<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU442759.10	1	GAATTCTTCGGAACTGTTGTTGCTCAAAGGCTGTCACCATAGCAACAAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50008	GAATTCTTCGGAACTGTTGTTGCTCAAAGGCTGTCACCATAGCAACAAGG	50057

CU442759.10	51	TCAATAGGAAATGGCAGCCGTGAGTAGGTTTCATCCTCACTGTATCCTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50058	TCAATAGGAAATGGCAGCCGTGAGTAGGTTTCATCCTCACTGTATCCTTG	50107

CU442759.10	101	TTGACAGGAATAAAGGCCCTGCTTCTGATTTCTTGGCTCAACTAGATGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50108	TTGACAGGAATAAAGGCCCTGCTTCTGATTTCTTGGCTCAACTAGATGAA	50157

CU442759.10	151	GTTTTCATTAGATTTAACTTCTCATATCCAGACACCCACATGCTAGTCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50158	GTTTTCATTAGATTTAACTTCTCATATCCAGACACCCACATGCTAGTCAG	50207

CU442759.10	201	CTCCCCATCTCCGCTCTCATTTGGAGGAGCACCATCGGGGCTGAGGGTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50208	CTCCCCATCTCCGCTCTCATTTGGAGGAGCACCATCGGGGCTGAGGGTTT	50257

CU442759.10	251	GGCGTGGCGTGCATACTGGCTGTGTGCAAGGATCCTCTGCGTGCAGCATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50258	GGCGTGGCGTGCATACTGGCTGTGTGCAAGGATCCTCTGCGTGCAGCATC	50307

CU442759.10	301	TCCAAGGAGCCTGGTTACTGTGTTGGGAGTCAGCATGCTAGAAGCCCCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50308	TCCAAGGAGCCTGGTTACTGTGTTGGGAGTCAGCATGCTAGAAGCCCCTT	50357

CU442759.10	351	TCTACTGGGAGACCTAGACTTCATGCTCGGTCACACCCACCTCTGGAGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50358	TCTACTGGGAGACCTAGACTTCATGCTCGGTCACACCCACCTCTGGAGAA	50407

CU442759.10	401	AGCCAGAAGCTGAGGTTTGGTGTCAGCTGTGGAGTGGGGAACTCACCCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50408	AGCCAGAAGCTGAGGTTTGGTGTCAGCTGTGGAGTGGGGAACTCACCCTG	50457

CU442759.10	451	GCCATATTGTTTCAGAGGAGAGGGGCACTGGATGTGAGGGGCCGGGATGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50458	GCCATATTGTTTCAGAGGAGAGGGGCACTGGATGTGAGGGGCCGGGATGC	50507

CU442759.10	501	CTAAATCAGGGAATCTAGACCACATAGTGATAGTGTAGCCTTGGCTTGGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50508	CTAAATCAGGGAATCTAGACCACATAGTGATAGTGTAGCCTTGGCTTGGA	50557

CU442759.10	551	AAACCGTAAAGGCGGACGGACATGCTAGAAACTGTCCTTGGCTGAGAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50558	AAACCGTAAAGGCGGACGGACATGCTAGAAACTGTCCTTGGCTGAGAGCT	50607

CU442759.10	601	TAGCCTCTTCTCCCTGGGATGGTGACTCTTCACAATGGTAGTGAATGTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50608	TAGCCTCTTCTCCCTGGGATGGTGACTCTTCACAATGGTAGTGAATGTGC	50657

CU442759.10	651	CAGAAACCCTGACTTGCTGGCAATGCTGGAAGATCAGTGTGGCAGCGAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50658	CAGAAACCCTGACTTGCTGGCAATGCTGGAAGATCAGTGTGGCAGCGAGA	50707

CU442759.10	701	GGAGTCACTCCTGGTGTCGGCTTCAAACCTGGAGTCCCTAGTCCTTCCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50708	GGAGTCACTCCTGGTGTCGGCTTCAAACCTGGAGTCCCTAGTCCTTCCTG	50757

CU442759.10	751	CTACTCGAGGGAAGAGCCAGTCAACGGGGAAACATGTAGTCGTAAATAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50758	CTACTCGAGGGAAGAGCCAGTCAACGGGGAAACATGTAGTCGTAAATAGT	50807

CU442759.10	801	TGGGTACCCAGTCCTACAGGGCCACTTGAAATTAGGGACATTTCATATGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50808	TGGGTACCCAGTCCTACAGGGCCACTTGAAATTAGGGACATTTCATATGG	50857

CU442759.10	851	CTGGCTTCCCTTAGGGGAAACTCCCTTCTAACTCTCCACTATGTGGTCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50858	CTGGCTTCCCTTAGGGGAAACTCCCTTCTAACTCTCCACTATGTGGTCCA	50907

CU442759.10	901	GAGATCTTGATTCTTACAGAGACATAAAACCTAGGGAGATGGAGTGCCAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50908	GAGATCTTGATTCTTACAGAGACATAAAACCTAGGGAGATGGAGTGCCAC	50957

CU442759.10	951	ACTTCACTAGAGCGTCTCCTCTTTAGCGAGCTGATCTCTGAGTTAGAATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	50958	ACTTCACTAGAGCGTCTCCTCTTTAGCGAGCTGATCTCTGAGTTAGAATC	51007

