<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210876.20	1	AGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGATCTGGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249274	AGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGATCTGGCT	249323

CU210876.20	51	GGAGAGATGGCTCAGTGATTAAAAGCACTTACTGCTCTTTCAGAGGACCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249324	GGAGAGATGGCTCAGTGATTAAAAGCACTTACTGCTCTTTCAGAGGACCT	249373

CU210876.20	101	AGGTTCAATTCCCAGCATCCATATGGTATTTCTCAACCATCTGTAACCCG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249374	AGGTTCAATTCCCAGCATCCATATGGTATTTCTCAACCATCTGTAACCCG	249423

CU210876.20	151	TTTCAGGGAATCCAACACCCTCATACAGATGTACTATGATCATTAATCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249424	TTTCAGGGAATCCAACACCCTCATACAGATGTACTATGATCATTAATCCT	249473

CU210876.20	201	TCCCAATGATTCTCTTCTCTTCTCTCTTCCACTGACCCTCTCCTACTTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249474	TCCCAATGATTCTCTTCTCTTCTCTCTTCCACTGACCCTCTCCTACTTCC	249523

CU210876.20	251	ATATGTGCATATATGCACAGGTATGCTCAATTGCATTTGTGTATGAGGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249524	ATATGTGCATATATGCACAGGTATGCTCAATTGCATTTGTGTATGAGGAT	249573

CU210876.20	301	GCTGGAAGCTGGCTTTGGGTGTCATACTCTCATGTCCACATAATTTTTAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249574	GCTGGAAGCTGGCTTTGGGTGTCATACTCTCATGTCCACATAATTTTTAC	249623

CU210876.20	351	ATTTATTTTTTGAGACAGGCTTTCTCTATGTAGTCTTGGTTGTCCTTGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249624	ATTTATTTTTTGAGACAGGCTTTCTCTATGTAGTCTTGGTTGTCCTTGAA	249673

CU210876.20	401	CTGCATGACTGAGCATGGCCACCACACCCAGGTCTCGTGTTATTTTTTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249674	CTGCATGACTGAGCATGGCCACCACACCCAGGTCTCGTGTTATTTTTTGA	249723

CU210876.20	451	GATATTTCTTACTGAGCCAAGAGTTTATTGGCATTTCAGCTGAATGAGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249724	GATATTTCTTACTGAGCCAAGAGTTTATTGGCATTTCAGCTGAATGAGCT	249773

CU210876.20	501	GGCCAGTGAGTCCGTGAGGTCCTCCTGTCTCGGTCACTAGCATGGGGACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249774	GGCCAGTGAGTCCGTGAGGTCCTCCTGTCTCGGTCACTAGCATGGGGACT	249823

CU210876.20	551	GCTCACTGCCACACCTGGCTTTTACATGGCTGCTGGGGCTCGTACCCAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249824	GCTCACTGCCACACCTGGCTTTTACATGGCTGCTGGGGCTCGTACCCAGG	249873

CU210876.20	601	TTCTCATGACACTGCATCTTCCCAGTCTTTCTTCAGGTAACTTTTAAATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249874	TTCTCATGACACTGCATCTTCCCAGTCTTTCTTCAGGTAACTTTTAAATA	249923

CU210876.20	651	CAGAGATAACTGTCATTTGCTGTTTTCTCTCAGTCTAAAATTCTGATGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249924	CAGAGATAACTGTCATTTGCTGTTTTCTCTCAGTCTAAAATTCTGATGAA	249973

CU210876.20	701	GAGGTCCTCTAGAAAGCTACCTTTAACTTATGAAACAATCTCAATGTAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	249974	GAGGTCCTCTAGAAAGCTACCTTTAACTTATGAAACAATCTCAATGTAGT	250023

CU210876.20	751	CATGAAACTACAGAGCCAGCCAATTGCCCCAAACAGCAGCCCACAATTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250024	CATGAAACTACAGAGCCAGCCAATTGCCCCAAACAGCAGCCCACAATTTA	250073

CU210876.20	801	TAAAGTACTTCCACATATATTACTGCAGGGGCCTTTTTTTCTTTCTGTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250074	TAAAGTACTTCCACATATATTACTGCAGGGGCCTTTTTTTCTTTCTGTAT	250123

CU210876.20	851	TTCTCTATTTAGTGTCTCTTTCATAAGAATGTGTGTTCTGCTTACTGTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250124	TTCTCTATTTAGTGTCTCTTTCATAAGAATGTGTGTTCTGCTTACTGTGT	250173

CU210876.20	901	TTCTGGTCCAGGAGTTAGTATGAAGAAGCCTCTGACAGAGTGGACAGTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250174	TTCTGGTCCAGGAGTTAGTATGAAGAAGCCTCTGACAGAGTGGACAGTTA	250223

CU210876.20	951	ATACATCAGTAAGATACACAAGAATACAAAATAGGAGGTGTAACACAGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250224	ATACATCAGTAAGATACACAAGAATACAAAATAGGAGGTGTAACACAGTA	250273

CU210876.20	1001	CCATTAACATGCTCTGGAGGCCTAATTCACAGTTTTAACACTATCTGAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250274	CCATTAACATGCTCTGGAGGCCTAATTCACAGTTTTAACACTATCTGAGA	250323

