<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207315.17	1	GAATTCACCTGCAGACAGGCTTTGGTGAGCTGCAGAAGGCTCATGCATCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135474	GAATTCACCTGCAGACAGGCTTTGGTGAGCTGCAGAAGGCTCATGCATCT	135523

CU207315.17	51	TCCTGGCTTCTAAACTGTTGTGTTCTGAAGTGAGTTCTGGAAAGAGAGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135524	TCCTGGCTTCTAAACTGTTGTGTTCTGAAGTGAGTTCTGGAAAGAGAGGT	135573

CU207315.17	101	GAGAAATGGGTCAGTAGAAACAGAACCAGAAGGAGACAACATGGGGCAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135574	GAGAAATGGGTCAGTAGAAACAGAACCAGAAGGAGACAACATGGGGCAGA	135623

CU207315.17	151	TTGCATTGAATGGTACAGTAGCAAGGGAGTATACGGTAAATCCACCAAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135624	TTGCATTGAATGGTACAGTAGCAAGGGAGTATACGGTAAATCCACCAAGC	135673

CU207315.17	201	TGGGAGGAATGAAAACAAAGCCTTAGAGAGATAAAGAAGGAAGACAGAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135674	TGGGAGGAATGAAAACAAAGCCTTAGAGAGATAAAGAAGGAAGACAGAGA	135723

CU207315.17	251	GAATGGAAGCTGGAAGGTGCATGGGACACAGACAAGAAGAGGGCAAAGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135724	GAATGGAAGCTGGAAGGTGCATGGGACACAGACAAGAAGAGGGCAAAGAT	135773

CU207315.17	301	GGTGTGACAGTAACCACGACAACATCCCGATAATCCCACCAACCACACGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135774	GGTGTGACAGTAACCACGACAACATCCCGATAATCCCACCAACCACACGT	135823

CU207315.17	351	GAGCCAGCATGTAGCAGTTTACTTACTTCGTTCTCAAATGCTTCAACTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135824	GAGCCAGCATGTAGCAGTTTACTTACTTCGTTCTCAAATGCTTCAACTTT	135873

CU207315.17	401	ATTATACTTAAGTATGTGAACATGAGTGCAGGTGTTATTGGAAGCCAGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135874	ATTATACTTAAGTATGTGAACATGAGTGCAGGTGTTATTGGAAGCCAGAG	135923

CU207315.17	451	ATGTTGGATCCCCTAGAACGGGAGTGGCAGGCAATGGTGAGCTGCCATGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135924	ATGTTGGATCCCCTAGAACGGGAGTGGCAGGCAATGGTGAGCTGCCATGT	135973

CU207315.17	501	GGCTGCTGGGAGCAGAACTCAGGTTAAAGAACCAAGTTTTTATGAGGAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	135974	GGCTGCTGGGAGCAGAACTCAGGTTAAAGAACCAAGTTTTTATGAGGAAA	136023

CU207315.17	551	CTAAGACATGTAGGCATCAATTCTCACCGAGAAGTACCGATGCCATGTAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136024	CTAAGACATGTAGGCATCAATTCTCACCGAGAAGTACCGATGCCATGTAA	136073

CU207315.17	601	ATTGAACATTGGAAGTGCAGCCACAGAACACTCAGTGTTCCTTGAACGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136074	ATTGAACATTGGAAGTGCAGCCACAGAACACTCAGTGTTCCTTGAACGAT	136123

CU207315.17	651	AGCTGCCACTCTACGAAGCTCGGGAAAAATGTTTCTGACTGATACACTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136124	AGCTGCCACTCTACGAAGCTCGGGAAAAATGTTTCTGACTGATACACTTA	136173

CU207315.17	701	GTAAAGTGGTCTCATAAGGCGGTCAGCACTACAAGTACATGGAAGGCTAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136174	GTAAAGTGGTCTCATAAGGCGGTCAGCACTACAAGTACATGGAAGGCTAG	136223

CU207315.17	751	AGAATTTTCTGTTTGTTCATCTGTTTATTCGATGCTTCATTTTTGTGCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136224	AGAATTTTCTGTTTGTTCATCTGTTTATTCGATGCTTCATTTTTGTGCAA	136273

CU207315.17	801	TAGTGACTTGATAGAGAAAAAGGTGTAAGACAACACTCTCAAAGGTTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136274	TAGTGACTTGATAGAGAAAAAGGTGTAAGACAACACTCTCAAAGGTTTTT	136323

CU207315.17	851	ATCTACATGAACAAGGGGAATATCAGCTGTTTATAATATAGTCATATTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136324	ATCTACATGAACAAGGGGAATATCAGCTGTTTATAATATAGTCATATTAT	136373

CU207315.17	901	TATGGCATGTATGTGTAATCAGCTGTGGTTATTTCTAGTTTATTAAGAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136374	TATGGCATGTATGTGTAATCAGCTGTGGTTATTTCTAGTTTATTAAGAAA	136423

CU207315.17	951	CCAACCCCCTTCCCACCAAGAGGAGCCTCCTATAAAAAGCTGTATAGCGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136424	CCAACCCCCTTCCCACCAAGAGGAGCCTCCTATAAAAAGCTGTATAGCGC	136473

