<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207405.9	1	CAACTGTGTTTGAGGAATCTCTAGGACCCCGTGAGGTAAGGCTCCAGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154419	CAACTGTGTTTGAGGAATCTCTAGGACCCCGTGAGGTAAGGCTCCAGTTC	154468

CU207405.9	51	CTCCCCTGTTCTGTGTGTTGTGAGACAGTTGGTGTGAGATACATCACCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154469	CTCCCCTGTTCTGTGTGTTGTGAGACAGTTGGTGTGAGATACATCACCCT	154518

CU207405.9	101	GGGCCGAGTTCAGTTCTTCGAAGCATCCAAGACTGATGGGATGGGGTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154519	GGGCCGAGTTCAGTTCTTCGAAGCATCCAAGACTGATGGGATGGGGTGTG	154568

CU207405.9	151	GGAGACAGGGAATGGGAGCCCCATGGCTACTGGAACCTGTCAGGAACAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154569	GGAGACAGGGAATGGGAGCCCCATGGCTACTGGAACCTGTCAGGAACAAT	154618

CU207405.9	201	GAGGGACCAGCAAGAGATGTTTGGCTTTTATGCTGGAAATGGGCTGGGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154619	GAGGGACCAGCAAGAGATGTTTGGCTTTTATGCTGGAAATGGGCTGGGGA	154668

CU207405.9	251	ATGGATGGATTGCTGATTTGGAGCAAGGATTGATCTCCAGGCATCAGGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154669	ATGGATGGATTGCTGATTTGGAGCAAGGATTGATCTCCAGGCATCAGGAG	154718

CU207405.9	301	TAGCAGTGCACCCGCGCCATGCTTGGACTTCTCATAAGTCCGGTCTCACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154719	TAGCAGTGCACCCGCGCCATGCTTGGACTTCTCATAAGTCCGGTCTCACT	154768

CU207405.9	351	CTAGCCGCCCTGTATGTCCATTGTAGTAGCTGCCTCAGGCTTCCCAGGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154769	CTAGCCGCCCTGTATGTCCATTGTAGTAGCTGCCTCAGGCTTCCCAGGGA	154818

CU207405.9	401	AGTTCTGCTTCTAATCATGCTTTGAGATCCAAAAGAGTTTAACGTCCTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154819	AGTTCTGCTTCTAATCATGCTTTGAGATCCAAAAGAGTTTAACGTCCTAG	154868

CU207405.9	451	ACCCCAAGTTCTGCCTCCTCCTCTGAGGTTGAGTTAACTTCCACAAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154869	ACCCCAAGTTCTGCCTCCTCCTCTGAGGTTGAGTTAACTTCCACAAAAAA	154918

CU207405.9	501	CTGGCTGAGAGGAGGCTGCCGGCAATGGAGAGAGCAGGCTGCCATACCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154919	CTGGCTGAGAGGAGGCTGCCGGCAATGGAGAGAGCAGGCTGCCATACCCT	154968

CU207405.9	551	GCCTTACCCTAAGCCCAAGGCTCCCTGGAAGCCAGGCACTCAGGACTGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	154969	GCCTTACCCTAAGCCCAAGGCTCCCTGGAAGCCAGGCACTCAGGACTGCC	155018

CU207405.9	601	ATGTTCTTCACAGACTGTCACAGTCCCCTGGTGGCTCGAGAACTGCGGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155019	ATGTTCTTCACAGACTGTCACAGTCCCCTGGTGGCTCGAGAACTGCGGGG	155068

CU207405.9	651	GCCACCGGGCCTTGGCCCCGGGCAGTGCAGTGTCAGAGGTGACCGGTGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155069	GCCACCGGGCCTTGGCCCCGGGCAGTGCAGTGTCAGAGGTGACCGGTGGA	155118

CU207405.9	701	ACGCCAGTGTTATGTAAATAGCGGGGCCTGCCCGGCGGGCGAGCAGGCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155119	ACGCCAGTGTTATGTAAATAGCGGGGCCTGCCCGGCGGGCGAGCAGGCTG	155168

CU207405.9	751	GCTGCAGCCATCCATCATTCCCGGCTCCGCGGGGCGGGGGACAGACACAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155169	GCTGCAGCCATCCATCATTCCCGGCTCCGCGGGGCGGGGGACAGACACAG	155218

CU207405.9	801	CACCGTGCGCTTGGCTCCAAACCTGTTTGTTTTCCCTTTGTCTCGCGCGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155219	CACCGTGCGCTTGGCTCCAAACCTGTTTGTTTTCCCTTTGTCTCGCGCGT	155268

CU207405.9	851	TTCGGGGGCCAGGCTGCGACCCGCTCCAGTTTTGTCCCGCTGGCCTCCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155269	TTCGGGGGCCAGGCTGCGACCCGCTCCAGTTTTGTCCCGCTGGCCTCCTC	155318

CU207405.9	901	CCCATAGGGAGCACGGGGGAAGGGAGGAGAGTCCCTTGGCTCCCACCGCG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155319	CCCATAGGGAGCACGGGGGAAGGGAGGAGAGTCCCTTGGCTCCCACCGCG	155368

CU207405.9	951	GCATCCCTTTCGGACTTCAAAGGCTCCCCCAGCATTGTCTGCGCCTGCGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155369	GCATCCCTTTCGGACTTCAAAGGCTCCCCCAGCATTGTCTGCGCCTGCGG	155418

