<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU302290.9	1	CAAAGGTCCTGGGTTCAATTCCCAGGAATCACATGATGGCTCACAACCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91139	CAAAGGTCCTGGGTTCAATTCCCAGGAATCACATGATGGCTCACAACCAT	91188

CU302290.9	51	CTGTAATGGGATCCAATGCTCTCTTCTGGTGTGTCTGAGGACAGCAATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91189	CTGTAATGGGATCCAATGCTCTCTTCTGGTGTGTCTGAGGACAGCAATAA	91238

CU302290.9	101	TGTAGTCACATACATTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATCTTAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91239	TGTAGTCACATACATTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATCTTAAT	91288

CU302290.9	151	AGCATCAACAACAACAATAATAACAGCATGCACTGCTTTTGCAAGAGGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91289	AGCATCAACAACAACAATAATAACAGCATGCACTGCTTTTGCAAGAGGAC	91338

CU302290.9	201	CAGGGTTCAGTTTCAAGCACTCACACTAGGCTAGGCAGTCCACAACCACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91339	CAGGGTTCAGTTTCAAGCACTCACACTAGGCTAGGCAGTCCACAACCACC	91388

CU302290.9	251	TGTAACTCCAGCTCCAGGAGGTCTTCTTGAACACCTGCACACATGTGGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91389	TGTAACTCCAGCTCCAGGAGGTCTTCTTGAACACCTGCACACATGTGGCA	91438

CU302290.9	301	TATACATGTGGCATACACTGACATATTCATATACTCATTAATAAAAACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91439	TATACATGTGGCATACACTGACATATTCATATACTCATTAATAAAAACAA	91488

CU302290.9	351	AATCTTTATGTAATTCAGTCTTAAAAAGAGAGGGAATTCTGACTTACTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91489	AATCTTTATGTAATTCAGTCTTAAAAAGAGAGGGAATTCTGACTTACTTG	91538

CU302290.9	401	TCAGAATATTATATTAATAGTATGCGAAATAAGCCAGATACTGGGACTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91539	TCAGAATATTATATTAATAGTATGCGAAATAAGCCAGATACTGGGACTGG	91588

CU302290.9	451	AGAGAGAGGCCTCAGTGAAAGCATGAGGACCAGAGTTCAAATCCCAAGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91589	AGAGAGAGGCCTCAGTGAAAGCATGAGGACCAGAGTTCAAATCCCAAGCA	91638

CU302290.9	501	CTCACATAAAAGCTGGGTGTGGCCAGGTAGTGGTGGTGCATGCCTGTAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91639	CTCACATAAAAGCTGGGTGTGGCCAGGTAGTGGTGGTGCATGCCTGTAAT	91688

CU302290.9	551	CCCAGGGAGAGAGCACTCTTCAGGTAGTAGTGGTGGCATAGCAGTGGGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91689	CCCAGGGAGAGAGCACTCTTCAGGTAGTAGTGGTGGCATAGCAGTGGGAA	91738

CU302290.9	601	CAAGATCCTTTGTTTTGGTTTGGTGCACTCTTTCTTAAAGATTTATTTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91739	CAAGATCCTTTGTTTTGGTTTGGTGCACTCTTTCTTAAAGATTTATTTAT	91788

CU302290.9	651	TATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGATCTCATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91789	TATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGATCTCATT	91838

CU302290.9	701	GTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCCGGACCTTTAGAAGAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91839	GTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCCGGACCTTTAGAAGAG	91888

CU302290.9	751	CAGTCTGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCTGGTTTGGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91889	CAGTCTGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCTGGTTTGGTG	91938

CU302290.9	801	CACTCTTGAGACAGGTCTTGTGTAACCTAGACTGACCTTGAGTTCCTTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91939	CACTCTTGAGACAGGTCTTGTGTAACCTAGACTGACCTTGAGTTCCTTGC	91988

CU302290.9	851	ATAGACCTTGAGTCCTGTACTTCCTGGCTCACTATGTTGGGTTTTACATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	91989	ATAGACCTTGAGTCCTGTACTTCCTGGCTCACTATGTTGGGTTTTACATA	92038

CU302290.9	901	AGTCTCTCCATACCTGGCAGTATAAATGTTCTTATTTATTTATTTCCTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92039	AGTCTCTCCATACCTGGCAGTATAAATGTTCTTATTTATTTATTTCCTTA	92088

CU302290.9	951	TTTGGGGACAGTGTCTCTCTGTGTAGTCCTGGCTGTCCTGGAACTCTCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92089	TTTGGGGACAGTGTCTCTCTGTGTAGTCCTGGCTGTCCTGGAACTCTCTC	92138

CU302290.9	1001	TATAGACCAGGTTGGCCTCAAACTCACAGAAATCCACCTATCTCTGCCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92139	TATAGACCAGGTTGGCCTCAAACTCACAGAAATCCACCTATCTCTGCCTC	92188

