<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207325.6	1	AAGCTTTCAAGCCCTGAATTGTCAATAACCCAGGGGACTGAGAAATCAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	72788	AAGCTTTCAAGCCCTGAATTGTCAATAACCCAGGGGACTGAGAAATCAAA	72837

CU207325.6	51	ACCATAGAATGTTGATGCTGGTTGAACATAGACTAAGTGAGTGCAAACTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	72838	ACCATAGAATGTTGATGCTGGTTGAACATAGACTAAGTGAGTGCAAACTT	72887

CU207325.6	101	GCTTAGTTTACTATATCGGTTTGGCCCCAGTTCAGAAAAGGCTGTTTCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	72888	GCTTAGTTTACTATATCGGTTTGGCCCCAGTTCAGAAAAGGCTGTTTCAA	72937

CU207325.6	151	TTCCCATGCAGCCATCCACTCAGATTATCTGTTGATGAGCCTCTATTCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	72938	TTCCCATGCAGCCATCCACTCAGATTATCTGTTGATGAGCCTCTATTCTG	72987

CU207325.6	201	TCCTCTCACCTCTCAACTTCCCCCACTCCCATATAGGGTGCTTTCTGCCG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	72988	TCCTCTCACCTCTCAACTTCCCCCACTCCCATATAGGGTGCTTTCTGCCG	73037

CU207325.6	251	CTTTTTACGAGCCTAGCACATAGGCAATAGCAGACACTCTTTGGTGAAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73038	CTTTTTACGAGCCTAGCACATAGGCAATAGCAGACACTCTTTGGTGAAAG	73087

CU207325.6	301	AGGTTTATCATTTCATTGCCCCATGAATCAATTCAAAACCCTTATGACTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73088	AGGTTTATCATTTCATTGCCCCATGAATCAATTCAAAACCCTTATGACTC	73137

CU207325.6	351	ACAGATGAAAATTTCTTTTCCTAGCCACACTTTCCCCAAATGTGCTGTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73138	ACAGATGAAAATTTCTTTTCCTAGCCACACTTTCCCCAAATGTGCTGTTT	73187

CU207325.6	401	CTCCCATTAGAATATAAGTTCCTTCCAGGCAGGGACTGTCACTTTTTTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73188	CTCCCATTAGAATATAAGTTCCTTCCAGGCAGGGACTGTCACTTTTTTGA	73237

CU207325.6	451	TTTGTATTTCCAGCATTTAGTAGTGTCTAACACAAAGTAAATATTTAATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73238	TTTGTATTTCCAGCATTTAGTAGTGTCTAACACAAAGTAAATATTTAATA	73287

CU207325.6	501	AATGCTTTTAAATTCATTCATTCATTCATTCATGGAACAGACTATCAGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73288	AATGCTTTTAAATTCATTCATTCATTCATTCATGGAACAGACTATCAGAG	73337

CU207325.6	551	CTTGAAGGGATCATTCCGTTCAGTACTTTTCCCTCTACCCCACCCCCATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73338	CTTGAAGGGATCATTCCGTTCAGTACTTTTCCCTCTACCCCACCCCCATC	73387

CU207325.6	601	TCAATCCCCACTCCCCCAACCCTGGAAATTGAGTTATCTAGACTCAGTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73388	TCAATCCCCACTCCCCCAACCCTGGAAATTGAGTTATCTAGACTCAGTCT	73437

CU207325.6	651	AAAGAACAAAGTATTTAAAAGAATAAAAACAATGTCATTTAAACTACTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73438	AAAGAACAAAGTATTTAAAAGAATAAAAACAATGTCATTTAAACTACTCC	73487

CU207325.6	701	ATATAGGTTTTAGTAGGGAACCTGGTTACAAGTGTTCAACTGTCTTTTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73488	ATATAGGTTTTAGTAGGGAACCTGGTTACAAGTGTTCAACTGTCTTTTTG	73537

CU207325.6	751	ATCCTTTTCAGAGAATTTTCACAGACCTGCAGCGACTTCAAGTACTATGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73538	ATCCTTTTCAGAGAATTTTCACAGACCTGCAGCGACTTCAAGTACTATGG	73587

CU207325.6	801	TACTTGAAAGATTGTAGAACATTTTCCTGACCACAACAGCTTGGTAAGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73588	TACTTGAAAGATTGTAGAACATTTTCCTGACCACAACAGCTTGGTAAGGA	73637

CU207325.6	851	TCTGCTGAGGGCATTGATGTAAGCTGTTATATATATCCTGAAAGCATTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73638	TCTGCTGAGGGCATTGATGTAAGCTGTTATATATATCCTGAAAGCATTAT	73687

CU207325.6	901	CCTCATTTTACATATAAGGACACTGAGGCTCAAAATCACCCAGCCATGTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73688	CCTCATTTTACATATAAGGACACTGAGGCTCAAAATCACCCAGCCATGTC	73737

CU207325.6	951	GGTCACCAGACCTGGACTTTAAACCTCAGTGCCCTGGGTGCAGTGCTCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73738	GGTCACCAGACCTGGACTTTAAACCTCAGTGCCCTGGGTGCAGTGCTCAC	73787

CU207325.6	1001	AAAACCAATTGTAAGAGATGACTGCATCTGTCAGAAACATGAAGAGACCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73788	AAAACCAATTGTAAGAGATGACTGCATCTGTCAGAAACATGAAGAGACCA	73837

