<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207415.5	1	GAATTCCTACAAGTCTTGCTTACCTCCACACGGGCCTGGCACCTATAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138599	GAATTCCTACAAGTCTTGCTTACCTCCACACGGGCCTGGCACCTATAGCT	138648

CU207415.5	51	CCTCCCCCAGAGTAGTCAATCAAACCACCCACACAGACGCAGTGCAGTGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138649	CCTCCCCCAGAGTAGTCAATCAAACCACCCACACAGACGCAGTGCAGTGC	138698

CU207415.5	101	ACCGTCCGGCGGGCCTACAATGCTCACAGTGATGTGGATGGGACGTGAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138699	ACCGTCCGGCGGGCCTACAATGCTCACAGTGATGTGGATGGGACGTGAAG	138748

CU207415.5	151	CAGGTTCCCGGCACGGCCTGGGGAGCCATGCTGAGAAAAGTGGTCTCCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138749	CAGGTTCCCGGCACGGCCTGGGGAGCCATGCTGAGAAAAGTGGTCTCCAA	138798

CU207415.5	201	ATGTTCACTGCCTTTTCTAAAGGGCCTAGCAAGTGCGGTACACACTGTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138799	ATGTTCACTGCCTTTTCTAAAGGGCCTAGCAAGTGCGGTACACACTGTTT	138848

CU207415.5	251	ACTTGTGTCCTCCACCTGTGCCTGCCCCCCAGGCAGGGTTTCTCTGTGTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138849	ACTTGTGTCCTCCACCTGTGCCTGCCCCCCAGGCAGGGTTTCTCTGTGTA	138898

CU207415.5	301	GCCCTGGCTGTCCTGGAACTTAAGTCTGTGGACCAGATTGGCCTCCAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138899	GCCCTGGCTGTCCTGGAACTTAAGTCTGTGGACCAGATTGGCCTCCAACT	138948

CU207415.5	351	CAGAGATCCTCCTGCCTCTGTGCTGGAATTGAAGGTGTGTGCCACTCCGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138949	CAGAGATCCTCCTGCCTCTGTGCTGGAATTGAAGGTGTGTGCCACTCCGA	138998

CU207415.5	401	CTCATTCTTTTCTAACCTTTTGAACCACAATTGTTTTAAAGTGGACACCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	138999	CTCATTCTTTTCTAACCTTTTGAACCACAATTGTTTTAAAGTGGACACCT	139048

CU207415.5	451	ATGCAGAAGGAAGTACTGCATAAGGCAAAAGTACTGCATAAGCGGTGACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139049	ATGCAGAAGGAAGTACTGCATAAGGCAAAAGTACTGCATAAGCGGTGACA	139098

CU207415.5	501	ATGGGATCCACACGCTGCAGTGTTGAGTGGCAGGGTGGCTGTCCCGGCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139099	ATGGGATCCACACGCTGCAGTGTTGAGTGGCAGGGTGGCTGTCCCGGCTA	139148

CU207415.5	551	CAGGGCAAGGCACGCACTGCTGGGCAGTGTACTGCAGTCCCGGGTTCGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139149	CAGGGCAAGGCACGCACTGCTGGGCAGTGTACTGCAGTCCCGGGTTCGCC	139198

CU207415.5	601	TCTTACCTACCTTCGGATGATGCAGCCCCCTCTCCACATCAGGGCAATGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139199	TCTTACCTACCTTCGGATGATGCAGCCCCCTCTCCACATCAGGGCAATGG	139248

CU207415.5	651	CGCCATAATTGAGGGTCCAGCCAAACTCAGTGGCTGCCTGTCTGAGCAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139249	CGCCATAATTGAGGGTCCAGCCAAACTCAGTGGCTGCCTGTCTGAGCAGC	139298

CU207415.5	701	ATAAAGCCTTGGGCGTAGGAGATGATCTTGGAAGCATAGAGGGCCTGGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139299	ATAAAGCCTTGGGCGTAGGAGATGATCTTGGAAGCATAGAGGGCCTGGAA	139348

CU207415.5	751	AGTGACACAGGACTTCAGAGCTGTGGTTGGTGGAGTAGCCACACCCATGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139349	AGTGACACAGGACTTCAGAGCTGTGGTTGGTGGAGTAGCCACACCCATGT	139398

CU207415.5	801	CCCAGTTTCATTCGCACCTCAGAGACGCGAGAGAGGGTGACAGAACGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139399	CCCAGTTTCATTCGCACCTCAGAGACGCGAGAGAGGGTGACAGAACGGGA	139448

CU207415.5	851	AAGGCTGGAATTGGAGGACCTCTACAGACCCCACCACAGGCGACGAGGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139449	AAGGCTGGAATTGGAGGACCTCTACAGACCCCACCACAGGCGACGAGGTG	139498

CU207415.5	901	AGGGGCAGTCACCTTACGGATGTCCTCCAGGAATGACTTCTTACTGCCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139499	AGGGGCAGTCACCTTACGGATGTCCTCCAGGAATGACTTCTTACTGCCTT	139548

CU207415.5	951	CCAGCTGGACCACCTTAGGACCCTTCAGCTTTTGGCTGGCCTGAACCCGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139549	CCAGCTGGACCACCTTAGGACCCTTCAGCTTTTGGCTGGCCTGAACCCGC	139598