CU210876.20	1051	AGAAGGTAGTGTTGGCAAAAGCTGAGTTAATTATATATATATGTTTATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250324	AGAAGGTAGTGTTGGCAAAAGCTGAGTTAATTATATATATATGTTTATTT	250373

CU210876.20	1101	ATTTAAAGTCAGGGTTTCACCATGCAGCCCAGGCTGGATTCACACTACTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250374	ATTTAAAGTCAGGGTTTCACCATGCAGCCCAGGCTGGATTCACACTACTC	250423

CU210876.20	1151	ATCTCCTGCCTCAGATTCTCCATTGCTGGGATTACAAATGTGTGTCACCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250424	ATCTCCTGCCTCAGATTCTCCATTGCTGGGATTACAAATGTGTGTCACCA	250473

CU210876.20	1201	AGCCCAGCATACTGAATGTTTAAGTTGAAGATGTCAGGTTCCTAGAAGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250474	AGCCCAGCATACTGAATGTTTAAGTTGAAGATGTCAGGTTCCTAGAAGCA	250523

CU210876.20	1251	TAAAACACTGAGGGCCCTAAGGTGTGTTGGGAAGCTACTGCAGCCTCCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250524	TAAAACACTGAGGGCCCTAAGGTGTGTTGGGAAGCTACTGCAGCCTCCTC	250573

CU210876.20	1301	CTGCTGATCCACAAGGACGGTTGGGAAGTGACATGAAAACAAGGCTGGAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250574	CTGCTGATCCACAAGGACGGTTGGGAAGTGACATGAAAACAAGGCTGGAG	250623

CU210876.20	1351	ATGTGAGCAGATCCCATGGTCTAAAAATCCTCAAAGTCTTTTTCATAATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250624	ATGTGAGCAGATCCCATGGTCTAAAAATCCTCAAAGTCTTTTTCATAATG	250673

CU210876.20	1401	ACTATATCTGAAAACCTTGCAAGTGAAATCCCCACACTCAGGAGGGAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250674	ACTATATCTGAAAACCTTGCAAGTGAAATCCCCACACTCAGGAGGGAAAG	250723

CU210876.20	1451	TTAGGAAGACTGCTATGAATTTGAGGTCAGCCTGTGCTACAAAGTGAGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250724	TTAGGAAGACTGCTATGAATTTGAGGTCAGCCTGTGCTACAAAGTGAGAC	250773

CU210876.20	1501	CCTGTCTTGAAAGGGAAAAAAAAAAATGGAATGGCAGTCCTGGGAGAATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250774	CCTGTCTTGAAAGGGAAAAAAAAAAATGGAATGGCAGTCCTGGGAGAATG	250823

CU210876.20	1551	CATAAAAACTGAGTATTTTTTTTTTTTACTTCCCTACTTCCCTTGACTAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250824	CATAAAAACTGAGTATTTTTTTTTTTTACTTCCCTACTTCCCTTGACTAG	250873

CU210876.20	1601	GAAAACCTTGGGCAGTTGTTATTTTTCATGTGACTTGGGGCTTGGCATTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250874	GAAAACCTTGGGCAGTTGTTATTTTTCATGTGACTTGGGGCTTGGCATTA	250923

CU210876.20	1651	GAGCACAGCTCCATAGTAACTAAGGGTCTGTGGGAGCTATCATACTAGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250924	GAGCACAGCTCCATAGTAACTAAGGGTCTGTGGGAGCTATCATACTAGCA	250973

CU210876.20	1701	GCTCCTGGGGACTCAGCCATGACTGGGGACAATACTGAAGACAGTGCAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	250974	GCTCCTGGGGACTCAGCCATGACTGGGGACAATACTGAAGACAGTGCAGG	251023

CU210876.20	1751	TGGTGACAGAGGGCCAATGAGCAGCACTTGCATGTGAGTGAACTCATGTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	251024	TGGTGACAGAGGGCCAATGAGCAGCACTTGCATGTGAGTGAACTCATGTT	251073

CU210876.20	1801	GGGCTGGGTGGGAGATATAGAACAGGGAAGGCCAAGCAAAGGCAAGGGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	251074	GGGCTGGGTGGGAGATATAGAACAGGGAAGGCCAAGCAAAGGCAAGGGCA	251123

CU210876.20	1851	GAAGGAAGGGAGGATTCTACAGCGATGTGAGGGATGGATGGAGGCATGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	251124	GAAGGAAGGGAGGATTCTACAGCGATGTGAGGGATGGATGGAGGCATGAA	251173

CU210876.20	1901	GAGAAAGACAGGAAAGAGCATGAGAGAAGAGCAGAAGGGAAGGCAGAGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	251174	GAGAAAGACAGGAAAGAGCATGAGAGAAGAGCAGAAGGGAAGGCAGAGGG	251223

CU210876.20	1951	GAGAGAAAGGGACAGAAAAACTTGCTGAAAGACCACATGACAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207302.23	251224	GAGAGAAAGGGACAGAAAAACTTGCTGAAAGACCACATGACAAGGAATTC	251273

Overview

Query
CU210876.20 - 116112 bps
Hit
CU207302.23 - 251273 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link