<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU442725.4	1	TGCTCTTTTCTGAAGGGAAATGGAAGGGTGAGTCTGGGGAAAGGGGGGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	197867	TGCTCTTTTCTGAAGGGAAATGGAAGGGTGAGTCTGGGGAAAGGGGGGGA	197916

CU442725.4	51	AGTGTAGGGGAGGGACTAGGAGAAAAGGAGGGAGGAGAAACTGAGGGAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	197917	AGTGTAGGGGAGGGACTAGGAGAAAAGGAGGGAGGAGAAACTGAGGGAGG	197966

CU442725.4	101	GATGTAATATATGAAACAAGGTCCAATAACCATGAGTTTGGGACTTTCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	197967	GATGTAATATATGAAACAAGGTCCAATAACCATGAGTTTGGGACTTTCCA	198016

CU442725.4	151	CTAGAGTCTGGTGAGCTCCCCAGCAGGTCCTCAACTGAAAACAATGACTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198017	CTAGAGTCTGGTGAGCTCCCCAGCAGGTCCTCAACTGAAAACAATGACTC	198066

CU442725.4	201	CCCTTCTCCCACAGTCTATCCATAGCCAATAGTTCACAGTGGAGAGGTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198067	CCCTTCTCCCACAGTCTATCCATAGCCAATAGTTCACAGTGGAGAGGTTG	198116

CU442725.4	251	GATCTCACAAACCTCTCCACTTTTCAAGACAGGCTGTTGACTCTAGGCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198117	GATCTCACAAACCTCTCCACTTTTCAAGACAGGCTGTTGACTCTAGGCCC	198166

CU442725.4	301	AGTTGCTCACAGCTGCTGTGATTTCATAATTGCAGTGACTGTGTCATGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198167	AGTTGCTCACAGCTGCTGTGATTTCATAATTGCAGTGACTGTGTCATGCC	198216

CU442725.4	351	CAGATGTCAGTAAAACTTTTACAGTGCTATTAATTTGCTCAAATAATCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198217	CAGATGTCAGTAAAACTTTTACAGTGCTATTAATTTGCTCAAATAATCCA	198266

CU442725.4	401	GGGAACTGAGATAAATACAGTGAAACTGTTGCATAATAGATCAAATTTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198267	GGGAACTGAGATAAATACAGTGAAACTGTTGCATAATAGATCAAATTTAA	198316

CU442725.4	451	CAAAAAACACTTGTCTGGTAAAATGAGTTCCATGATCACTATATAATTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198317	CAAAAAACACTTGTCTGGTAAAATGAGTTCCATGATCACTATATAATTCA	198366

CU442725.4	501	GCAGGAATGCACCAAGAGAGAATAATTCTTTCTAACCCAACTTTTTTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198367	GCAGGAATGCACCAAGAGAGAATAATTCTTTCTAACCCAACTTTTTTTTT	198416

CU442725.4	551	CCCCACTGACACCGTGGCTTTCGACCAAGGGAAAGCTTCAATCCAACGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198417	CCCCACTGACACCGTGGCTTTCGACCAAGGGAAAGCTTCAATCCAACGGT	198466

CU442725.4	601	AAAACAAATTCATGCTAAGACATATTTATATACTTGTGTCAGGGACATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198467	AAAACAAATTCATGCTAAGACATATTTATATACTTGTGTCAGGGACATTT	198516

CU442725.4	651	AGACAAAGTCTAGCTGCCAAGTTTCAAAAGGTTCCTTCGATAAAAAATAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198517	AGACAAAGTCTAGCTGCCAAGTTTCAAAAGGTTCCTTCGATAAAAAATAT	198566

CU442725.4	701	TGTTTGCAAGGATACCCTTGCATCTATGGAGGGCCATTGAGATAACTGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198567	TGTTTGCAAGGATACCCTTGCATCTATGGAGGGCCATTGAGATAACTGCT	198616

CU442725.4	751	CTATGATTAGGGGAAAGGAGTGTGTGTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198617	CTATGATTAGGGGAAAGGAGTGTGTGTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	198666

CU442725.4	801	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198667	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	198716

CU442725.4	851	AGAGAGCACCCAGAGGCATCTGGAAGAGTCCAGAACAGAGAGAAACAGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198717	AGAGAGCACCCAGAGGCATCTGGAAGAGTCCAGAACAGAGAGAAACAGCA	198766

CU442725.4	901	GCGTCCTGGACATGGCCAGGGCTAGGGAATCAGGACTTGCAGAGAAGAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198767	GCGTCCTGGACATGGCCAGGGCTAGGGAATCAGGACTTGCAGAGAAGAGC	198816

CU442725.4	951	AGGAGAGAATAGTGAAGATGGTTAGGGCAGGGGAATACCTTGCCATTATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198817	AGGAGAGAATAGTGAAGATGGTTAGGGCAGGGGAATACCTTGCCATTATA	198866

CU442725.4	1001	CAGAGAATAGATGGGAATCTGGGGAAAGGGAAGCCCGTTGGGGAGGGAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198867	CAGAGAATAGATGGGAATCTGGGGAAAGGGAAGCCCGTTGGGGAGGGAAG	198916

