<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU024913.1	1	GAATTCTCTACTTCCTCTTACAGTGCAAGCATTTGAATCTCTGGGAGGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140528	GAATTCTCTACTTCCTCTTACAGTGCAAGCATTTGAATCTCTGGGAGGTG	140577

CU024913.1	51	GCTACCCTCACCAAGGGACTTTTTTCCTAGTCTCCTTTGCATCCATGTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140578	GCTACCCTCACCAAGGGACTTTTTTCCTAGTCTCCTTTGCATCCATGTGT	140627

CU024913.1	101	GACTGACCATAATGACTACTTATAGCCAAAAATCTGGACAGAAATGATGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140628	GACTGACCATAATGACTACTTATAGCCAAAAATCTGGACAGAAATGATGT	140677

CU024913.1	151	GCGTCAATCAATTTTGCAAGTTTACAAATATTTTCTGTGTCTCCTCTTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140678	GCGTCAATCAATTTTGCAAGTTTACAAATATTTTCTGTGTCTCCTCTTTC	140727

CU024913.1	201	TGTTTGAAGTATGGGACGCCATTGCCCAAGGGGATGATGTGAGCACAATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140728	TGTTTGAAGTATGGGACGCCATTGCCCAAGGGGATGATGTGAGCACAATG	140777

CU024913.1	251	GAAGAAGCGGATGTCCCTGAGTCATCCTGGGGAGAAAATTCAAATTCTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140778	GAAGAAGCGGATGTCCCTGAGTCATCCTGGGGAGAAAATTCAAATTCTGC	140827

CU024913.1	301	CCAGAGAAACCCTCATTGGTCATTTACATGAGTGAGATGCCAAACCTCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140828	CCAGAGAAACCCTCATTGGTCATTTACATGAGTGAGATGCCAAACCTCAC	140877

CU024913.1	351	TGTGTTAAGCCATCGGTAATTTTTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCACTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140878	TGTGTTAAGCCATCGGTAATTTTTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCACTG	140927

CU024913.1	401	TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140928	TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTG	140977

CU024913.1	451	CCTCCGAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	140978	CCTCCGAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA	141027

CU024913.1	501	CTACAGGCACCCACTATCACGCCTGGCTAATTTTTTGCATTTTTAGTAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141028	CTACAGGCACCCACTATCACGCCTGGCTAATTTTTTGCATTTTTAGTAGA	141077

CU024913.1	551	GATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141078	GATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGT	141127

CU024913.1	601	GATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141128	GATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCA	141177

CU024913.1	651	CCGCGCCCGGCCAGTATTTTAAGACTTACTTATAACGGTGGTTAGTGTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141178	CCGCGCCCGGCCAGTATTTTAAGACTTACTTATAACGGTGGTTAGTGTCA	141227

CU024913.1	701	CCCTAACTCTTACCTCACAATAGTAGCTAAACAATTTGTGATTTGCTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141228	CCCTAACTCTTACCTCACAATAGTAGCTAAACAATTTGTGATTTGCTCTT	141277

CU024913.1	751	TGATCCTGTCCCTATCATCATTAGACTCAAGCTCTGTTGAGGGCAGGGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141278	TGATCCTGTCCCTATCATCATTAGACTCAAGCTCTGTTGAGGGCAGGGGC	141327

CU024913.1	801	TGCATCTGTTTTGTTCACTCCTGAATCTCAAACACCAAGCAGATAATAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141328	TGCATCTGTTTTGTTCACTCCTGAATCTCAAACACCAAGCAGATAATAAG	141377

CU024913.1	851	CAATTGATAAATATTGGTTGATCGGCTTCTGAAGAAAGAAAATTCACACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141378	CAATTGATAAATATTGGTTGATCGGCTTCTGAAGAAAGAAAATTCACACA	141427

CU024913.1	901	TTTATATTTAGAAAAATTTATAAGGGAAGTAGCCGAGTGGGGTGGCTCAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141428	TTTATATTTAGAAAAATTTATAAGGGAAGTAGCCGAGTGGGGTGGCTCAC	141477

CU024913.1	951	GCCTGTCATCCCAGCATTTTGGGAGGTTGAGGTGGGTGGATCACCTGAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141478	GCCTGTCATCCCAGCATTTTGGGAGGTTGAGGTGGGTGGATCACCTGAGG	141527

CU024913.1	1001	TCAGGAATTCAAGACTAGCGTGGCTGACGTGGGGAAACCCCGTCTCTACT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141528	TCAGGAATTCAAGACTAGCGTGGCTGACGTGGGGAAACCCCGTCTCTACT	141577

