<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207373.6	1	TGACCCTAAAATTTTCCATCTATCTACTCTGAAGAGGAGATATCTTGCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180473	TGACCCTAAAATTTTCCATCTATCTACTCTGAAGAGGAGATATCTTGCTT	180522

CU207373.6	51	CTTGTGTTTGTGGGTCACACGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180523	CTTGTGTTTGTGGGTCACACGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	180572

CU207373.6	101	GTGTGTGTGTGTGTGGTGTGTGTGTGTGCTCGAGCACACATGAGTTTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180573	GTGTGTGTGTGTGTGGTGTGTGTGTGTGCTCGAGCACACATGAGTTTGTG	180622

CU207373.6	151	TATGCGTGTGATGTGTGAAGTCCTTCTGTCTTTGTCCGCCCACACCTCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180623	TATGCGTGTGATGTGTGAAGTCCTTCTGTCTTTGTCCGCCCACACCTCCA	180672

CU207373.6	201	GCTCACTGAAGCATGTTTTGGTTCTACTCTCCTGTTTCCCACAACTCATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180673	GCTCACTGAAGCATGTTTTGGTTCTACTCTCCTGTTTCCCACAACTCATG	180722

CU207373.6	251	ACTTTATTGACTGTGTCAGATGAACTGACAAGTTTACCCACTTCAACACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180723	ACTTTATTGACTGTGTCAGATGAACTGACAAGTTTACCCACTTCAACACA	180772

CU207373.6	301	GCGGAAGGTTAAGAATGAGAAAGGAGTCTTTGTGCTTCTTGGGTTTGTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180773	GCGGAAGGTTAAGAATGAGAAAGGAGTCTTTGTGCTTCTTGGGTTTGTTG	180822

CU207373.6	351	GAAAGGCCCAAAGAGGTGAAGAAAAAGAAGAGAGGGAGGCACGGCCATCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180823	GAAAGGCCCAAAGAGGTGAAGAAAAAGAAGAGAGGGAGGCACGGCCATCC	180872

CU207373.6	401	CGGGTGAGTAGGAAGTACCAGCAGCCCAAGTAAACAGGCAGGCACCTCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180873	CGGGTGAGTAGGAAGTACCAGCAGCCCAAGTAAACAGGCAGGCACCTCCT	180922

CU207373.6	451	GCCCAGGTGTGCTCAGCCCACACAGGCAGGGAGGAACCATCTGTCTGCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180923	GCCCAGGTGTGCTCAGCCCACACAGGCAGGGAGGAACCATCTGTCTGCAC	180972

CU207373.6	501	AGGGAACAGAGACAAGATCAAGGAAGGTGAGCACAGGTGAGCTGGAAGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	180973	AGGGAACAGAGACAAGATCAAGGAAGGTGAGCACAGGTGAGCTGGAAGGC	181022

CU207373.6	551	AGCCCAACGAGCAGACACTTAGGTTCATACAGGACTGACATACAGGGGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181023	AGCCCAACGAGCAGACACTTAGGTTCATACAGGACTGACATACAGGGGTG	181072

CU207373.6	601	ACTGTGGTTGCACAAGAATATTCTGTGCCCAACACAGAGAGGCCATTATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181073	ACTGTGGTTGCACAAGAATATTCTGTGCCCAACACAGAGAGGCCATTATC	181122

CU207373.6	651	CATTCCCTACAGCCCTGGGAGCTCCCAGGAACCATGGAGGCTGAGCCATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181123	CATTCCCTACAGCCCTGGGAGCTCCCAGGAACCATGGAGGCTGAGCCATT	181172

CU207373.6	701	CTGCATAGGCTCTCTGCATCATTTGGTCCAATTTAAGCCACCGTCAACCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181173	CTGCATAGGCTCTCTGCATCATTTGGTCCAATTTAAGCCACCGTCAACCT	181222

CU207373.6	751	ATCACAGTCGAAGCCCATCTGCTTCCTTGCCTCTTGCTGTTGTGTTGTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181223	ATCACAGTCGAAGCCCATCTGCTTCCTTGCCTCTTGCTGTTGTGTTGTGT	181272

CU207373.6	801	GGTCTTACCTGGTCTGGCTGTCCTGGAACACCTGGACAGCCTTAAATGTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181273	GGTCTTACCTGGTCTGGCTGTCCTGGAACACCTGGACAGCCTTAAATGTC	181322

CU207373.6	851	CTAGAATTTGCCGTAGAAGACCAAGCTGACCTCCAACTCAGAGATCTGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181323	CTAGAATTTGCCGTAGAAGACCAAGCTGACCTCCAACTCAGAGATCTGCT	181372

CU207373.6	901	GGCCTCTGCCTCCCGAGTACTGGGATTAAAGTAGGCTATCACACCTGGTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181373	GGCCTCTGCCTCCCGAGTACTGGGATTAAAGTAGGCTATCACACCTGGTA	181422

CU207373.6	951	AAGCCTGCTTTCTTAACCATATTAATAGGGATGTGTCTAAGCTTTTCCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181423	AAGCCTGCTTTCTTAACCATATTAATAGGGATGTGTCTAAGCTTTTCCTG	181472

