<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210950.8	1	TTAGATTAAACAGCCATCTTTCGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124675	TTAGATTAAACAGCCATCTTTCGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGAA	124724

CU210950.8	51	AATAGACTACATAGGTAGAAAATATTTCTTACAAAGTTTGTAAATTTTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124725	AATAGACTACATAGGTAGAAAATATTTCTTACAAAGTTTGTAAATTTTCC	124774

CU210950.8	101	ATAAATAAAATGGTATTTCTCTCTGATATCTTTCCAGGCATTTTTATCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124775	ATAAATAAAATGGTATTTCTCTCTGATATCTTTCCAGGCATTTTTATCTC	124824

CU210950.8	151	CAATTCTTCATATAGCTAGGAGAACAAAGTACCAACTTCTTATGTGCTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124825	CAATTCTTCATATAGCTAGGAGAACAAAGTACCAACTTCTTATGTGCTTC	124874

CU210950.8	201	TACATCATCTTTTAATTCTCTGATCTTTGTTTCCTCATCCTAGCAACTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124875	TACATCATCTTTTAATTCTCTGATCTTTGTTTCCTCATCCTAGCAACTCC	124924

CU210950.8	251	ATAGCTTCATATATTCTCCTTCTAATACTTATTTTTTCCTAAATTATTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124925	ATAGCTTCATATATTCTCCTTCTAATACTTATTTTTTCCTAAATTATTTA	124974

CU210950.8	301	TAAATTCCTATTTTTCTATCCATGTCTTTAATTTTTAGACCCCTTTACTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	124975	TAAATTCCTATTTTTCTATCCATGTCTTTAATTTTTAGACCCCTTTACTT	125024

CU210950.8	351	CTCTATCCTTGATGTCTCCAAGTTTACCAAGGCTAATAAATGCAGTAGTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125025	CTCTATCCTTGATGTCTCCAAGTTTACCAAGGCTAATAAATGCAGTAGTC	125074

CU210950.8	401	ATGGGACTGGAGGGTACACATATTTCTTCATGATTCCAAATTCAAGGCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125075	ATGGGACTGGAGGGTACACATATTTCTTCATGATTCCAAATTCAAGGCCA	125124

CU210950.8	451	ATTCTGGCAATAAAATATTTCTACAAAGGACCATGTAGGGTTTATGGACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125125	ATTCTGGCAATAAAATATTTCTACAAAGGACCATGTAGGGTTTATGGACT	125174

CU210950.8	501	TAATGGTTTAAGAGACCATAATGTGATTGCATTGGAATCGGCTCCTTGGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125175	TAATGGTTTAAGAGACCATAATGTGATTGCATTGGAATCGGCTCCTTGGT	125224

CU210950.8	551	AGTTTAGGGGTTCACAAATGAATCCTGGCACAAAACAATCAACCTCAATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125225	AGTTTAGGGGTTCACAAATGAATCCTGGCACAAAACAATCAACCTCAATG	125274

CU210950.8	601	GTTAGTATTTACTGGAGGCAATTGGTCACAAAGATTCTATCCCAAATACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125275	GTTAGTATTTACTGGAGGCAATTGGTCACAAAGATTCTATCCCAAATACT	125324

CU210950.8	651	AAGCAAATGTGTTTCTATTTCAGAGTGTCTGCTTTATGGACCCATTCAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125325	AAGCAAATGTGTTTCTATTTCAGAGTGTCTGCTTTATGGACCCATTCAGT	125374

CU210950.8	701	TTTACAATACATTCTGTCATCCTTAGCTGCAAGTCTGGTTACAGAGTATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125375	TTTACAATACATTCTGTCATCCTTAGCTGCAAGTCTGGTTACAGAGTATT	125424

CU210950.8	751	TCTATCTGCCTTTGTTGTGCCATGAGTGTAACTATTCTTAGGTGCAGTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125425	TCTATCTGCCTTTGTTGTGCCATGAGTGTAACTATTCTTAGGTGCAGTAT	125474

CU210950.8	801	ATGTTTTCCTCACACAAAATTATTTGTAGTATAGTTTGTATTATTTTAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125475	ATGTTTTCCTCACACAAAATTATTTGTAGTATAGTTTGTATTATTTTAAA	125524

CU210950.8	851	GGTACATATTAAGATGACAAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125525	GGTACATATTAAGATGACAAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATACC	125574

CU210950.8	901	CAGAGGTTCATCCTATAATCAGTCTCCAAACGCTGATACCATTGCATACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125575	CAGAGGTTCATCCTATAATCAGTCTCCAAACGCTGATACCATTGCATACA	125624

CU210950.8	951	CCAGCAAAATTTTGCTGAAAGGACCCTGATATAGTTGTCTTTTGTGAGTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125625	CCAGCAAAATTTTGCTGAAAGGACCCTGATATAGTTGTCTTTTGTGAGTC	125674

