<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207308.6	1	GAATTCATTCTTCTGGGTTTGGTGGAGACACCAGAGCTGTGGCCACTTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87608	GAATTCATTCTTCTGGGTTTGGTGGAGACACCAGAGCTGTGGCCACTTGT	87657

CU207308.6	51	CTTCATACTCTTCCTCTTGGCTTACATGACAACAGTTGGAGGTAACCTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87658	CTTCATACTCTTCCTCTTGGCTTACATGACAACAGTTGGAGGTAACCTGA	87707

CU207308.6	101	GCATCCTGGCAGCTGTCTTGGTGGAACCCAAACTGCACACTCCCATGTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87708	GCATCCTGGCAGCTGTCTTGGTGGAACCCAAACTGCACACTCCCATGTAC	87757

CU207308.6	151	TTCTTCCTGGGGAATCTGTCAGTGATGGATGTGGGGTGCATCAGTGTCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87758	TTCTTCCTGGGGAATCTGTCAGTGATGGATGTGGGGTGCATCAGTGTCAC	87807

CU207308.6	201	TATTCCCTCCATGTTGGTTCGGCTCTTGGTCCAAAAGCATACAATTCCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87808	TATTCCCTCCATGTTGGTTCGGCTCTTGGTCCAAAAGCATACAATTCCAT	87857

CU207308.6	251	ATGGAGACTGCCTCACACAGCTCTTCTTCTTCCATCTGCTGGCTGGGGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87858	ATGGAGACTGCCTCACACAGCTCTTCTTCTTCCATCTGCTGGCTGGGGTT	87907

CU207308.6	301	GACTGTTTCCTGTTGACAGCCATGGCTTATGACCGCTTCCTGGCCATCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87908	GACTGTTTCCTGTTGACAGCCATGGCTTATGACCGCTTCCTGGCCATCTG	87957

CU207308.6	351	CCAGCCCCTCACTTACAGCACCCGAATGAACTACACTATACAGAGGATCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	87958	CCAGCCCCTCACTTACAGCACCCGAATGAACTACACTATACAGAGGATCT	88007

CU207308.6	401	TGGTGGCTATGTCCTGGGCTTGTGCCTTTAGCAATGCACTGACACACACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88008	TGGTGGCTATGTCCTGGGCTTGTGCCTTTAGCAATGCACTGACACACACA	88057

CU207308.6	451	GTAGCCATATCCACACTTCACTTCTGTGGCCCAAATGTAATCAATCACTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88058	GTAGCCATATCCACACTTCACTTCTGTGGCCCAAATGTAATCAATCACTT	88107

CU207308.6	501	CTACTGTGACCTGCCTCAGCTCTTCCAGCTGTCCTGCTCCAGTACCCAGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88108	CTACTGTGACCTGCCTCAGCTCTTCCAGCTGTCCTGCTCCAGTACCCAGC	88157

CU207308.6	551	TCAATGAGCTGCTGCTCTTTGGAGTGGGTTTCATAATGGCAGGAACCCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88158	TCAATGAGCTGCTGCTCTTTGGAGTGGGTTTCATAATGGCAGGAACCCCT	88207

CU207308.6	601	ATGGCACTCATTTTTATCTCTTATATCCATGTGGCAGCTGCAGTTCTGCG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88208	ATGGCACTCATTTTTATCTCTTATATCCATGTGGCAGCTGCAGTTCTGCG	88257

CU207308.6	651	AATTCGCTCTGCTGAAGGCAGAAAGAAAGCTTTCTCCACATGCAGCTCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88258	AATTCGCTCTGCTGAAGGCAGAAAGAAAGCTTTCTCCACATGCAGCTCTC	88307

CU207308.6	701	ACCTCACTGTGGTTGCCATGTTCTATGGCACAGGCATGTTTAACTACATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88308	ACCTCACTGTGGTTGCCATGTTCTATGGCACAGGCATGTTTAACTACATG	88357

CU207308.6	751	AGACTGGGTTCCACCAAATTTTCAGATAAGGACAAAGCTATTGGGATTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88358	AGACTGGGTTCCACCAAATTTTCAGATAAGGACAAAGCTATTGGGATTTT	88407

CU207308.6	801	CAACACTGTCATCAACCCTATGCTGAACCCACTCATCTACAGTCTCAGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88408	CAACACTGTCATCAACCCTATGCTGAACCCACTCATCTACAGTCTCAGGA	88457

CU207308.6	851	ACCCTGATGTGCAGGCTGCCCTCTGGAGGGTACTCACAGGGAGACGGCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88458	ACCCTGATGTGCAGGCTGCCCTCTGGAGGGTACTCACAGGGAGACGGCCA	88507

CU207308.6	901	GCAGCTTGAAGAGGTCTCAAGGTCCCTTCCACATATTTAATTTAAAATAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88508	GCAGCTTGAAGAGGTCTCAAGGTCCCTTCCACATATTTAATTTAAAATAA	88557

CU207308.6	951	CAGCTGAGAATAGGGGTCTCCAGTAGTTTCAAATGCTAGAACAATTTTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88558	CAGCTGAGAATAGGGGTCTCCAGTAGTTTCAAATGCTAGAACAATTTTTC	88607

