<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210913.6	1	TTTATAACACATGCAAAGCCTTAGTTTCAATTGCATGAAGTGGGGGTGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163560	TTTATAACACATGCAAAGCCTTAGTTTCAATTGCATGAAGTGGGGGTGTA	163609

CU210913.6	51	GTGATGTACACAAGGAATGTTAGTGTTCAGAGGTGAAGACCAAAAGCTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163610	GTGATGTACACAAGGAATGTTAGTGTTCAGAGGTGAAGACCAAAAGCTGT	163659

CU210913.6	101	GTCATCACTACACAGTGAGTTCAAGGCCAGCCTATGCTGTATAAGACTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163660	GTCATCACTACACAGTGAGTTCAAGGCCAGCCTATGCTGTATAAGACTAT	163709

CU210913.6	151	CTAAAAATATATAAAATAAAAAAGGTCTTATCAGAGTACAGAGTATTTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163710	CTAAAAATATATAAAATAAAAAAGGTCTTATCAGAGTACAGAGTATTTTC	163759

CU210913.6	201	TTCTATTCCCCCTTTGCCCTCAGTGCTAGAATGGAACCCAGCACTACTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163760	TTCTATTCCCCCTTTGCCCTCAGTGCTAGAATGGAACCCAGCACTACTGG	163809

CU210913.6	251	GCTATACTTTTAGCCCTATTTCTTCCTCAAATTCTGTTTCTTCCCACATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163810	GCTATACTTTTAGCCCTATTTCTTCCTCAAATTCTGTTTCTTCCCACATT	163859

CU210913.6	301	CTAATTTCAAAGAGCTGGGAAATGGAAACACTAGACTTACATCTTAATTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163860	CTAATTTCAAAGAGCTGGGAAATGGAAACACTAGACTTACATCTTAATTG	163909

CU210913.6	351	CTGGAAACAAAAGATCCGAGAAACCGTATTCAATGTCTAATCCCAAACTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163910	CTGGAAACAAAAGATCCGAGAAACCGTATTCAATGTCTAATCCCAAACTT	163959

CU210913.6	401	ACCTACTTCAAGCTTCACAGACATCATAGTACCAGGGAAGGGATGGGAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	163960	ACCTACTTCAAGCTTCACAGACATCATAGTACCAGGGAAGGGATGGGAAC	164009

CU210913.6	451	ACCCTGATGGAAAAGCCCAACTCCAAAGACTGACAAAGGGGCAGCCAACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164010	ACCCTGATGGAAAAGCCCAACTCCAAAGACTGACAAAGGGGCAGCCAACA	164059

CU210913.6	501	AACATCAAACATGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164060	AACATCAAACATGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTG	164109

CU210913.6	551	TGTAGCTCTGGCTGGCCTGGAACTCACTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164110	TGTAGCTCTGGCTGGCCTGGAACTCACTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAA	164159

CU210913.6	601	CTGAGAAATCTGCCTGCCTCTGACTGCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164160	CTGAGAAATCTGCCTGCCTCTGACTGCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTG	164209

CU210913.6	651	CGCCACCACCGCCCGACACCAACAAACATCTTAAACACAATATTAAATTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164210	CGCCACCACCGCCCGACACCAACAAACATCTTAAACACAATATTAAATTA	164259

CU210913.6	701	TACCCAAATTTCTGCTTTTATTTCCTGACTTGTTTTGTCAAATGGCCTGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164260	TACCCAAATTTCTGCTTTTATTTCCTGACTTGTTTTGTCAAATGGCCTGT	164309

CU210913.6	751	GGTTCACTGCCCAGAAACACCCCAAAGGATCAAATTTTTCTCGAGACCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164310	GGTTCACTGCCCAGAAACACCCCAAAGGATCAAATTTTTCTCGAGACCCA	164359

CU210913.6	801	CAACTTCCACAGGGCCTTCTTGAAGCAGGAAGCTCCTTAAACCAAGGGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164360	CAACTTCCACAGGGCCTTCTTGAAGCAGGAAGCTCCTTAAACCAAGGGGG	164409

CU210913.6	851	TTGCCTGTGTGACATCTGAGAACTCTACCTGTCCACTTCCTGCTTGGGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164410	TTGCCTGTGTGACATCTGAGAACTCTACCTGTCCACTTCCTGCTTGGGAT	164459

CU210913.6	901	GCAGCCAAAGGCAGTCACTGCAACACAGGACAGGAATGGTAAGGATGAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164460	GCAGCCAAAGGCAGTCACTGCAACACAGGACAGGAATGGTAAGGATGAGA	164509

CU210913.6	951	TGCTACGATTATGGTCAAGAAATGCCAAAGCTGGGCTGGAGGAATGGTGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164510	TGCTACGATTATGGTCAAGAAATGCCAAAGCTGGGCTGGAGGAATGGTGC	164559

CU210913.6	1001	AGTGGGTAAGAGCAGTGCCTGCCTTTAGAGAACCAGGGTTTGCTTTCCCG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164560	AGTGGGTAAGAGCAGTGCCTGCCTTTAGAGAACCAGGGTTTGCTTTCCCG	164609

