<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU074383.3	1	GTAGAAGAAAAGAAGGGAGGTGAGGTAGGAGGGGGCCAGGATATGGAGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81454	GTAGAAGAAAAGAAGGGAGGTGAGGTAGGAGGGGGCCAGGATATGGAGAG	81503

CU074383.3	51	CTTTGAAGCCAAGAGCGAGGAGTTTTTGTTTCATGTGAACAAGTGCACAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81504	CTTTGAAGCCAAGAGCGAGGAGTTTTTGTTTCATGTGAACAAGTGCACAC	81553

CU074383.3	101	AGCAATTGTCTGCTGTGTGACCTTGAACAAGTCACTTTACTTCTCTGTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81554	AGCAATTGTCTGCTGTGTGACCTTGAACAAGTCACTTTACTTCTCTGTGC	81603

CU074383.3	151	CTCAGTTTCCTCATCTGTAAAATGGGGATTAAGACTGTGAGCCTTATATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81604	CTCAGTTTCCTCATCTGTAAAATGGGGATTAAGACTGTGAGCCTTATATG	81653

CU074383.3	201	GGACAAGGACTGTGTCCAACCCAATTAGCTTATATCTACCCCAGTGCTTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81654	GGACAAGGACTGTGTCCAACCCAATTAGCTTATATCTACCCCAGTGCTTA	81703

CU074383.3	251	GAACAGGACCTGGAACATAGTAAGCACTTAAATACCACTATTATTATTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81704	GAACAGGACCTGGAACATAGTAAGCACTTAAATACCACTATTATTATTGT	81753

CU074383.3	301	CATTATTTTAACTGGGCTGCCCCCTCTAGACTGTAAGCTCGCTGTGGACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81754	CATTATTTTAACTGGGCTGCCCCCTCTAGACTGTAAGCTCGCTGTGGACA	81803

CU074383.3	351	TGGAATATATCTACCAACTCTGATATACTGTAGTCTCCCAAGCACTTAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81804	TGGAATATATCTACCAACTCTGATATACTGTAGTCTCCCAAGCACTTAGT	81853

CU074383.3	401	ACAGTGCCCTGTACTCGGTAAGCACTCAGTAAGTAACAGTGAGGTAGTGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81854	ACAGTGCCCTGTACTCGGTAAGCACTCAGTAAGTAACAGTGAGGTAGTGC	81903

CU074383.3	451	AAAAGGGATTTAGTACAGGACCCCTTTTTGTCTGTAATCTCAGCCCCCAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81904	AAAAGGGATTTAGTACAGGACCCCTTTTTGTCTGTAATCTCAGCCCCCAG	81953

CU074383.3	501	GCTCCCTTCACTGAAGCTCCTGATGCCAAATCCTTCAGTTTGAACATGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	81954	GCTCCCTTCACTGAAGCTCCTGATGCCAAATCCTTCAGTTTGAACATGGC	82003

CU074383.3	551	ATCCCAGTTCTTTGAGAGGACCTCAAAGACTCTGGAGGGATGGTGAGGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82004	ATCCCAGTTCTTTGAGAGGACCTCAAAGACTCTGGAGGGATGGTGAGGGA	82053

CU074383.3	601	CAGGGCATCCCAGAGAAACATTCCTCTTTGGTCTAAGGGCAAATCCTCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82054	CAGGGCATCCCAGAGAAACATTCCTCTTTGGTCTAAGGGCAAATCCTCTT	82103

CU074383.3	651	CTGAGGCATAGTCAGACAAGTCAAACATCTTCTCTTGGCCATTTGTTTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82104	CTGAGGCATAGTCAGACAAGTCAAACATCTTCTCTTGGCCATTTGTTTTG	82153

CU074383.3	701	GAATCTGGGGCCACTGGGGCTTTTTCGAGTAGGGTGTGTAACGGGTTGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82154	GAATCTGGGGCCACTGGGGCTTTTTCGAGTAGGGTGTGTAACGGGTTGGC	82203

CU074383.3	751	TGAATCAGAGCCTGGTTTTCTCTGCCACCAAATAAGGTAATGTTCAAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82204	TGAATCAGAGCCTGGTTTTCTCTGCCACCAAATAAGGTAATGTTCAAACA	82253

CU074383.3	801	TTTTTAAGGGGCAGCAGGGGGTGTAATAGAAGAGGAGTTGGGGGAGAGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82254	TTTTTAAGGGGCAGCAGGGGGTGTAATAGAAGAGGAGTTGGGGGAGAGGT	82303

CU074383.3	851	TCATTCTCTTTTATCTCAACTTATTTTCTTAGAAGGGTATTGAAAACACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82304	TCATTCTCTTTTATCTCAACTTATTTTCTTAGAAGGGTATTGAAAACACA	82353

CU074383.3	901	TTTGTAATATCTTTGTCCTCTATAAAACCAAAAGAAAAAAAATCTGCAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82354	TTTGTAATATCTTTGTCCTCTATAAAACCAAAAGAAAAAAAATCTGCAGA	82403

CU074383.3	951	TGGTTTTCTGGATGAGATACATTTGTCTGGGGGCCATCTTATTTGGATAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82404	TGGTTTTCTGGATGAGATACATTTGTCTGGGGGCCATCTTATTTGGATAT	82453

CU074383.3	1001	CCCAAAACCAAGATGGATTTTGCAGGGTTCATGGGGCGGGACAACAGCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82454	CCCAAAACCAAGATGGATTTTGCAGGGTTCATGGGGCGGGACAACAGCCA	82503

CU074383.3	1051	ATCAGCGGGCACAGAGGGGCACGCAGAGGGCAAACTTGTAAATCCTGGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82504	ATCAGCGGGCACAGAGGGGCACGCAGAGGGCAAACTTGTAAATCCTGGGC	82553

