<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210873.5	1	ATATAGAGAGGCCTTTTGCAGGAGATTAGACTGTTGTTCTGTAGGCAAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183365	ATATAGAGAGGCCTTTTGCAGGAGATTAGACTGTTGTTCTGTAGGCAAAG	183414

CU210873.5	51	GCCTTCTCCATGGCTCCCCATGGCAGATCTCAATGAAAAGAGATAGTAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183415	GCCTTCTCCATGGCTCCCCATGGCAGATCTCAATGAAAAGAGATAGTAGT	183464

CU210873.5	101	CCATGGTTCTGAGACATTTATTGTCATGGCGGAAAGTTGATGTTTAAAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183465	CCATGGTTCTGAGACATTTATTGTCATGGCGGAAAGTTGATGTTTAAAAC	183514

CU210873.5	151	CATACCCCATTTCTCAGGGTAGGCCTGAGATTAAATATCTTTTGCAGGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183515	CATACCCCATTTCTCAGGGTAGGCCTGAGATTAAATATCTTTTGCAGGGA	183564

CU210873.5	201	ATATCTGAGAAGGGAAGCATATTGGCAACACTCTCTGGACCTCTACATAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183565	ATATCTGAGAAGGGAAGCATATTGGCAACACTCTCTGGACCTCTACATAC	183614

CU210873.5	251	CTCGTTTGCATGGACATCTCTGTCTTGAGCTTATGTGACCATAGGTCACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183615	CTCGTTTGCATGGACATCTCTGTCTTGAGCTTATGTGACCATAGGTCACA	183664

CU210873.5	301	TCTCTTTTCCTATTGTCTTGATCTGAGTTGTTAGGTATGCCTCATGTACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183665	TCTCTTTTCCTATTGTCTTGATCTGAGTTGTTAGGTATGCCTCATGTACA	183714

CU210873.5	351	TGTGGAAGGGTTTGGGGTGTTGCCCTTACATGACCGATGGCCACAAATCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183715	TGTGGAAGGGTTTGGGGTGTTGCCCTTACATGACCGATGGCCACAAATCT	183764

CU210873.5	401	ATGAGGAGTTGAGGCTACGTGACAGAGGCTTGGTGCCAGGAACAGGAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183765	ATGAGGAGTTGAGGCTACGTGACAGAGGCTTGGTGCCAGGAACAGGAAAA	183814

CU210873.5	451	GTTCTTACCATTCCTCCAGGGCTTCAAGCCTTCAGGTTAACCAGGGACCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183815	GTTCTTACCATTCCTCCAGGGCTTCAAGCCTTCAGGTTAACCAGGGACCA	183864

CU210873.5	501	GGCTTTCTCTCACAGTCTACTGCTCCTCACTCCAGTATGTCTTCACCCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183865	GGCTTTCTCTCACAGTCTACTGCTCCTCACTCCAGTATGTCTTCACCCCC	183914

CU210873.5	551	TTACCCCCATTCTCCTTTTTTCTAACAAATGCTTCTGACCTCCAAGAAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183915	TTACCCCCATTCTCCTTTTTTCTAACAAATGCTTCTGACCTCCAAGAAGT	183964

CU210873.5	601	GCTAAACTGTTTTCTACCATGACATCTAATGACATTCTGGTCCAACCACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	183965	GCTAAACTGTTTTCTACCATGACATCTAATGACATTCTGGTCCAACCACT	184014

CU210873.5	651	CCAAGTTGGCCATCTTTCTATGTGAACCTGCTACGATATGGATACCTATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184015	CCAAGTTGGCCATCTTTCTATGTGAACCTGCTACGATATGGATACCTATG	184064

CU210873.5	701	ACTAATGCAACTCATTTCCATGCTATCACTTTGATGTCTAAAACTGACTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184065	ACTAATGCAACTCATTTCCATGCTATCACTTTGATGTCTAAAACTGACTT	184114

CU210873.5	751	ACAACCCCTACAACAGGTCAAATAAGATTTTGGCATCACTGTGTCCACAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184115	ACAACCCCTACAACAGGTCAAATAAGATTTTGGCATCACTGTGTCCACAA	184164

CU210873.5	801	TTAGCACCATCTTGGCAGCTGTAGTTGGGTCAACTACAACAACAGTGGCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184165	TTAGCACCATCTTGGCAGCTGTAGTTGGGTCAACTACAACAACAGTGGCC	184214

CU210873.5	851	TATGAAAACAGTAGAAATATTAGACAGAATAGTATTTTACTCTGTTGATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184215	TATGAAAACAGTAGAAATATTAGACAGAATAGTATTTTACTCTGTTGATG	184264

CU210873.5	901	CCCTCCAGGTATAGGTGATGCTTAATTATCTTTAGTAGGTCATCCATATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184265	CCCTCCAGGTATAGGTGATGCTTAATTATCTTTAGTAGGTCATCCATATT	184314

CU210873.5	951	TTATAACAGGTTGACCTGTTGAGATGGTACAGGATATGTCTCTTCTTGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184315	TTATAACAGGTTGACCTGTTGAGATGGTACAGGATATGTCTCTTCTTGCT	184364

