<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU151874.13	1	AAGCTTGTCGTATAGCCAACATTTTTTGGTGTTTTACTTTATAACTTTCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	42767	AAGCTTGTCGTATAGCCAACATTTTTTGGTGTTTTACTTTATAACTTTCA	42816

CU151874.13	51	TAAATTTTATTTGATGAACTGATCTCTATATGATGAATACATCATAGGCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	42817	TAAATTTTATTTGATGAACTGATCTCTATATGATGAATACATCATAGGCT	42866

CU151874.13	101	ATGGATAAACTCCAATGAAGCCTGTTTATGTCATAGTTACACTGATAGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	42867	ATGGATAAACTCCAATGAAGCCTGTTTATGTCATAGTTACACTGATAGAG	42916

CU151874.13	151	AATCATTCATCCTTTGTTTCATATATACCTACTTTCCTTTGGTTGTGTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	42917	AATCATTCATCCTTTGTTTCATATATACCTACTTTCCTTTGGTTGTGTTT	42966

CU151874.13	201	TTTATTGGCCTTGTCCTACTTGAAGCAATTTTTTTCCTCATTTTTCGAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	42967	TTTATTGGCCTTGTCCTACTTGAAGCAATTTTTTTCCTCATTTTTCGAGA	43016

CU151874.13	251	TTAATAATGATAATATAAAGAAGCTTCATCTTTTGTATATTTGGACTCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43017	TTAATAATGATAATATAAAGAAGCTTCATCTTTTGTATATTTGGACTCCT	43066

CU151874.13	301	GATACTTGTATATGATAGAAATGTAATATTGGCAACTTTGCCGAGGTGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43067	GATACTTGTATATGATAGAAATGTAATATTGGCAACTTTGCCGAGGTGAT	43116

CU151874.13	351	CAAAACCATATTGGTTTCCTCTTTTTCCCTGTTGCCAAAACTTGAATGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43117	CAAAACCATATTGGTTTCCTCTTTTTCCCTGTTGCCAAAACTTGAATGAC	43166

CU151874.13	401	TGGAACTAGTTTCATGCTATTCTGATTTATATTGTCAGTACAGTTTTCTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43167	TGGAACTAGTTTCATGCTATTCTGATTTATATTGTCAGTACAGTTTTCTA	43216

CU151874.13	451	GTGCAGCCAACATATATTGGTTTTTTACTTTATAACTTGTGTAAATTTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43217	GTGCAGCCAACATATATTGGTTTTTTACTTTATAACTTGTGTAAATTTGA	43266

CU151874.13	501	TTTGATGAACTGATCTCTATATGAATATAGTTTATGGAAAAAAAAAGTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43267	TTTGATGAACTGATCTCTATATGAATATAGTTTATGGAAAAAAAAAGTTA	43316

CU151874.13	551	TGAAGATACAATTTTCGTTTGTGAAAAGTTATAAATTAACATAAAAACTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43317	TGAAGATACAATTTTCGTTTGTGAAAAGTTATAAATTAACATAAAAACTT	43366

CU151874.13	601	ATTTATTTGCATAAGCCATTTTTCATAACCTCAAAAATAAGCCAATCCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43367	ATTTATTTGCATAAGCCATTTTTCATAACCTCAAAAATAAGCCAATCCAA	43416

CU151874.13	651	ACGGGCCCATGAATCTGATAAGTGCTTATGCTATAAGCTATTTATCCAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43417	ACGGGCCCATGAATCTGATAAGTGCTTATGCTATAAGCTATTTATCCAAA	43466

CU151874.13	701	CTGGGCCTATTACAAAAACTTTCTGAGCCGGCATTTGCTTATGAGAACTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43467	CTGGGCCTATTACAAAAACTTTCTGAGCCGGCATTTGCTTATGAGAACTA	43516

CU151874.13	751	TTGAGATTTAACCGATGTCGTCTCCTTCTTGTCATGTACAGTGTGGAAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43517	TTGAGATTTAACCGATGTCGTCTCCTTCTTGTCATGTACAGTGTGGAAAT	43566

CU151874.13	801	CACTTCCAAATTGTAACAGTGTAGCTCATCTTAATATATTTTACCCATTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43567	CACTTCCAAATTGTAACAGTGTAGCTCATCTTAATATATTTTACCCATTA	43616

CU151874.13	851	TAGTTATGAATTTAACTGACGTAGGATATAATTTTTGTGTATCCTAAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43617	TAGTTATGAATTTAACTGACGTAGGATATAATTTTTGTGTATCCTAAGGC	43666

CU151874.13	901	ATGTTACACGGGTTGCTGATGCTAAAGACGATGCTTTGGAGAAACTATAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43667	ATGTTACACGGGTTGCTGATGCTAAAGACGATGCTTTGGAGAAACTATAT	43716

CU151874.13	951	GAGCAACGACGCATGAAAAAAGATGCTAAAAAAGAAACAGAAGAAACAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43717	GAGCAACGACGCATGAAAAAAGATGCTAAAAAAGAAACAGAAGAAACAGG	43766

