<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207348.13	1	GAATTCAGGGATCAAAAAGGCATGGAAAAATTTGAACGTCATGTCGAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	44960	GAATTCAGGGATCAAAAAGGCATGGAAAAATTTGAACGTCATGTCGAGCT	45009

CU207348.13	51	GGTATCGGCTTCTGGAACACCGAAAGGATCTCCCATCTCGGCTCCATCGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45010	GGTATCGGCTTCTGGAACACCGAAAGGATCTCCCATCTCGGCTCCATCGT	45059

CU207348.13	101	TTGTGCTTGTGGGAATATCCACCACATCCACAGGGGCAACTGGATCAGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45060	TTGTGCTTGTGGGAATATCCACCACATCCACAGGGGCAACTGGATCAGGA	45109

CU207348.13	151	GCCTCATTCTTGTAGCGTCTCACCAATCTCTCCGGCACCCAAAGAGGTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45110	GCCTCATTCTTGTAGCGTCTCACCAATCTCTCCGGCACCCAAAGAGGTTC	45159

CU207348.13	201	CATCTGGTCCTGTGGAAACACACAAACAGACCCTCTCGCCCACGTCAACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45160	CATCTGGTCCTGTGGAAACACACAAACAGACCCTCTCGCCCACGTCAACA	45209

CU207348.13	251	CCTGATCCTGTCGATCCTCTCCAAATCTCCGGACAGAAGGTCCACCTACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45210	CCTGATCCTGTCGATCCTCTCCAAATCTCCGGACAGAAGGTCCACCTACA	45259

CU207348.13	301	GGTGGCTGCTGAGGAGGCATAGGGAGGCGGCACAAAAGCTAATTCGCCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45260	GGTGGCTGCTGAGGAGGCATAGGGAGGCGGCACAAAAGCTAATTCGCCTT	45309

CU207348.13	351	CCTCCTCCACCTCGGCTCTTTTATTTTGTCCTTTCTGTCCACCTGATAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45310	CCTCCTCCACCTCGGCTCTTTTATTTTGTCCTTTCTGTCCACCTGATAAC	45359

CU207348.13	401	ACTGTGTCTTTCTTTTTCCTTTTTCTTTTTAAGCCCTTCTCCTCTTCCGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45360	ACTGTGTCTTTCTTTTTCCTTTTTCTTTTTAAGCCCTTCTCCTCTTCCGA	45409

CU207348.13	451	CATACTTTCTTGTTGCTCTGTAAGGATTTTCTGACCTGTCTTGACTGCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45410	CATACTTTCTTGTTGCTCTGTAAGGATTTTCTGACCTGTCTTGACTGCCT	45459

CU207348.13	501	CTACACACAGTTTCAAACAGTAACAGAGTCCATATATCAGAACAAACAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45460	CTACACACAGTTTCAAACAGTAACAGAGTCCATATATCAGAACAAACAAG	45509

CU207348.13	551	ACCAAAACTATCAGACCTACCCACAAAGGGTCAATGGGAGAAAAAAGCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45510	ACCAAAACTATCAGACCTACCCACAAAGGGTCAATGGGAGAAAAAAGCAT	45559

CU207348.13	601	AACTACACAGCGAGGATCTATTGATCACTACACTGAGGTTATCATAGTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45560	AACTACACAGCGAGGATCTATTGATCACTACACTGAGGTTATCATAGTTC	45609

CU207348.13	651	CTTAACTTGTCCCCAAACCGGGAACCTTAACTTGTCCCAAAGCCGGGAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45610	CTTAACTTGTCCCCAAACCGGGAACCTTAACTTGTCCCAAAGCCGGGAAC	45659

CU207348.13	701	CTTTCGTTACCTTGTGCCTACTTCCTGGCAACTTTATGCTTGCCTCTATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45660	CTTTCGTTACCTTGTGCCTACTTCCTGGCAACTTTATGCTTGCCTCTATT	45709

CU207348.13	751	TTATCCGAGGTCCTTCCCAAACTCCTGGGGTCGCAAATTTCACTCACCGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45710	TTATCCGAGGTCCTTCCCAAACTCCTGGGGTCGCAAATTTCACTCACCGT	45759

CU207348.13	801	GAACTTACCCTGCCGGCAACCACTGACTGCTGAAAGTTCTGAACTTGGTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45760	GAACTTACCCTGCCGGCAACCACTGACTGCTGAAAGTTCTGAACTTGGTG	45809

CU207348.13	851	GGGGAGTCGCTTCCCCGTACGGGCCACCAATTGTCGCGTCCGCTCTCGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45810	GGGGAGTCGCTTCCCCGTACGGGCCACCAATTGTCGCGTCCGCTCTCGAA	45859

CU207348.13	901	CAGCAAGAACGACACGACCACCAGTCCTTCTAACAGCAGTTTATTCCGTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45860	CAGCAAGAACGACACGACCACCAGTCCTTCTAACAGCAGTTTATTCCGTC	45909

CU207348.13	951	CTCATCTTTCTTCTTTCTCTTCATCAGTACCGTTCCCCAGCTGAAGAGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45910	CTCATCTTTCTTCTTTCTCTTCATCAGTACCGTTCCCCAGCTGAAGAGTT	45959

