<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU234132.14	1	GAATTCATGTCCTGTGTTGGCCAGTTCCTCTGTGAAGAAACCACTTAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	120818	GAATTCATGTCCTGTGTTGGCCAGTTCCTCTGTGAAGAAACCACTTAGCT	120867

CU234132.14	51	TTGGTGCCCCATGTCCTTCTCTGTCAAACTGGGACAATGATAATAACATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	120868	TTGGTGCCCCATGTCCTTCTCTGTCAAACTGGGACAATGATAATAACATC	120917

CU234132.14	101	CTCCTTGTAGGGCCATTGCGGTGATGCAAGGGATTAATGAGGCTAAAAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	120918	CTCCTTGTAGGGCCATTGCGGTGATGCAAGGGATTAATGAGGCTAAAAGC	120967

CU234132.14	151	ACGCGGAGCAGAAAGAAGCTGGCACAAAATAAGTGTTCATTATTAGGCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	120968	ACGCGGAGCAGAAAGAAGCTGGCACAAAATAAGTGTTCATTATTAGGCTG	121017

CU234132.14	201	CCGCTCCTACTCCAGCTATTATTAATGGGATAACGAATGGGGCTCACCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121018	CCGCTCCTACTCCAGCTATTATTAATGGGATAACGAATGGGGCTCACCTG	121067

CU234132.14	251	GCAAGAGGGAAGGACCTGGTAAACAGAAGATGACTGGCTTTTAAGCCTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121068	GCAAGAGGGAAGGACCTGGTAAACAGAAGATGACTGGCTTTTAAGCCTTT	121117

CU234132.14	301	CTCTGGTCTACCTTGCTTTCCTAGGCCCTCAGATTGATCATCCTGGGGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121118	CTCTGGTCTACCTTGCTTTCCTAGGCCCTCAGATTGATCATCCTGGGGTG	121167

CU234132.14	351	GTCACCTAGGGTGGTCAGTCTGATGACCTAATTTGGTTCCAGTCACTTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121168	GTCACCTAGGGTGGTCAGTCTGATGACCTAATTTGGTTCCAGTCACTTTC	121217

CU234132.14	401	TGCTTCTCACTTGGGGCTCCTGGCTCAGCACAGGCCAAAGCTATGGATGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121218	TGCTTCTCACTTGGGGCTCCTGGCTCAGCACAGGCCAAAGCTATGGATGG	121267

CU234132.14	451	TTTATTGCGGTGGCTGTCAAGCAAACACAGGATGCTTAGCCCCGGCAGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121268	TTTATTGCGGTGGCTGTCAAGCAAACACAGGATGCTTAGCCCCGGCAGCT	121317

CU234132.14	501	GTCTCTCCACCTCACCAACTATCCACGGCTCCCAGTTGTCCTCAGGGTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121318	GTCTCTCCACCTCACCAACTATCCACGGCTCCCAGTTGTCCTCAGGGTCT	121367

CU234132.14	551	TACTCAAGGACTATGGAGATGGCTAAACTGTTAAGGGCACTTTCTCCCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121368	TACTCAAGGACTATGGAGATGGCTAAACTGTTAAGGGCACTTTCTCCCAA	121417

CU234132.14	601	GCTTGGTGGCCTGAGTTCAGTCCCTGGGGTCCATAGGTTGTCCTCTGACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121418	GCTTGGTGGCCTGAGTTCAGTCCCTGGGGTCCATAGGTTGTCCTCTGACC	121467

CU234132.14	651	TCGGCATGTGTGCCGGGGCTCTGGTGCCTGTGTGTACTCAGGAAATACAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121468	TCGGCATGTGTGCCGGGGCTCTGGTGCCTGTGTGTACTCAGGAAATACAT	121517

CU234132.14	701	GAAATAATGTTAACAGTGGTAACAATCCCACTTGGCTCCCCCTCAGCTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121518	GAAATAATGTTAACAGTGGTAACAATCCCACTTGGCTCCCCCTCAGCTCT	121567

CU234132.14	751	GCCACCTAAGGTCTCACCTCTCGTCTCCCACCAGGATACCAGCTCTCCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121568	GCCACCTAAGGTCTCACCTCTCGTCTCCCACCAGGATACCAGCTCTCCCT	121617

CU234132.14	801	GCTGCCAGGCCCTTGTGAATGTATAGCTCGTCTGGGAGTGTCTGGTTGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121618	GCTGCCAGGCCCTTGTGAATGTATAGCTCGTCTGGGAGTGTCTGGTTGGT	121667

CU234132.14	851	AAACTTCTGCTTCTTCACCAAGGCCCAGCCTTACCAAGTCCCCTGTGACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121668	AAACTTCTGCTTCTTCACCAAGGCCCAGCCTTACCAAGTCCCCTGTGACA	121717

CU234132.14	901	CCAAGTATCAATTACAGTCAGCTATGGGGGGTGTGGGGACCGTGAGATCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121718	CCAAGTATCAATTACAGTCAGCTATGGGGGGTGTGGGGACCGTGAGATCT	121767

CU234132.14	951	TTGTCACCAGTTCTCTCTCCTCACCCTTCTCGTGCTAGCACTACCAAGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121768	TTGTCACCAGTTCTCTCTCCTCACCCTTCTCGTGCTAGCACTACCAAGCC	121817