CU210913.6	1051	CACTCACATGGTGGAGCGTAACTGTTAACTGCAGCCTTAACAGTCCCAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164610	CACTCACATGGTGGAGCGTAACTGTTAACTGCAGCCTTAACAGTCCCAGG	164659

CU210913.6	1101	ATATTCAACACCCTCTTCTGACCTCCACAGATACTAGACCATCACACATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164660	ATATTCAACACCCTCTTCTGACCTCCACAGATACTAGACCATCACACATG	164709

CU210913.6	1151	GTTCACAAATCTATCTGTACGTGAAACACCCCAATACAGAAAATAAACCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164710	GTTCACAAATCTATCTGTACGTGAAACACCCCAATACAGAAAATAAACCT	164759

CU210913.6	1201	TTAAAATAAACAAATAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTTTACTCCCAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164760	TTAAAATAAACAAATAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTTTACTCCCAGA	164809

CU210913.6	1251	ACTTGGGAGCAGAGGTAGGTGAATCTTTGTGAAGTTGCAGGTCAGCTAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164810	ACTTGGGAGCAGAGGTAGGTGAATCTTTGTGAAGTTGCAGGTCAGCTAGT	164859

CU210913.6	1301	GATATAGTCACACCCTATCACAACGAACAACCAGAAATTTTGGAAAATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164860	GATATAGTCACACCCTATCACAACGAACAACCAGAAATTTTGGAAAATTT	164909

CU210913.6	1351	TGTTTAACACAAGGTCTCTTTATTTAGTCTAGGCTGACCTTTAGCTAGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164910	TGTTTAACACAAGGTCTCTTTATTTAGTCTAGGCTGACCTTTAGCTAGCT	164959

CU210913.6	1401	AAGGCTACCCTTGAAATGTTTGTTCTACACCTCTGCCCTTCGAATGCTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	164960	AAGGCTACCCTTGAAATGTTTGTTCTACACCTCTGCCCTTCGAATGCTGG	165009

CU210913.6	1451	GATCACAGGCATGTACCACCACACATGACTGTTTATTTAGAGTCTATGTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165010	GATCACAGGCATGTACCACCACACATGACTGTTTATTTAGAGTCTATGTA	165059

CU210913.6	1501	TATACCCTTCCTACCTGTTAAATCCAAGTCCCTGCCAGACACAAGTCTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165060	TATACCCTTCCTACCTGTTAAATCCAAGTCCCTGCCAGACACAAGTCTAT	165109

CU210913.6	1551	CAGTGAGCCAGTAAAGGCTGGCATTTTATCTCCTGCTTCTGTCTGCTGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165110	CAGTGAGCCAGTAAAGGCTGGCATTTTATCTCCTGCTTCTGTCTGCTGAG	165159

CU210913.6	1601	TGCCAGGGATTACAGCTATGAGAAAACACACAGCCTTTCTCCTGAAGGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165160	TGCCAGGGATTACAGCTATGAGAAAACACACAGCCTTTCTCCTGAAGGAG	165209

CU210913.6	1651	AGATGTGGTTGGCAGAGTACTAGGTGAGAATGTATTATCTCGACAGCCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165210	AGATGTGGTTGGCAGAGTACTAGGTGAGAATGTATTATCTCGACAGCCCA	165259

CU210913.6	1701	GGGTATGGAAAATTGCTAAGTGGACCCAACTGTTCCAGGATGCAGTGCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165260	GGGTATGGAAAATTGCTAAGTGGACCCAACTGTTCCAGGATGCAGTGCTT	165309

CU210913.6	1751	ACCACTATAGGACTTCTCTGCTAATGGGCCTAGAAAAGACAGTCCTTCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165310	ACCACTATAGGACTTCTCTGCTAATGGGCCTAGAAAAGACAGTCCTTCTT	165359

CU210913.6	1801	CTCTAGGCCTGAAAACAGAAGAAGGGGTAATTAGGCAGTGTAGTGGACTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165360	CTCTAGGCCTGAAAACAGAAGAAGGGGTAATTAGGCAGTGTAGTGGACTT	165409

CU210913.6	1851	CCTCCCCTCCCCCCAGCAGCTGCTGTCTCACACAACTGTTTCCAGCCTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165410	CCTCCCCTCCCCCCAGCAGCTGCTGTCTCACACAACTGTTTCCAGCCTGT	165459

CU210913.6	1901	CTATTCCATGTTATTAAATATTCATCAGATGTGTGCTTGCTCTAAGCGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165460	CTATTCCATGTTATTAAATATTCATCAGATGTGTGCTTGCTCTAAGCGTG	165509

CU210913.6	1951	CAATGACTATTAATATGAAATCGAGGCGTGCACATGAGTCCACAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210937.2	165510	CAATGACTATTAATATGAAATCGAGGCGTGCACATGAGTCCACAGAATTC	165559

Overview

Query
CU210913.6 - 120610 bps
Hit
CU210937.2 - 165559 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link