<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210861.18	1	GAATTCTTAAAAAGTATAACATAAACACAGGGTTTTATCAAGAACGCAGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149477	GAATTCTTAAAAAGTATAACATAAACACAGGGTTTTATCAAGAACGCAGT	149526

CU210861.18	51	GAAGTTCAAGCAGTAGGCTTCCAGAGAGGCCTCATAGTAGCATGTTCACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149527	GAAGTTCAAGCAGTAGGCTTCCAGAGAGGCCTCATAGTAGCATGTTCACA	149576

CU210861.18	101	GAGTCTCAACAGCTATGTTTCACCAATTCCTTGATTTTATACTTGGTTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149577	GAGTCTCAACAGCTATGTTTCACCAATTCCTTGATTTTATACTTGGTTTT	149626

CU210861.18	151	GATTTTGTGTTATAATAAATATTTTTTACTGCTATGGAGATTGTGTGTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149627	GATTTTGTGTTATAATAAATATTTTTTACTGCTATGGAGATTGTGTGTAT	149676

CU210861.18	201	ATATATATATATGTATATATATATATATGTATATATATACATATATATAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149677	ATATATATATATGTATATATATATATATGTATATATATACATATATATAT	149726

CU210861.18	251	ACACTATTTAGTATTTTTATTGGAAAGAGAATGCTCTAGCTTTGTTTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149727	ACACTATTTAGTATTTTTATTGGAAAGAGAATGCTCTAGCTTTGTTTCTG	149776

CU210861.18	301	TTATTGTGACAGATTGCCTGAGAAAAAGCAACCAGGGGAATCAAGAACTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149777	TTATTGTGACAGATTGCCTGAGAAAAAGCAACCAGGGGAATCAAGAACTT	149826

CU210861.18	351	ATTTGGATTTCAATTCCAGGTGACGTTCCCTTGCTGAGGGGAAGTCACGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149827	ATTTGGATTTCAATTCCAGGTGACGTTCCCTTGCTGAGGGGAAGTCACGG	149876

CU210861.18	401	GAAGAACTTGAGACAGCCAATCACATAACATTCACAAACACGCAGGGGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149877	GAAGAACTTGAGACAGCCAATCACATAACATTCACAAACACGCAGGGGGG	149926

CU210861.18	451	ACTGAATGTATGTACATACGCTGCCTGCTTGCTTCTCCAGCTAGATTCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149927	ACTGAATGTATGTACATACGCTGCCTGCTTGCTTCTCCAGCTAGATTCCT	149976

CU210861.18	501	TACACAGTCCCGAGCCTTGCCTAGGGAATGGTGCTGCCCACAATGGGCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	149977	TACACAGTCCCGAGCCTTGCCTAGGGAATGGTGCTGCCCACAATGGGCTG	150026

CU210861.18	551	AATGCTCTAGGGCAACCAACAATGGAGATAATCCCCACGGTCTTAGTGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150027	AATGCTCTAGGGCAACCAACAATGGAGATAATCCCCACGGTCTTAGTGAC	150076

CU210861.18	601	AGGCCAATCTGATTTAGGTAATTCTGAAACTGAGACTCTTTTCCCAGGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150077	AGGCCAATCTGATTTAGGTAATTCTGAAACTGAGACTCTTTTCCCAGGCA	150126

CU210861.18	651	ATATAGGTGGTGTCAAGTTGACAGTTTAAACTAAGAGCACAGGGTGGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150127	ATATAGGTGGTGTCAAGTTGACAGTTTAAACTAAGAGCACAGGGTGGCTG	150176

CU210861.18	701	AACCACAGAGCGGGTTGAAATAGATAAGCAAGGACTGTGGACAGTGTTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150177	AACCACAGAGCGGGTTGAAATAGATAAGCAAGGACTGTGGACAGTGTTGG	150226

CU210861.18	751	GTGGTAACTTAGTATCCAGGGTACTATACACAAATATTAAAGCGCCTAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150227	GTGGTAACTTAGTATCCAGGGTACTATACACAAATATTAAAGCGCCTAAC	150276

CU210861.18	801	TTTACCCTACAGAAGAAAGGGAACCCCACGTGTGAAGAAGAAAAACAACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150277	TTTACCCTACAGAAGAAAGGGAACCCCACGTGTGAAGAAGAAAAACAACC	150326

CU210861.18	851	AAGACTACTTAACTAGCAAGTGGAAGTCACAGGAGCCGTCTTCTGTGTAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150327	AAGACTACTTAACTAGCAAGTGGAAGTCACAGGAGCCGTCTTCTGTGTAG	150376

CU210861.18	901	CAGGTGACAGGGGGTGGATTGGTAAAAACCTAAGAAATTCAACACTTACG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150377	CAGGTGACAGGGGGTGGATTGGTAAAAACCTAAGAAATTCAACACTTACG	150426

CU210861.18	951	GGGGTCGAACTCACAAGGAAGTTGGCTGGCTTTGTGACAAAGTAGGAACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150427	GGGGTCGAACTCACAAGGAAGTTGGCTGGCTTTGTGACAAAGTAGGAACT	150476