CU210950.8	1001	TATGCCAGGGCCTGGAAAACACAGAAGTGGATGCTTACAGTCAGCTATTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125675	TATGCCAGGGCCTGGAAAACACAGAAGTGGATGCTTACAGTCAGCTATTG	125724

CU210950.8	1051	GATGGAACACAGGTCCCACAATGGAGAAGCTAGAGAAAGCACCCATGGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125725	GATGGAACACAGGTCCCACAATGGAGAAGCTAGAGAAAGCACCCATGGAG	125774

CU210950.8	1101	CTGAAGGAGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125775	CTGAAGGAGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACAAG	125824

CU210950.8	1151	TACCCCCAGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCAGAAGATGGCCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125825	TACCCCCAGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCAGAAGATGGCCTA	125874

CU210950.8	1201	GTCGGCCATCATTGGGAAGAGATGCCCCTTGGTCTTGCAAACTTTATATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125875	GTCGGCCATCATTGGGAAGAGATGCCCCTTGGTCTTGCAAACTTTATATG	125924

CU210950.8	1251	CCTCAGTACAGGGAAACACCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125925	CCTCAGTACAGGGAAACACCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGG	125974

CU210950.8	1301	GGAGTGTGGGGGAGGGTCTGGGGGGGGGCTTTTGGGGTAGCATTTGAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	125975	GGAGTGTGGGGGAGGGTCTGGGGGGGGGCTTTTGGGGTAGCATTTGAAAT	126024

CU210950.8	1351	GTAAATGAAGAAAATACCTAATTAAAAAATTAAAAATAAAAGATTTGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126025	GTAAATGAAGAAAATACCTAATTAAAAAATTAAAAATAAAAGATTTGAAA	126074

CU210950.8	1401	GTTCTCTGTGAACTAAAACTATATCTTCCATTTCTGAAATTTCTGAATCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126075	GTTCTCTGTGAACTAAAACTATATCTTCCATTTCTGAAATTTCTGAATCC	126124

CU210950.8	1451	TTGTATCTATGGCATAGAGCCTTTAAGTGTAAAAATCCCATCAAATGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126125	TTGTATCTATGGCATAGAGCCTTTAAGTGTAAAAATCCCATCAAATGAAA	126174

CU210950.8	1501	CAGAAAAAAAAAATGAAAGAGAAATCTATGGAAAAACCCAATTAATCATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126175	CAGAAAAAAAAAATGAAAGAGAAATCTATGGAAAAACCCAATTAATCATT	126224

CU210950.8	1551	GAGGCAAAGCTTGAGTTCTTATTACTATTTCTTCTAGAAACTGATAATAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126225	GAGGCAAAGCTTGAGTTCTTATTACTATTTCTTCTAGAAACTGATAATAA	126274

CU210950.8	1601	ATCATATGGGTGAACATTGCAGGAGAGAACAATGTTTCTCTCTGCACTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126275	ATCATATGGGTGAACATTGCAGGAGAGAACAATGTTTCTCTCTGCACTAT	126324

CU210950.8	1651	ATTCTTTGAGGAAAGTAAATGGCAAACTATTAGTTGGTAATGATGCCTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126325	ATTCTTTGAGGAAAGTAAATGGCAAACTATTAGTTGGTAATGATGCCTTT	126374

CU210950.8	1701	AATATAACAAATACTTTTTAGCTTCTTACCAGCTTAAACGTGTTAACAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126375	AATATAACAAATACTTTTTAGCTTCTTACCAGCTTAAACGTGTTAACAAG	126424

CU210950.8	1751	AAAAGTGTAAGAGGATGAACTTCAGCTGCCTTCAGTGACAGGTGAAGGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126425	AAAAGTGTAAGAGGATGAACTTCAGCTGCCTTCAGTGACAGGTGAAGGTA	126474

CU210950.8	1801	TTAGAATTGTTACAAATGTATCATATTTACATATGAACAGATGGTGGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126475	TTAGAATTGTTACAAATGTATCATATTTACATATGAACAGATGGTGGTTT	126524

CU210950.8	1851	TGATAATGAATCCAAAAGAAGCAATGTCACTGTTAAAAGGAACATGGTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126525	TGATAATGAATCCAAAAGAAGCAATGTCACTGTTAAAAGGAACATGGTGA	126574

CU210950.8	1901	GATGGGTAATTCTTTAAACTCTCAAAATCCTGGAATTTTAGAGTGGGACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126575	GATGGGTAATTCTTTAAACTCTCAAAATCCTGGAATTTTAGAGTGGGACA	126624

CU210950.8	1951	TGGAAGCCAAAAGTAATATCTCAGTGGAGACGATGGTGAGGCAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207348.13	126625	TGGAAGCCAAAAGTAATATCTCAGTGGAGACGATGGTGAGGCAAGAATTC	126674

Overview

Query
CU210950.8 - 63635 bps
Hit
CU207348.13 - 126674 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link