CU207348.13	1001	CTGAATCCACGCCGGATCCTTCTCAACAGTCTGTTTTACGGGAACTTTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	45960	CTGAATCCACGCCGGATCCTTCTCAACAGTCTGTTTTACGGGAACTTTTA	46009

CU207348.13	1051	TTAACCACTCCTTCCCCGTGATGCAGTTCTGAATCCTCCCTGTAGCAGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46010	TTAACCACTCCTTCCCCGTGATGCAGTTCTGAATCCTCCCTGTAGCAGGG	46059

CU207348.13	1101	GGTCTTCGCTCTTGCCTGAAGATGTTTCTTTTTCCCGGGTTTCGGCACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46060	GGTCTTCGCTCTTGCCTGAAGATGTTTCTTTTTCCCGGGTTTCGGCACCA	46109

CU207348.13	1151	ACTGTTGCGCGCGCTCAACTGGCCAGGAAGAACGACGCTGCTACAGGATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46110	ACTGTTGCGCGCGCTCAACTGGCCAGGAAGAACGACGCTGCTACAGGATC	46159

CU207348.13	1201	CTTCTGCACACATTTATTCAGTCCTATTTCTTCTTGTTTATATCTCTCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46160	CTTCTGCACACATTTATTCAGTCCTATTTCTTCTTGTTTATATCTCTCTT	46209

CU207348.13	1251	GTTTTTATATCTCCCTTGTTTTTATATCTCCCTTGTTTTTATATCTCCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46210	GTTTTTATATCTCCCTTGTTTTTATATCTCCCTTGTTTTTATATCTCCCC	46259

CU207348.13	1301	TGTTTATATCTCCCTTGTTTATATCTCTCCCTTGTTTATATATCTCCCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46260	TGTTTATATCTCCCTTGTTTATATCTCTCCCTTGTTTATATATCTCCCTT	46309

CU207348.13	1351	GTTTATATCTCCCCTGTTTATATATCTCCCTTGTTTTTATATCTCCCTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46310	GTTTATATCTCCCCTGTTTATATATCTCCCTTGTTTTTATATCTCCCTTG	46359

CU207348.13	1401	TTTTTATATCTCTCCCCTGTTTTTATATCTCTCCCTTGTTTATATCTCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46360	TTTTTATATCTCTCCCCTGTTTTTATATCTCTCCCTTGTTTATATCTCCC	46409

CU207348.13	1451	CCGAACCCTGGGCCTCTCACTCTTTTATACTCTCAGTTCCCATCCACGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46410	CCGAACCCTGGGCCTCTCACTCTTTTATACTCTCAGTTCCCATCCACGCA	46459

CU207348.13	1501	CAGCAGGCCACGCCACCTCACCAGGCACGCAGCTTCAGCTAATCAGGGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46460	CAGCAGGCCACGCCACCTCACCAGGCACGCAGCTTCAGCTAATCAGGGCA	46509

CU207348.13	1551	GCAGGGGCAAATCTCCACCAAATTGGATTCACCTGTATCCTGGTACACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46510	GCAGGGGCAAATCTCCACCAAATTGGATTCACCTGTATCCTGGTACACCT	46559

CU207348.13	1601	GCCCAGCACTCAAGATGTTTGTGTCTTATATGAGGAAGTCAGGTGCAAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46560	GCCCAGCACTCAAGATGTTTGTGTCTTATATGAGGAAGTCAGGTGCAAGT	46609

CU207348.13	1651	CATATGACTTAGCTGCAGTCCCTGGCGCCTTTGGGACTGCCGCCACACCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46610	CATATGACTTAGCTGCAGTCCCTGGCGCCTTTGGGACTGCCGCCACACCC	46659

CU207348.13	1701	GCTCCCCACATCTAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAATGTAACATATTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46660	GCTCCCCACATCTAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAATGTAACATATTG	46709

CU207348.13	1751	TTCTGTAAGCATGCATGTGGAAGCATTTTCTTGATTAATGCTAGACGGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46710	TTCTGTAAGCATGCATGTGGAAGCATTTTCTTGATTAATGCTAGACGGGG	46759

CU207348.13	1801	AGGTGGGGCTCAGATCCCTGTAGATAGTGCTATCCCAGCCTAGTTAGACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46760	AGGTGGGGCTCAGATCCCTGTAGATAGTGCTATCCCAGCCTAGTTAGACC	46809

CU207348.13	1851	ATCCTGGGTTAGATAAAAAGAAAGTAAAGCAAGCCAGAGGAAACAAGCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46810	ATCCTGGGTTAGATAAAAAGAAAGTAAAGCAAGCCAGAGGAAACAAGCCA	46859

CU207348.13	1901	ATAGCAAGCATTCTTCCATGACTTCTGCTCCAGTTTTTGCCTTGAGTTCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46860	ATAGCAAGCATTCTTCCATGACTTCTGCTCCAGTTTTTGCCTTGAGTTCC	46909

CU207348.13	1951	TGCCTTGATCTCCTGACTCCCCTCATGATGAACTGTGTTTAGGATATGTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405929.2	46910	TGCCTTGATCTCCTGACTCCCCTCATGATGAACTGTGTTTAGGATATGTG	46959

Overview

Query
CU207348.13 - 126674 bps
Hit
CU405929.2 - 46959 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link