CU442759.10	1001	AGACCCTTGACTCTCAGGCTTAGGGCAGGTCTGAGAATAAGCCACAAAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51008	AGACCCTTGACTCTCAGGCTTAGGGCAGGTCTGAGAATAAGCCACAAAGG	51057

CU442759.10	1051	TTGGTTGGGCTGGTGAATGGGGAGGAGAAAGCCAAAGGAGACTTCTGGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51058	TTGGTTGGGCTGGTGAATGGGGAGGAGAAAGCCAAAGGAGACTTCTGGAA	51107

CU442759.10	1101	CAGCCTACGGGTACAAGTGCCCAAGGAGCCTCAAAGAACAAGCAGCGAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51108	CAGCCTACGGGTACAAGTGCCCAAGGAGCCTCAAAGAACAAGCAGCGAGG	51157

CU442759.10	1151	GACAGGCAGGAAATCAGAAGCATGTTCTTTCTGGGGGACACATCCGCTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51158	GACAGGCAGGAAATCAGAAGCATGTTCTTTCTGGGGGACACATCCGCTCA	51207

CU442759.10	1201	ATAGAATCTAGCCTGAAGGAAAAAAAAGAACATTTGCAAAACAAACCAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51208	ATAGAATCTAGCCTGAAGGAAAAAAAAGAACATTTGCAAAACAAACCAAG	51257

CU442759.10	1251	GTCCCACGGGCAGGGGTGGGAGGTGTCTGCCAAAGGCACCCACCTCTGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51258	GTCCCACGGGCAGGGGTGGGAGGTGTCTGCCAAAGGCACCCACCTCTGTG	51307

CU442759.10	1301	CCAGGCTGGAAGATGGCCAAGGTGCAGCAGGATGAGGTCTGCAGCCAGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51308	CCAGGCTGGAAGATGGCCAAGGTGCAGCAGGATGAGGTCTGCAGCCAGGA	51357

CU442759.10	1351	GTGTGGCAGAGCAGAGCAGGGCTCAGCCAATCTGAGGCTCCAGGACAGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51358	GTGTGGCAGAGCAGAGCAGGGCTCAGCCAATCTGAGGCTCCAGGACAGTA	51407

CU442759.10	1401	GCTCCTTTCCCAGGGACAGCAGAGGGCACAGGGAATCCTCTGCAGGCCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51408	GCTCCTTTCCCAGGGACAGCAGAGGGCACAGGGAATCCTCTGCAGGCCTT	51457

CU442759.10	1451	TGGGGGTCTATCTTTGTTTTCCCAGACTCTCAGGTCCTGCAGTGACTGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51458	TGGGGGTCTATCTTTGTTTTCCCAGACTCTCAGGTCCTGCAGTGACTGCA	51507

CU442759.10	1501	GGACACAAGACTTCTCTCCCTAAGGACAGAGCTGCTATTCTTGGCCCCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51508	GGACACAAGACTTCTCTCCCTAAGGACAGAGCTGCTATTCTTGGCCCCAG	51557

CU442759.10	1551	GGACAAAGGTATAGGTATGGTCCATACTCAGGACTTTTCTTGAGTTACAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51558	GGACAAAGGTATAGGTATGGTCCATACTCAGGACTTTTCTTGAGTTACAG	51607

CU442759.10	1601	TCAACAAGTGTTCAGCAAGGACACCCCCCCCCCCCCCCCGTGTCAGCCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51608	TCAACAAGTGTTCAGCAAGGACACCCCCCCCCCCCCCCCGTGTCAGCCAG	51657

CU442759.10	1651	GCCTTGGTGGCACAGGCCTGAAATCCAAGCAACCCAGAAGGCTGAGATGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51658	GCCTTGGTGGCACAGGCCTGAAATCCAAGCAACCCAGAAGGCTGAGATGG	51707

CU442759.10	1701	GAGGAGCATAAGTTCAAATCCAGTCCGGGAAACTTAGCAAGATCCTATCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51708	GAGGAGCATAAGTTCAAATCCAGTCCGGGAAACTTAGCAAGATCCTATCT	51757

CU442759.10	1751	CAAAATGGAAAATAGAAAAAGGGCTTAGCACTGTGGCTTAGTGGTAGCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51758	CAAAATGGAAAATAGAAAAAGGGCTTAGCACTGTGGCTTAGTGGTAGCAC	51807

CU442759.10	1801	TTGCCCAGCATGCGTGAGGCTCTGGGTTTGAACCCCAGCCTCATGGCTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51808	TTGCCCAGCATGCGTGAGGCTCTGGGTTTGAACCCCAGCCTCATGGCTTC	51857

CU442759.10	1851	CAAGAGATCACACTGTGTGCTGGCACCAAGACTCAAACTACAAATCCAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51858	CAAGAGATCACACTGTGTGCTGGCACCAAGACTCAAACTACAAATCCAGA	51907

CU442759.10	1901	AAATATTAAGGGTTGTAGTTCTTAATTAGGAGCCTAGGGAGACATCTCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51908	AAATATTAAGGGTTGTAGTTCTTAATTAGGAGCCTAGGGAGACATCTCAG	51957

CU442759.10	1951	TTCTGGAACACCCAGAAACTAGGTCTCCCATCTCCGGGACATTTCCCTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407306.7	51958	TTCTGGAACACCCAGAAACTAGGTCTCCCATCTCCGGGACATTTCCCTCT	52007

Overview

Query
CU442759.10 - 166068 bps
Hit
CU407306.7 - 52007 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link