAC 126449 CU424437.12 1051 TATACAAATAGCAATCTTTATTGTCTTAGTAACATTATTTTTAAAAAGAT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126450 TATACAAATAGCAATCTTTATTGTCTTAGTAACATTATTTTTAAAAAGAT 126499 CU424437.12 1101 TTGTTTTTATTTTATGTGTATGGGTGTTTTACCTGAATGTATGTCTATGC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126500 TTGTTTTTATTTTATGTGTATGGGTGTTTTACCTGAATGTATGTCTATGC 126549 CU424437.12 1151 ACCACATGTATGCTCAGTAACTGTAGAAATTAAAGAGGGCACCTGACTCC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126550 ACCACATGTATGCTCAGTAACTGTAGAAATTAAAGAGGGCACCTGACTCC 126599 CU424437.12 1201 CTGAAACTGGAGTTTAAAAGGGATATAGGCCATCCTGTGGGTGCTGGCAA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126600 CTGAAACTGGAGTTTAAAAGGGATATAGGCCATCCTGTGGGTGCTGGCAA 126649 CU424437.12 1251 TCAAACCCTGGTCTTCTACAAGAAGCAGCCAGTGCCCATACCGCGGAGCC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126650 TCAAACCCTGGTCTTCTACAAGAAGCAGCCAGTGCCCATACCGCGGAGCC 126699 CU424437.12 1301 ATCTCTCCAGTCCATGCTATCTTAGTGATATATTTTTAAATACTAGTGGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126700 ATCTCTCCAGTCCATGCTATCTTAGTGATATATTTTTAAATACTAGTGGT 126749 CU424437.12 1351 TTGTGTCCCTGAACATTGTGATGGTTCTTTGCATCTATTGGATCCTGTAA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126750 TTGTGTCCCTGAACATTGTGATGGTTCTTTGCATCTATTGGATCCTGTAA 126799 CU424437.12 1401 TGACTGCTGCTACAATGGCTTTTTAAATTACTAGTCCCAGTACTAATTAC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126800 TGACTGCTGCTACAATGGCTTTTTAAATTACTAGTCCCAGTACTAATTAC 126849 CU424437.12 1451 TGGAAAAAAAAAAGATCTCAAAAATGGCGTGTATGATTGATGAGTAAAAC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126850 TGGAAAAAAAAAAGATCTCAAAAATGGCGTGTATGATTGATGAGTAAAAC 126899 CU424437.12 1501 GACTAATACAACAGTAAAAACATTAGCAGGAACAAAGACACGAGCAAGCT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126900 GACTAATACAACAGTAAAAACATTAGCAGGAACAAAGACACGAGCAAGCT 126949 CU424437.12 1551 GAGAGCCACAGCTTACAAAACAGAGCTACTGTAGATGATTTGTTGCTCAA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 126950 GAGAGCCACAGCTTACAAAACAGAGCTACTGTAGATGATTTGTTGCTCAA 126999 CU424437.12 1601 GCATAACCTTGCCAATAATTTCTTGGCAGGTGTTGCTTTAATGTGTCGGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127000 GCATAACCTTGCCAATAATTTCTTGGCAGGTGTTGCTTTAATGTGTCGGA 127049 CU424437.12 1651 TTTCTCTCAATCAATGTACTTTATCAATGGTTGAATAGATGATCTGCATG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127050 TTTCTCTCAATCAATGTACTTTATCAATGGTTGAATAGATGATCTGCATG 127099 CU424437.12 1701 AAGAGACAAACTAAATTTCTCAAGTGATCTTTAACTAGCTGTCATGGTTA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127100 AAGAGACAAACTAAATTTCTCAAGTGATCTTTAACTAGCTGTCATGGTTA 127149 CU424437.12 1751 GGATGGCTTTTCCCTTTCCTTGGTACTCTGCGAGCTATTCTTACAATCTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127150 GGATGGCTTTTCCCTTTCCTTGGTACTCTGCGAGCTATTCTTACAATCTT 127199 CU424437.12 1801 GCTATGCCTGCCCACAATAGCTAGACTAGCCATGCAAGTTGCATTCAACC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127200 GCTATGCCTGCCCACAATAGCTAGACTAGCCATGCAAGTTGCATTCAACC 127249 CU424437.12 1851 TTGGTCTCTATTACAACACAAGAGAGAAGCTGTCGTGGGCACAGACGTGC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127250 TTGGTCTCTATTACAACACAAGAGAGAAGCTGTCGTGGGCACAGACGTGC 127299 CU424437.12 1901 ACATGGGATTGTTCCTTCAAGGAAAGGATGCAAAACCTGTTCTCTGTCCA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127300 ACATGGGATTGTTCCTTCAAGGAAAGGATGCAAAACCTGTTCTCTGTCCA 127349 CU424437.12 1951 AAAGGCTGGAGCTTTCTAGTATGGTGACCTCTGCACTCTGTGTGCAAATG 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU407331.10 127350 AAAGGCTGGAGCTTTCTAGTATGGTGACCTCTGCACTCTGTGTGCAAATG 127399
