<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210928.16	1	GAATTCTTTATCCTTTCTGGCAGCTGACACATGGGTCTTCCCAGTGTGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	185853	GAATTCTTTATCCTTTCTGGCAGCTGACACATGGGTCTTCCCAGTGTGGC	185902

CU210928.16	51	CACCGCAACAAGCCATCTGTCCAGCCATATAGACGCTGGAACGAGGAAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	185903	CACCGCAACAAGCCATCTGTCCAGCCATATAGACGCTGGAACGAGGAAGG	185952

CU210928.16	101	AGTGGCACTTGTTAACATTCTCCCAAATTTGCAGAAACCTACAGCTGTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	185953	AGTGGCACTTGTTAACATTCTCCCAAATTTGCAGAAACCTACAGCTGTGA	186002

CU210928.16	151	GCGTGGCAGTTGTGATGATAGGTGACAAGAGAGGTGATCGGATGGGTGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186003	GCGTGGCAGTTGTGATGATAGGTGACAAGAGAGGTGATCGGATGGGTGCC	186052

CU210928.16	201	TTTTATCCCCACTAATAAATTAGATCCTTGGTAAATAAAAATTTTAAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186053	TTTTATCCCCACTAATAAATTAGATCCTTGGTAAATAAAAATTTTAAAAA	186102

CU210928.16	251	CCCATATTTAAATACTAGGGCATGTGGAAAGACAATAAAGAAATGATCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186103	CCCATATTTAAATACTAGGGCATGTGGAAAGACAATAAAGAAATGATCAT	186152

CU210928.16	301	CAAATTTAGACAATTATCTTTCCCTCATAATTCTACTTGAATCTTTACCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186153	CAAATTTAGACAATTATCTTTCCCTCATAATTCTACTTGAATCTTTACCT	186202

CU210928.16	351	TCTGAAAGACCCCTGATACTTCTGACGTATCCGGGAGTGACCCCCGTGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186203	TCTGAAAGACCCCTGATACTTCTGACGTATCCGGGAGTGACCCCCGTGTG	186252

CU210928.16	401	GTAGTCAAGAACCCATGAAAATGCCAGCCCAGGAAGAAGGCAGTCTCCTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186253	GTAGTCAAGAACCCATGAAAATGCCAGCCCAGGAAGAAGGCAGTCTCCTC	186302

CU210928.16	451	ATCCTTCCTGCCCCAGGAGAATGAGGGCTTGCTCTGCAAGCATCATTGCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186303	ATCCTTCCTGCCCCAGGAGAATGAGGGCTTGCTCTGCAAGCATCATTGCC	186352

CU210928.16	501	TGCCAGAGGAACACAGTGTGGCCATTTTCATTGAGCTTCATATGTATGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186353	TGCCAGAGGAACACAGTGTGGCCATTTTCATTGAGCTTCATATGTATGAA	186402

CU210928.16	551	GCCTGAGTCCCAGGACTGGAACCTGCCCAACACTGCTCTACTCACCAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186403	GCCTGAGTCCCAGGACTGGAACCTGCCCAACACTGCTCTACTCACCAGCT	186452

CU210928.16	601	CAGAGACAATCCACATACACGGGCCTCTTACAAAAGTCCATTGCTATCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186453	CAGAGACAATCCACATACACGGGCCTCTTACAAAAGTCCATTGCTATCCA	186502

CU210928.16	651	TTTATTATACGTAGTAGCATCAAACAGGGAGAGATAATGAGAAAGCTCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186503	TTTATTATACGTAGTAGCATCAAACAGGGAGAGATAATGAGAAAGCTCCC	186552

CU210928.16	701	ATAGAGCACCTAGGGACCTTGAATGCCGACAGGAGGTGGGTTGGAGGGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186553	ATAGAGCACCTAGGGACCTTGAATGCCGACAGGAGGTGGGTTGGAGGGGG	186602

CU210928.16	751	GGGGGGGGGGACAAAGGCAAGATACCGGCTTGCGAGAGTCAGGCCTCACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186603	GGGGGGGGGGACAAAGGCAAGATACCGGCTTGCGAGAGTCAGGCCTCACC	186652

CU210928.16	801	TCCTTAATTAATATTTATTTTCAGTACATTTTTGGCTCTTCTGTTATTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186653	TCCTTAATTAATATTTATTTTCAGTACATTTTTGGCTCTTCTGTTATTTT	186702

CU210928.16	851	CTCCTCAGTCCCTTGGTTCTCACAGATGTGTACACATACATGTATATATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186703	CTCCTCAGTCCCTTGGTTCTCACAGATGTGTACACATACATGTATATATT	186752

CU210928.16	901	TCATTAAGAGGAAATAAAAGGGTTGTCTTTAGCTAAGATGTTTCCATTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186753	TCATTAAGAGGAAATAAAAGGGTTGTCTTTAGCTAAGATGTTTCCATTCA	186802

CU210928.16	951	CAGAGACCGCACATTTAAAAAAATAAATTGCCTGAATAAATTCAATTATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186803	CAGAGACCGCACATTTAAAAAAATAAATTGCCTGAATAAATTCAATTATC	186852

CU210928.16	1001	TAGGGGAGCAGAGGAAATCACATGCAAATGGCATTATACGCACGGGCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186853	TAGGGGAGCAGAGGAAATCACATGCAAATGGCATTATACGCACGGGCCAT	186902