CU207308.6	1001	AGAACTCTTTCATCTTAGAACTTAATTTAAGGGATGATAATTATTGTTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88608	AGAACTCTTTCATCTTAGAACTTAATTTAAGGGATGATAATTATTGTTGC	88657

CU207308.6	1051	CCAAAGATCATGCCCATGTCTACATGATGGTGTATATATGGATCCTCCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88658	CCAAAGATCATGCCCATGTCTACATGATGGTGTATATATGGATCCTCCTA	88707

CU207308.6	1101	GGTTTGCCCTTTGAAGGTTCTACCTTTACTTAGTGTATTTTCCCTTTAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88708	GGTTTGCCCTTTGAAGGTTCTACCTTTACTTAGTGTATTTTCCCTTTAGC	88757

CU207308.6	1151	TGGAGTTCCCAGAGTATCTCAGAAAATGTTCCTCTTGGGAGTCTTATTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88758	TGGAGTTCCCAGAGTATCTCAGAAAATGTTCCTCTTGGGAGTCTTATTTC	88807

CU207308.6	1201	TTCCTCAAGTTTCGATACCTTTGGTCTATGTATGCAACCTAACTTGAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88808	TTCCTCAAGTTTCGATACCTTTGGTCTATGTATGCAACCTAACTTGAGGA	88857

CU207308.6	1251	GAAATGGCTCATTCCTCTTATACAACTCTATATGATTCAGAGGAAATGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88858	GAAATGGCTCATTCCTCTTATACAACTCTATATGATTCAGAGGAAATGAG	88907

CU207308.6	1301	AGAAATTTTGCACTCTGGTTTCATATTCCCTAGTAACTGGTATCTGCATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88908	AGAAATTTTGCACTCTGGTTTCATATTCCCTAGTAACTGGTATCTGCATG	88957

CU207308.6	1351	CAGTTCACAGACCTGACTGTACATGTCAAAACTCCACTCACAAGATAGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	88958	CAGTTCACAGACCTGACTGTACATGTCAAAACTCCACTCACAAGATAGAG	89007

CU207308.6	1401	ACATTATGATGGAAAAGAGCTTCCCTCAATTATCTTCCTCACATTTCTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89008	ACATTATGATGGAAAAGAGCTTCCCTCAATTATCTTCCTCACATTTCTCA	89057

CU207308.6	1451	ACTTTAAGTGCCACACTACTCAATATTAAATTTCTCTGTAAATTCTCACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89058	ACTTTAAGTGCCACACTACTCAATATTAAATTTCTCTGTAAATTCTCACT	89107

CU207308.6	1501	CTTCACCTCTAAATCCGAAAGATGTAAATCTAAGTTTCAATGCAAATCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89108	CTTCACCTCTAAATCCGAAAGATGTAAATCTAAGTTTCAATGCAAATCAC	89157

CU207308.6	1551	ACTATGATGACTTATCATGTCAGTGAAAAAGTGTGGCTCTACTCTAAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89158	ACTATGATGACTTATCATGTCAGTGAAAAAGTGTGGCTCTACTCTAAAAT	89207

CU207308.6	1601	ATTCTCAATCCCATTTTCTGTTAACTGGCCACCAATCTAGTCATTACTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89208	ATTCTCAATCCCATTTTCTGTTAACTGGCCACCAATCTAGTCATTACTTA	89257

CU207308.6	1651	AGTGCATCTTCCTCCTTACACGTTTTTTAGAATTAATCTATTCTTGAAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89258	AGTGCATCTTCCTCCTTACACGTTTTTTAGAATTAATCTATTCTTGAAAG	89307

CU207308.6	1701	TGCTACTATCTCATTGATACGTCTCTAATCCATAAATCCATCTAACACTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89308	TGCTACTATCTCATTGATACGTCTCTAATCCATAAATCCATCTAACACTC	89357

CU207308.6	1751	TCATCTGATCTGAATATATGAGTTAGCTTCTCCATTATATATGATTTGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89358	TCATCTGATCTGAATATATGAGTTAGCTTCTCCATTATATATGATTTGGG	89407

CU207308.6	1801	TGGGTAGACTGGAGGAATGGGCTAAGATAGAGTTGGAAAGAGGACATAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89408	TGGGTAGACTGGAGGAATGGGCTAAGATAGAGTTGGAAAGAGGACATAAA	89457

CU207308.6	1851	TGAAGGCAGTAGGTAGAGGATTTGTTGGGAAATGCAGATAAACTATGTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89458	TGAAGGCAGTAGGTAGAGGATTTGTTGGGAAATGCAGATAAACTATGTGG	89507

CU207308.6	1901	ACATAGGAGAGATTGGAATCAAGGATCAAAGGGTTGAAAAGAAATAGCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89508	ACATAGGAGAGATTGGAATCAAGGATCAAAGGGTTGAAAAGAAATAGCAG	89557

CU207308.6	1951	AAGCATTACAGAGGTTGACATGGGCTCCAGGGATAGAATAGCATATGAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU406973.8	89558	AAGCATTACAGAGGTTGACATGGGCTCCAGGGATAGAATAGCATATGAGA	89607

Overview

Query
CU207308.6 - 215446 bps
Hit
CU406973.8 - 89607 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link