<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210927.8	1	GTGGGGCTATGCCAGAGCTATGTCAGGGCTATGCCGGGGCTATGCCGGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155409	GTGGGGCTATGCCAGAGCTATGTCAGGGCTATGCCGGGGCTATGCCGGGG	155458

CU210927.8	51	TATGTCGGGGCTATGTCAGGGCTATGACTGGGCTGTGACAGAGCTGTGCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155459	TATGTCGGGGCTATGTCAGGGCTATGACTGGGCTGTGACAGAGCTGTGCT	155508

CU210927.8	101	GGGGCTGTGCCGAGGCTGGGCAGGGTGTGGTGCCCCTTGAGCACTCCTTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155509	GGGGCTGTGCCGAGGCTGGGCAGGGTGTGGTGCCCCTTGAGCACTCCTTA	155558

CU210927.8	151	TTTAGGAAATGCACTTTCAACCATGAAGAAGAAGAATTTTTGATGCATTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155559	TTTAGGAAATGCACTTTCAACCATGAAGAAGAAGAATTTTTGATGCATTC	155608

CU210927.8	201	TTTGTGAAGCTGGTATATGGTACTCCATGCCCAAGTCCCTGCTCTATAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155609	TTTGTGAAGCTGGTATATGGTACTCCATGCCCAAGTCCCTGCTCTATAAA	155658

CU210927.8	251	TTTTGGGTTTAAAAGAGTTGCCAGCTGAGTGACTTTCTGGACAAATCCAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155659	TTTTGGGTTTAAAAGAGTTGCCAGCTGAGTGACTTTCTGGACAAATCCAA	155708

CU210927.8	301	ACCCAGGAAGTTCCTTGGCGACTAGTGTGTTTGTAGAGCATGCTACCCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155709	ACCCAGGAAGTTCCTTGGCGACTAGTGTGTTTGTAGAGCATGCTACCCCC	155758

CU210927.8	351	ACCTCTTTTGTTCTGCCATATATATTTGATTTAGTTCCATATAAGATATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155759	ACCTCTTTTGTTCTGCCATATATATTTGATTTAGTTCCATATAAGATATT	155808

CU210927.8	401	TTTCCATTATGAAGCCCAAGTATTTCCCTTTCTTGGTAGCTGCAGGCAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155809	TTTCCATTATGAAGCCCAAGTATTTCCCTTTCTTGGTAGCTGCAGGCAGC	155858

CU210927.8	451	ATTTAACCCACATCACTATTTGTTCCTGAAATGTGAAAAGCTACATCTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155859	ATTTAACCCACATCACTATTTGTTCCTGAAATGTGAAAAGCTACATCTTT	155908

CU210927.8	501	ATGAGAAAATTTTTCATCTAAAGTATCTCTCCCATACATTGTAAATTATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155909	ATGAGAAAATTTTTCATCTAAAGTATCTCTCCCATACATTGTAAATTATT	155958

CU210927.8	551	CTTTCATCCAATTAGTAAGAGATGGGGCTGCTAGTGAGACCCTGTCTTTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	155959	CTTTCATCCAATTAGTAAGAGATGGGGCTGCTAGTGAGACCCTGTCTTTA	156008

CU210927.8	601	CTAAATTAGAAAAAGATTCCTTCAAAACGGGGCAACATCGATAATCAAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156009	CTAAATTAGAAAAAGATTCCTTCAAAACGGGGCAACATCGATAATCAAAG	156058

CU210927.8	651	GCTTACAGATGAAGCACAGCTGTAAAAATGGAAGCATGGTTAAATGAGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156059	GCTTACAGATGAAGCACAGCTGTAAAAATGGAAGCATGGTTAAATGAGAA	156108

CU210927.8	701	GAGGAGAAACGTTAAAAAAACAAAATAAAACAAACTTCTATGTGAAGCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156109	GAGGAGAAACGTTAAAAAAACAAAATAAAACAAACTTCTATGTGAAGCCA	156158

CU210927.8	751	AAATTATGCATAAAACATTTAAATATAAAATAATGACATGAAAAGGGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156159	AAATTATGCATAAAACATTTAAATATAAAATAATGACATGAAAAGGGAAT	156208

CU210927.8	801	CAGATGAGGAAGGCAACCATTAAGGATCCGATACAGTTAGGAGTAGTCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156209	CAGATGAGGAAGGCAACCATTAAGGATCCGATACAGTTAGGAGTAGTCCC	156258

CU210927.8	851	AGAAGGGCTACGGAGCTCAGAGCCATGCCCTTTCTCATGTTCCACTTCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156259	AGAAGGGCTACGGAGCTCAGAGCCATGCCCTTTCTCATGTTCCACTTCTC	156308

CU210927.8	901	AGTGTTATCTCTAAGAATGGGGCTTCAGCTTTCAAAGGAATGTTGAGAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156309	AGTGTTATCTCTAAGAATGGGGCTTCAGCTTTCAAAGGAATGTTGAGAAT	156358

CU210927.8	951	GAATCACTAGGCACATACACTACTTACAGCAGCCTATTGTGAACGCCGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156359	GAATCACTAGGCACATACACTACTTACAGCAGCCTATTGTGAACGCCGTA	156408