CU207325.6	1051	AGTTCCCAGGCTGTTGAAGCAATGTTTATTGTTACAAGTGCCATAGATAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73838	AGTTCCCAGGCTGTTGAAGCAATGTTTATTGTTACAAGTGCCATAGATAC	73887

CU207325.6	1101	AACATTGTTGTCAATTAGCCTCTAATGGAGCAAGAAGAATTAGAAGAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73888	AACATTGTTGTCAATTAGCCTCTAATGGAGCAAGAAGAATTAGAAGAGAG	73937

CU207325.6	1151	CTGTGCCACTTTCAAGATCTCTGGTTTGGATAAAAGCCCATTATACTCCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73938	CTGTGCCACTTTCAAGATCTCTGGTTTGGATAAAAGCCCATTATACTCCC	73987

CU207325.6	1201	ATACTATTCAATCTTGAAAGCAAAGACCACTGCATATTGGACTCTTTGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	73988	ATACTATTCAATCTTGAAAGCAAAGACCACTGCATATTGGACTCTTTGTA	74037

CU207325.6	1251	ATCCCCTCCCCATTGTTTGATTTTTCTTGGGCCCTGTTGGCCTGTGTGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74038	ATCCCCTCCCCATTGTTTGATTTTTCTTGGGCCCTGTTGGCCTGTGTGAA	74087

CU207325.6	1301	TGCAGATATTTCTGCCTGAGGACGACAGGCTTTTCAATTCACCCAATACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74088	TGCAGATATTTCTGCCTGAGGACGACAGGCTTTTCAATTCACCCAATACA	74137

CU207325.6	1351	AGGAATTTCAACAACTTCTCAGAATAACCCATGTTCTCACTCTCCACACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74138	AGGAATTTCAACAACTTCTCAGAATAACCCATGTTCTCACTCTCCACACT	74187

CU207325.6	1401	GTGAGGAAATCATGTTGGTTTCAGGACATTTTGAATTAACTCATTTTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74188	GTGAGGAAATCATGTTGGTTTCAGGACATTTTGAATTAACTCATTTTTCA	74237

CU207325.6	1451	TAAGTCTCCATTGTAATCCCCCTATCTACCTTTCCAGTTTTATTTTATTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74238	TAAGTCTCCATTGTAATCCCCCTATCTACCTTTCCAGTTTTATTTTATTC	74287

CU207325.6	1501	ATCTATACCTCAGGGACTCTAGTTTATAACTGCAAAAAAAAGGGCTCATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74288	ATCTATACCTCAGGGACTCTAGTTTATAACTGCAAAAAAAAGGGCTCATT	74337

CU207325.6	1551	TATTTTTGTATCCCCTTTTCCACTCTCTACCCTCCAACAGACATGCAGTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74338	TATTTTTGTATCCCCTTTTCCACTCTCTACCCTCCAACAGACATGCAGTA	74387

CU207325.6	1601	CTCTGCACTTAGTTGGCAAAAGGGGGTAATAAATGTGCAACAAACTGAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74388	CTCTGCACTTAGTTGGCAAAAGGGGGTAATAAATGTGCAACAAACTGAGT	74437

CU207325.6	1651	CAAACTCTTTACAACCAGTTCATATATCTAATGCCCTGTGTCTCTGACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74438	CAAACTCTTTACAACCAGTTCATATATCTAATGCCCTGTGTCTCTGACTC	74487

CU207325.6	1701	CAACCTCCTTTTCCAGCTTACTCCCTTTCATATACTCACCATTTCAATCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74488	CAACCTCCTTTTCCAGCTTACTCCCTTTCATATACTCACCATTTCAATCA	74537

CU207325.6	1751	AACTAGAATATGACTCACTCCTTGACCTTTTCCACTCTCTCCTTCATGTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74538	AACTAGAATATGACTCACTCCTTGACCTTTTCCACTCTCTCCTTCATGTC	74587

CU207325.6	1801	ATAATTTGCATCTCATGCCTCCCTTTCCTATGTCTGCCTAATAAAGTGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74588	ATAATTTGCATCTCATGCCTCCCTTTCCTATGTCTGCCTAATAAAGTGCT	74637

CU207325.6	1851	GCTCTCCTTTCAAAGTCTAGCTCAAGTGCTGCCTCCAATCAATCAACAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74638	GCTCTCCTTTCAAAGTCTAGCTCAAGTGCTGCCTCCAATCAATCAACAAA	74687

CU207325.6	1901	TATTTATTAAGCACTTACTGTGCTCTAGGCATTTGTGCTACCATGTTGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74688	TATTTATTAAGCACTTACTGTGCTCTAGGCATTTGTGCTACCATGTTGGA	74737

CU207325.6	1951	AATACAAACACAAAGAATGGTTCCTGATCTCAAGGAACATACATTCTACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU326345.11	74738	AATACAAACACAAAGAATGGTTCCTGATCTCAAGGAACATACATTCTACT	74787

Overview

Query
CU207325.6 - 136906 bps
Hit
CU326345.11 - 74787 bps
Total alignments
17
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001956200012000172788747871
297.37381141687216985192910421
380.884341359105640106998-1423355971
484.59122825384431946856-1684193711
589.1618472913118668121580-1684697691
685.517333977653779911767080071
781.552165861129611881110014106041
881.73431022520525306115658157611
984.614038652537826242115826166831
1085.6550410754473945813116069171551
1193.711081437785777999-117010171521
1282.941303374626546601117154174931
1380.42100332121000121331117154174901
1481.951202665277053035124122243871
1580.971132876198062266136773370611
1697.5934837288672968163739638211
1799.12521136985169963163745638571
Short-link