<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210925.4	1	GAATTCTAAGTCTTATGTCCTGAGTAAGTCTGTGTCATAGTGATAGACTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201650	GAATTCTAAGTCTTATGTCCTGAGTAAGTCTGTGTCATAGTGATAGACTG	201699

CU210925.4	51	CCATAGAGTCATCAGGATTGGGGGTTATTTTACTTCCTCGGAACTAAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201700	CCATAGAGTCATCAGGATTGGGGGTTATTTTACTTCCTCGGAACTAAATT	201749

CU210925.4	101	CTACTCCTAAAGGTGGTTTCCCATTGTTTGCCTGCCAGTCTGTGGCCTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201750	CTACTCCTAAAGGTGGTTTCCCATTGTTTGCCTGCCAGTCTGTGGCCTGT	201799

CU210925.4	151	CTGTACTGCTTGGTTGTCATGCCTTGAAATTTGAGGACTGTCTGCTCACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201800	CTGTACTGCTTGGTTGTCATGCCTTGAAATTTGAGGACTGTCTGCTCACT	201849

CU210925.4	201	GCCCAGTGAAAGGATGCCAAATCTGCCAAAATAAAGGAAAACGGGGTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201850	GCCCAGTGAAAGGATGCCAAATCTGCCAAAATAAAGGAAAACGGGGTAAT	201899

CU210925.4	251	GTGAATGAAATCTGAAGCTGCAGCACATACTTTCATATTCCCGTCATATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201900	GTGAATGAAATCTGAAGCTGCAGCACATACTTTCATATTCCCGTCATATA	201949

CU210925.4	301	GACCCAGAACAGGCAGAGAATGGAGCAGCCGTGCCCAGGTTTGACAGTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	201950	GACCCAGAACAGGCAGAGAATGGAGCAGCCGTGCCCAGGTTTGACAGTGA	201999

CU210925.4	351	AGGAATTGGGGGAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATGTTGAGGCTGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202000	AGGAATTGGGGGAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATGTTGAGGCTGGAG	202049

CU210925.4	401	GACTTGGCTCCGTAGTGCAATATATGCTTACAGAGTGCTAGGTCCAATCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202050	GACTTGGCTCCGTAGTGCAATATATGCTTACAGAGTGCTAGGTCCAATCC	202099

CU210925.4	451	CCTACACACACACACATACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202100	CCTACACACACACACATACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	202149

CU210925.4	501	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202150	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGA	202199

CU210925.4	551	CAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGAGACAGAGGAGAGAGAGGAAATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202200	CAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGAGACAGAGGAGAGAGAGGAAATA	202249

CU210925.4	601	AGCACTTGAATAATCATGTGATGTAGGAATGTGTTATAAAGTTTTAAGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202250	AGCACTTGAATAATCATGTGATGTAGGAATGTGTTATAAAGTTTTAAGCC	202299

CU210925.4	651	CCCCCCCCATTGGTACTCTTCTTACTTTATATCTTTAGAACTTCGCTAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202300	CCCCCCCCATTGGTACTCTTCTTACTTTATATCTTTAGAACTTCGCTAAT	202349

CU210925.4	701	TACTTTTAGAAGCCATCTGTACCTTTTCATTTCAGTTAACACAAAATAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202350	TACTTTTAGAAGCCATCTGTACCTTTTCATTTCAGTTAACACAAAATAGA	202399

CU210925.4	751	AAGCCAGTCACTTTTTTTCTAAGATACATTGTTTAGTAGTTGTTTTTCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202400	AAGCCAGTCACTTTTTTTCTAAGATACATTGTTTAGTAGTTGTTTTTCCT	202449

CU210925.4	801	GCTAGCTGGGGTAAATGGGCTCAGAACTTCTACAGGAAGTGAATCATCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202450	GCTAGCTGGGGTAAATGGGCTCAGAACTTCTACAGGAAGTGAATCATCAT	202499

CU210925.4	851	ATTTACACATTGATCTAGTCTCACTTTGTTCCTTCTGAGAATATTAAGGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202500	ATTTACACATTGATCTAGTCTCACTTTGTTCCTTCTGAGAATATTAAGGA	202549

CU210925.4	901	AGCATATTATGTGACAGGAGATAAATACATTGTCCTTTATATCTGTAGTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202550	AGCATATTATGTGACAGGAGATAAATACATTGTCCTTTATATCTGTAGTA	202599

CU210925.4	951	TACTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGTTGTCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202600	TACTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGTTGTCC	202649

CU210925.4	1001	TGGAACTCACGTTGTAGACTAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAACTTGCCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202650	TGGAACTCACGTTGTAGACTAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAACTTGCCTG	202699