CU074383.3	1101	CTCGTGGAATGCAGTTATAAAACGTTGGCTGTGGGGAGCTCTGTGCATCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82554	CTCGTGGAATGCAGTTATAAAACGTTGGCTGTGGGGAGCTCTGTGCATCT	82603

CU074383.3	1151	CTCAAGTGGAAGCGTAGTGAGGTTTCAAGTGCTAGGGAGGGAATGGCAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82604	CTCAAGTGGAAGCGTAGTGAGGTTTCAAGTGCTAGGGAGGGAATGGCAGG	82653

CU074383.3	1201	GAGATGAGACCACCAGAGGAGGTGTATTGCCTTCTGGGACTTCATGTGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82654	GAGATGAGACCACCAGAGGAGGTGTATTGCCTTCTGGGACTTCATGTGTG	82703

CU074383.3	1251	ACTGATACACTTGAAAATACATGGGTATGGAACAGAACGGTCCACCCTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82704	ACTGATACACTTGAAAATACATGGGTATGGAACAGAACGGTCCACCCTTG	82753

CU074383.3	1301	GAGCATTAATTATGTTATTCAAAGCTTGCCGCTTTAACCAATTTACATGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82754	GAGCATTAATTATGTTATTCAAAGCTTGCCGCTTTAACCAATTTACATGT	82803

CU074383.3	1351	TCAATTCCATTCACCGATTTTGCATTTATAATCATGAAGGGATGTTAAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82804	TCAATTCCATTCACCGATTTTGCATTTATAATCATGAAGGGATGTTAAAG	82853

CU074383.3	1401	TAAGGAAGGAGGCCTGCACATTGGAAAGGTTATAAGTGACATTTAGGGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82854	TAAGGAAGGAGGCCTGCACATTGGAAAGGTTATAAGTGACATTTAGGGAG	82903

CU074383.3	1451	AAGGGCAACACTTGCTATTTCCTGGTGCTGATTTAAGATGTTCTCATTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82904	AAGGGCAACACTTGCTATTTCCTGGTGCTGATTTAAGATGTTCTCATTGC	82953

CU074383.3	1501	ATAATGCAAACTGTTTGCAAGAGAATATGAGAAGGATGGTCCCTTGTCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	82954	ATAATGCAAACTGTTTGCAAGAGAATATGAGAAGGATGGTCCCTTGTCCT	83003

CU074383.3	1551	AGCATACTGTAGATTCACACCAAGAATTTTTCAAAAGAAATGACCAGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83004	AGCATACTGTAGATTCACACCAAGAATTTTTCAAAAGAAATGACCAGTGA	83053

CU074383.3	1601	CAGATAAACAAGATTAGTGAAAGGATTGGTTTAACATTTGGGTTCCACAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83054	CAGATAAACAAGATTAGTGAAAGGATTGGTTTAACATTTGGGTTCCACAT	83103

CU074383.3	1651	CTGGAAAAATTTTAAAGGTGTTGAGGAGAGTCAAACTTCAAAATGTCTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83104	CTGGAAAAATTTTAAAGGTGTTGAGGAGAGTCAAACTTCAAAATGTCTGA	83153

CU074383.3	1701	ACTCCAGTAAGGGCAAAATGATTGAAAACTAAATGCAATGGAATTCTCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83154	ACTCCAGTAAGGGCAAAATGATTGAAAACTAAATGCAATGGAATTCTCTG	83203

CU074383.3	1751	CCTCTGTTAATGAGGGAATACCTGCTGTGGATAGTCAAATCCAGCCAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83204	CCTCTGTTAATGAGGGAATACCTGCTGTGGATAGTCAAATCCAGCCAAGA	83253

CU074383.3	1801	TGATAATGATAATAATACAATCCTTTAGACTGTAAGATCCTTGTGGGAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83254	TGATAATGATAATAATACAATCCTTTAGACTGTAAGATCCTTGTGGGAGG	83303

CU074383.3	1851	TGAGCATGCCTACCAAATCTGCCCCATTATATCAACCAATCAATCAATCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83304	TGAGCATGCCTACCAAATCTGCCCCATTATATCAACCAATCAATCAATCA	83353

CU074383.3	1901	ATGGTATTTATTAAGTGCTTACTGTGTGCAGAGTTCTATACTAACTGCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83354	ATGGTATTTATTAAGTGCTTACTGTGTGCAGAGTTCTATACTAACTGCTT	83403

CU074383.3	1951	GCAAGAGTACAGTAGGGTTGGTAGACATGATCCTTGCCCACAAGAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207378.2	83404	GCAAGAGTACAGTAGGGTTGGTAGACATGATCCTTGCCCACAAGAAGCTT	83453

Overview

Query
CU074383.3 - 67649 bps
Hit
CU207378.2 - 83453 bps
Total alignments
26
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001981200012000181454834531
295.652202531935619608-115084153361
394.492122545229852551-115084153371
496.0522325386848936115084153361
594.462092521056710818115084153361
695.222152514855248802115084153341
795.8821324384348676115090153321
893.082062604611146370-115615158741
991.771912575229952555-115615158691
1091.0419527086808949115615158821
1190.271812581056310820115615158711
1289.511822691934319611-115616158821
1393.151972484611446361-118610188571
1497.592312491935619604-124698249461
1595.9221524584328676124698249421
1694.7821024986888936124698249461
1796.362202474855648802124698249441
1892.711932475229952545-124700249461
1992.311882461057310818124700249461
2090.661852571934619602-139939401951
2192.461922504611146360-139939401901
2291.51842475229952545-139939401851
2390.6618525786908946139939401951
2491.571842481057310820139939401871
2590.231812564855848813139939401941
2698.011882011935319553140471406711
Short-link