<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU405929.2	1	GAAGCAGACAGCCACATACCGGTCATAAGCCATGACCAAAAGAAGGATGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66197	GAAGCAGACAGCCACATACCGGTCATAAGCCATGACCAAAAGAAGGATGC	66246

CU405929.2	51	TCTCCAGGTCTCCAAAAACCAATAAAAAGTACATTTGTGTCAGACAGCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66247	TCTCCAGGTCTCCAAAAACCAATAAAAAGTACATTTGTGTCAGACAGCCA	66296

CU405929.2	101	GCATAGGAGATGGACGTGTCCTGGCTCTGCATGTTCTGTAGCAACTTGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66297	GCATAGGAGATGGACGTGTCCTGGCTCTGCATGTTCTGTAGCAACTTGGG	66346

CU405929.2	151	CATTGTGACAGAGGAAAAGCAGAGATCAGAGAAGGACAAGTTGCTGAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66347	CATTGTGACAGAGGAAAAGCAGAGATCAGAGAAGGACAAGTTGCTGAGAA	66396

CU405929.2	201	ACAAGTACATGGGTGTGTGGAGATGGGAGTCCAGTATTATGAGGATAATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66397	ACAAGTACATGGGTGTGTGGAGATGGGAGTCCAGTATTATGAGGATAATG	66446

CU405929.2	251	ATGATGAGGTTCCCCAGGACGGTGGTGAGGTACATGGCCAGGAACAGGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66447	ATGATGAGGTTCCCCAGGACGGTGGTGAGGTACATGGCCAGGAACAGGGC	66496

CU405929.2	301	ATAGTACAGGTGCTGGTACTCTTGGGGTATGGGCAGGCCCAGGAGGATGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66497	ATAGTACAGGTGCTGGTACTCTTGGGGTATGGGCAGGCCCAGGAGGATGA	66546

CU405929.2	351	ACTGGGAGATGACAGTTTTGTTGTTCATTATCATTCTTTGTCTCCACTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66547	ACTGGGAGATGACAGTTTTGTTGTTCATTATCATTCTTTGTCTCCACTAT	66596

CU405929.2	401	CCTAATTAGAAAATATCCATGTCCCTTAAAATTCAAGATAAAAATGAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66597	CCTAATTAGAAAATATCCATGTCCCTTAAAATTCAAGATAAAAATGAACA	66646

CU405929.2	451	TGTATCTAGAATATATATTCTACCACAGTGGATTTTGCAGTCATCATATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66647	TGTATCTAGAATATATATTCTACCACAGTGGATTTTGCAGTCATCATATA	66696

CU405929.2	501	TTCAAAACTTCTAATATCTACAATCATTACTGTCAATATTTTCAACTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66697	TTCAAAACTTCTAATATCTACAATCATTACTGTCAATATTTTCAACTTTT	66746

CU405929.2	551	CTTTCAAAAGGTTCTATTTCTCTTCCTAGAAGACAGTTCTATGTCTTTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66747	CTTTCAAAAGGTTCTATTTCTCTTCCTAGAAGACAGTTCTATGTCTTTTT	66796

CU405929.2	601	TTTTTTAAAATAAGATACAAAATTGACTAATGCCTTTCTTTCCTGCTACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66797	TTTTTTAAAATAAGATACAAAATTGACTAATGCCTTTCTTTCCTGCTACC	66846

CU405929.2	651	TGCTCATCCTGGGTGACTGTTGTTTGTTCATTTGTAAGTTGCTTTATTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66847	TGCTCATCCTGGGTGACTGTTGTTTGTTCATTTGTAAGTTGCTTTATTTA	66896

CU405929.2	701	TTTATTTTTTGTATATTGATGTTTTTGAAGAATTTGCTTAAACTTTATCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66897	TTTATTTTTTGTATATTGATGTTTTTGAAGAATTTGCTTAAACTTTATCA	66946

CU405929.2	751	TCATAGTTTCATATAAAGTCCACAAACATCCCACATTCTCCAATGTCTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66947	TCATAGTTTCATATAAAGTCCACAAACATCCCACATTCTCCAATGTCTTA	66996

CU405929.2	801	GATTAGTATTTTAAACTCAGGCATCCAAGTTCCTGTAACATACAGATTTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	66997	GATTAGTATTTTAAACTCAGGCATCCAAGTTCCTGTAACATACAGATTTC	67046

CU405929.2	851	TGTTCCACTCTTAACTAATCATCTTCTTTCCATTGCCTGTGTGACAGATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67047	TGTTCCACTCTTAACTAATCATCTTCTTTCCATTGCCTGTGTGACAGATA	67096

CU405929.2	901	TCAGAAGCTCAAAGCTTTGTTGTTTCTCAAAGGATTCCACATTTTGCTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67097	TCAGAAGCTCAAAGCTTTGTTGTTTCTCAAAGGATTCCACATTTTGCTAC	67146

CU405929.2	951	TTCTCTAGTCTCCCATAGAATAAAGAAAGCAATTCAGGTTTGAGTCTGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67147	TTCTCTAGTCTCCCATAGAATAAAGAAAGCAATTCAGGTTTGAGTCTGAA	67196