CU207405.9	1001	GCAGTGGCCCTGAAAACGTGATCAGAGGCGGCCCGGTGTAGGGCAGGCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155419	GCAGTGGCCCTGAAAACGTGATCAGAGGCGGCCCGGTGTAGGGCAGGCCC	155468

CU207405.9	1051	GGCCCGCGCCCTGCGCTCTCGCTGGGGCCCGTGGATTCCTCCCTTTGCCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155469	GGCCCGCGCCCTGCGCTCTCGCTGGGGCCCGTGGATTCCTCCCTTTGCCG	155518

CU207405.9	1101	CCAGCACCACCCTGGTTACAGCGCAGCTCCGGGGCGCTCACTGGCCTTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155519	CCAGCACCACCCTGGTTACAGCGCAGCTCCGGGGCGCTCACTGGCCTTTC	155568

CU207405.9	1151	TCTCCCCGCGCCCTTTCTGGCTCCCTCTGGTCTCTCCTTCCTGCTCTCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155569	TCTCCCCGCGCCCTTTCTGGCTCCCTCTGGTCTCTCCTTCCTGCTCTCTA	155618

CU207405.9	1201	GCCTCGGCCTCACTTCTGTCTAGGCGCATTGAGACTCTAGAAATGGCCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155619	GCCTCGGCCTCACTTCTGTCTAGGCGCATTGAGACTCTAGAAATGGCCAG	155668

CU207405.9	1251	AGCTGCATGCAGCCTTACACTCTTTCCTCGCCCGCCTCCTTAAGAATCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155669	AGCTGCATGCAGCCTTACACTCTTTCCTCGCCCGCCTCCTTAAGAATCTC	155718

CU207405.9	1301	AACCCCGCCAAAGGGTTTCCCAGGATGCTGTGAGGCATAAATAGGATTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155719	AACCCCGCCAAAGGGTTTCCCAGGATGCTGTGAGGCATAAATAGGATTCC	155768

CU207405.9	1351	CATGCTAGATCGGATTCTCAGTGCACCCCACCCCCCACTCAGCGTGGCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155769	CATGCTAGATCGGATTCTCAGTGCACCCCACCCCCCACTCAGCGTGGCAC	155818

CU207405.9	1401	CGGACACAGGAGAACATGTCTTGCTTCCTCTGGGGACCTCTGTCAGATTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155819	CGGACACAGGAGAACATGTCTTGCTTCCTCTGGGGACCTCTGTCAGATTA	155868

CU207405.9	1451	GGTACAAGGTCCCCAGGAATCATCTAAGCATCCTGAAAGACAGGATGCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155869	GGTACAAGGTCCCCAGGAATCATCTAAGCATCCTGAAAGACAGGATGCTT	155918

CU207405.9	1501	CCATTTTCTGGACAAGTCTCGGGCAAACCGCAGTTCCAAGATCACATTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155919	CCATTTTCTGGACAAGTCTCGGGCAAACCGCAGTTCCAAGATCACATTTG	155968

CU207405.9	1551	ATCCTCGGCCTGTGTTTTGTAAATAAAGTTTTATTGGAAAGGGATGGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	155969	ATCCTCGGCCTGTGTTTTGTAAATAAAGTTTTATTGGAAAGGGATGGCCT	156018

CU207405.9	1601	TTCGTTTTCATATTGTCTATGGCTGTTTTCACTCTACAATAGCAGAGCCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156019	TTCGTTTTCATATTGTCTATGGCTGTTTTCACTCTACAATAGCAGAGCCG	156068

CU207405.9	1651	AGTGACTACAGTGGAAACAGCTTGGCCTGCAAAGCATAAGATTACTATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156069	AGTGACTACAGTGGAAACAGCTTGGCCTGCAAAGCATAAGATTACTATCT	156118

CU207405.9	1701	GCCCAGTAGTGATGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156119	GCCCAGTAGTGATGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAG	156168

CU207405.9	1751	GCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCTAGAGAGTGAGTTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156169	GCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCTAGAGAGTGAGTTCC	156218

CU207405.9	1801	AGGACAGCCAGGGCTACACAGAAAAAAACCCTGTCTCGAAAAACAAAACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156219	AGGACAGCCAGGGCTACACAGAAAAAAACCCTGTCTCGAAAAACAAAACA	156268

CU207405.9	1851	AAACAAAACAAAAAAGGATATTTACTATCTGGCCCTTCTACAAAGAAGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156269	AAACAAAACAAAAAAGGATATTTACTATCTGGCCCTTCTACAAAGAAGGG	156318

CU207405.9	1901	CTTGCTGGCCCGGATTCTGTTCTGTCTCTGATAAAAATATACATGAGATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156319	CTTGCTGGCCCGGATTCTGTTCTGTCTCTGATAAAAATATACATGAGATT	156368

CU207405.9	1951	TGCCGTTGAAACCTGCCAACGTGTGTAAGTCCTTGGGGTTGAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU234132.14	156369	TGCCGTTGAAACCTGCCAACGTGTGTAAGTCCTTGGGGTTGAGTGAATTC	156418

Overview

Query
CU207405.9 - 132058 bps
Hit
CU234132.14 - 156418 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link