<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT030734.24	1	GAATTCTTTCATGTTTGCGAAGGTACGAAGAACGTCCGAATACTTTCCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44625	GAATTCTTTCATGTTTGCGAAGGTACGAAGAACGTCCGAATACTTTCCCA	44674

CT030734.24	51	CACTGCTTACACGCATAAAGTTTTTCTCGGGTATGACTTCTTTCATGTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44675	CACTGCTTACACGCATAAAGTTTTTCTCGGGTATGACTTCTTTCATGTTG	44724

CT030734.24	101	GAGAAGGTGGTAAGAATGAATACATGCTTTCCCACATTGTTTACACACAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44725	GAGAAGGTGGTAAGAATGAATACATGCTTTCCCACATTGTTTACACACAT	44774

CT030734.24	151	AAGGTCTGTCTCCAGTATGAGTTCGTTCATGGTTATAACAGGCCCTTGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44775	AAGGTCTGTCTCCAGTATGAGTTCGTTCATGGTTATAACAGGCCCTTGGA	44824

CT030734.24	201	TGAATGAAAGCTTTCCCACAATATTTACATGCAAATGTCTTCTCTCTGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44825	TGAATGAAAGCTTTCCCACAATATTTACATGCAAATGTCTTCTCTCTGGT	44874

CT030734.24	251	ATGAATTTTATAATGTTTGATAAGGTGACTGGAATTAACAAAGGCTTCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44875	ATGAATTTTATAATGTTTGATAAGGTGACTGGAATTAACAAAGGCTTCTC	44924

CT030734.24	301	CACACTGCTTACACACAAATGGTTTTTCTCCAGTTTGGATTCTTTCATAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44925	CACACTGCTTACACACAAATGGTTTTTCTCCAGTTTGGATTCTTTCATAT	44974

CT030734.24	351	GACTGACCATAACTACATGTCATGATAGCCGTTTCAAATTGCTTGTATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	44975	GACTGACCATAACTACATGTCATGATAGCCGTTTCAAATTGCTTGTATTC	45024

CT030734.24	401	ATGGAGGTTATCACCAGTATGTGTTGTCTCATAATCTTGATCAGAAGTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45025	ATGGAGGTTATCACCAGTATGTGTTGTCTCATAATCTTGATCAGAAGTGA	45074

CT030734.24	451	GACTCCTACAGGGGTCATTAGACTGTTTATTTCCATATGGTTTCTCTTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45075	GACTCCTACAGGGGTCATTAGACTGTTTATTTCCATATGGTTTCTCTTTG	45124

CT030734.24	501	GGAGGATTCTCATGGGCAAGAAAAGACTCAGAATATGCAAGATCTTTCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45125	GGAGGATTCTCATGGGCAAGAAAAGACTCAGAATATGCAAGATCTTTCCA	45174

CT030734.24	551	ATATTTCTTATGCTTAATAGGCTTTTCCATACATTTCTGATACTCATATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45175	ATATTTCTTATGCTTAATAGGCTTTTCCATACATTTCTGATACTCATATG	45224

CT030734.24	601	GTTTCTCTACAGTTAGTAGTCTGAGGTGCACATCTGACTGTGAAAGACCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45225	GTTTCTCTACAGTTAGTAGTCTGAGGTGCACATCTGACTGTGAAAGACCA	45274

CT030734.24	651	ATGACATCATTTTTACTTGCACTGTTTTCATATACTACTATTCCGGGAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45275	ATGACATCATTTTTACTTGCACTGTTTTCATATACTACTATTCCGGGAGG	45324

CT030734.24	701	TATGTACTTATTAACGATATGCTCTTGAATCTGTTGGTGCATTTCTCTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45325	TATGTACTTATTAACGATATGCTCTTGAATCTGTTGGTGCATTTCTCTAT	45374

CT030734.24	751	ACTGAATACCACGTTCAAATTCATAGAATCCTTCAACCATGAGAGTGCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45375	ACTGAATACCACGTTCAAATTCATAGAATCCTTCAACCATGAGAGTGCTG	45424

CT030734.24	801	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAATAGTACTATAGTCTTATGGCTAGCCCGAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45425	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAATAGTACTATAGTCTTATGGCTAGCCCGAAA	45474

CT030734.24	851	AGTGTTGGAGGCTGGGTTTGCCACACTTGTTATTGTAATACTTAGAGGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45475	AGTGTTGGAGGCTGGGTTTGCCACACTTGTTATTGTAATACTTAGAGGGT	45524

CT030734.24	901	AAAGGTTGAGCAACTGCAAGTTTGAGGTCAACCTGAGTCACAAAGAAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45525	AAAGGTTGAGCAACTGCAAGTTTGAGGTCAACCTGAGTCACAAAGAAAGA	45574

CT030734.24	951	CCTCATATTAAGGGAAAACAATTTATAAACCTGAAAGGACTGAACACTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45575	CCTCATATTAAGGGAAAACAATTTATAAACCTGAAAGGACTGAACACTGA	45624

