<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207385.10	1	GAATTCTTTGCATTCAGGGCTGCAAAACAAAGACACATATTATTTAAATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38575	GAATTCTTTGCATTCAGGGCTGCAAAACAAAGACACATATTATTTAAATC	38624

CU207385.10	51	AGTTTTATTTAAGAATTTCCAACAATGACAACTCTTATAAAAAAGCATCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38625	AGTTTTATTTAAGAATTTCCAACAATGACAACTCTTATAAAAAAGCATCC	38674

CU207385.10	101	AAGCACAGGACACAGAACTGCAGCAAACAGCATTCTTATGAATAGCTAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38675	AAGCACAGGACACAGAACTGCAGCAAACAGCATTCTTATGAATAGCTAAC	38724

CU207385.10	151	AGACATGAGAACTTCCACCCTTCTTTGAGACACCTGAGCTCACTGGTGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38725	AGACATGAGAACTTCCACCCTTCTTTGAGACACCTGAGCTCACTGGTGAA	38774

CU207385.10	201	CTCTGCTTCCAAGTTCTCCTGCAAAGCACACCACAAGCTCAGTCCATGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38775	CTCTGCTTCCAAGTTCTCCTGCAAAGCACACCACAAGCTCAGTCCATGTT	38824

CU207385.10	251	CGCAGCCCATCAGCTTCAGTTCACGTTCCCACACTTCCAGATCAGTAACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38825	CGCAGCCCATCAGCTTCAGTTCACGTTCCCACACTTCCAGATCAGTAACA	38874

CU207385.10	301	GAGGAGAACACACACCATACAGCATTCACAGCAGTTGACAGAGGGGGAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38875	GAGGAGAACACACACCATACAGCATTCACAGCAGTTGACAGAGGGGGAGG	38924

CU207385.10	351	GAAGTACAAGTATTTCACTTAACACATTCAACTAAAGTGGGTTTCCTAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38925	GAAGTACAAGTATTTCACTTAACACATTCAACTAAAGTGGGTTTCCTAAG	38974

CU207385.10	401	AACAAAACTCAAAGTCTTCCAACTGATGTGGATGTCCTTTGATGTAAAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	38975	AACAAAACTCAAAGTCTTCCAACTGATGTGGATGTCCTTTGATGTAAAAC	39024

CU207385.10	451	ATTCGTACGTTATTTGCTATCATTGCTCTCTGCACACTCTCTCACCAAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39025	ATTCGTACGTTATTTGCTATCATTGCTCTCTGCACACTCTCTCACCAAAG	39074

CU207385.10	501	CCACAGGATTGAGTGACACATCTCTCCAAGTTAAAAAATATCCATTTTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39075	CCACAGGATTGAGTGACACATCTCTCCAAGTTAAAAAATATCCATTTTCC	39124

CU207385.10	551	ACCACCAAGTCTCTGCACGCGCTCTCCTTTTCTCGCTCATACTAGCCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39125	ACCACCAAGTCTCTGCACGCGCTCTCCTTTTCTCGCTCATACTAGCCTTT	39174

CU207385.10	601	CATGCCTCGGCACCACCATCAATCCCACACAAGGTTTCAAAAGTTCAAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39175	CATGCCTCGGCACCACCATCAATCCCACACAAGGTTTCAAAAGTTCAAAC	39224

CU207385.10	651	AGCCTTCTGGTTCCATATCACAGCCTTGCGTTCATAGCGTTGATACGACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39225	AGCCTTCTGGTTCCATATCACAGCCTTGCGTTCATAGCGTTGATACGACT	39274

CU207385.10	701	CCATGAAATAAAGAGTAGCGGATAAAAATGGAACACCCACCGTCAAAGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39275	CCATGAAATAAAGAGTAGCGGATAAAAATGGAACACCCACCGTCAAAGAC	39324

CU207385.10	751	GCAGCCTGTGCAGCGTGATGACGAATTCTTGGATGAGAAAGCATGTAGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39325	GCAGCCTGTGCAGCGTGATGACGAATTCTTGGATGAGAAAGCATGTAGAC	39374

CU207385.10	801	AGAAGTATTCCTATGGCAGAATATTTACAGCACTACTTTCAATGAAGTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39375	AGAAGTATTCCTATGGCAGAATATTTACAGCACTACTTTCAATGAAGTGC	39424

CU207385.10	851	TTCTTCCATAAACATTTGAAATGAGATGAACTGCAGAGATTAAATGAAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39425	TTCTTCCATAAACATTTGAAATGAGATGAACTGCAGAGATTAAATGAAGG	39474

CU207385.10	901	CTTCATATTGTACTTTCGTATATGAAGGAAGACAAGTGTTAAAAACAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39475	CTTCATATTGTACTTTCGTATATGAAGGAAGACAAGTGTTAAAAACAAAA	39524

CU207385.10	951	CCAAAAGAATCAAACACCATGACATCATGATCTCCCAAATGGAGATTTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39525	CCAAAAGAATCAAACACCATGACATCATGATCTCCCAAATGGAGATTTTC	39574

