<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210839.7	1	GAATTCTGTCAAACCATTAACAGGAGATGCTATTCACTCCAAAGATGTCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130059	GAATTCTGTCAAACCATTAACAGGAGATGCTATTCACTCCAAAGATGTCA	130108

CU210839.7	51	CTCCTGCCTTAGGTAATTTTCATACTGAATGTAATTAGATTACAATTCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130109	CTCCTGCCTTAGGTAATTTTCATACTGAATGTAATTAGATTACAATTCCA	130158

CU210839.7	101	AGGAGACTGGCAGGTGATGTGGGGAGGAGCAGGATTAAGAAGAGGAGATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130159	AGGAGACTGGCAGGTGATGTGGGGAGGAGCAGGATTAAGAAGAGGAGATG	130208

CU210839.7	151	TGGAGTCCCAGAGACTGGCTCAGTGACTGAACAGGACCTGTGTGGGATTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130209	TGGAGTCCCAGAGACTGGCTCAGTGACTGAACAGGACCTGTGTGGGATTC	130258

CU210839.7	201	CCAGGACCCACATGGTGGCCCACAGCCATTTCTAACTCCTATTCCAAAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130259	CCAGGACCCACATGGTGGCCCACAGCCATTTCTAACTCCTATTCCAAAGG	130308

CU210839.7	251	ACACCCTCTTCTGGCCTCTGCAGGCACTGAATGCATGCGGTGCAGACACG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130309	ACACCCTCTTCTGGCCTCTGCAGGCACTGAATGCATGCGGTGCAGACACG	130358

CU210839.7	301	TGCAGACAAAATGCCCACACATATAAAAGAAAAGAAGTTACAAAAACTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130359	TGCAGACAAAATGCCCACACATATAAAAGAAAAGAAGTTACAAAAACTTT	130408

CU210839.7	351	TTAGGGGGGAGTTATGTGATAAGGAACGTAGACACCAGGGCTGCTCTTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130409	TTAGGGGGGAGTTATGTGATAAGGAACGTAGACACCAGGGCTGCTCTTAC	130458

CU210839.7	401	CAGCAACAACAGTGACGTAGAAGTTACAATCTAAAGGAATGGAGGCACTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130459	CAGCAACAACAGTGACGTAGAAGTTACAATCTAAAGGAATGGAGGCACTG	130508

CU210839.7	451	CAGCCCAGCAGACAGGGACATCAGCTCATGAGAACACTGAATGCAATGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130509	CAGCCCAGCAGACAGGGACATCAGCTCATGAGAACACTGAATGCAATGGA	130558

CU210839.7	501	TTACAAACTGACATGTCGCTAAGTGGTGCCAGAACAATCAAGTCGGTCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130559	TTACAAACTGACATGTCGCTAAGTGGTGCCAGAACAATCAAGTCGGTCAC	130608

CU210839.7	551	CAGGAAAAATAAAGTTATAGTCCTATCAACAAAATAAATTCCATGGAAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130609	CAGGAAAAATAAAGTTATAGTCCTATCAACAAAATAAATTCCATGGAAGA	130658

CU210839.7	601	AAACTAGACCCATAAAAGAAAAAGGGAGGCAAGAGTGTCTGTGTCCTTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130659	AAACTAGACCCATAAAAGAAAAAGGGAGGCAAGAGTGTCTGTGTCCTTAG	130708

CU210839.7	651	GCTGTGGGAAGGATTTCTGATTTCAACCAAAACAAGGACCTATGAACTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130709	GCTGTGGGAAGGATTTCTGATTTCAACCAAAACAAGGACCTATGAACTTG	130758

CU210839.7	701	ACAATCTGGAAGTTTAAAACCTCATGGGGTGGAGGGTGGAGGATGCCCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130759	ACAATCTGGAAGTTTAAAACCTCATGGGGTGGAGGGTGGAGGATGCCCAC	130808

CU210839.7	751	TGAGTCAGTAGAGTGGTGTAGATTAACATGAAAACAAGTCCATTTCCATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130809	TGAGTCAGTAGAGTGGTGTAGATTAACATGAAAACAAGTCCATTTCCATT	130858

CU210839.7	801	CATGGAGGCCTGGCAACTCAAGGCTTTACAGTTTTCCCCTAAAGGGCAGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130859	CATGGAGGCCTGGCAACTCAAGGCTTTACAGTTTTCCCCTAAAGGGCAGT	130908

CU210839.7	851	CACAGAGGTGAGACCTGTCTCTCCAGGGAATTTAAAGAAGAGACTGCTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130909	CACAGAGGTGAGACCTGTCTCTCCAGGGAATTTAAAGAAGAGACTGCTGG	130958

CU210839.7	901	GATGGAGACATCACAGTACTCAGGTGTCCATCAAAGGGGAAGGGCTGGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	130959	GATGGAGACATCACAGTACTCAGGTGTCCATCAAAGGGGAAGGGCTGGTG	131008

CU210839.7	951	AAAATAAATCATGGCACATGTTCTCTGTCCCACACCCAGCAGTGGTTAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131009	AAAATAAATCATGGCACATGTTCTCTGTCCCACACCCAGCAGTGGTTAAA	131058

CU210839.7	1001	ACTGTCAGAGATCTGTACTTACAGACATGAATTATGTCTGAGCAGAAAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131059	ACTGTCAGAGATCTGTACTTACAGACATGAATTATGTCTGAGCAGAAAGA	131108