CU210861.18	1001	GGCTCAAGGTGAATTTCGGAGTCTATTTATTTGGCTCATAACAGAGATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150477	GGCTCAAGGTGAATTTCGGAGTCTATTTATTTGGCTCATAACAGAGATAA	150526

CU210861.18	1051	GGGATAAGGTTGCTACACGAGGGTGGGAGGCGGAGTGAGACACACGAAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150527	GGGATAAGGTTGCTACACGAGGGTGGGAGGCGGAGTGAGACACACGAAGG	150576

CU210861.18	1101	AATAAGAAAATACTTTGGATATTTGCTTACCAACCTTTGCAAGAGGTGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150577	AATAAGAAAATACTTTGGATATTTGCTTACCAACCTTTGCAAGAGGTGAG	150626

CU210861.18	1151	CACGCATCCCAGTGAAGCCCTGAGACTCAGTAACATCAGTTTGGAGTAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150627	CACGCATCCCAGTGAAGCCCTGAGACTCAGTAACATCAGTTTGGAGTAAA	150676

CU210861.18	1201	TACAGAGGAGAACAAACCTCAAGCAAACAGTTCCTAGGACTGGAGACTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150677	TACAGAGGAGAACAAACCTCAAGCAAACAGTTCCTAGGACTGGAGACTGT	150726

CU210861.18	1251	AATGATGATTTATCATCTAAAGGGAACATGGAGACTATTGGTGACTTTAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150727	AATGATGATTTATCATCTAAAGGGAACATGGAGACTATTGGTGACTTTAA	150776

CU210861.18	1301	AAATAAGTGTGAGATCCTGGGATTTTAGTGATTAAAGTGACCTGGGAAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150777	AAATAAGTGTGAGATCCTGGGATTTTAGTGATTAAAGTGACCTGGGAAGA	150826

CU210861.18	1351	AAGTCTCAGTGAGAGACAGTAGGAAAAGCTGGTCTGTGGGGGCAGGGCGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150827	AAGTCTCAGTGAGAGACAGTAGGAAAAGCTGGTCTGTGGGGGCAGGGCGG	150876

CU210861.18	1401	GGGCGATCTCGGTAGCATTAACTGATGTTGGAGGAGCGAGCCTAAGAAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150877	GGGCGATCTCGGTAGCATTAACTGATGTTGGAGGAGCGAGCCTAAGAAAT	150926

CU210861.18	1451	GTGTAGCCCCATTCACTCCCTGGGTTTGGAACAGCAGCGGAAAGGGTGCG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150927	GTGTAGCCCCATTCACTCCCTGGGTTTGGAACAGCAGCGGAAAGGGTGCG	150976

CU210861.18	1501	CTGAAGAGGAAGCCAGCACCCAGTCACACCATTTCTCTCCGCCCTTGCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	150977	CTGAAGAGGAAGCCAGCACCCAGTCACACCATTTCTCTCCGCCCTTGCCT	151026

CU210861.18	1551	GTGGGTATGACCATTTGCTTCAAGTTTCTGCCATCTTGACTGCCCCACCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151027	GTGGGTATGACCATTTGCTTCAAGTTTCTGCCATCTTGACTGCCCCACCC	151076

CU210861.18	1601	CCACTCCCACGTTGGACCCCGTAACTTGGAATTGCAAGCTAACTTGAACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151077	CCACTCCCACGTTGGACCCCGTAACTTGGAATTGCAAGCTAACTTGAACT	151126

CU210861.18	1651	CCTTCCCCGAGCCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTAGGTGATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151127	CCTTCCCCGAGCCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTAGGTGATT	151176

CU210861.18	1701	TCAACATAGCAACAGTGAATGAGAGGAAGTCATTCTGGAAATTTCGACTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151177	TCAACATAGCAACAGTGAATGAGAGGAAGTCATTCTGGAAATTTCGACTG	151226

CU210861.18	1751	ACAGCGAAGGAATGTTCAGGGAAGAAGAGGCTACAGAAAAGGAAGCTGGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151227	ACAGCGAAGGAATGTTCAGGGAAGAAGAGGCTACAGAAAAGGAAGCTGGA	151276

CU210861.18	1801	GTGGAAAGGGTGAGTTGGGGGAGGGAGTCAGGTCTCACTGGAGAGAAGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151277	GTGGAAAGGGTGAGTTGGGGGAGGGAGTCAGGTCTCACTGGAGAGAAGCT	151326

CU210861.18	1851	GGTGAAAACTGACTTGGAGTGAATATGGTCAGGTGAGGGCAGGAAAGGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151327	GGTGAAAACTGACTTGGAGTGAATATGGTCAGGTGAGGGCAGGAAAGGGT	151376

CU210861.18	1901	GCTGGAGGCAGCAGTTGTGGATGCTTCTTAAAATGTGACTGCCCCTGAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151377	GCTGGAGGCAGCAGTTGTGGATGCTTCTTAAAATGTGACTGCCCCTGAGT	151426

CU210861.18	1951	GGAGGCCACAGCTCCTAAGAAAGATACAGTTGCAAAGTCCTCCCTAAAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207379.7	151427	GGAGGCCACAGCTCCTAAGAAAGATACAGTTGCAAAGTCCTCCCTAAAGC	151476

Overview

Query
CU210861.18 - 187852 bps
Hit
CU207379.7 - 151476 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link