CU210873.5	1001	TGTGACCCTAGGTTTACGTCTTTCTACCTGACCCCCTACCAGGTACATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184365	TGTGACCCTAGGTTTACGTCTTTCTACCTGACCCCCTACCAGGTACATAA	184414

CU210873.5	1051	TTTCACCTCAGATAGGCTGAAGTTGGTCTATACATCAAGAAGACATGGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184415	TTTCACCTCAGATAGGCTGAAGTTGGTCTATACATCAAGAAGACATGGTC	184464

CU210873.5	1101	CACCAAGTCCCTCAATTATTCTATAATCTTCAGGGAACAAATAGGTAAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184465	CACCAAGTCCCTCAATTATTCTATAATCTTCAGGGAACAAATAGGTAAAC	184514

CU210873.5	1151	TTCACTAGACCTCCAGCTATGTCCTTGAAATGAGCTTTATCATTAAAGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184515	TTCACTAGACCTCCAGCTATGTCCTTGAAATGAGCTTTATCATTAAAGTA	184564

CU210873.5	1201	TGAGACCTTAAAGTAAAGACTTTAAAAGGATCTTTAACCCCTCTTGGATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184565	TGAGACCTTAAAGTAAAGACTTTAAAAGGATCTTTAACCCCTCTTGGATG	184614

CU210873.5	1251	GACATTTACACAATATTAGGGGGTGTTCGGTTAGTAATCCTTCTCTATAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184615	GACATTTACACAATATTAGGGGGTGTTCGGTTAGTAATCCTTCTCTATAA	184664

CU210873.5	1301	GTGTCTTATGCAGCATATGTTGCTCCAGTGTTCCATCAATAAGACCATGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184665	GTGTCTTATGCAGCATATGTTGCTCCAGTGTTCCATCAATAAGACCATGC	184714

CU210873.5	1351	TCCAAGTGTTGATGGCCCTGAACAGGGCACCCCTCCTGAGGTTATAGATA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184715	TCCAAGTGTTGATGGCCCTGAACAGGGCACCCCTCCTGAGGTTATAGATA	184764

CU210873.5	1401	CAAAGGCCTCTGAATAGGCTGACCTACTCCACCTGGGCATATTCTCTAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184765	CAAAGGCCTCTGAATAGGCTGACCTACTCCACCTGGGCATATTCTCTAGG	184814

CU210873.5	1451	GAGGCTGATCTTCCAGAGCCTGTAGTCAATGACTGGGAAGTCCCCAATAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184815	GAGGCTGATCTTCCAGAGCCTGTAGTCAATGACTGGGAAGTCCCCAATAG	184864

CU210873.5	1501	CTGGGGCAACCTAAGACAGGCATAGTTCCTTATGCTGGTTGTCCCCTGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184865	CTGGGGCAACCTAAGACAGGCATAGTTCCTTATGCTGGTTGTCCCCTGAG	184914

CU210873.5	1551	GTGGGGTCAACAAGGTCAGAGCATAGAACTCTGGCTCCCACTGAGCTGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184915	GTGGGGTCAACAAGGTCAGAGCATAGAACTCTGGCTCCCACTGAGCTGAC	184964

CU210873.5	1601	AACTTTTAAGAAAAAAAAAGGGTGGATATGTAGAAGGAGTGAGTCATCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	184965	AACTTTTAAGAAAAAAAAAGGGTGGATATGTAGAAGGAGTGAGTCATCAT	185014

CU210873.5	1651	GTTCTGACTAGCAGTGTGCAATGGCCCACACAGGTGCAGCAGGCACATCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185015	GTTCTGACTAGCAGTGTGCAATGGCCCACACAGGTGCAGCAGGCACATCC	185064

CU210873.5	1701	ACATTGATGAACCCCATAGCCTTCCTGATACCTGGGGATGAACAAAGACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185065	ACATTGATGAACCCCATAGCCTTCCTGATACCTGGGGATGAACAAAGACA	185114

CU210873.5	1751	GAGCTTATGACCAGAGCAGTCAATTGGCTGGTGCCAGCTATGTAGAACAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185115	GAGCTTATGACCAGAGCAGTCAATTGGCTGGTGCCAGCTATGTAGAACAA	185164

CU210873.5	1801	GCATTTACAGACTGAGGGGACATGGACAGAGGGCATAACGGCACTCCTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185165	GCATTTACAGACTGAGGGGACATGGACAGAGGGCATAACGGCACTCCTCA	185214

CU210873.5	1851	CTACTACAATACATGAGTCTGCTTCTATTTCTCACCTGGTCCCCAGGGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185215	CTACTACAATACATGAGTCTGCTTCTATTTCTCACCTGGTCCCCAGGGGT	185264

CU210873.5	1901	TCTATCATTGATTTCATTGCTTATCAACTACCCCCAACTACCATGCTAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185265	TCTATCATTGATTTCATTGCTTATCAACTACCCCCAACTACCATGCTAAG	185314

CU210873.5	1951	GGGCTTAGGGCTAGGTAGGGCAACAGTACAGTCATTATTAGACAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207323.5	185315	GGGCTTAGGGCTAGGTAGGGCAACAGTACAGTCATTATTAGACAGAATTC	185364

Overview

Query
CU210873.5 - 68196 bps
Hit
CU207323.5 - 185364 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link