CU024913.1	1051	AAAAATAGAAAAATTAGCTGGTCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141578	AAAAATAGAAAAATTAGCTGGTCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGC	141627

CU024913.1	1101	TACTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141628	TACTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGT	141677

CU024913.1	1151	TGCAGTGAGCTGAGATGGTGCCATTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAGAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141678	TGCAGTGAGCTGAGATGGTGCCATTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAGAGC	141727

CU024913.1	1201	GAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAGAAGAGAGAAGTTTATAGGTGAAGTGGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141728	GAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAGAAGAGAGAAGTTTATAGGTGAAGTGGC	141777

CU024913.1	1251	TTGTCCGAGGTCTCTGAGGCTGTGGGACAGGAAGTCACAGGAGAAGCTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141778	TTGTCCGAGGTCTCTGAGGCTGTGGGACAGGAAGTCACAGGAGAAGCTCA	141827

CU024913.1	1301	TTCTGGCTGACTTCCCAGCTGGTGTTCTGCACCTCTATCAGTATCTTAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141828	TTCTGGCTGACTTCCCAGCTGGTGTTCTGCACCTCTATCAGTATCTTAGG	141877

CU024913.1	1351	AACCAAGTTACCACGACACACCTATTAGAGTGGCCAAATTCTAAAACATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141878	AACCAAGTTACCACGACACACCTATTAGAGTGGCCAAATTCTAAAACATG	141927

CU024913.1	1401	GACAATACCACATACTGGCATACTGGTGAGGATGTGGAGCAACAGGAACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141928	GACAATACCACATACTGGCATACTGGTGAGGATGTGGAGCAACAGGAACT	141977

CU024913.1	1451	CTCATTGCTGGTGGGATTGCCAAATGGTACAGTCACTTTGGGAGACAGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	141978	CTCATTGCTGGTGGGATTGCCAAATGGTACAGTCACTTTGGGAGACAGTG	142027

CU024913.1	1501	CGGCAATTTCTTCTAAAACTAAATGTAGCTTTGCCATGTAATCCAGCAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142028	CGGCAATTTCTTCTAAAACTAAATGTAGCTTTGCCATGTAATCCAGCAAT	142077

CU024913.1	1551	TGCATTCCTTGGTATTTACCCAAGGAAGTTTGAAATGTATGTTCACATAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142078	TGCATTCCTTGGTATTTACCCAAGGAAGTTTGAAATGTATGTTCACATAA	142127

CU024913.1	1601	AGTCTGCATATGAATCTTTACAGTAGCTTTATTCATAATCGCCCAAACTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142128	AGTCTGCATATGAATCTTTACAGTAGCTTTATTCATAATCGCCCAAACTT	142177

CU024913.1	1651	GGAAGCAACCAAGATGCCCTTCAGTAAGTGAGTGGATTAACTATGTGTCG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142178	GGAAGCAACCAAGATGCCCTTCAGTAAGTGAGTGGATTAACTATGTGTCG	142227

CU024913.1	1701	AGACAATGGAATATTATCCCATGCTAAGAAGATACAAGCTCTCAAGTCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142228	AGACAATGGAATATTATCCCATGCTAAGAAGATACAAGCTCTCAAGTCAT	142277

CU024913.1	1751	GAAAAGACGTGGAGGAGAGTTCAACGTATATCACTACACGAAATAAGCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142278	GAAAAGACGTGGAGGAGAGTTCAACGTATATCACTACACGAAATAAGCCT	142327

CU024913.1	1801	GCCCAAATGGCGTATCCACTGTCTGATTCCAACTATGTGACATTCTGGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142328	GCCCAAATGGCGTATCCACTGTCTGATTCCAACTATGTGACATTCTGGAA	142377

CU024913.1	1851	GATGCAAAACTATAGAAAGAGTGTAAAGTTCATTGGTTGCCAGAATAAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142378	GATGCAAAACTATAGAAAGAGTGTAAAGTTCATTGGTTGCCAGAATAAAA	142427

CU024913.1	1901	GGCTTGGGCAAGAGGAAATCATCCCAGTGGAAATGGAGAAACGCAGGAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142428	GGCTTGGGCAAGAGGAAATCATCCCAGTGGAAATGGAGAAACGCAGGAAC	142477

CU024913.1	1951	AAATGAAGAGCAACAGAAGAAGCTAAATATTTGGGTAAAGATAGGAATTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207370.12	142478	AAATGAAGAGCAACAGAAGAAGCTAAATATTTGGGTAAAGATAGGAATTT	142527

Overview

Query
CU024913.1 - 175729 bps
Hit
CU207370.12 - 142527 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link