CU210927.8	1001	TATCAATCATCCCCAACCTTTGAAGTTCTAAACTCTGACAGTCTCAAAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156409	TATCAATCATCCCCAACCTTTGAAGTTCTAAACTCTGACAGTCTCAAAGG	156458

CU210927.8	1051	ATGGAGAAGGAGTCTAGTCAAGCCCCAGGGTAGAGAAACCATAAGAAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156459	ATGGAGAAGGAGTCTAGTCAAGCCCCAGGGTAGAGAAACCATAAGAAGAA	156508

CU210927.8	1101	AAAGTTTCCTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGCCTTTGCCTTTGTGAATGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156509	AAAGTTTCCTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGCCTTTGCCTTTGTGAATGA	156558

CU210927.8	1151	AAGCGAGAGGCTTCAATGCTTTATTCAACAGAACAACCCTTTATTTCGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156559	AAGCGAGAGGCTTCAATGCTTTATTCAACAGAACAACCCTTTATTTCGAT	156608

CU210927.8	1201	ACAGCTTCTTCTCCTCTATGGGGGACAGGATGAAAAGAGACAGCAGATGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156609	ACAGCTTCTTCTCCTCTATGGGGGACAGGATGAAAAGAGACAGCAGATGA	156658

CU210927.8	1251	GGTTCTTACTGCCAGGAATGGATGGAGATGCCCGATCAGGTTCCTCAGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156659	GGTTCTTACTGCCAGGAATGGATGGAGATGCCCGATCAGGTTCCTCAGTG	156708

CU210927.8	1301	CCGGAGAAGTGGCACAGCAGTCAACACTGAGCAGAACGGCGAATGCCGGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156709	CCGGAGAAGTGGCACAGCAGTCAACACTGAGCAGAACGGCGAATGCCGGC	156758

CU210927.8	1351	TCTATTCAGCCCTGCTGAAAACATCGACGTTGTTTGTGAATGAGACTCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156759	TCTATTCAGCCCTGCTGAAAACATCGACGTTGTTTGTGAATGAGACTCCT	156808

CU210927.8	1401	TTAAGTATCGCTCTGGGTCTGTTGCAAGCATTTTGATTGTGGGTTTCCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156809	TTAAGTATCGCTCTGGGTCTGTTGCAAGCATTTTGATTGTGGGTTTCCCC	156858

CU210927.8	1451	CACACTGTGCCTGCTTTACTAATAACATCACAGATATTATAGTTCTGAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156859	CACACTGTGCCTGCTTTACTAATAACATCACAGATATTATAGTTCTGAAT	156908

CU210927.8	1501	TCCGTGGCTTGTTTGAACTGGTGTAACCTGTTTATTCTTCTTCCAAGAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156909	TCCGTGGCTTGTTTGAACTGGTGTAACCTGTTTATTCTTCTTCCAAGAAA	156958

CU210927.8	1551	CTTTTTGTGTCTAAGATTCTTCTCTCCTGTTGTGATGCGGAGTGATAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	156959	CTTTTTGTGTCTAAGATTCTTCTCTCCTGTTGTGATGCGGAGTGATAACA	157008

CU210927.8	1601	AAGGCTCACCAAGACTCCAGTGTTTCAGAGTAGGAAAAAAACAAAACAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157009	AAGGCTCACCAAGACTCCAGTGTTTCAGAGTAGGAAAAAAACAAAACAAA	157058

CU210927.8	1651	ACAAAACAAAACAACCAAACAAAACAAAACAAAATCCTTTCCATACGTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157059	ACAAAACAAAACAACCAAACAAAACAAAACAAAATCCTTTCCATACGTCA	157108

CU210927.8	1701	ACCACAGCCAAAAGTAAACGAAGCCAACTTTCAGCAGCCACATGGCCACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157109	ACCACAGCCAAAAGTAAACGAAGCCAACTTTCAGCAGCCACATGGCCACA	157158

CU210927.8	1751	GCTTTCACAGTGCTGGACTCTACAGTAGACTTTCAAAAAGGAGTTTAAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157159	GCTTTCACAGTGCTGGACTCTACAGTAGACTTTCAAAAAGGAGTTTAAGG	157208

CU210927.8	1801	GTAGAATAAAGGACTATTTCTTTAAATAAAGGGGGGAAAACGTTTTCTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157209	GTAGAATAAAGGACTATTTCTTTAAATAAAGGGGGGAAAACGTTTTCTGA	157258

CU210927.8	1851	GCAACTTTCTTTCACCTATACAATATTTTTCCTCTGTTCTTGTTTTGTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157259	GCAACTTTCTTTCACCTATACAATATTTTTCCTCTGTTCTTGTTTTGTTT	157308

CU210927.8	1901	TTGTTTGTGTATGTGTGCTTTGGAGGATGGTATGTGTCCCTAAGTGCTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157309	TTGTTTGTGTATGTGTGCTTTGGAGGATGGTATGTGTCCCTAAGTGCTGG	157358

CU210927.8	1951	TGCCTGTTGTGGCCAGAAGAAGGTATCGAATCTCCCCATAGTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210848.9	157359	TGCCTGTTGTGGCCAGAAGAAGGTATCGAATCTCCCCATAGTTGGAATTC	157408

Overview

Query
CU210927.8 - 20959 bps
Hit
CU210848.9 - 157408 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link