<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CT967303.6 1 AAGCTTGCAATACTGCTCCAAAAATATTCTAGTAGAATAATAGCAAAGAA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84481 AAGCTTGCAATACTGCTCCAAAAATATTCTAGTAGAATAATAGCAAAGAA 84530 CT967303.6 51 ATGTTTAAAAAAACATGGAAAGTGTACATGGGATGATGAAAGGAAAGAAG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84531 ATGTTTAAAAAAACATGGAAAGTGTACATGGGATGATGAAAGGAAAGAAG 84580 CT967303.6 101 TCTGTTTATTTGCCTTAAAAAAGACGGGATCACCAAAAAAATGAGATTGG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84581 TCTGTTTATTTGCCTTAAAAAAGACGGGATCACCAAAAAAATGAGATTGG 84630 CT967303.6 151 GTCACTTGCAGCAAGCTTGCAATACTACTACAAAAATAATCTTGTATAAT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84631 GTCACTTGCAGCAAGCTTGCAATACTACTACAAAAATAATCTTGTATAAT 84680 CT967303.6 201 AATAGCATATTAAGATCTAGTTCTATAGCACTGCATGACTGCGTGATGAC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84681 AATAGCATATTAAGATCTAGTTCTATAGCACTGCATGACTGCGTGATGAC 84730 CT967303.6 251 AACATAGTTTTCAAATTCGCAACAACAGATATAGCCAAGAATATAATCCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84731 AACATAGTTTTCAAATTCGCAACAACAGATATAGCCAAGAATATAATCCA 84780 CT967303.6 301 AATTTAAACAATGGTGTTAATAAACAGAAACAAGTGGCTTATTTAACTTA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84781 AATTTAAACAATGGTGTTAATAAACAGAAACAAGTGGCTTATTTAACTTA 84830 CT967303.6 351 AACATCACTCACCTGTACCAAAGAGTAACTACCAATGATGTATACGGTTT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84831 AACATCACTCACCTGTACCAAAGAGTAACTACCAATGATGTATACGGTTT 84880 CT967303.6 401 CAATGGACTCCCATACTGACGAGCTAATCCGAAATCGCAGATTTTTAACT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84881 CAATGGACTCCCATACTGACGAGCTAATCCGAAATCGCAGATTTTTAACT 84930 CT967303.6 451 CACCCCTATTATTCAGAAGCAGGTTTGAAGTCTTCAAATCCCTATGAATC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84931 CACCCCTATTATTCAGAAGCAGGTTTGAAGTCTTCAAATCCCTATGAATC 84980 CT967303.6 501 ACCCAGTTGTCATGCAGATACTTCACACCTTCTAACAGCTGGAGCATTAA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 84981 ACCCAGTTGTCATGCAGATACTTCACACCTTCTAACAGCTGGAGCATTAA 85030 CT967303.6 551 GCATTTTACTTCACTCTGGCTAAATGGCTGTTTTATTGCCTCCATTAGTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85031 GCATTTTACTTCACTCTGGCTAAATGGCTGTTTTATTGCCTCCATTAGTC 85080 CT967303.6 601 CTTTAAGATCGTGTTCCATGTATTCCATAACCATAAAAATACTATCAAGG 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85081 CTTTAAGATCGTGTTCCATGTATTCCATAACCATAAAAATACTATCAAGG 85130 CT967303.6 651 CTACTACCTACCACTACTTCCTTAACGTCAACTATGAATGGATGGTGAAA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85131 CTACTACCTACCACTACTTCCTTAACGTCAACTATGAATGGATGGTGAAA 85180 CT967303.6 701 GGAAAGAAGTATGTTGATTTCCCTCAGAGAAGTCAGTGGAAACCCTTCTT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85181 GGAAAGAAGTATGTTGATTTCCCTCAGAGAAGTCAGTGGAAACCCTTCTT 85230 CT967303.6 751 TTTCCTTCTCCATCTTCACCTTTTTCAGTGCCACTATTTCGCCAGTCTTC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85231 TTTCCTTCTCCATCTTCACCTTTTTCAGTGCCACTATTTCGCCAGTCTTC 85280 CT967303.6 801 TTGTCTTTGGCCCTGTATACAACACCATATGTTCCTTCATTAATCTTGTT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85281 TTGTCTTTGGCCCTGTATACAACACCATATGTTCCTTCATTAATCTTGTT 85330 CT967303.6 851 CAGTCTCTCAAACTCATCAACACTTCTACAACCATGAAGCATGTTAACAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85331 CAGTCTCTCAAACTCATCAACACTTCTACAACCATGAAGCATGTTAACAA 85380 CT967303.6 901 CTCTGTGTGGTGGAGTCGGAGGTTCCATACTTTCCCTGCAATCATCTTCA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85381 CTCTGTGTGGTGGAGTCGGAGGTTCCATACTTTCCCTGCAATCATCTTCA 85430 CT967303.6 951 CTTTCAGAATCAGTATTTGAGTGACTGCCACTTGTGTCACTTTTGCAAAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85431 CTTTCAGAATCAGTATTTGAGTGACTGCCACTTGTGTCACTTTTGCAAAT 