CU302290.9	1051	CCGAGTGCTGGGACTAAAGGCATGCGCCACTACACCCAACATTATGAATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92189	CCGAGTGCTGGGACTAAAGGCATGCGCCACTACACCCAACATTATGAATT	92238

CU302290.9	1101	TTCTTAATGTTCCCCATTTGGATTGTTCAAAGTGTCCAACATGGTCGATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92239	TTCTTAATGTTCCCCATTTGGATTGTTCAAAGTGTCCAACATGGTCGATT	92288

CU302290.9	1151	TTATGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGTCTTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92289	TTATGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGTCTTCA	92338

CU302290.9	1201	CTGCTCACCTGAACCCAGGGTCTCTGCATGCTAGCCAAGTGTGCTCCCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92339	CTGCTCACCTGAACCCAGGGTCTCTGCATGCTAGCCAAGTGTGCTCCCAT	92388

CU302290.9	1251	GGAGACAGCACATTTCCACTTTGGCAATACATCTCTAAGGCTTTATGCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92389	GGAGACAGCACATTTCCACTTTGGCAATACATCTCTAAGGCTTTATGCCA	92438

CU302290.9	1301	CCCTATGTGTATTTCATTTGCACTTATTTATTTATTATTTGTGTGCACGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92439	CCCTATGTGTATTTCATTTGCACTTATTTATTTATTATTTGTGTGCACGT	92488

CU302290.9	1351	GTTAACACAGGTGTGGAGATCAGAGATGACCTTTGGGTCCTCTTTACAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92489	GTTAACACAGGTGTGGAGATCAGAGATGACCTTTGGGTCCTCTTTACAGG	92538

CU302290.9	1401	ACTCTGTTCTCTCCTCCTATCACATGGATTCCAGATATCACAAACACAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92539	ACTCTGTTCTCTCCTCCTATCACATGGATTCCAGATATCACAAACACAAG	92588

CU302290.9	1451	GCTTAGTGACAGGTGCCTTTGTGTGCTGTGTCATCTCCCTGACCCTGATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92589	GCTTAGTGACAGGTGCCTTTGTGTGCTGTGTCATCTCCCTGACCCTGATA	92638

CU302290.9	1501	TATGTATTTTTACCACAACTAAAAGAGAAAAAAAAAAAGCTGGGTGTGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92639	TATGTATTTTTACCACAACTAAAAGAGAAAAAAAAAAAGCTGGGTGTGGT	92688

CU302290.9	1551	GGCCCATATATTTAATACCAGCAGTAGGGAGGCAGAGGCCAGTGGATCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92689	GGCCCATATATTTAATACCAGCAGTAGGGAGGCAGAGGCCAGTGGATCTC	92738

CU302290.9	1601	TATGAGTTACAGGAGAGGTCAGCCTGGTCTACATATTGAGTTCCAGGCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92739	TATGAGTTACAGGAGAGGTCAGCCTGGTCTACATATTGAGTTCCAGGCCA	92788

CU302290.9	1651	CAGCCACAAAGTGAGACCTTGTCTCCAACCCCCCTTAATCCCAGAAAGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92789	CAGCCACAAAGTGAGACCTTGTCTCCAACCCCCCTTAATCCCAGAAAGGA	92838

CU302290.9	1701	TTTGTGTATGTGTGTGTATATATATGTGTGTGTGTGTGTACTAAGGCTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92839	TTTGTGTATGTGTGTGTATATATATGTGTGTGTGTGTGTACTAAGGCTAA	92888

CU302290.9	1751	TTTTTAAACATTGTTTTTGTTTGCTTGCTTTTATTTAGTTTTTTTTTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92889	TTTTTAAACATTGTTTTTGTTTGCTTGCTTTTATTTAGTTTTTTTTTTTT	92938

CU302290.9	1801	TAAGGCAAGATTTTCTCTATTCCTACTGGGTAGGAATAAGTAAAAATTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92939	TAAGGCAAGATTTTCTCTATTCCTACTGGGTAGGAATAAGTAAAAATTAA	92988

CU302290.9	1851	TTAAAACCAAGGACCAAGCGTCTTCTCGGCTTCCTCTCGGGTGTCCCCGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	92989	TTAAAACCAAGGACCAAGCGTCTTCTCGGCTTCCTCTCGGGTGTCCCCGT	93038

CU302290.9	1901	GTAGAACTGCAGGTCACCTCCCTAACCACAGACTTCCCATTGTTCTCCGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	93039	GTAGAACTGCAGGTCACCTCCCTAACCACAGACTTCCCATTGTTCTCCGG	93088

CU302290.9	1951	CTCCACAGCTCTCCTGCTCCCCTCGAGTCCAGGCTGAGGAGCTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207374.15	93089	CTCCACAGCTCTCCTGCTCCCCTCGAGTCCAGGCTGAGGAGCTGGAATTC	93138

Overview

Query
CU302290.9 - 111302 bps
Hit
CU207374.15 - 93138 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link