CU442725.4	1051	GGGCCAGAGTCATTGTGCAGACTTGTGAATGGGGACTACAGGATCCTGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198917	GGGCCAGAGTCATTGTGCAGACTTGTGAATGGGGACTACAGGATCCTGAA	198966

CU442725.4	1101	GGCTAGCATGGCTATGATGCGCTGGTAGGCACCACATGTATATATCACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	198967	GGCTAGCATGGCTATGATGCGCTGGTAGGCACCACATGTATATATCACCA	199016

CU442725.4	1151	GAGAGCCTTATGTCCCTTCCTCCAGAAGCGAGGAAAATGACTCCTTCTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199017	GAGAGCCTTATGTCCCTTCCTCCAGAAGCGAGGAAAATGACTCCTTCTGG	199066

CU442725.4	1201	CAAACAGAAAACTTCTTCATGAGTTCCTGAGGATGGTGGCTTTTATCTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199067	CAAACAGAAAACTTCTTCATGAGTTCCTGAGGATGGTGGCTTTTATCTAA	199116

CU442725.4	1251	CCACCAGAAACACTTCCTATATAGCTCTGCTTGGCCTGAGTCAGGACCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199117	CCACCAGAAACACTTCCTATATAGCTCTGCTTGGCCTGAGTCAGGACCAT	199166

CU442725.4	1301	CATTTCCTGACATATCTTTTTTCCTACTTCCTGAGCACTTCCTGAGACCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199167	CATTTCCTGACATATCTTTTTTCCTACTTCCTGAGCACTTCCTGAGACCT	199216

CU442725.4	1351	AACACAAGCGCTCTTGGGTGCCATGAAGTGACTTAGCAGGCTTGTGTTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199217	AACACAAGCGCTCTTGGGTGCCATGAAGTGACTTAGCAGGCTTGTGTTTG	199266

CU442725.4	1401	GAACAAGCAGAACACACAGCTGATGGAAGAGCATAGGCTCTGCTATTGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199267	GAACAAGCAGAACACACAGCTGATGGAAGAGCATAGGCTCTGCTATTGCC	199316

CU442725.4	1451	TTTGCCTTTTTAGTACTTGCTTTAGGATGTGCTAGGGTTTTAATGATGGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199317	TTTGCCTTTTTAGTACTTGCTTTAGGATGTGCTAGGGTTTTAATGATGGC	199366

CU442725.4	1501	AAATTGGGCAAATGGATAGCATCCAGCAATTGTGAAATATGCTGACTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199367	AAATTGGGCAAATGGATAGCATCCAGCAATTGTGAAATATGCTGACTTTT	199416

CU442725.4	1551	CTGAAGAGCTGGCCAGAGAGATTTGGAAATTCTCTTTCTCATGCAGCACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199417	CTGAAGAGCTGGCCAGAGAGATTTGGAAATTCTCTTTCTCATGCAGCACT	199466

CU442725.4	1601	TACTCCCTGTGAGTGTGTTATCGCTACTCTGTTTTCTGCTAAATGGAGCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199467	TACTCCCTGTGAGTGTGTTATCGCTACTCTGTTTTCTGCTAAATGGAGCA	199516

CU442725.4	1651	CTTTGGTTAAGGCTATAAATTCAGCCACTTGAGCAGATTTAATGAGCACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199517	CTTTGGTTAAGGCTATAAATTCAGCCACTTGAGCAGATTTAATGAGCACA	199566

CU442725.4	1701	TTCATTACATCAGGACTGAAAGCAACTGCATATCCTGCATATCCTGCCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199567	TTCATTACATCAGGACTGAAAGCAACTGCATATCCTGCATATCCTGCCTA	199616

CU442725.4	1751	AACCTGACCTTGTTTATCTCAGAACTGTCAGTAAATAAAATCAATTTTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199617	AACCTGACCTTGTTTATCTCAGAACTGTCAGTAAATAAAATCAATTTTGC	199666

CU442725.4	1801	ATTTTCAGTAGCTGTGTCAAATGTGTGTCTCCTAGAAGCAAGTAGTATAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199667	ATTTTCAGTAGCTGTGTCAAATGTGTGTCTCCTAGAAGCAAGTAGTATAT	199716

CU442725.4	1851	CAGGTGTGGATCCCAGCCAAGTTTCTCCTCTTCTGGGTCTTCTGATGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199717	CAGGTGTGGATCCCAGCCAAGTTTCTCCTCTTCTGGGTCTTCTGATGAAG	199766

CU442725.4	1901	GGATTGAGGGTTGCAAGACACAGGAGTCGAAAACAGACTTGTCTCAGGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199767	GGATTGAGGGTTGCAAGACACAGGAGTCGAAAACAGACTTGTCTCAGGAG	199816

CU442725.4	1951	AAGTTAGACCTCCCCAGTAGTGCTGGTGTGATGTAAATGAAGCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU222534.13	199817	AAGTTAGACCTCCCCAGTAGTGCTGGTGTGATGTAAATGAAGCAGAATTC	199866

Overview

Query
CU442725.4 - 128161 bps
Hit
CU222534.13 - 199866 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link