<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207379.7	1	ATGGTGTGGGATGTTGAAGCTTCAAAGCTCACACCCCAGTGATACATCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256337	ATGGTGTGGGATGTTGAAGCTTCAAAGCTCACACCCCAGTGATACATCTC	256386

CU207379.7	51	CCCAACAAGGAAACACCCCTAATCCTTCCCAAACAGTTCCACCAACTAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256387	CCCAACAAGGAAACACCCCTAATCCTTCCCAAACAGTTCCACCAACTAGA	256436

CU207379.7	101	ACCAAATATTCAAATATATGAGCCTATGGGAAGCTTTTCTCTCTTACATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256437	ACCAAATATTCAAATATATGAGCCTATGGGAAGCTTTTCTCTCTTACATC	256486

CU207379.7	151	ACCACAACCACAATGGGACAGCTGAGGCTCTGAACCATGCCAGTTACTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256487	ACCACAACCACAATGGGACAGCTGAGGCTCTGAACCATGCCAGTTACTCT	256536

CU207379.7	201	TGAATAGTTTTCTCATTCTCAACATAAATTAATCTTCAATGTTTAAGAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256537	TGAATAGTTTTCTCATTCTCAACATAAATTAATCTTCAATGTTTAAGAAA	256586

CU207379.7	251	GAAAATTTGTAATTCCTAAACACAAAGAGATTAGGTGGGGCATTAGCAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256587	GAAAATTTGTAATTCCTAAACACAAAGAGATTAGGTGGGGCATTAGCAGA	256636

CU207379.7	301	AACCCTCAATGAATTGTAGTTTGGGTATTCACCCTTAGATATATTTAGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256637	AACCCTCAATGAATTGTAGTTTGGGTATTCACCCTTAGATATATTTAGAA	256686

CU207379.7	351	AAGAACCAATTCAGAGAAGCTGGGGCTGGGATGTGGGTCTGCGCAAGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256687	AAGAACCAATTCAGAGAAGCTGGGGCTGGGATGTGGGTCTGCGCAAGAGA	256736

CU207379.7	401	ACTTGCCCAGTAAGTGTAAGACTCTGGATTTAGTCTCTTGCACCACCACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256737	ACTTGCCCAGTAAGTGTAAGACTCTGGATTTAGTCTCTTGCACCACCACC	256786

CU207379.7	451	AATACAATACACCACAACAGTGGAGAGAGGGGCCAGTAAGGGGTGTAAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256787	AATACAATACACCACAACAGTGGAGAGAGGGGCCAGTAAGGGGTGTAAGC	256836

CU207379.7	501	TCAATGACTCTTGCTCAATATCATGGAACTCAGTCTGAGAAATCCAGCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256837	TCAATGACTCTTGCTCAATATCATGGAACTCAGTCTGAGAAATCCAGCAC	256886

CU207379.7	551	TCTCTGTCCCCTGTTTGGAAGACTCTAAACAGAACTCTAATAGAGAAATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256887	TCTCTGTCCCCTGTTTGGAAGACTCTAAACAGAACTCTAATAGAGAAATA	256936

CU207379.7	601	GATTCTTTTCCATCAGATCTCCCTCACACACCTCCTTTTTCCCTTAAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256937	GATTCTTTTCCATCAGATCTCCCTCACACACCTCCTTTTTCCCTTAAAAT	256986

CU207379.7	651	TGAAGCTATTGTAGCTGGTGTGTATGACTAACTCAAGGCGCTCGTGTTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	256987	TGAAGCTATTGTAGCTGGTGTGTATGACTAACTCAAGGCGCTCGTGTTGG	257036

CU207379.7	701	AGAGACCGTTAGAAGAAAGTAGAAACTAGAACTTTGCAGATGTGTCTCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257037	AGAGACCGTTAGAAGAAAGTAGAAACTAGAACTTTGCAGATGTGTCTCCA	257086

CU207379.7	751	CTTGTGTGATAACAGGGCATGTATATAGGTTTGTTTACACAAACATCGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257087	CTTGTGTGATAACAGGGCATGTATATAGGTTTGTTTACACAAACATCGCC	257136

CU207379.7	801	CAATTTAAAATAATTTACAAGGATACCTGTGATTCAACTTGATAGTTCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257137	CAATTTAAAATAATTTACAAGGATACCTGTGATTCAACTTGATAGTTCAA	257186

CU207379.7	851	ATTAAAAGTGAAATGAGTGAAGAGGTAGAAGGCAGTGTGAATATTAACTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257187	ATTAAAAGTGAAATGAGTGAAGAGGTAGAAGGCAGTGTGAATATTAACTT	257236

CU207379.7	901	AGGAACCGAATGGGAAATGACGCTAAAATGAATAGCATGCATTATTTTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257237	AGGAACCGAATGGGAAATGACGCTAAAATGAATAGCATGCATTATTTTCT	257286

CU207379.7	951	GCCAGTGTGCAATAAATATCACTTAAGGTTTTTATACCTAGAGTGTAAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257287	GCCAGTGTGCAATAAATATCACTTAAGGTTTTTATACCTAGAGTGTAAAA	257336