CU405929.2	1001	TTGTGTGTCCCTTAAATGCTGTCTTGCATAACCCTGGAAATTTGGTGTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67197	TTGTGTGTCCCTTAAATGCTGTCTTGCATAACCCTGGAAATTTGGTGTGA	67246

CU405929.2	1051	ACTGAAAAGACAGCAGCTTTTTTTCCTAAATGGCTCAGCTCTGCTGAGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67247	ACTGAAAAGACAGCAGCTTTTTTTCCTAAATGGCTCAGCTCTGCTGAGGC	67296

CU405929.2	1101	TGAGTCAAAGTTTCTGGTTGATCCTGCTCACCTTAATTTTATTTGCAGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67297	TGAGTCAAAGTTTCTGGTTGATCCTGCTCACCTTAATTTTATTTGCAGAC	67346

CU405929.2	1151	AAAGGAACATGCTTCTGTTCTTAGCACTTATCTGCATCATCCCTACTCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67347	AAAGGAACATGCTTCTGTTCTTAGCACTTATCTGCATCATCCCTACTCAC	67396

CU405929.2	1201	ATTCTTCTGCTGCCATCACTGCACATGAGGTGCTCTGCATCTTAGAGAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67397	ATTCTTCTGCTGCCATCACTGCACATGAGGTGCTCTGCATCTTAGAGAAG	67446

CU405929.2	1251	GCTAGATCCTGTATAACTCATTAAAGTCATAGTAAACACCTAGGACTTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67447	GCTAGATCCTGTATAACTCATTAAAGTCATAGTAAACACCTAGGACTTTT	67496

CU405929.2	1301	CTAGGAACAATTTACCTCAGGGATCTCTAATGGAAACAAATTATAATCAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67497	CTAGGAACAATTTACCTCAGGGATCTCTAATGGAAACAAATTATAATCAC	67546

CU405929.2	1351	CAATCTCTCCTTCCTACACTTATGGGAATGTAGAATTTATATAACCACAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67547	CAATCTCTCCTTCCTACACTTATGGGAATGTAGAATTTATATAACCACAG	67596

CU405929.2	1401	CAGCAGCAGCAACAACAAAAGAAGAAAGAAATAGCAAAAATAGTATAATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67597	CAGCAGCAGCAACAACAAAAGAAGAAAGAAATAGCAAAAATAGTATAATC	67646

CU405929.2	1451	AAAGCATGGAAGGATGCACACTCATTCCTTGTTTAGGTAACAATCAAGGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67647	AAAGCATGGAAGGATGCACACTCATTCCTTGTTTAGGTAACAATCAAGGC	67696

CU405929.2	1501	TTCTGCTTGACTGGCTCCCACTTTAACAGGACAAATTCTAGTTGCTATGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67697	TTCTGCTTGACTGGCTCCCACTTTAACAGGACAAATTCTAGTTGCTATGC	67746

CU405929.2	1551	AGATATTTCCTAAATATCATTAAAATCTGTAGACTTTGAGTAAATAATTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67747	AGATATTTCCTAAATATCATTAAAATCTGTAGACTTTGAGTAAATAATTA	67796

CU405929.2	1601	GCACTTCATCACATGATGCACTTCATGCAACCAGATGGAGGAACTAGGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67797	GCACTTCATCACATGATGCACTTCATGCAACCAGATGGAGGAACTAGGGG	67846

CU405929.2	1651	AAAAGGACAGATGATTAGAGAAAAAAATTTGTATCTTCTGCCTTAGTTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67847	AAAAGGACAGATGATTAGAGAAAAAAATTTGTATCTTCTGCCTTAGTTGC	67896

CU405929.2	1701	AAGTGTGTAACCTCCACTTTTCTAAGGATCTCCAATATTCTAGACAGTGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67897	AAGTGTGTAACCTCCACTTTTCTAAGGATCTCCAATATTCTAGACAGTGC	67946

CU405929.2	1751	CTTAAATGTTCCCATTATCAGTCTCCAACACTATACATTCTCTTGCTTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67947	CTTAAATGTTCCCATTATCAGTCTCCAACACTATACATTCTCTTGCTTAA	67996

CU405929.2	1801	GTAACATACATGGACCCCCACCCCAAACACATGTCATTCTTTGGTTATAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	67997	GTAACATACATGGACCCCCACCCCAAACACATGTCATTCTTTGGTTATAG	68046

CU405929.2	1851	AGAAGACTGGCTAATGAATCAATCACAGTCCTCAAAGCTGACAAAACAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	68047	AGAAGACTGGCTAATGAATCAATCACAGTCCTCAAAGCTGACAAAACAGA	68096

CU405929.2	1901	AGAAATGTCAAAAGATCTCAGCAACTCTATCTGAAATGGTGTAACCTCGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	68097	AGAAATGTCAAAAGATCTCAGCAACTCTATCTGAAATGGTGTAACCTCGT	68146

CU405929.2	1951	CTGAGTGTGTGTATCTTCACAGACTGACAGTGTTTAGTGCAGCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210873.5	68147	CTGAGTGTGTGTATCTTCACAGACTGACAGTGTTTAGTGCAGCTGAATTC	68196

Overview

Query
CU405929.2 - 46959 bps
Hit
CU210873.5 - 68196 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link