CU207385.10	1001	CTAAGGAAAAAATTCATAGGGTGGGATTCAAATTAAAATAAGGAGAAAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39575	CTAAGGAAAAAATTCATAGGGTGGGATTCAAATTAAAATAAGGAGAAAAG	39624

CU207385.10	1051	AATGTAGTTCTAACCAATGGTTTCTACTCTGAACATGCAAAGAATTCATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39625	AATGTAGTTCTAACCAATGGTTTCTACTCTGAACATGCAAAGAATTCATT	39674

CU207385.10	1101	AACAATTTCAATGATAGAATATTACAGAGAAACCTTCTGAGATCAATTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39675	AACAATTTCAATGATAGAATATTACAGAGAAACCTTCTGAGATCAATTGT	39724

CU207385.10	1151	AGTGTTGGTTTACCAATTAGGCAAACAGCAGTTCACTTTCACCCACTCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39725	AGTGTTGGTTTACCAATTAGGCAAACAGCAGTTCACTTTCACCCACTCAG	39774

CU207385.10	1201	TATTTTAACCCTTTATATAACAAAACTTATAAAATTCATTTAGCTTTCCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39775	TATTTTAACCCTTTATATAACAAAACTTATAAAATTCATTTAGCTTTCCC	39824

CU207385.10	1251	CTCTTTTTTTCTAAAGAAAAATGTCAAAAATACTGCTGAATATACTCCAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39825	CTCTTTTTTTCTAAAGAAAAATGTCAAAAATACTGCTGAATATACTCCAC	39874

CU207385.10	1301	ACTGAACAAACCAATCTGAAAATTTTAGTACATATGTATTTTACAATATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39875	ACTGAACAAACCAATCTGAAAATTTTAGTACATATGTATTTTACAATATA	39924

CU207385.10	1351	CTTACCATGAGTTTAGAAAAATTTGAATCCCACCATTCTAAATCTACCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39925	CTTACCATGAGTTTAGAAAAATTTGAATCCCACCATTCTAAATCTACCTA	39974

CU207385.10	1401	ACCTAACAACCAACCTACTAACCACCCCCCACCACCTACATTCCCCAGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	39975	ACCTAACAACCAACCTACTAACCACCCCCCACCACCTACATTCCCCAGCC	40024

CU207385.10	1451	AGAAGACTTAGAATCCATGCTCGAGCCAAAGCCCCCATTAAAACCACTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40025	AGAAGACTTAGAATCCATGCTCGAGCCAAAGCCCCCATTAAAACCACTGC	40074

CU207385.10	1501	CCGATCCTGCATTTGATGCTGACCCCCAACCAAGGGGGGCACCAGAATTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40075	CCGATCCTGCATTTGATGCTGACCCCCAACCAAGGGGGGCACCAGAATTA	40124

CU207385.10	1551	GAACCACTGTAGGAATTATTTCCAGAACCAAAAGCCTGATTTGGTTCCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40125	GAACCACTGTAGGAATTATTTCCAGAACCAAAAGCCTGATTTGGTTCCCT	40174

CU207385.10	1601	CTGCATGCTGCCCTGGCTTTGGTTATTCCCAGATGGGCCCGACTGGTTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40175	CTGCATGCTGCCCTGGCTTTGGTTATTCCCAGATGGGCCCGACTGGTTCT	40224

CU207385.10	1651	GCTGGCTGGCTAACATGCCCATCATACCCCAACTGCTCTGCAACGCTGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40225	GCTGGCTGGCTAACATGCCCATCATACCCCAACTGCTCTGCAACGCTGCC	40274

CU207385.10	1701	TGAGCCGCAGCCATCATCGCTGGGTTAATGCTAAAAGCACCAAAGTTCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40275	TGAGCCGCAGCCATCATCGCTGGGTTAATGCTAAAAGCACCAAAGTTCAT	40324

CU207385.10	1751	CCCTCCACCCATATTACCACCCTGGTTATTTCCCAAGCCAGCTCCACCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40325	CCCTCCACCCATATTACCACCCTGGTTATTTCCCAAGCCAGCTCCACCCC	40374

CU207385.10	1801	CTCTACTGTTACCAAACCCACCCTGATTCCCAAAGCCACCTGGATTACCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40375	CTCTACTGTTACCAAACCCACCCTGATTCCCAAAGCCACCTGGATTACCA	40424

CU207385.10	1851	CCAAATCTTCCACTTCTTTCTAACTGTCTATTGCTATTATGCTTAGGTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40425	CCAAATCTTCCACTTCTTTCTAACTGTCTATTGCTATTATGCTTAGGTTC	40474

CU207385.10	1901	AGCATTGGATATATGCACGCTGATTCCTTTAATGATCAAATCCTCTCCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40475	AGCATTGGATATATGCACGCTGATTCCTTTAATGATCAAATCCTCTCCAC	40524

CU207385.10	1951	AAAGAGACTGGGCAACCTGTAAGAAACAAGGATATAAATAAATGATTAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207387.6	40525	AAAGAGACTGGGCAACCTGTAAGAAACAAGGATATAAATAAATGATTAGA	40574

Overview

Query
CU207385.10 - 122817 bps
Hit
CU207387.6 - 40574 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link