CU207379.7	1001	TATAAGGTAATGCCACCCTAGAATGTTCTCTTATTCTTTATTGCTAGAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257337	TATAAGGTAATGCCACCCTAGAATGTTCTCTTATTCTTTATTGCTAGAGT	257386

CU207379.7	1051	GCATAATTACTTATATTTTAACGTACTTTAATAGACTTTTCTCAGCGGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257387	GCATAATTACTTATATTTTAACGTACTTTAATAGACTTTTCTCAGCGGCC	257436

CU207379.7	1101	TAACCAGAAAGAACATAACAGGATTCATTTTACTCATAGAAACACTGAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257437	TAACCAGAAAGAACATAACAGGATTCATTTTACTCATAGAAACACTGAAA	257486

CU207379.7	1151	TTTGGAATAATACAGAATTTGACAAAAGATTGTAGGATTACTAAATGAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257487	TTTGGAATAATACAGAATTTGACAAAAGATTGTAGGATTACTAAATGAAG	257536

CU207379.7	1201	CTTGACTAATACACATGGTATGAAATGTCATGGTATGTCACTGAGAAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257537	CTTGACTAATACACATGGTATGAAATGTCATGGTATGTCACTGAGAAAAA	257586

CU207379.7	1251	ATCAGAAATTTAGTCTGGTGTGGAGACACACCTCTTTAATCTCTGCACTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257587	ATCAGAAATTTAGTCTGGTGTGGAGACACACCTCTTTAATCTCTGCACTG	257636

CU207379.7	1301	GGTAGCACAGAGAAAAAGATTGAGGTTGAAAGGCTAGCCTGGGCTACATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257637	GGTAGCACAGAGAAAAAGATTGAGGTTGAAAGGCTAGCCTGGGCTACATA	257686

CU207379.7	1351	ATTAGATCTTGTCTCAAAAACAAAGCAGTAAATTGCAGCAGACCTCTGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257687	ATTAGATCTTGTCTCAAAAACAAAGCAGTAAATTGCAGCAGACCTCTGAG	257736

CU207379.7	1401	TTTATAATCTGTGTTCTTCAATTATAAGCATATCTCAAACACTCAACTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257737	TTTATAATCTGTGTTCTTCAATTATAAGCATATCTCAAACACTCAACTGG	257786

CU207379.7	1451	TCTTATCATAGGAATGATAATAAGCACATTTTCACCCACAGTAGACTCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257787	TCTTATCATAGGAATGATAATAAGCACATTTTCACCCACAGTAGACTCTA	257836

CU207379.7	1501	TCATCAAATTAATTTTACCAGAACAGTAGCTTATATACGTAAGCAAAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257837	TCATCAAATTAATTTTACCAGAACAGTAGCTTATATACGTAAGCAAAGAA	257886

CU207379.7	1551	GAGGGGTTGTTCTCAAAATGTGAGTTCCCAACTAACTGTGCAACAAACGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257887	GAGGGGTTGTTCTCAAAATGTGAGTTCCCAACTAACTGTGCAACAAACGG	257936

CU207379.7	1601	TATTCTCACAGCCAGAGATGCAAGCTTTGTAAACTGAACCATAGTAGAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257937	TATTCTCACAGCCAGAGATGCAAGCTTTGTAAACTGAACCATAGTAGAAA	257986

CU207379.7	1651	TCAGAAAACACTGGGACAATTGCACAGAGGCAAGACTTTCCCTGCCCAAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	257987	TCAGAAAACACTGGGACAATTGCACAGAGGCAAGACTTTCCCTGCCCAAC	258036

CU207379.7	1701	AAAAACTTTAATAGAAAAATAAAACATTCCATGGATGTGGTAGTTTTCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	258037	AAAAACTTTAATAGAAAAATAAAACATTCCATGGATGTGGTAGTTTTCTG	258086

CU207379.7	1751	TCCACTTGACTCAAGCCAGGGGCATCTGGGAAGTGGAACCCTCTGCTCCG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	258087	TCCACTTGACTCAAGCCAGGGGCATCTGGGAAGTGGAACCCTCTGCTCCG	258136

CU207379.7	1801	AAAATACTTTCATCATATTGGCCTGTAGGCCAGGCTGTGGTGGCACATTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	258137	AAAATACTTTCATCATATTGGCCTGTAGGCCAGGCTGTGGTGGCACATTT	258186

CU207379.7	1851	TCATAATTGGTGACTGGTGTATAAGGGCTCAACCCACTGTACGTGGTGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	258187	TCATAATTGGTGACTGGTGTATAAGGGCTCAACCCACTGTACGTGGTGCT	258236

CU207379.7	1901	GCCCTTGGGCAGGTGGTCCTTATATGTTTACAGAAATGAGCTGATTCACC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	258237	GCCCTTGGGCAGGTGGTCCTTATATGTTTACAGAAATGAGCTGATTCACC	258286

CU207379.7	1951	CAATAAGTAAGTTTGCCATGGCCAACGCTTCAGTTCCTGCCTGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207393.16	258287	CAATAAGTAAGTTTGCCATGGCCAACGCTTCAGTTCCTGCCTGTGAATTC	258336

Overview

Query
CU207379.7 - 151476 bps
Hit
CU207393.16 - 258336 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link