CU210928.16	1051	GCCGACAGCTTCATGTTTATTTTTATTGTTTCGCTCAGTGGAAGGGAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186903	GCCGACAGCTTCATGTTTATTTTTATTGTTTCGCTCAGTGGAAGGGAAAA	186952

CU210928.16	1101	GCTGTCAAAAATGTAACATCTCTTCCTTTCTAAAGGCCCGATGTCTCTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	186953	GCTGTCAAAAATGTAACATCTCTTCCTTTCTAAAGGCCCGATGTCTCTGA	187002

CU210928.16	1151	AAACTGCAAGAGCGATAATACTGAGAGAAGAAATGTCTCTGCTTCCCCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187003	AAACTGCAAGAGCGATAATACTGAGAGAAGAAATGTCTCTGCTTCCCCAG	187052

CU210928.16	1201	AGGAAATGCCTCAGAGTCAGCTTTCTCCATACCAGTGTGTAAGAGGGGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187053	AGGAAATGCCTCAGAGTCAGCTTTCTCCATACCAGTGTGTAAGAGGGGCC	187102

CU210928.16	1251	CTGGATACATGTATCGCATTTTACCTGCCGAAACCAGAGTCTCCTTCACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187103	CTGGATACATGTATCGCATTTTACCTGCCGAAACCAGAGTCTCCTTCACC	187152

CU210928.16	1301	TGACAGCGGTGTAGACAATGAAGACGGAGTCTTTAAAGCAGAGTAATGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187153	TGACAGCGGTGTAGACAATGAAGACGGAGTCTTTAAAGCAGAGTAATGAA	187202

CU210928.16	1351	CCAGAGGCGGAGGTGCACACCTTGACTCCTAGCACCAAGGCCAAGAACTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187203	CCAGAGGCGGAGGTGCACACCTTGACTCCTAGCACCAAGGCCAAGAACTG	187252

CU210928.16	1401	ACAGGACTTTGAGGTCAGCCAGGTTCACACAGTAAGACTTGGTCTCAAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187253	ACAGGACTTTGAGGTCAGCCAGGTTCACACAGTAAGACTTGGTCTCAAAA	187302

CU210928.16	1451	AAACCACAAACATGACTTTTGAAATCAATTTAAAAAAGGTTATCTGAAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187303	AAACCACAAACATGACTTTTGAAATCAATTTAAAAAAGGTTATCTGAAAA	187352

CU210928.16	1501	AGTGAAGAAGTCACATATTCACACCGGCATTTTAACTAGCTAAAACTTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187353	AGTGAAGAAGTCACATATTCACACCGGCATTTTAACTAGCTAAAACTTCA	187402

CU210928.16	1551	TTTAAAGGATCATTGGCCTTGTGTTTTGTGGAGAGCAGAGTTTCATTTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187403	TTTAAAGGATCATTGGCCTTGTGTTTTGTGGAGAGCAGAGTTTCATTTCT	187452

CU210928.16	1601	CCTTTCCCTCCCTGTTCTTTCGGGATGACCAGAGTGATCGACGGAGACTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187453	CCTTTCCCTCCCTGTTCTTTCGGGATGACCAGAGTGATCGACGGAGACTG	187502

CU210928.16	1651	GAACACACTTACAGAGGATCTCGCTGGGACGCTCTGACTTCTCCCACAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187503	GAACACACTTACAGAGGATCTCGCTGGGACGCTCTGACTTCTCCCACAGA	187552

CU210928.16	1701	ATTTCCATGCTACCCGGACGGGGTCTTGAAGCAGGGAGATCCTGAGGAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187553	ATTTCCATGCTACCCGGACGGGGTCTTGAAGCAGGGAGATCCTGAGGAAA	187602

CU210928.16	1751	TGTGGCACTTGCCTACACGTTCTTGCCAACTCCAAATTCATTCATTCAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187603	TGTGGCACTTGCCTACACGTTCTTGCCAACTCCAAATTCATTCATTCAGA	187652

CU210928.16	1801	TCGCTCTCGCTGGGGGCCAAATTCTTACCCAGTTCCGCAGAGCCACCGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187653	TCGCTCTCGCTGGGGGCCAAATTCTTACCCAGTTCCGCAGAGCCACCGAT	187702

CU210928.16	1851	TTCCTGGAAGTGAATGGAGCCTTGTGCGTGTGAGCGGGTGTGAATGGCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187703	TTCCTGGAAGTGAATGGAGCCTTGTGCGTGTGAGCGGGTGTGAATGGCAG	187752

CU210928.16	1901	GTCTGTGCAGGGGATCAAGCTCCGACCAATGACCGACCGCAGGCTTTCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187753	GTCTGTGCAGGGGATCAAGCTCCGACCAATGACCGACCGCAGGCTTTCAC	187802

CU210928.16	1951	AAGCGATGGAGAACTGAGTTGGAAGTGATCAGGAGTGTACAGCTTTCAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210861.18	187803	AAGCGATGGAGAACTGAGTTGGAAGTGATCAGGAGTGTACAGCTTTCAAC	187852

Overview

Query
CU210928.16 - 207389 bps
Hit
CU210861.18 - 187852 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link