CU207315.17	1001	AGCACAGCCTTGTGCATCTTACACCAAGGCCCAACCTGGGAAGTCTCTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136474	AGCACAGCCTTGTGCATCTTACACCAAGGCCCAACCTGGGAAGTCTCTAT	136523

CU207315.17	1051	TGCCTATGAGAGCTCACCAATATGGCTGCCTAAACAAGACCAAATTAAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136524	TGCCTATGAGAGCTCACCAATATGGCTGCCTAAACAAGACCAAATTAAAT	136573

CU207315.17	1101	ATTAACTTAATCTCACAGGATCCCACCCTTAGACAAAGAATTACATACAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136574	ATTAACTTAATCTCACAGGATCCCACCCTTAGACAAAGAATTACATACAA	136623

CU207315.17	1151	CGTACGACTTCAAATAGGTGGTCTCTCCCAGGGAAGAGCCCCTAATTGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136624	CGTACGACTTCAAATAGGTGGTCTCTCCCAGGGAAGAGCCCCTAATTGGT	136673

CU207315.17	1201	TATAAAATACAAAGTAGTCAACCCAGAAATTATATATATATACAAGTAAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136674	TATAAAATACAAAGTAGTCAACCCAGAAATTATATATATATACAAGTAAC	136723

CU207315.17	1251	ATTAATAGATAACAAGCAGGTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136724	ATTAATAGATAACAAGCAGGTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	136773

CU207315.17	1301	GTGTGTAAAACTATATAACAATTACATATAGAAAAAGAGGCCATAAATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136774	GTGTGTAAAACTATATAACAATTACATATAGAAAAAGAGGCCATAAATTT	136823

CU207315.17	1351	GACAGGGCATGATGGGGGCATGGAAGTAGGTGAAGGGAGGAGACGAAAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136824	GACAGGGCATGATGGGGGCATGGAAGTAGGTGAAGGGAGGAGACGAAAAG	136873

CU207315.17	1401	GGAGAAATAATGTCATCCTACTTTAATTTAAAATTATTTGAAAGAAATTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136874	GGAGAAATAATGTCATCCTACTTTAATTTAAAATTATTTGAAAGAAATTC	136923

CU207315.17	1451	TCTACCTCTCTTGTCTAACCCACTAGTTGCTTTTTGTGCTAAATATATCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136924	TCTACCTCTCTTGTCTAACCCACTAGTTGCTTTTTGTGCTAAATATATCT	136973

CU207315.17	1501	GACAAAAGCAACCTGAGGAGTGAAGTGCTGTTTTGGTTCGAAGTTTGGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	136974	GACAAAAGCAACCTGAGGAGTGAAGTGCTGTTTTGGTTCGAAGTTTGGGG	137023

CU207315.17	1551	GTACAGTTCACAGTGTGGGAGCCGCTCACACCGCACCAGCAATCATGAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137024	GTACAGTTCACAGTGTGGGAGCCGCTCACACCGCACCAGCAATCATGAAG	137073

CU207315.17	1601	CCGAGAGAGATGCATGATGGGACTTAACTCCTTTTCCCCTTTTCAGTCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137074	CCGAGAGAGATGCATGATGGGACTTAACTCCTTTTCCCCTTTTCAGTCAG	137123

CU207315.17	1651	CTCAGCCCATGGCAAGGTGTCACCCACATTAGGGGTGAGCCATTCATCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137124	CTCAGCCCATGGCAAGGTGTCACCCACATTAGGGGTGAGCCATTCATCCC	137173

CU207315.17	1701	CTCTGGTAGTCCTGTCCAGAAATGGCCTCACAGACATACCCCAGCTATGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137174	CTCTGGTAGTCCTGTCCAGAAATGGCCTCACAGACATACCCCAGCTATGT	137223

CU207315.17	1751	CTCACGGCTGATTCTAAATTCAGTGAAGGTGACTACCATTGCCAGCAATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137224	CTCACGGCTGATTCTAAATTCAGTGAAGGTGACTACCATTGCCAGCAATC	137273

CU207315.17	1801	ATGCTCGCTACTGTCTCCCTTCATTCCATTTGTCTAAGAAGTCAAAGGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137274	ATGCTCGCTACTGTCTCCCTTCATTCCATTTGTCTAAGAAGTCAAAGGAA	137323

CU207315.17	1851	CCCTGTGAGCACTTTGGGGTGTGATAAATGGCCAAAGCCTTCTGCTAAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137324	CCCTGTGAGCACTTTGGGGTGTGATAAATGGCCAAAGCCTTCTGCTAAGC	137373

CU207315.17	1901	ATAGCCAAGTTCCTGGCTAGAGGTCTACAGTCTTCATTGTTTAATATACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137374	ATAGCCAAGTTCCTGGCTAGAGGTCTACAGTCTTCATTGTTTAATATACA	137423

CU207315.17	1951	AAACAACCCATGCAAAAGAAAGCTTAGATTCCAAGTTCAATGAGCGGCAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326367.19	137424	AAACAACCCATGCAAAAGAAAGCTTAGATTCCAAGTTCAATGAGCGGCAC	137473

Overview

Query
CU207315.17 - 123015 bps
Hit
CU326367.19 - 137473 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link