CU210839.7	1051	AAGACAGCAACAGAGGCAAACTCCAAGAAGAGTTGTCAAAGAAAAAGCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131109	AAGACAGCAACAGAGGCAAACTCCAAGAAGAGTTGTCAAAGAAAAAGCAG	131158

CU210839.7	1101	GACCCAACAGCCCCAAAAGAAGGCAAAGGGCTGAGAGCTCCCACCCACCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131159	GACCCAACAGCCCCAAAAGAAGGCAAAGGGCTGAGAGCTCCCACCCACCT	131208

CU210839.7	1151	TCGGATGTGCGTCCTCTCGCCGGCCCCAGCCTGTCCCGGCCTGGGCTGAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131209	TCGGATGTGCGTCCTCTCGCCGGCCCCAGCCTGTCCCGGCCTGGGCTGAC	131258

CU210839.7	1201	CCGGGGCTTCCAGGTGCCTGGGATGTGTGCAGCTGTGCTGGGTTACTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131259	CCGGGGCTTCCAGGTGCCTGGGATGTGTGCAGCTGTGCTGGGTTACTCAG	131308

CU210839.7	1251	CACAGTTCCTTCCCATCACGCTTACCGGGTCTTTATAAAGTTCTTACAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131309	CACAGTTCCTTCCCATCACGCTTACCGGGTCTTTATAAAGTTCTTACAGA	131358

CU210839.7	1301	AAACCGAAGAACTTTAGCTGAAATGCCCCGAAGACAAGCACGCAGGGCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131359	AAACCGAAGAACTTTAGCTGAAATGCCCCGAAGACAAGCACGCAGGGCAA	131408

CU210839.7	1351	CATGGAAGGTGTGGGACAGACATCCCAGCAACCCTCTCCATACCCACACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131409	CATGGAAGGTGTGGGACAGACATCCCAGCAACCCTCTCCATACCCACACC	131458

CU210839.7	1401	AGATGCAGTGCAGGCAGCAAGGCTAAGCTAGAGTTTCATCAGCAGTCCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131459	AGATGCAGTGCAGGCAGCAAGGCTAAGCTAGAGTTTCATCAGCAGTCCCC	131508

CU210839.7	1451	TTGGGATGAGGTCATCACATCCCGACTACCTCTGGTCCTCCAAGGGGACG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131509	TTGGGATGAGGTCATCACATCCCGACTACCTCTGGTCCTCCAAGGGGACG	131558

CU210839.7	1501	ATTATCACACTGTCACCAGTGTCCCTGGAGCTCCTTATTAGTCTAATAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131559	ATTATCACACTGTCACCAGTGTCCCTGGAGCTCCTTATTAGTCTAATAGA	131608

CU210839.7	1551	AACCCTTCACGCTTGCATAGAGACTGACAGAGACCATGAGGCTGAAATGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131609	AACCCTTCACGCTTGCATAGAGACTGACAGAGACCATGAGGCTGAAATGA	131658

CU210839.7	1601	ACTTGTGCATATAGGCACCCCTACCTCAGGGCCTAATGAGGGGTACAAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131659	ACTTGTGCATATAGGCACCCCTACCTCAGGGCCTAATGAGGGGTACAAGG	131708

CU210839.7	1651	ACTGGTGTGCATGGTTCCCCTGCACAAGCCAGCCCATCTTCTGGGACTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131709	ACTGGTGTGCATGGTTCCCCTGCACAAGCCAGCCCATCTTCTGGGACTCT	131758

CU210839.7	1701	GATGGCAGCTGCTGCCAGGCTCTGGGGATGTCTAGGGAGAACCGGAGCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131759	GATGGCAGCTGCTGCCAGGCTCTGGGGATGTCTAGGGAGAACCGGAGCAG	131808

CU210839.7	1751	CTTCCAGAGGAGCAGCACACAAGCAACACCTCAAACCACAGCCATGAGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131809	CTTCCAGAGGAGCAGCACACAAGCAACACCTCAAACCACAGCCATGAGCC	131858

CU210839.7	1801	CAGAAGACAAAGGTGATGTCACTGAAGGGCAGGTGCCACACTGCTAAATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131859	CAGAAGACAAAGGTGATGTCACTGAAGGGCAGGTGCCACACTGCTAAATC	131908

CU210839.7	1851	CCTGACATTTCGCAGAGGAACAAGCAGCAAGTCACAGAACTGGCAACTGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131909	CCTGACATTTCGCAGAGGAACAAGCAGCAAGTCACAGAACTGGCAACTGC	131958

CU210839.7	1901	AGTGAGGCACGCAGGAGATGCTCTGGAAGCCTCCATCACAGCCTCCCAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	131959	AGTGAGGCACGCAGGAGATGCTCTGGAAGCCTCCATCACAGCCTCCCAGG	132008

CU210839.7	1951	CCGCCCCTCTGGTCCAGCTCACTGAGGAATGTTGGCTGTGGGCACTAGAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207405.9	132009	CCGCCCCTCTGGTCCAGCTCACTGAGGAATGTTGGCTGTGGGCACTAGAC	132058

Overview

Query
CU210839.7 - 140598 bps
Hit
CU207405.9 - 132058 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link