<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957349.7	1	GTTCGCCAATGTATTCCATGTCAGATCAGGGTGTGTGTTTACTATGGGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120616	GTTCGCCAATGTATTCCATGTCAGATCAGGGTGTGTGTTTACTATGGGCA	120665

BX957349.7	51	ATACAACACTTGTGTGCTGCGCTAATGCCATTACTTCATATTGCCCTGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120666	ATACAACACTTGTGTGCTGCGCTAATGCCATTACTTCATATTGCCCTGAC	120715

BX957349.7	101	CAGGAACAGAAGATATAGGCAGAATATCTCATTTTAAGGAGTTTGTTGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120716	CAGGAACAGAAGATATAGGCAGAATATCTCATTTTAAGGAGTTTGTTGGT	120765

BX957349.7	151	GCACAAAAATGTTCTTGGAGCTTCGTATGATTATTGTTAATCCACTGAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120766	GCACAAAAATGTTCTTGGAGCTTCGTATGATTATTGTTAATCCACTGAAG	120815

BX957349.7	201	TCACGTGATTTGAGTTTTGGGTTTTTTTTCTGAAATTTTCCTGATCCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120816	TCACGTGATTTGAGTTTTGGGTTTTTTTTCTGAAATTTTCCTGATCCTTT	120865

BX957349.7	251	CTGTCTGTGGAGACAGCAACAGTCCTGATATGTTTCAAGTCCTTAAAAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120866	CTGTCTGTGGAGACAGCAACAGTCCTGATATGTTTCAAGTCCTTAAAAGG	120915

BX957349.7	301	AACCAAAAACACTGCCAAGAACACTTTTGTGAACCAAAGAACTCTAAAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120916	AACCAAAAACACTGCCAAGAACACTTTTGTGAACCAAAGAACTCTAAAAT	120965

BX957349.7	351	TAAGTGGTTTGCCCTTATCTTCTGTTCTGTTCCCAGTCAGGACAATATGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	120966	TAAGTGGTTTGCCCTTATCTTCTGTTCTGTTCCCAGTCAGGACAATATGA	121015

BX957349.7	401	AATCTTTGCCATTGGAGTCAGTAACGCAACACAGAATCTTCAAGAACACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121016	AATCTTTGCCATTGGAGTCAGTAACGCAACACAGAATCTTCAAGAACACT	121065

BX957349.7	451	TTGTTCGCTAATGTATTCCATGTCAGATCAGGGTGTGCGTTTACTATGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121066	TTGTTCGCTAATGTATTCCATGTCAGATCAGGGTGTGCGTTTACTATGGG	121115

BX957349.7	501	CAATACAATACGTGTGTGCTGCGCTAATGCCATTACTTCATATTGCCCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121116	CAATACAATACGTGTGTGCTGCGCTAATGCCATTACTTCATATTGCCCAG	121165

BX957349.7	551	ACCAGGAACAGAAGATATAGGCACATAACCTAATTTTTAGAGTTGTTTTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121166	ACCAGGAACAGAAGATATAGGCACATAACCTAATTTTTAGAGTTGTTTTG	121215

BX957349.7	601	GTGCTCAAAAGTGTTCTTGGAGCTTTGTATGATTACAGCGGATCAACTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121216	GTGCTCAAAAGTGTTCTTGGAGCTTTGTATGATTACAGCGGATCAACTGA	121265

BX957349.7	651	AGCCACGTGGAGTTTACTGACTTTTTGGTTCCTTTACTGGAATTTTCCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121266	AGCCACGTGGAGTTTACTGACTTTTTGGTTCCTTTACTGGAATTTTCCAA	121315

BX957349.7	701	ATCATTTCTGTCTATGGAGACAGCAACAGTCCTGAGATGCTTAAAGTTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121316	ATCATTTCTGTCTATGGAGACAGCAACAGTCCTGAGATGCTTAAAGTTTA	121365

BX957349.7	751	TAAAATGAACCAAGAACATTGCCAAGAACACTTTTGTGCACCAAAAAAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121366	TAAAATGAACCAAGAACATTGCCAAGAACACTTTTGTGCACCAAAAAAAC	121415

BX957349.7	801	AACTCTTAAATGAGTTTGTTTGCCTTTATCTTCTGTTCCAAGTCAGGACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121416	AACTCTTAAATGAGTTTGTTTGCCTTTATCTTCTGTTCCAAGTCAGGACA	121465

BX957349.7	851	ATATGAAGTATTCGCCAGTCAGTAATGCAACACAAAGGCTCCAAAAACAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121466	ATATGAAGTATTCGCCAGTCAGTAATGCAACACAAAGGCTCCAAAAACAC	121515

BX957349.7	901	TTTTGTACAAAAAAAAAAATGTGTTCGCTAATGTCAGATCAGAATGCACG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121516	TTTTGTACAAAAAAAAAAATGTGTTCGCTAATGTCAGATCAGAATGCACG	121565

BX957349.7	951	CTTACTACAGGTAATACAACACTTGTCTGTTGTGATAATGGCAAATACTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121566	CTTACTACAGGTAATACAACACTTGTCTGTTGTGATAATGGCAAATACTT	121615