CU207373.6	1001	GTCCAGAGGTATAACTCAGTGACAGTGAATTTACCTAGAGTACAAGGCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181473	GTCCAGAGGTATAACTCAGTGACAGTGAATTTACCTAGAGTACAAGGCTG	181522

CU207373.6	1051	AATACCTAGCACTCAAGAGAAAAATTAACAATTTTCTTTCTTCTTTTTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181523	AATACCTAGCACTCAAGAGAAAAATTAACAATTTTCTTTCTTCTTTTTAA	181572

CU207373.6	1101	AGATAGGGTCTCATGTACCCAAAGCTAGCCTCAAACTCACTGTGTGGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181573	AGATAGGGTCTCATGTACCCAAAGCTAGCCTCAAACTCACTGTGTGGCCA	181622

CU207373.6	1151	AGGATATCCTTGAACATCTGATTTTCTTGTCTCTACTCCCAAGTGCCGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181623	AGGATATCCTTGAACATCTGATTTTCTTGTCTCTACTCCCAAGTGCCGAT	181672

CU207373.6	1201	TCTAACTAAGTATGTGTGTGTATCCATGCAATTTCATACAGTGCTGAGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181673	TCTAACTAAGTATGTGTGTGTATCCATGCAATTTCATACAGTGCTGAGAC	181722

CU207373.6	1251	CGAACCCAATATCTTATGCATGCTGGGTCAGATCTCTGCCAGCTAAACTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181723	CGAACCCAATATCTTATGCATGCTGGGTCAGATCTCTGCCAGCTAAACTA	181772

CU207373.6	1301	CATACCCAGCCCCAGCAATGACTTTCTTTCTGAGGGTGTCCTATGTCTGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181773	CATACCCAGCCCCAGCAATGACTTTCTTTCTGAGGGTGTCCTATGTCTGC	181822

CU207373.6	1351	TCTGTCACTCGCTGCTTTATTCCCTTGAGGACACCAGACATCCTCCTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181823	TCTGTCACTCGCTGCTTTATTCCCTTGAGGACACCAGACATCCTCCTCTG	181872

CU207373.6	1401	GCTTCCAAATGTGTGTATGAGAATATGCCACAAACACACATCCACATGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181873	GCTTCCAAATGTGTGTATGAGAATATGCCACAAACACACATCCACATGCA	181922

CU207373.6	1451	CTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTATATACCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181923	CTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTATATACCC	181972

CU207373.6	1501	ATTCATCCACGATTCTTCTTTGTGGATATCAGTAACCCACATAAAAAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	181973	ATTCATCCACGATTCTTCTTTGTGGATATCAGTAACCCACATAAAAAAAA	182022

CU207373.6	1551	TCTCCCATCCCAAAAGCTGGTTAGAAATGTCTTCCTTACTATTAATTCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182023	TCTCCCATCCCAAAAGCTGGTTAGAAATGTCTTCCTTACTATTAATTCAG	182072

CU207373.6	1601	ATACAAGCAACACGGGACCTAAATATCTAAAATTATGAGTAGCTTTGCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182073	ATACAAGCAACACGGGACCTAAATATCTAAAATTATGAGTAGCTTTGCCT	182122

CU207373.6	1651	GACTCACACCCTTCTTGTTGCAAACGCAGCAGAGTTCCAGGCACCAGGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182123	GACTCACACCCTTCTTGTTGCAAACGCAGCAGAGTTCCAGGCACCAGGAC	182172

CU207373.6	1701	TAGCTGCTCCCTAGCCTCTCCTGCTAATTGGACCAGCTGCTTATTGATGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182173	TAGCTGCTCCCTAGCCTCTCCTGCTAATTGGACCAGCTGCTTATTGATGG	182222

CU207373.6	1751	AGCCTGGATCCTGCTCTATCTGCCCAGTGTCTCCCTATCAATTTACCCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182223	AGCCTGGATCCTGCTCTATCTGCCCAGTGTCTCCCTATCAATTTACCCTT	182272

CU207373.6	1801	GACTGATCAAGTCCATTGTAAATCTGTGGTGTATGTAACCTGGCAAGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182273	GACTGATCAAGTCCATTGTAAATCTGTGGTGTATGTAACCTGGCAAGAAA	182322

CU207373.6	1851	GAAGTTTCTGTTGGTTTCTTGGTGCCACTGAAACAAATATCCACAAACTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182323	GAAGTTTCTGTTGGTTTCTTGGTGCCACTGAAACAAATATCCACAAACTC	182372

CU207373.6	1901	AGTGCTTAAAAGGAGGCAAACTCTGACTGGAGCGATGGCTCAGTCTGGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182373	AGTGCTTAAAAGGAGGCAAACTCTGACTGGAGCGATGGCTCAGTCTGGAA	182422

CU207373.6	1951	AGTGTTTGCCTCAAAGGCCTGAGGACCCAGGTGATGGGCACTTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210939.14	182423	AGTGTTTGCCTCAAAGGCCTGAGGACCCAGGTGATGGGCACTTAGAATTC	182472

Overview

Query
CU207373.6 - 112617 bps
Hit
CU210939.14 - 182472 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link