85480 CT967303.6 1001 TCCACCATCAATCTCCATGTTGTTATTCCTCTCTCCCTCCATACCAGAAT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85481 TCCACCATCAATCTCCATGTTGTTATTCCTCTCTCCCTCCATACCAGAAT 85530 CT967303.6 1051 GATCATCTTCACCGGAGTATCTCCCAGTGCTATCTCTTTCTTCCGATTCA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85531 GATCATCTTCACCGGAGTATCTCCCAGTGCTATCTCTTTCTTCCGATTCA 85580 CT967303.6 1101 GATGATTTGGCTCTAGCCCTATCAAAACCTTTGATTTTATCATCGGGTCT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85581 GATGATTTGGCTCTAGCCCTATCAAAACCTTTGATTTTATCATCGGGTCT 85630 CT967303.6 1151 CAACATCTTGTTTCTTACTCTCGTACCTGATTCAGGAGATAACCTCCTCC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85631 CAACATCTTGTTTCTTACTCTCGTACCTGATTCAGGAGATAACCTCCTCC 85680 CT967303.6 1201 TTTTAAGGAATTCCTTCTCATCAATGATTTCACCTTCATCATTAGGAGAG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85681 TTTTAAGGAATTCCTTCTCATCAATGATTTCACCTTCATCATTAGGAGAG 85730 CT967303.6 1251 TCGTCTCCGGATGCCCATCTTGAAGATGATATATTACGAGTAGGCACATA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85731 TCGTCTCCGGATGCCCATCTTGAAGATGATATATTACGAGTAGGCACATA 85780 CT967303.6 1301 ATCTTCAACTTTTGGTTGCTCAGCTACCTGCCCATTAACCAACCCCTGCT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85781 ATCTTCAACTTTTGGTTGCTCAGCTACCTGCCCATTAACCAACCCCTGCT 85830 CT967303.6 1351 CTGACAACATTGAATGCAAACCTATAGGAGACTCGGCATCTAGAACTGAC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85831 CTGACAACATTGAATGCAAACCTATAGGAGACTCGGCATCTAGAACTGAC 85880 CT967303.6 1401 TCAGACACCATAGAAGGATCCATTGCTGTCGGCAACTCGGGATTCTCAAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85881 TCAGACACCATAGAAGGATCCATTGCTGTCGGCAACTCGGGATTCTCAAG 85930 CT967303.6 1451 ATAATGAACTTCAACTCCATTGTAATTAACATTAGGCGACTCACGAAATG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85931 ATAATGAACTTCAACTCCATTGTAATTAACATTAGGCGACTCACGAAATG 85980 CT967303.6 1501 CTATTGGTAATGGAGGTGGTGGAGGAAGAGCGGCCACTGTTGTGACAACC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 85981 CTATTGGTAATGGAGGTGGTGGAGGAAGAGCGGCCACTGTTGTGACAACC 86030 CT967303.6 1551 TTCAGATTGGATAAATTATTCACTTTGCTCTCCTCTTGATCCCATACTAT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86031 TTCAGATTGGATAAATTATTCACTTTGCTCTCCTCTTGATCCCATACTAT 86080 CT967303.6 1601 AGGCGAAAATTTTCTTTTCCTCTCTAATGGTGCCTGACTCTCGTTTTCTT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86081 AGGCGAAAATTTTCTTTTCCTCTCTAATGGTGCCTGACTCTCGTTTTCTT 86130 CT967303.6 1651 TGCCCGTGGCAACCCCATGGCGTTTCAACACTGATTCCGATTCAACACCA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86131 TGCCCGTGGCAACCCCATGGCGTTTCAACACTGATTCCGATTCAACACCA 86180 CT967303.6 1701 TAATCAAACTCTTTCCCCATCACAACCTCATGGCGTTTCACCAATGACTC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86181 TAATCAAACTCTTTCCCCATCACAACCTCATGGCGTTTCACCAATGACTC 86230 CT967303.6 1751 TAATTCAACACCATCATCCGACCCACTCTCACTAGAAAGCTCGCCCGGCT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86231 TAATTCAACACCATCATCCGACCCACTCTCACTAGAAAGCTCGCCCGGCT 86280 CT967303.6 1801 CTCTATCCATAATCTTAACAGAAAACTCACATCTTCTTGAACCAGGCACG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86281 CTCTATCCATAATCTTAACAGAAAACTCACATCTTCTTGAACCAGGCACG 86330 CT967303.6 1851 CCACTACGACCACCACTGCTACCAGAGTCACTCCTACTCGAAGATGACCG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86331 CCACTACGACCACCACTGCTACCAGAGTCACTCCTACTCGAAGATGACCG 86380 CT967303.6 1901 GTAACTTCCATTCAAAACTTCTTTCTGACTCTCCCTAATATCTTTCTGTC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86381 GTAACTTCCATTCAAAACTTCTTTCTGACTCTCCCTAATATCTTTCTGTC 86430 CT967303.6 1951 TCTGAATAATCCTATCCCTTGTATCCCTACTTCGACCCTTACCATTTCTA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CT963131.5 86431 TCTGAATAATCCTATCCCTTGTATCCCTACTTCGACCCTTACCATTTCTA 86480