BX957349.7	1001	CATATTGCTCTGACAAGGAACAGAAGATATAGCCAGAATACCTCATTTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121616	CATATTGCTCTGACAAGGAACAGAAGATATAGCCAGAATACCTCATTTTA	121665

BX957349.7	1051	AGGAGTTTGTTAATGCACAAAAGTGTTCTTGGAGCTTCGTATGATTATTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121666	AGGAGTTTGTTAATGCACAAAAGTGTTCTTGGAGCTTCGTATGATTATTG	121715

BX957349.7	1101	TTAATCCACTGAAGTCACGTGTTTTGAGTTTTTGGTTTCTTTTCTGAAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121716	TTAATCCACTGAAGTCACGTGTTTTGAGTTTTTGGTTTCTTTTCTGAAAT	121765

BX957349.7	1151	TTTCCAGATCATTTCTGTCTGTGGAGACAGCAACAGTCCAGATATGTTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121766	TTTCCAGATCATTTCTGTCTGTGGAGACAGCAACAGTCCAGATATGTTTA	121815

BX957349.7	1201	AAGTCCATAAAAGGAACCAAAAACTGTCAAAACAATGCCAAGAACACTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121816	AAGTCCATAAAAGGAACCAAAAACTGTCAAAACAATGCCAAGAACACTTT	121865

BX957349.7	1251	TGTGCACCAAAACAACATAAAAATGAGGTTATATTCTGTTCCTTGACTCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121866	TGTGCACCAAAACAACATAAAAATGAGGTTATATTCTGTTCCTTGACTCC	121915

BX957349.7	1301	AATGACAAATATTTAATATTTTCAGACAAGCAAGCGTCAAGAACGCTTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121916	AATGACAAATATTTAATATTTTCAGACAAGCAAGCGTCAAGAACGCTTTG	121965

BX957349.7	1351	TTTGCCTATATAATCCATGTCAGATCAGGGTGTGCGTTTACTATGGGCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	121966	TTTGCCTATATAATCCATGTCAGATCAGGGTGTGCGTTTACTATGGGCAA	122015

BX957349.7	1401	TACAACACTTGTGTGCTGCGCTAATGCCATTACTTCATGTTGTCCAGACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122016	TACAACACTTGTGTGCTGCGCTAATGCCATTACTTCATGTTGTCCAGACA	122065

BX957349.7	1451	AGGAACAGAACAGTAGACATAGGCACACAGCCTCGTTTTTAGAGTTGTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122066	AGGAACAGAACAGTAGACATAGGCACACAGCCTCGTTTTTAGAGTTGTTT	122115

BX957349.7	1501	TGGTGCACAAATGTGTCCTTGGGGCTTCGTATGATTATTGTTAATCCACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122116	TGGTGCACAAATGTGTCCTTGGGGCTTCGTATGATTATTGTTAATCCACT	122165

BX957349.7	1551	GAAGTCACATGAAGTGTTTTGACAATGTTTTGGGTTCCTTTTCTGGGATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122166	GAAGTCACATGAAGTGTTTTGACAATGTTTTGGGTTCCTTTTCTGGGATT	122215

BX957349.7	1601	TGAACATCTCAATACCCTTGCTGTCTGCGGAGGATGAGAAAGCTCTCAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122216	TGAACATCTCAATACCCTTGCTGTCTGCGGAGGATGAGAAAGCTCTCAGA	122265

BX957349.7	1651	TTTTATATATCTAAATTTGTGTTCTAAAGATGAACGAATGTCTCAGGCGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122266	TTTTATATATCTAAATTTGTGTTCTAAAGATGAACGAATGTCTCAGGCGA	122315

BX957349.7	1701	TAACAACCTAAGTTAAAAGGCCATGAAACCCCCTTGTTTCAGCAGGGTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122316	TAACAACCTAAGTTAAAAGGCCATGAAACCCCCTTGTTTCAGCAGGGTGT	122365

BX957349.7	1751	TTTCACACCTCTACTTTGGAAAAAGTCAGAAAAGTGGGCGTGTCCAGCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122366	TTTCACACCTCTACTTTGGAAAAAGTCAGAAAAGTGGGCGTGTCCAGCTT	122415

BX957349.7	1801	TGTTTAGGGGGAAGTGTCGGAGGAATGAAAGAGGCTTGGTGTGGGAGTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122416	TGTTTAGGGGGAAGTGTCGGAGGAATGAAAGAGGCTTGGTGTGGGAGTGT	122465

BX957349.7	1851	CTATTTGGCCGCGCTGAGTTTTAGAATCAAAATACACAAACACAGTGGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122466	CTATTTGGCCGCGCTGAGTTTTAGAATCAAAATACACAAACACAGTGGAC	122515

BX957349.7	1901	AAAGTGACTGTGTTTACATGGACATCTGTAGTCGAATTATTTGCCAAATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122516	AAAGTGACTGTGTTTACATGGACATCTGTAGTCGAATTATTTGCCAAATT	122565

BX957349.7	1951	ATTAAATGGTGGACTTTAACTGCAGTTTGGCTCTTTCATTCAGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062482.10	122566	ATTAAATGGTGGACTTTAACTGCAGTTTGGCTCTTTCATTCAGGGAATTC	122615

Overview

Query
BX957349.7 - 41277 bps
Hit
CU062482.10 - 122615 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link