CT030734.24	1001	ACTACAGGCCCTGAGGACATCATACAATCTTCTTAGTTTCTCTAATATCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45625	ACTACAGGCCCTGAGGACATCATACAATCTTCTTAGTTTCTCTAATATCA	45674

CT030734.24	1051	TTGCTGTCTCCTAAAACAATCAACACATACATTTACAAAAAGCTGTAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45675	TTGCTGTCTCCTAAAACAATCAACACATACATTTACAAAAAGCTGTAATA	45724

CT030734.24	1101	CACAGTGGTAGATAAGTAGATACACAGTGGTTTATTTTGCTCATTTCAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45725	CACAGTGGTAGATAAGTAGATACACAGTGGTTTATTTTGCTCATTTCAGA	45774

CT030734.24	1151	CTTTGTTCTTTACTTATCCTTATTTCATGGCTAGCTCATATCTTTCCCAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45775	CTTTGTTCTTTACTTATCCTTATTTCATGGCTAGCTCATATCTTTCCCAA	45824

CT030734.24	1201	TTTACCAAAATTGAATGTTCACTATGCAAAATGATGAGGGTCAGGTTTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45825	TTTACCAAAATTGAATGTTCACTATGCAAAATGATGAGGGTCAGGTTTTA	45874

CT030734.24	1251	TGGAATTGACATAGATGAATATTTTTAATGGAATTTTATGAAGGTGTGTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45875	TGGAATTGACATAGATGAATATTTTTAATGGAATTTTATGAAGGTGTGTC	45924

CT030734.24	1301	ACAATATATCCCAGACATGTATTTTATATTCCAAGTCTAAGAATATATTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45925	ACAATATATCCCAGACATGTATTTTATATTCCAAGTCTAAGAATATATTA	45974

CT030734.24	1351	AATAATTTCATATTTAAAGGAAAAGTTTCTGTATAATGAGAGAATTGGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	45975	AATAATTTCATATTTAAAGGAAAAGTTTCTGTATAATGAGAGAATTGGAA	46024

CT030734.24	1401	AATGTCTCATACAGTGTAAAGTTGCAGGATATTGTGCAACGTTCCAGTAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46025	AATGTCTCATACAGTGTAAAGTTGCAGGATATTGTGCAACGTTCCAGTAC	46074

CT030734.24	1451	AGAGTTGGGATTCCCCAATTCTGAATGGTCAAATTCAATGCAGTTCACAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46075	AGAGTTGGGATTCCCCAATTCTGAATGGTCAAATTCAATGCAGTTCACAT	46124

CT030734.24	1501	TAAGCAAATTTGTAAATTTGGATTATTTACTTGAGGCTCAGATTTCCTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46125	TAAGCAAATTTGTAAATTTGGATTATTTACTTGAGGCTCAGATTTCCTAT	46174

CT030734.24	1551	AACTTTCAAGTATTTGATGTAAACTCGTTTTCTTTGAGAATACATTACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46175	AACTTTCAAGTATTTGATGTAAACTCGTTTTCTTTGAGAATACATTACCT	46224

CT030734.24	1601	CAAATTTCTCCTAATATTTTGGTAATCTTCAATATTGTCTTCCTCGCTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46225	CAAATTTCTCCTAATATTTTGGTAATCTTCAATATTGTCTTCCTCGCTTT	46274

CT030734.24	1651	TCCCTGAAAGGTAAACCCAAAGAAAGTATTATATTCAACATTACATTAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46275	TCCCTGAAAGGTAAACCCAAAGAAAGTATTATATTCAACATTACATTAAA	46324

CT030734.24	1701	AATCATTACATTCTGGTTCCCCCCACACTCTGTGGTACAATGTAACAAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46325	AATCATTACATTCTGGTTCCCCCCACACTCTGTGGTACAATGTAACAAGG	46374

CT030734.24	1751	CATGCAATATTCACCAACAGCTTTCAGTATTTCAAATTATGCAAGTACAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46375	CATGCAATATTCACCAACAGCTTTCAGTATTTCAAATTATGCAAGTACAC	46424

CT030734.24	1801	AGATGAATAAGAAACAGTTATTTTTCTGAGTGAACAAGGAAAAGTTATCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46425	AGATGAATAAGAAACAGTTATTTTTCTGAGTGAACAAGGAAAAGTTATCA	46474

CT030734.24	1851	TGCTGTATTTTTTACCTATGGAGATCAGGTTGCTAAAGGTTTCCTTCATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46475	TGCTGTATTTTTTACCTATGGAGATCAGGTTGCTAAAGGTTTCCTTCATC	46524

CT030734.24	1901	ACATCTCTGTAGAGCTCCTTTTGATAAGAATCCAACAAAGCCCACTCTCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46525	ACATCTCTGTAGAGCTCCTTTTGATAAGAATCCAACAAAGCCCACTCTCC	46574

CT030734.24	1951	TAAGGTGAAGTTCACAGCCACATCCTCAAAGGTCACTGGTTCCTAAAATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT485619.6	46575	TAAGGTGAAGTTCACAGCCACATCCTCAAAGGTCACTGGTTCCTAAAATA	46624

Overview

Query
CT030734.24 - 232864 bps
Hit
CT485619.6 - 46624 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link