CU210925.4	1051	CCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCACGCCTGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202700	CCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCACGCCTGGC	202749

CU210925.4	1101	TGTAGTATACTTTTTAAGTCAACCTGAGTATCAAATTGCTATACTCAACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202750	TGTAGTATACTTTTTAAGTCAACCTGAGTATCAAATTGCTATACTCAACA	202799

CU210925.4	1151	TATATATTAATAAGAAAACTATAGGATAAATAAGGAAAGCTTACTAGCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202800	TATATATTAATAAGAAAACTATAGGATAAATAAGGAAAGCTTACTAGCAT	202849

CU210925.4	1201	TTATTTAAGTTGTTTGAGGTCTTTGAATATTGGAGAAAGGTGTAAACTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202850	TTATTTAAGTTGTTTGAGGTCTTTGAATATTGGAGAAAGGTGTAAACTAG	202899

CU210925.4	1251	AGGACAGCAAAACATAGACAGCAAGAAACCAACAATCATTGATGTGTTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202900	AGGACAGCAAAACATAGACAGCAAGAAACCAACAATCATTGATGTGTTTG	202949

CU210925.4	1301	AGGGCTAGTGAGATGATGCAGCAGTTAAGAGCTCAGACTAGCCAGGCATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	202950	AGGGCTAGTGAGATGATGCAGCAGTTAAGAGCTCAGACTAGCCAGGCATG	202999

CU210925.4	1351	GTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAAGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203000	GTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAAGTT	203049

CU210925.4	1401	TCTGAGTTCGAGGCCAGCTTAGTCTACAACGTGAGGTCCAGGACAGCCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203050	TCTGAGTTCGAGGCCAGCTTAGTCTACAACGTGAGGTCCAGGACAGCCAG	203099

CU210925.4	1451	GGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAGGGGAGGAGGGGAAGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203100	GGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAGGGGAGGAGGGGAAGCT	203149

CU210925.4	1501	CAGACTATTCTTCAGATGATCTGAGTTCAATTCCCAGCACCCATATCAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203150	CAGACTATTCTTCAGATGATCTGAGTTCAATTCCCAGCACCCATATCAGG	203199

CU210925.4	1551	TGATTTGCACGGTCACCTGCCTGCCTGTAACTCCAACCCAACTCCAGGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203200	TGATTTGCACGGTCACCTGCCTGCCTGTAACTCCAACCCAACTCCAGGGG	203249

CU210925.4	1601	ATCTGACAGCTCTGACCTCCACAGGCACCCACCTTTGTGTGTACATGCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203250	ATCTGACAGCTCTGACCTCCACAGGCACCCACCTTTGTGTGTACATGCCC	203299

CU210925.4	1651	ACACATCTAGTCATAATTAGAAATAAAACATCATTTTTAAAAACTATATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203300	ACACATCTAGTCATAATTAGAAATAAAACATCATTTTTAAAAACTATATT	203349

CU210925.4	1701	TGCTTCTTTAAAGTACTTTTTAAAGTTAATTAATTTTACAGTGCCTGGGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203350	TGCTTCTTTAAAGTACTTTTTAAAGTTAATTAATTTTACAGTGCCTGGGA	203399

CU210925.4	1751	TTAGGGTCTTGCACATATTAGGCAAATGCTGAGCAACATCCCGGCCCTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203400	TTAGGGTCTTGCACATATTAGGCAAATGCTGAGCAACATCCCGGCCCTTT	203449

CU210925.4	1801	AATTTTAAGCAAATGCCCACTTATAAGAGCAATGTGAGCGATTCCTTGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203450	AATTTTAAGCAAATGCCCACTTATAAGAGCAATGTGAGCGATTCCTTGAC	203499

CU210925.4	1851	AATATTAAGAATTAATTTAAAATGTCAGTAGTTATTTGTGAGGGACTAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203500	AATATTAAGAATTAATTTAAAATGTCAGTAGTTATTTGTGAGGGACTAAC	203549

CU210925.4	1901	AGCACTTGTAAGGATGGTTGGTGCTAGTGCAGCCTGTCTGCAGTAGTGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203550	AGCACTTGTAAGGATGGTTGGTGCTAGTGCAGCCTGTCTGCAGTAGTGCA	203599

CU210925.4	1951	TCTTTAACATACCTCAGCAGAGGGAGAGGAAGGCATGGCTTTGCTGTGTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210866.8	203600	TCTTTAACATACCTCAGCAGAGGGAGAGGAAGGCATGGCTTTGCTGTGTT	203649

Overview

Query
CU210925.4 - 112449 bps
Hit
CU210866.8 - 203649 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link