CU151874.13	1001	TTTGCAGGTTGACCGAGTAGATGCTCTTCCTGTCAAGTCCTTAGATGGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43767	TTTGCAGGTTGACCGAGTAGATGCTCTTCCTGTCAAGTCCTTAGATGGAG	43816

CU151874.13	1051	AAGTCTATTACCGGACAGGTATATAGTGTTCTCTTATATAGAATTTGTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43817	AAGTCTATTACCGGACAGGTATATAGTGTTCTCTTATATAGAATTTGTGC	43866

CU151874.13	1101	ATTGTCGTCGTTTGTCATTCTTTTCTTTCTTTTACTTGTTGATCTGGTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43867	ATTGTCGTCGTTTGTCATTCTTTTCTTTCTTTTACTTGTTGATCTGGTAA	43916

CU151874.13	1151	CATATGCTGTTCTCACATTCTGCAGCCACGCGGACGGCACCAGTAAATGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43917	CATATGCTGTTCTCACATTCTGCAGCCACGCGGACGGCACCAGTAAATGG	43966

CU151874.13	1201	TCCAAGGAAAGAGGAAACTGAAGAGGATGACAATGAAGACAAAGGTTTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	43967	TCCAAGGAAAGAGGAAACTGAAGAGGATGACAATGAAGACAAAGGTTTTG	44016

CU151874.13	1251	TGAAGCTAACTAAGGCTGAAAAAAGAGCCAAACTTAAGAAAAGTAGAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44017	TGAAGCTAACTAAGGCTGAAAAAAGAGCCAAACTTAAGAAAAGTAGAAAA	44066

CU151874.13	1301	GAGGGAAAGAAACAAGGGAAAGAGGTGGCTAAAGAAGAAGTGGAAGAAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44067	GAGGGAAAGAAACAAGGGAAAGAGGTGGCTAAAGAAGAAGTGGAAGAAGC	44116

CU151874.13	1351	ACCACAATCAACAGTTTTGGTATATTACCTATAACCTGTTTAACATTATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44117	ACCACAATCAACAGTTTTGGTATATTACCTATAACCTGTTTAACATTATT	44166

CU151874.13	1401	AATTTAACATATTCTTTGGATCCATTTGATTTGCTAATGAGGGATTTGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44167	AATTTAACATATTCTTTGGATCCATTTGATTTGCTAATGAGGGATTTGAC	44216

CU151874.13	1451	AAGACAATACTATTTGCTTCATGTTAGATTTCTAATATAGTCACAGGACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44217	AAGACAATACTATTTGCTTCATGTTAGATTTCTAATATAGTCACAGGACA	44266

CU151874.13	1501	AAACAAGGTTTTTGTTTCACTTTTGATTTTGAAAATAGTCGCAAACAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44267	AAACAAGGTTTTTGTTTCACTTTTGATTTTGAAAATAGTCGCAAACAAAA	44316

CU151874.13	1551	CTTTTCAAAATGAAATGCTAAGTATTATCCCTCCTTAACTCTATTACCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44317	CTTTTCAAAATGAAATGCTAAGTATTATCCCTCCTTAACTCTATTACCTA	44366

CU151874.13	1601	TTTCCATCCCCTCTGCTATTAATTCAGATTCCATTCCTCCGGAATTATTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44367	TTTCCATCCCCTCTGCTATTAATTCAGATTCCATTCCTCCGGAATTATTA	44416

CU151874.13	1651	TCTTCTTATAAATTCTAACTCGGATACTACAGCACCTCCTGTCCCAGGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44417	TCTTCTTATAAATTCTAACTCGGATACTACAGCACCTCCTGTCCCAGGAG	44466

CU151874.13	1701	ACCCCTAACATTCATCTATGCAAACAAGTTCAAAGTCCGTAATTCATAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44467	ACCCCTAACATTCATCTATGCAAACAAGTTCAAAGTCCGTAATTCATAAA	44516

CU151874.13	1751	ACCCAGATTAGTTCCCACTCTCCTTACACATTTGGAACCTACCACCACTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44517	ACCCAGATTAGTTCCCACTCTCCTTACACATTTGGAACCTACCACCACTC	44566

CU151874.13	1801	CCTTTACACGTCTGAAACCTACCATAGTTACTTACTTGGCTGGCACTAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44567	CCTTTACACGTCTGAAACCTACCATAGTTACTTACTTGGCTGGCACTAAG	44616

CU151874.13	1851	TGGTTGGCAACGATGCAGTGTGAGAATGATGCATTCATTAATAAAAATAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44617	TGGTTGGCAACGATGCAGTGTGAGAATGATGCATTCATTAATAAAAATAC	44666

CU151874.13	1901	TTGTTGCTCTTCATGCACATAGGCAGGCATTCGACTGTAAATAAGTATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44667	TTGTTGCTCTTCATGCACATAGGCAGGCATTCGACTGTAAATAAGTATTT	44716

CU151874.13	1951	TAGGTAAAGGGTAATCCACATAGAAATATTAATAAATACAAAGCAGAACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU151875.4	44717	TAGGTAAAGGGTAATCCACATAGAAATATTAATAAATACAAAGCAGAACA	44766

Overview

Query
CU151874.13 - 86419 bps
Hit
CU151875.4 - 44766 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001926200012000142767447661
Short-link