<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210953.7	1	TTATTTTAGATTCGGAGTCTCTGATCTACCACTGTTCTGTTGGCTCCTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207099	TTATTTTAGATTCGGAGTCTCTGATCTACCACTGTTCTGTTGGCTCCTGG	207148

CU210953.7	51	CTTTGTCTGAGGATTTTCCAGTTAAACTTAGCATAATCAAACTGAAATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207149	CTTTGTCTGAGGATTTTCCAGTTAAACTTAGCATAATCAAACTGAAATTT	207198

CU210953.7	101	ACCATCATTTTGTTCCAATCCTTTTCCATTTGGACAAATGAGTCCTTGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207199	ACCATCATTTTGTTCCAATCCTTTTCCATTTGGACAAATGAGTCCTTGAC	207248

CU210953.7	151	TGCTTCAGGTAATAGCCCTACTGGTTATATGACTAACCTAGATCCAGTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207249	TGCTTCAGGTAATAGCCCTACTGGTTATATGACTAACCTAGATCCAGTCA	207298

CU210953.7	201	GAAATGTTCTATTATTGAGAGAGATTCAATAAACTGTCTAGAAAAAGAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207299	GAAATGTTCTATTATTGAGAGAGATTCAATAAACTGTCTAGAAAAAGAAG	207348

CU210953.7	251	CAAGGCCAAGATCTGGGGAAATTCTTGTGATCTAGTGGACCATGGATATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207349	CAAGGCCAAGATCTGGGGAAATTCTTGTGATCTAGTGGACCATGGATATG	207398

CU210953.7	301	TTTAAAGACAAGAAAGCAAGGGCTAGAGACATGGCTCAGCTGTCTTAAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207399	TTTAAAGACAAGAAAGCAAGGGCTAGAGACATGGCTCAGCTGTCTTAAGC	207448

CU210953.7	351	ATTTGCTCTTCTTCCAGGAGACCCCAGTTCAGTTCCAGAGCCTTTGTTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207449	ATTTGCTCTTCTTCCAGGAGACCCCAGTTCAGTTCCAGAGCCTTTGTTCT	207498

CU210953.7	401	GCAACCTACAACTTCCTATAACCCCAGTTCTAGAGAGTTCAATGCCTCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207499	GCAACCTACAACTTCCTATAACCCCAGTTCTAGAGAGTTCAATGCCTCTG	207548

CU210953.7	451	GCCTCTAGGTACTCATGGCCTCACATACTGAAAAATAAACATAACTTAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207549	GCCTCTAGGTACTCATGGCCTCACATACTGAAAAATAAACATAACTTAAA	207598

CU210953.7	501	ATAATAAAGAACACAATCACAAATGAGGTAGTGAAGGTAGAGGGGGATTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207599	ATAATAAAGAACACAATCACAAATGAGGTAGTGAAGGTAGAGGGGGATTA	207648

CU210953.7	551	CTAATAATAATGTGGTCAAGAGACAACTAAACCATTCTGGGAACCCCTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207649	CTAATAATAATGTGGTCAAGAGACAACTAAACCATTCTGGGAACCCCTCA	207698

CU210953.7	601	TAGGCAGTGTAGACTCTGATGATAAATACGAGAAACACAATCAATGTAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207699	TAGGCAGTGTAGACTCTGATGATAAATACGAGAAACACAATCAATGTAGG	207748

CU210953.7	651	TATAGGTGGGATGTCCTAGGGAAGAGAGAGGGAAAACACCAGGAACTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207749	TATAGGTGGGATGTCCTAGGGAAGAGAGAGGGAAAACACCAGGAACTCCT	207798

CU210953.7	701	GATAAAGAAGGTTCTGAGGGGGTCCTTTGAGAGGCAAGCAATGAACAGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207799	GATAAAGAAGGTTCTGAGGGGGTCCTTTGAGAGGCAAGCAATGAACAGAC	207848

CU210953.7	751	GAATCCTCATTAGTGGTAGCAGCAAAAACCATGTGCGTGGATCCTCACAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207849	GAATCCTCATTAGTGGTAGCAGCAAAAACCATGTGCGTGGATCCTCACAC	207898

CU210953.7	801	AGAACTACAAGAGCCTGGTGTGGTGGTGCACACCTTTAATCCCAGCACTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207899	AGAACTACAAGAGCCTGGTGTGGTGGTGCACACCTTTAATCCCAGCACTA	207948

CU210953.7	851	TGGAGGTTGACTGAGGCAGATGGATCTCAGTTTGAGGCCACCCTGGTGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207949	TGGAGGTTGACTGAGGCAGATGGATCTCAGTTTGAGGCCACCCTGGTGTC	207998

CU210953.7	901	CCAGGACAGTCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGACTTGAAAAAACCAACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	207999	CCAGGACAGTCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGACTTGAAAAAACCAACC	208048

CU210953.7	951	AACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCATAAAACACCCCCAAAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208049	AACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCATAAAACACCCCCAAAAA	208098

CU210953.7	1001	ACCCCAACCAATCAACAAACCCACAAACCTCATCAAGAGTGCAAAAAGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208099	ACCCCAACCAATCAACAAACCCACAAACCTCATCAAGAGTGCAAAAAGTG	208148

CU210953.7	1051	GGGCTGGAGAGTTGGTTCAGTGGTTAAGATCACTTACATTTCTCACAAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208149	GGGCTGGAGAGTTGGTTCAGTGGTTAAGATCACTTACATTTCTCACAAAG	208198

CU210953.7	1101	GACCCAGATTCAGTTCCCAGTACCCACGTGGAGTACCACATGGAGTACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208199	GACCCAGATTCAGTTCCCAGTACCCACGTGGAGTACCACATGGAGTACCA	208248

CU210953.7	1151	CTTCTCAGTGTCATGGTTTGTATATGCTTAGCCCAGGGAGTGGCACTATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208249	CTTCTCAGTGTCATGGTTTGTATATGCTTAGCCCAGGGAGTGGCACTATT	208298

CU210953.7	1201	AGGAGATGTGGCCTTGCTGGAATAGGTGTGTAACTGTGGGCATGGGCTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208299	AGGAGATGTGGCCTTGCTGGAATAGGTGTGTAACTGTGGGCATGGGCTTA	208348

CU210953.7	1251	AGACCCTCACCCCAGCTACCTGGAAGTCAGTCTTCTACTAGCAGCCTTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208349	AGACCCTCACCCCAGCTACCTGGAAGTCAGTCTTCTACTAGCAGCCTTCA	208398

CU210953.7	1301	GATGAAGATGTAGAACTCTTGGCTCTGCCTGCACCATGCCTGCCTAGATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208399	GATGAAGATGTAGAACTCTTGGCTCTGCCTGCACCATGCCTGCCTAGATT	208448

CU210953.7	1351	TTGCCATGTTCCCACCTTGATGATAATGAACTGAACCTCTGAACCTGTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208449	TTGCCATGTTCCCACCTTGATGATAATGAACTGAACCTCTGAACCTGTAA	208498

CU210953.7	1401	GCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTCATAAGACTTGCCTTAGTCATGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208499	GCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTCATAAGACTTGCCTTAGTCATGGT	208548

CU210953.7	1451	GTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACATTCAAGTACTAGGCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208549	GTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACATTCAAGTACTAGGCAC	208598

CU210953.7	1501	ACATGTGGTAACTGGACATGCAGGCAAAACACTCATACACAGAAAAATAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208599	ACATGTGGTAACTGGACATGCAGGCAAAACACTCATACACAGAAAAATAA	208648

CU210953.7	1551	GATAAATATTAAAATAGAATACAGAAAGAAATATCTCCCTGGAAGTTGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208649	GATAAATATTAAAATAGAATACAGAAAGAAATATCTCCCTGGAAGTTGCC	208698

CU210953.7	1601	TTGGAGAACCTAAGTCAGACCCACTTTCCTAAAAAACTAAAGAGAGCAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208699	TTGGAGAACCTAAGTCAGACCCACTTTCCTAAAAAACTAAAGAGAGCAAC	208748

CU210953.7	1651	AAGCCAACTGGCTTGTCTGCTATTTCCTACCATGAAGGGCAATCTAGGTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208749	AAGCCAACTGGCTTGTCTGCTATTTCCTACCATGAAGGGCAATCTAGGTC	208798

CU210953.7	1701	AGTAGTGAGAGATGGTCCTCCAAAGCCTACCAGGAAGATCTCATTTTTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208799	AGTAGTGAGAGATGGTCCTCCAAAGCCTACCAGGAAGATCTCATTTTTCC	208848

CU210953.7	1751	TATAAAGGGACTTGAGCCTGTGGAAAAATACAAGGTCTCCTACTGATCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208849	TATAAAGGGACTTGAGCCTGTGGAAAAATACAAGGTCTCCTACTGATCAT	208898

CU210953.7	1801	GAAACAAGACACTAATGAATCTCTAGGGAATTGTTTTGTGATGCACACTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208899	GAAACAAGACACTAATGAATCTCTAGGGAATTGTTTTGTGATGCACACTC	208948

CU210953.7	1851	CCCCACCCCAGATACCTTCCAATCTAATTGTAAGATTGTCATGTATCTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208949	CCCCACCCCAGATACCTTCCAATCTAATTGTAAGATTGTCATGTATCTGG	208998

CU210953.7	1901	GGGTGGGGAGGACGGGACATTCTTAGATTCTAAAAATAAGAAAATTTTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	208999	GGGTGGGGAGGACGGGACATTCTTAGATTCTAAAAATAAGAAAATTTTAA	209048

CU210953.7	1951	TTAGTGACTTACAGAGAGATGGGACACAGTGTTATTATATGTGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210935.8	209049	TTAGTGACTTACAGAGAGATGGGACACAGTGTTATTATATGTGAGAATTC	209098

Overview

Query
CU210953.7 - 118457 bps
Hit
CU210935.8 - 209098 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link