CU207415.5	1001	TCCTCCTTCAGAGAGGACAAGCACCGAGCAAAGACAGCTTCTCCTGGTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139599	TCCTCCTTCAGAGAGGACAAGCACCGAGCAAAGACAGCTTCTCCTGGTGG	139648

CU207415.5	1051	GGAAGACAGGGCCGATCAGGGATCCAACCAGAGGCCAGGACAGGGGCAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139649	GGAAGACAGGGCCGATCAGGGATCCAACCAGAGGCCAGGACAGGGGCAAG	139698

CU207415.5	1101	AGATCCAGCCTGCACCAAGGGCTGAGTGCTTTGGCCTGGGTTACGGGGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139699	AGATCCAGCCTGCACCAAGGGCTGAGTGCTTTGGCCTGGGTTACGGGGAA	139748

CU207415.5	1151	GGGCCACATAGCTCTGTTCATTCCAGAACTGAAAGACCAAGTTAGCCTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139749	GGGCCACATAGCTCTGTTCATTCCAGAACTGAAAGACCAAGTTAGCCTCT	139798

CU207415.5	1201	CCACACAGACGCAGGCATTCAACTACAAAGATCAACTCGGAATTCAAAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139799	CCACACAGACGCAGGCATTCAACTACAAAGATCAACTCGGAATTCAAAGG	139848

CU207415.5	1251	GACGTCTCGAGGTGAGAGAGGTAAGGCAAGGATTGCACAGAACAACTCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139849	GACGTCTCGAGGTGAGAGAGGTAAGGCAAGGATTGCACAGAACAACTCAA	139898

CU207415.5	1301	TATTAACCCAAGAGTAAAACCTCAGTTTCTATGAAGAAGAAATTAACTGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139899	TATTAACCCAAGAGTAAAACCTCAGTTTCTATGAAGAAGAAATTAACTGT	139948

CU207415.5	1351	TGTGAGACAAGACTGCATAAGTACAAGCTGACCTCACACTCACAATACGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139949	TGTGAGACAAGACTGCATAAGTACAAGCTGACCTCACACTCACAATACGG	139998

CU207415.5	1401	CAGAGGACGGCCTTGACCCACAGGTCCTCCTGCCTCTTCCTCCCAAGGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	139999	CAGAGGACGGCCTTGACCCACAGGTCCTCCTGCCTCTTCCTCCCAAGGGC	140048

CU207415.5	1451	TTGGATTACAGCTATGCTCCACACCTGACTGGTGAGAATTAAGTGCTCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140049	TTGGATTACAGCTATGCTCCACACCTGACTGGTGAGAATTAAGTGCTCAC	140098

CU207415.5	1501	CAAAGATGCAATTTATTGTCTTAAAAAAAAAGACGTTTATTAATTTTTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140099	CAAAGATGCAATTTATTGTCTTAAAAAAAAAGACGTTTATTAATTTTTTG	140148

CU207415.5	1551	TTTGAGACAGCAGGGTTTTTCCAGGTAGTCCTGGCTGCCTTGGAACTTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140149	TTTGAGACAGCAGGGTTTTTCCAGGTAGTCCTGGCTGCCTTGGAACTTAC	140198

CU207415.5	1601	TATGTAGACCAGGCTTGCCTTGAATTCAGAGCACCCCCTGCCCCTGCCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140199	TATGTAGACCAGGCTTGCCTTGAATTCAGAGCACCCCCTGCCCCTGCCTC	140248

CU207415.5	1651	TCAAGTTCTGGTGTTAAATGTGTACACCTCCATGCTCAGCTTTGAAAGCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140249	TCAAGTTCTGGTGTTAAATGTGTACACCTCCATGCTCAGCTTTGAAAGCT	140298

CU207415.5	1701	GATTTTTAATTTATTATTTCTATGTTTATGGGTGTCTGCCTTCATGTGTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140299	GATTTTTAATTTATTATTTCTATGTTTATGGGTGTCTGCCTTCATGTGTA	140348

CU207415.5	1751	TATGCATCACTTGCCTGCAGTGCCTTCAGAGGCTAGAAGAGGGCGCAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140349	TATGCATCACTTGCCTGCAGTGCCTTCAGAGGCTAGAAGAGGGCGCAAGA	140398

CU207415.5	1801	TCCAACCACGTGGGTGCTGGGAATCAAACCCAGATCAACAAGAGCAACAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140399	TCCAACCACGTGGGTGCTGGGAATCAAACCCAGATCAACAAGAGCAACAA	140448

CU207415.5	1851	GCGCTCTTGATTACTAGGCCATCTCTCTCACTAGCTCCCAGGTTTAGTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140449	GCGCTCTTGATTACTAGGCCATCTCTCTCACTAGCTCCCAGGTTTAGTGT	140498

CU207415.5	1901	TCTTCTTTTTGTAAGACTTATTTTTAATTATTTATATGTGTGTGTGTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140499	TCTTCTTTTTGTAAGACTTATTTTTAATTATTTATATGTGTGTGTGTCTG	140548

CU207415.5	1951	AGTGTAGGTTCGTACACTTGAACGCGAGAGCCCTCAGAGACCAGGAGTCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210839.7	140549	AGTGTAGGTTCGTACACTTGAACGCGAGAGCCCTCAGAGACCAGGAGTCA	140598

Overview

Query
CU207415.5 - 196015 bps
Hit
CU210839.7 - 140598 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link