CU234132.14	1001	TGGGCACTTAGACTCTTCAAAGAAACTGTCAGAGAACCTCTGACCTTGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121818	TGGGCACTTAGACTCTTCAAAGAAACTGTCAGAGAACCTCTGACCTTGTC	121867

CU234132.14	1051	CCATGGAGACTCAGACCTCCCAGTTTCTGTATGTCCTGGAAGACCCTGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121868	CCATGGAGACTCAGACCTCCCAGTTTCTGTATGTCCTGGAAGACCCTGCC	121917

CU234132.14	1101	CGGCTGATTTCCCTGTCTCTGTGTCCTCCCTCCTTTGCTCTTGGGCGTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121918	CGGCTGATTTCCCTGTCTCTGTGTCCTCCCTCCTTTGCTCTTGGGCGTCT	121967

CU234132.14	1151	CTGCCTCTGGGTTTTAGCTTTCTAGGACAGAGCCTTTAACTTCCTGTGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	121968	CTGCCTCTGGGTTTTAGCTTTCTAGGACAGAGCCTTTAACTTCCTGTGTG	122017

CU234132.14	1201	TTCAAGAAACACATCCTGTTCTGCCTGACTAAACAAATAAATCAGGGCGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122018	TTCAAGAAACACATCCTGTTCTGCCTGACTAAACAAATAAATCAGGGCGT	122067

CU234132.14	1251	AGGCTTAAATGCCCCTTCCTACAAGAAGCCCTCCCTGACTACCCTAACTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122068	AGGCTTAAATGCCCCTTCCTACAAGAAGCCCTCCCTGACTACCCTAACTT	122117

CU234132.14	1301	TGTTTGTAACCTTTACACCTGAGCTGTTTGTTTCCTCCTACCAGCTTTTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122118	TGTTTGTAACCTTTACACCTGAGCTGTTTGTTTCCTCCTACCAGCTTTTC	122167

CU234132.14	1351	AAGACAGAGACCTGTTGTTTTGTTTACTGCTACTTCCTGGCACCTGTCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122168	AAGACAGAGACCTGTTGTTTTGTTTACTGCTACTTCCTGGCACCTGTCCT	122217

CU234132.14	1401	GGAGACTGTCACATTCGTATGCTAATAGACATTCCCTGGGTGAGTGAGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122218	GGAGACTGTCACATTCGTATGCTAATAGACATTCCCTGGGTGAGTGAGTG	122267

CU234132.14	1451	AATGAACGAATGAATATCAGGATGAATGAGGGGGGCAAGTGAATGAATCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122268	AATGAACGAATGAATATCAGGATGAATGAGGGGGGCAAGTGAATGAATCA	122317

CU234132.14	1501	ATGACTGACTGACTGGACAAAAGAATGAATGAACCAGGAAGGGAAAGAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122318	ATGACTGACTGACTGGACAAAAGAATGAATGAACCAGGAAGGGAAAGAAT	122367

CU234132.14	1551	GAATGGGTGTGATTATGAATGCCAAGTAGAAGGGGCTAGAGACAGGACAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122368	GAATGGGTGTGATTATGAATGCCAAGTAGAAGGGGCTAGAGACAGGACAG	122417

CU234132.14	1601	TTTCTTCTGAGCCCTGGTCCCCACTGTGAACCTGTTTCCCCCAACTGTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122418	TTTCTTCTGAGCCCTGGTCCCCACTGTGAACCTGTTTCCCCCAACTGTTT	122467

CU234132.14	1651	ATTCTGTTGTGTAAAGTGCATAGGAAACATGATAATAATTAAAGCAGACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122468	ATTCTGTTGTGTAAAGTGCATAGGAAACATGATAATAATTAAAGCAGACA	122517

CU234132.14	1701	CAACAACAGGTAATTAATTGCATTTCCCAAATTTGATCCATGCATATGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122518	CAACAACAGGTAATTAATTGCATTTCCCAAATTTGATCCATGCATATGAA	122567

CU234132.14	1751	TGAGCGGGAGGTCACGGATTGGGTTGGTTGTTTAGGGGGTGGAGACCCCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122568	TGAGCGGGAGGTCACGGATTGGGTTGGTTGTTTAGGGGGTGGAGACCCCA	122617

CU234132.14	1801	TTCTCTTCCCCTCAGGATCTCAGAGTGCATGCAGCTCCTGGAGGCTGGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122618	TTCTCTTCCCCTCAGGATCTCAGAGTGCATGCAGCTCCTGGAGGCTGGTC	122667

CU234132.14	1851	CCCAGAGAGCATGTCTCCTCTTCCCCTGGGTGGGGCTCTGGCTCCCTGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122668	CCCAGAGAGCATGTCTCCTCTTCCCCTGGGTGGGGCTCTGGCTCCCTGGG	122717

CU234132.14	1901	TCCCAGATGGGAGGGAGGATTAAGGAAGGGCTCTGCAGGGAAGCTCAATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122718	TCCCAGATGGGAGGGAGGATTAAGGAAGGGCTCTGCAGGGAAGCTCAATA	122767

CU234132.14	1951	GCTAGCAGAGATGTCCTCCGGCGCCCGCTTACAGACACAGGATGTCTTTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207385.10	122768	GCTAGCAGAGATGTCCTCCGGCGCCCGCTTACAGACACAGGATGTCTTTG	122817

Overview

Query
CU234132.14 - 156418 bps
Hit
CU207385.10 - 122817 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link